Single-Cell RNA-Sequencing-Based CRISPRi Screening Resolves Molecular Drivers of Early Human Endoderm Development.

Genga, Ryan M J; Kernfeld, Eric M; Parsi, Krishna M; Parsons, Teagan J; Ziller, Michael J; Maehr, René

Genga, Ryan M J; Kernfeld, Eric M; Parsi, Krishna M; Parsons, Teagan J; Ziller, Michael J; Maehr, René.

Afiliação

Genga RMJ; Program in Molecular Medicine, Diabetes Center of Excellence, University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA 01605, USA.
Kernfeld EM; Program in Molecular Medicine, Diabetes Center of Excellence, University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA 01605, USA.
Parsi KM; Program in Molecular Medicine, Diabetes Center of Excellence, University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA 01605, USA.
Parsons TJ; Program in Molecular Medicine, Diabetes Center of Excellence, University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA 01605, USA.
Ziller MJ; Department of Translational Psychiatry, Max Planck Institute of Psychiatry, 80804 Munich, Germany.
Maehr R; Program in Molecular Medicine, Diabetes Center of Excellence, University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA 01605, USA. Electronic address: rene.maehr@umassmed.edu.

Cell Rep ; 27(3): 708-718.e10, 2019 04 16.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-30995470

Assuntos

Repetições Palindrômicas Curtas Agrupadas e Regularmente Espaçadas/genética; RNA Guia de Cinetoplastídeos/metabolismo; Fatores de Transcrição/metabolismo; Diferenciação Celular; Cromatina/metabolismo; Endoderma/citologia; Endoderma/metabolismo; Fator 3-beta Nuclear de Hepatócito/antagonistas & inibidores; Fator 3-beta Nuclear de Hepatócito/genética; Fator 3-beta Nuclear de Hepatócito/metabolismo; Células-Tronco Embrionárias Humanas/citologia; Células-Tronco Embrionárias Humanas/metabolismo; Humanos; Células-Tronco Pluripotentes/citologia; Células-Tronco Pluripotentes/metabolismo; Interferência de RNA; Fatores de Transcrição SOXF/genética; Fatores de Transcrição SOXF/metabolismo; Transdução de Sinais; Análise de Célula Única; Proteína Smad4/genética; Proteína Smad4/metabolismo; Fatores de Transcrição/antagonistas & inibidores; Fatores de Transcrição/genética; Fator de Crescimento Transformador beta/metabolismo

Palavras-chave

CRISPRi; chromatin accessibility; dCas9-KRAB; endoderm; hepatic endoderm; human development; perturbation screen; pluripotent stem cells; single-cell RNA-seq; stem cell differentiation

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Fatores de Transcrição / RNA Guia de Cinetoplastídeos / Repetições Palindrômicas Curtas Agrupadas e Regularmente Espaçadas Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Prognostic_studies / Screening_studies Limite: Humans Idioma: En Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article

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