Dynamic Rewiring of Promoter-Anchored Chromatin Loops during Adipocyte Differentiation.

Siersbæk, Rasmus; Madsen, Jesper Grud Skat; Javierre, Biola Maria; Nielsen, Ronni; Bagge, Emilie Kristine; Cairns, Jonathan; Wingett, Steven William; Traynor, Sofie; Spivakov, Mikhail; Fraser, Peter; Mandrup, Susanne

Siersbæk, Rasmus; Madsen, Jesper Grud Skat; Javierre, Biola Maria; Nielsen, Ronni; Bagge, Emilie Kristine; Cairns, Jonathan; Wingett, Steven William; Traynor, Sofie; Spivakov, Mikhail; Fraser, Peter; Mandrup, Susanne.

Afiliação

Siersbæk R; University of Southern Denmark, Campusvej 55, 5230 Odense M, Denmark.
Madsen JGS; University of Southern Denmark, Campusvej 55, 5230 Odense M, Denmark.
Javierre BM; Nuclear Dynamics Programme, Babraham Institute, Cambridge CB22 3AT, UK.
Nielsen R; University of Southern Denmark, Campusvej 55, 5230 Odense M, Denmark.
Bagge EK; University of Southern Denmark, Campusvej 55, 5230 Odense M, Denmark.
Cairns J; Nuclear Dynamics Programme, Babraham Institute, Cambridge CB22 3AT, UK.
Wingett SW; Nuclear Dynamics Programme, Babraham Institute, Cambridge CB22 3AT, UK; Bioinformatics Group, Babraham Institute, Cambridge CB22 3AT, UK.
Traynor S; University of Southern Denmark, Campusvej 55, 5230 Odense M, Denmark.
Spivakov M; Nuclear Dynamics Programme, Babraham Institute, Cambridge CB22 3AT, UK.
Fraser P; Nuclear Dynamics Programme, Babraham Institute, Cambridge CB22 3AT, UK; Department of Biological Science, Florida State University, Tallahassee, FL 32306, USA. Electronic address: peter.fraser@babraham.ac.uk.
Mandrup S; University of Southern Denmark, Campusvej 55, 5230 Odense M, Denmark. Electronic address: s.mandrup@bmb.sdu.dk.

Mol Cell ; 66(3): 420-435.e5, 2017 May 04.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-28475875

Assuntos

Adipócitos/metabolismo; Adipogenia; Montagem e Desmontagem da Cromatina; Cromatina/metabolismo; Regiões Promotoras Genéticas; Células 3T3-L1; Animais; Proteínas de Ciclo Celular/genética; Proteínas de Ciclo Celular/metabolismo; Cromatina/química; Cromatina/genética; Imunoprecipitação da Cromatina; Proteínas Cromossômicas não Histona/genética; Proteínas Cromossômicas não Histona/metabolismo; Proteína p300 Associada a E1A/genética; Proteína p300 Associada a E1A/metabolismo; Elementos Facilitadores Genéticos; Subunidade 1 do Complexo Mediador/genética; Subunidade 1 do Complexo Mediador/metabolismo; Camundongos; Conformação de Ácido Nucleico; RNA Mensageiro/genética; RNA Mensageiro/metabolismo; Análise de Sequência de RNA; Fatores de Tempo; Transcrição Gênica; Ativação Transcricional

Palavras-chave

ChIP-seq; adipocyte differentiation; chromatin looping; corepressors; poised enhancers; promoter capture Hi-C; single nucleotide variance; super-enhancers; topologically associating domains; transcriptional regulation

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Cromatina / Regiões Promotoras Genéticas / Adipócitos / Montagem e Desmontagem da Cromatina / Adipogenia Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Animals Idioma: En Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article

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