Optimized sequencing depth and de novo assembler for deeply reconstructing the transcriptome of the tea plant, an economically important plant species.

Li, Fang-Dong; Tong, Wei; Xia, En-Hua; Wei, Chao-Ling

Li, Fang-Dong; Tong, Wei; Xia, En-Hua; Wei, Chao-Ling.

Afiliação

Li FD; State Key Laboratory of Tea Plant Biology and Utilization, Anhui Agricultural University, Hefei, 230036, China.
Tong W; School of Science, Anhui Agricultural University, Hefei, 230036, China.
Xia EH; State Key Laboratory of Tea Plant Biology and Utilization, Anhui Agricultural University, Hefei, 230036, China.
Wei CL; State Key Laboratory of Tea Plant Biology and Utilization, Anhui Agricultural University, Hefei, 230036, China. xiaenhua@gmail.com.

BMC Bioinformatics ; 20(1): 553, 2019 Nov 06.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31694521

Assuntos

Camellia sinensis/genética; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Transcriptoma/genética; Perfilação da Expressão Gênica; Regulação da Expressão Gênica de Plantas; Genoma de Planta; Folhas de Planta/genética; RNA Mensageiro/genética; RNA Mensageiro/metabolismo

Palavras-chave

Camellia sinensis; Sequencing depth; Tea plant; Transcriptome; de novo assembly

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Camellia sinensis / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala / Transcriptoma Tipo de estudo: Health_economic_evaluation Idioma: En Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article

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