metaBIT, an integrative and automated metagenomic pipeline for analysing microbial profiles from high-throughput sequencing shotgun data.

Louvel, Guillaume; Der Sarkissian, Clio; Hanghøj, Kristian; Orlando, Ludovic

Louvel, Guillaume; Der Sarkissian, Clio; Hanghøj, Kristian; Orlando, Ludovic.

Afiliação

Louvel G; Centre for Geogenetics, Natural History Museum of Denmark, University of Copenhagen, Øster Voldgade 5-7, 1350, Copenhagen K, Denmark.
Der Sarkissian C; Centre for Geogenetics, Natural History Museum of Denmark, University of Copenhagen, Øster Voldgade 5-7, 1350, Copenhagen K, Denmark.
Hanghøj K; Centre for Geogenetics, Natural History Museum of Denmark, University of Copenhagen, Øster Voldgade 5-7, 1350, Copenhagen K, Denmark.
Orlando L; Centre for Geogenetics, Natural History Museum of Denmark, University of Copenhagen, Øster Voldgade 5-7, 1350, Copenhagen K, Denmark. lorlando@snm.ku.dk.

Mol Ecol Resour ; 16(6): 1415-1427, 2016 Nov.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-27238636

Assuntos

Biologia Computacional/métodos; Microbiologia Ambiental; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Metagenômica/métodos; Microbiota; Análise de Sequência de DNA/métodos; Automação

Palavras-chave

ancient DNA; metagenomics; microbial profiling; microbiome; shotgun sequencing

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Análise de Sequência de DNA / Biologia Computacional / Microbiologia Ambiental / Metagenômica / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala / Microbiota Tipo de estudo: Evaluation_studies Idioma: En Ano de publicação: 2016 Tipo de documento: Article

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