Molecular Dynamics Information Improves cis-Peptide-Based Function Annotation of Proteins.

Das, Sreetama; Bhadra, Pratiti; Ramakumar, Suryanarayanarao; Pal, Debnath

Das, Sreetama; Bhadra, Pratiti; Ramakumar, Suryanarayanarao; Pal, Debnath.

Afiliação

Das S; Department of Physics and Department of Computational and Data Sciences, Indian Institute of Science , Bangalore 560012, India.
Bhadra P; Department of Physics and Department of Computational and Data Sciences, Indian Institute of Science , Bangalore 560012, India.
Ramakumar S; Department of Physics and Department of Computational and Data Sciences, Indian Institute of Science , Bangalore 560012, India.
Pal D; Department of Physics and Department of Computational and Data Sciences, Indian Institute of Science , Bangalore 560012, India.

J Proteome Res ; 16(8): 2936-2946, 2017 08 04.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-28633522

Assuntos

Simulação de Dinâmica Molecular; Anotação de Sequência Molecular/métodos; Peptídeos/genética; Animais; Humanos; Isomerismo; Métodos; Anotação de Sequência Molecular/normas; Peptídeos/química; Estrutura Secundária de Proteína; Proteínas/química; Proteínas/fisiologia

Palavras-chave

Gene Ontology; autocorrelation vector; cis-peptide fragment; coarse-grained force field; fragment-based method; function annotation; geometric clustering; molecular dynamics simulation; sequence-structure patterns; validation

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Peptídeos / Simulação de Dinâmica Molecular / Anotação de Sequência Molecular Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Animals / Humans Idioma: En Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article

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