Why do the outer membrane proteins OmpF from E. coli and OprP from P. aeruginosa prefer trimers? Simulation studies.

Niramitranon, Jitti; Sansom, Mark S P; Pongprayoon, Prapasiri

Niramitranon, Jitti; Sansom, Mark S P; Pongprayoon, Prapasiri.

Afiliação

Niramitranon J; Department of Computer engineering, Faculty of Engineering, Kasetsart Univeristy, Chatuchak, Bangkok 10900, Thailand.
Sansom MS; Department of Biochemistry, University of Oxford, South Parks Road, Oxford OX1 3QU, UK.
Pongprayoon P; Department of Chemistry, Faculty of Science, Kasetsart University, Chatuchak, Bangkok 10900, Thailand. Electronic address: fsciprpo@ku.ac.th.

J Mol Graph Model ; 65: 1-7, 2016 Apr.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-26895142

Assuntos

Proteínas de Bactérias/química; Escherichia coli/química; Porinas/química; Pseudomonas aeruginosa/química; Proteínas de Bactérias/metabolismo; Bases de Dados de Proteínas; Escherichia coli/metabolismo; Expressão Gênica; Ligação de Hidrogênio; Simulação de Dinâmica Molecular; Porinas/metabolismo; Domínios Proteicos; Multimerização Proteica; Estabilidade Proteica; Estrutura Secundária de Proteína; Pseudomonas aeruginosa/metabolismo; Cloreto de Sódio/química; Termodinâmica; Água/química

Palavras-chave

Molecular dynamics simulations; OmpF; OprP; Outer membrane protein; Porin; Trimer

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Pseudomonas aeruginosa / Proteínas de Bactérias / Porinas / Escherichia coli Idioma: En Ano de publicação: 2016 Tipo de documento: Article

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