Sequence protein identification by randomized sequence database and transcriptome mass spectrometry (SPIDER-TMS): from manual to automatic application of a 'de novo sequencing' approach.

Pascale, Raffaella; Grossi, Gerarda; Cruciani, Gabriele; Mecca, Giansalvatore; Santoro, Donatello; Sarli Calace, Renzo; Falabella, Patrizia; Bianco, Giuliana

Sequence protein identification by randomized sequence database and transcriptome mass spectrometry (SPIDER-TMS): from manual to automatic application of a 'de novo sequencing' approach.

Pascale, Raffaella; Grossi, Gerarda; Cruciani, Gabriele; Mecca, Giansalvatore; Santoro, Donatello; Sarli Calace, Renzo; Falabella, Patrizia; Bianco, Giuliana.

Afiliação

Pascale R; Scuola di Ingegneria, Università degli Studi della Basilicata, Via dell'Ateneo Lucano, 10-85100 Potenza, Italy.
Grossi G; Dipartimento di Scienze, Università degli Studi della Basilicata, Via dell'Ateneo Lucano, 10-85100 Potenza, Italy.
Cruciani G; Dipartimento di Chimica, Università di Perugia, via Elce di Sotto, 8-06123 Perugia, Italy.
Mecca G; Dipartimento di Matematica, Informatica ed Economia, Via dell'Ateneo Lucano, 10-85100 Potenza, Italy.
Santoro D; Dipartimento di Matematica, Informatica ed Economia, Via dell'Ateneo Lucano, 10-85100 Potenza, Italy.
Sarli Calace R; Studio di Ingegneria, via Aldo Moro, 52-85010 Pignola (Pz), Italy.
Falabella P; Dipartimento di Scienze, Università degli Studi della Basilicata, Via dell'Ateneo Lucano, 10-85100 Potenza, Italy. patrizia.falabella@unibas.it.
Bianco G; Dipartimento di Scienze, Università degli Studi della Basilicata, Via dell'Ateneo Lucano, 10-85100 Potenza, Italy. giuliana.bianco@unibas.it.

Eur J Mass Spectrom (Chichester) ; 22(4): 193-198, 2016.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-27882884

Assuntos

Bases de Dados de Proteínas; Ensaios de Triagem em Larga Escala/métodos; Mapeamento de Peptídeos/métodos; Análise de Sequência de Proteína/métodos; Espectrometria de Massas em Tandem/métodos; Transcriptoma; Sequência de Aminoácidos; Mineração de Dados/métodos; Dados de Sequência Molecular

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Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Mapeamento de Peptídeos / Análise de Sequência de Proteína / Bases de Dados de Proteínas / Espectrometria de Massas em Tandem / Ensaios de Triagem em Larga Escala / Transcriptoma Tipo de estudo: Clinical_trials / Diagnostic_studies Idioma: En Ano de publicação: 2016 Tipo de documento: Article

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