Computational insights into the protonation states of catalytic dyad in BACE1-acyl guanidine based inhibitor complex.

Kocak, Abdulkadir; Erol, Ismail; Yildiz, Muslum; Can, Hatice

Kocak, Abdulkadir; Erol, Ismail; Yildiz, Muslum; Can, Hatice.

Afiliação

Kocak A; Department of Chemistry, Gebze Technical University, 41400, Gebze, Kocaeli, Turkey. Electronic address: kocak@gtu.edu.tr.
Erol I; Department of Chemistry, Gebze Technical University, 41400, Gebze, Kocaeli, Turkey.
Yildiz M; Molecular Biology and Genetics, Gebze Technical University, 41400, Gebze, Kocaeli, Turkey.
Can H; Department of Chemistry, Gebze Technical University, 41400, Gebze, Kocaeli, Turkey. Electronic address: hcan@gtu.edu.tr.

J Mol Graph Model ; 70: 226-235, 2016 11.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-27770745

Assuntos

Secretases da Proteína Precursora do Amiloide/antagonistas & inibidores; Secretases da Proteína Precursora do Amiloide/química; Biocatálise; Guanidina/farmacologia; Modelos Moleculares; Inibidores de Proteases/química; Inibidores de Proteases/farmacologia; Prótons; Acilação; Guanidina/química; Ligação de Hidrogênio; Ligantes; Simulação de Acoplamento Molecular; Simulação de Dinâmica Molecular; Teoria Quântica; Termodinâmica

Palavras-chave

BACE-1; DFT; Docking; Molecular dynamics; Protonation state; ß-secretase

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Inibidores de Proteases / Prótons / Modelos Moleculares / Guanidina / Secretases da Proteína Precursora do Amiloide / Biocatálise Idioma: En Ano de publicação: 2016 Tipo de documento: Article

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