From genotype to antibiotic susceptibility phenotype in the order Enterobacterales: a clinical perspective.

Ruppé, E; Cherkaoui, A; Charretier, Y; Girard, M; Schicklin, S; Lazarevic, V; Schrenzel, J

Ruppé, E; Cherkaoui, A; Charretier, Y; Girard, M; Schicklin, S; Lazarevic, V; Schrenzel, J.

Afiliação

Ruppé E; Laboratoire de Recherche Génomique, Service des Maladies Infectieuses, Hôpitaux Universitaires de Genève, Geneva, Switzerland. Electronic address: etienne.ruppe@inserm.fr.
Cherkaoui A; Laboratoire de Bactériologie, Service de Médecine de Laboratoire, Département de Médecine Génétique, de Laboratoire et de Pathologie, Hôpitaux Universitaires de Genève, Geneva, Switzerland.
Charretier Y; Laboratoire de Recherche Génomique, Service des Maladies Infectieuses, Hôpitaux Universitaires de Genève, Geneva, Switzerland.
Girard M; Laboratoire de Recherche Génomique, Service des Maladies Infectieuses, Hôpitaux Universitaires de Genève, Geneva, Switzerland.
Schicklin S; Data Analytics Unit, BioMérieux, Marcy-I'Étoile, France.
Lazarevic V; Laboratoire de Recherche Génomique, Service des Maladies Infectieuses, Hôpitaux Universitaires de Genève, Geneva, Switzerland.
Schrenzel J; Laboratoire de Recherche Génomique, Service des Maladies Infectieuses, Hôpitaux Universitaires de Genève, Geneva, Switzerland; Laboratoire de Bactériologie, Service de Médecine de Laboratoire, Département de Médecine Génétique, de Laboratoire et de Pathologie, Hôpitaux Universitaires de Genève, Gene

Clin Microbiol Infect ; 26(5): 643.e1-643.e7, 2020 May.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31586657

Assuntos

Antibacterianos/farmacologia; Enterobacteriaceae/efeitos dos fármacos; Enterobacteriaceae/genética; Proteínas de Bactérias/genética; DNA Bacteriano/genética; Farmacorresistência Bacteriana/efeitos dos fármacos; Farmacorresistência Bacteriana/genética; Enterobacteriaceae/isolamento & purificação; Genoma Bacteriano/genética; Genótipo; Humanos; Testes de Sensibilidade Microbiana; Fenótipo

Palavras-chave

Antibiotic resistance; Antibiotic resistance genes; Antibiotic susceptibility testing; Bioinformatics; Inference; Whole-genome sequencing

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Enterobacteriaceae / Antibacterianos Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Humans Idioma: En Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article

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