Crunch: integrated processing and modeling of ChIP-seq data in terms of regulatory motifs.

Berger, Severin; Pachkov, Mikhail; Arnold, Phil; Omidi, Saeed; Kelley, Nicholas; Salatino, Silvia; van Nimwegen, Erik

Berger, Severin; Pachkov, Mikhail; Arnold, Phil; Omidi, Saeed; Kelley, Nicholas; Salatino, Silvia; van Nimwegen, Erik.

Afiliação

Berger S; Biozentrum, University of Basel, and Swiss Institute of Bioinformatics, CH-4056 Basel, Switzerland.
Pachkov M; Biozentrum, University of Basel, and Swiss Institute of Bioinformatics, CH-4056 Basel, Switzerland.
Arnold P; Biozentrum, University of Basel, and Swiss Institute of Bioinformatics, CH-4056 Basel, Switzerland.
Omidi S; Biozentrum, University of Basel, and Swiss Institute of Bioinformatics, CH-4056 Basel, Switzerland.
Kelley N; Biozentrum, University of Basel, and Swiss Institute of Bioinformatics, CH-4056 Basel, Switzerland.
Salatino S; Biozentrum, University of Basel, and Swiss Institute of Bioinformatics, CH-4056 Basel, Switzerland.
van Nimwegen E; Biozentrum, University of Basel, and Swiss Institute of Bioinformatics, CH-4056 Basel, Switzerland.

Genome Res ; 29(7): 1164-1177, 2019 07.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31138617

Assuntos

Sequenciamento de Cromatina por Imunoprecipitação; Biologia Computacional/métodos; Fatores de Transcrição/metabolismo; Motivos de Aminoácidos; Animais; Sítios de Ligação; Conjuntos de Dados como Assunto; Humanos; Motivos de Nucleotídeos; Controle de Qualidade; Sequências Reguladoras de Ácido Nucleico

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Fatores de Transcrição / Biologia Computacional / Sequenciamento de Cromatina por Imunoprecipitação Tipo de estudo: Evaluation_studies / Prognostic_studies Limite: Animals / Humans Idioma: En Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article

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