Effects and limitations of a nucleobase-driven backmapping procedure for nucleic acids using steered molecular dynamics.

Poblete, Simón; Bottaro, Sandro; Bussi, Giovanni

Poblete, Simón; Bottaro, Sandro; Bussi, Giovanni.

Afiliação

Poblete S; Molecular and Statistical Biophysics Group, Scuola Internazionale Superiore di Studi Avanzati, 265, Via Bonomea, I-34136, Trieste, Italy. Electronic address: spoblete@sissa.it.
Bottaro S; Structural Biology and NMR Laboratory, Department of Biology, University of Copenhagen, Ole Maaloes Vej 5, 2200 Copenhagen N, Denmark. Electronic address: sandro.bottaro@bio.ku.dk.
Bussi G; Molecular and Statistical Biophysics Group, Scuola Internazionale Superiore di Studi Avanzati, 265, Via Bonomea, I-34136, Trieste, Italy. Electronic address: bussi@sissa.it.

Biochem Biophys Res Commun ; 498(2): 352-358, 2018 03 29.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-29248728

Assuntos

Simulação de Dinâmica Molecular; RNA/química; Conformação de Ácido Nucleico; Ácidos Nucleicos/química; RNA/metabolismo; Solventes/química

Palavras-chave

Backmapping; Coarse-graining; RNA; Steered molecular dynamics

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: RNA / Simulação de Dinâmica Molecular Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article

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