Defining nonsense-mediated mRNA decay intermediates in human cells.

Kurosaki, Tatsuaki; Myers, Jason R; Maquat, Lynne E

Kurosaki, Tatsuaki; Myers, Jason R; Maquat, Lynne E.

Afiliação

Kurosaki T; Department of Biochemistry and Biophysics, School of Medicine and Dentistry, University of Rochester, Rochester, NY 14642, USA; Center for RNA Biology, University of Rochester, Rochester, NY 14642, USA.
Myers JR; Genomics Research Center, University of Rochester, Rochester, NY 14642, USA.
Maquat LE; Department of Biochemistry and Biophysics, School of Medicine and Dentistry, University of Rochester, Rochester, NY 14642, USA; Center for RNA Biology, University of Rochester, Rochester, NY 14642, USA. Electronic address: lynne_maquat@urmc.rochester.edu.

Methods ; 155: 68-76, 2019 02 15.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-30576707

Assuntos

DNA Complementar/genética; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Degradação do RNAm Mediada por Códon sem Sentido; RNA Mensageiro/genética; Códon sem Sentido; DNA Complementar/metabolismo; Regulação da Expressão Gênica; Biblioteca Gênica; Células HEK293; Humanos; Imunoprecipitação/métodos; Ácido Okadáico/farmacologia; Fosforilação/efeitos dos fármacos; RNA Helicases/genética; RNA Helicases/metabolismo; Estabilidade de RNA/efeitos dos fármacos; RNA Mensageiro/metabolismo; Transativadores/genética; Transativadores/metabolismo

Palavras-chave

Co-translational mRNA decay; Immunoprecipitation; Next-generation transcriptome sequencing; Phosphorylated UPF1; RIP−seq; RNA helicase; mRNP

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: RNA Mensageiro / DNA Complementar / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala / Degradação do RNAm Mediada por Códon sem Sentido Limite: Humans Idioma: En Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article

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