From RNA-seq to Biological Inference: Using Compositional Data Analysis in Meta-Transcriptomics.

Macklaim, Jean M; Gloor, Gregory B

Macklaim, Jean M; Gloor, Gregory B.

Afiliação

Macklaim JM; Department of Biochemistry, Schulich School of Medicine and Dentistry, The University of Western Ontario, London, ON, Canada.
Gloor GB; Canadian Centre for Human Microbiome and Probiotic Research, Lawson Health Sciences Centre, London, ON, Canada.

Methods Mol Biol ; 1849: 193-213, 2018.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-30298256

Assuntos

Bactérias/genética; Biologia Computacional/métodos; Perfilação da Expressão Gênica/métodos; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Metagenoma; Microbiota; Transcriptoma; Bactérias/classificação; Bactérias/isolamento & purificação; Humanos

Palavras-chave

Bayesian inference; Compositional data; Meta-transcriptome; Microbiome; Probability distribution; Standardized effect; Transcriptomics

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Bactérias / Biologia Computacional / Perfilação da Expressão Gênica / Metagenoma / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala / Transcriptoma / Microbiota Limite: Humans Idioma: En Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article

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