A nonhomogeneous hidden markov model for gene mapping based on next-generation sequencing data.

Ghavidel, Fatemeh Zamanzad; Claesen, Jürgen; Burzykowski, Tomasz

Ghavidel, Fatemeh Zamanzad; Claesen, Jürgen; Burzykowski, Tomasz.

Afiliação

Ghavidel FZ; Interuniversity Institute for Biostatistics and statistical Bioinformatics, Hasselt University , Diepenbeek, Belgium .

J Comput Biol ; 22(2): 178-88, 2015 Feb.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-25611462

Assuntos

Algoritmos; Mapeamento Cromossômico/métodos; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Análise de Sequência de DNA/métodos; Cadeias de Markov; Modelos Genéticos; Polimorfismo de Nucleotídeo Único; Locos de Características Quantitativas; Saccharomyces cerevisiae/genética

Palavras-chave

next-generation sequencing; nonhomogeneous hidden Markov model; quantitative trait loci analysis; single-nucleotide polymorphisms

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Algoritmos / Mapeamento Cromossômico / Análise de Sequência de DNA / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala Tipo de estudo: Health_economic_evaluation / Prognostic_studies Idioma: En Ano de publicação: 2015 Tipo de documento: Article

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