AGeNNT: annotation of enzyme families by means of refined neighborhood networks.

Kandlinger, Florian; Plach, Maximilian G; Merkl, Rainer

Kandlinger, Florian; Plach, Maximilian G; Merkl, Rainer.

Afiliação

Kandlinger F; Institute of Biophysics and Physical Biochemistry, University of Regensburg, D-93040, Regensburg, Germany.
Plach MG; Faculty of Mathematics and Computer Science, University of Hagen, D-58084, Hagen, Germany.
Merkl R; Institute of Biophysics and Physical Biochemistry, University of Regensburg, D-93040, Regensburg, Germany.

BMC Bioinformatics ; 18(1): 274, 2017 May 25.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-28545394

Assuntos

Enzimas/metabolismo; Interface Usuário-Computador; Algoritmos; Antranilato Fosforribosiltransferase/química; Antranilato Fosforribosiltransferase/genética; Antranilato Fosforribosiltransferase/metabolismo; Biocatálise; Análise por Conglomerados; Enzimas/química; Enzimas/genética; Redes Reguladoras de Genes; Histidina/biossíntese; Internet; Anotação de Sequência Molecular; Timidina Fosforilase/química; Timidina Fosforilase/genética; Timidina Fosforilase/metabolismo

Palavras-chave

Enzyme function; GNN; Genome content; Genome neighborhood network; Homology-free annotation; SSN; Sequence similarity network

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Interface Usuário-Computador / Enzimas Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article

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