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Increased diagnostic yield in complex dystonia through exome sequencing.
Wirth, Thomas; Tranchant, Christine; Drouot, Nathalie; Keren, Boris; Mignot, Cyril; Cif, Laura; Lefaucheur, Romain; Lion-François, Laurence; Méneret, Aurélie; Gras, Domitille; Roze, Emmanuel; Laroche, Cécile; Burbaud, Pierre; Bannier, Stéphanie; Lagha-Boukbiza, Ouhaid; Spitz, Marie-Aude; Laugel, Vincent; Bereau, Matthieu; Ollivier, Emmanuelle; Nitschke, Patrick; Doummar, Diane; Rudolf, Gabrielle; Anheim, Mathieu; Chelly, Jamel.
Afiliação
  • Wirth T; Département de Neurologie, Hôpital de Hautepierre, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France; Unit of Functional Neurosurgery, National Hospital for Neurology and Neurosurgery, London, United Kingdom; Fédération de Médecine Translationnelle de Strasbourg (FMTS), Université de Strasbo
  • Tranchant C; Département de Neurologie, Hôpital de Hautepierre, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France; Fédération de Médecine Translationnelle de Strasbourg (FMTS), Université de Strasbourg, Strasbourg, France; Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Illkirch, France.
  • Drouot N; Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Illkirch, France.
  • Keren B; APHP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Département de Génétique et de Cytogénétique, Centre de Référence Déficience Intellectuelle de Causes Rares, GRC UPMC «Déficience Intellectuelle et Autisme¼, Paris, France.
  • Mignot C; APHP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Département de Génétique et de Cytogénétique, Centre de Référence Déficience Intellectuelle de Causes Rares, GRC UPMC «Déficience Intellectuelle et Autisme¼, Paris, France; Faculté de Médecine de Sorbonne Université, INSERM, U 1127, CNRS UMR 7225, Institut du Cerveau
  • Cif L; Département de Neurochirurgie, Centre Hospitalier Régional Montpellier, Montpellier, France.
  • Lefaucheur R; Département de neurologie, Hôpitaux Universitaires de Rouen, Rouen, France.
  • Lion-François L; Service de Neuropédiatrie, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France.
  • Méneret A; Faculté de Médecine de Sorbonne Université, INSERM, U 1127, CNRS UMR 7225, Institut du Cerveau et de la Moelle épinière, ICM, Paris, France; AP-HP, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière, Département de Neurologie, Paris, France.
  • Gras D; Service de Neuropédiatrie, Hôpital Robert Debré, AP-HP, Paris, France.
  • Roze E; Faculté de Médecine de Sorbonne Université, INSERM, U 1127, CNRS UMR 7225, Institut du Cerveau et de la Moelle épinière, ICM, Paris, France; AP-HP, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière, Département de Neurologie, Paris, France.
  • Laroche C; Département de pédiatrie, hôpital mère enfant, Limoges, France.
  • Burbaud P; CHU de Bordeaux, Service d'explorations Fonctionnelles du système nerveux, Bordeaux, France.
  • Bannier S; Service de neurologie, Centre hospitalier de la Côte Basque, Bayonne, France.
  • Lagha-Boukbiza O; Département de Neurologie, Hôpital de Hautepierre, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France.
  • Spitz MA; Service de pédiatrie, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France.
  • Laugel V; Service de pédiatrie, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France.
  • Bereau M; Service de Neurologie, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon, Besançon, France.
  • Ollivier E; Institut IMAGINE, IMAGINE Bioinformatics Platform, Université Paris Descartes, Paris, France.
  • Nitschke P; Institut IMAGINE, IMAGINE Bioinformatics Platform, Université Paris Descartes, Paris, France.
  • Doummar D; Service de Neuropédiatrie, CHU Paris Est-Hôpital Armand-Trousseau, Paris, France.
  • Rudolf G; Département de Neurologie, Hôpital de Hautepierre, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France; Fédération de Médecine Translationnelle de Strasbourg (FMTS), Université de Strasbourg, Strasbourg, France; Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Illkirch, France.
  • Anheim M; Département de Neurologie, Hôpital de Hautepierre, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France; Fédération de Médecine Translationnelle de Strasbourg (FMTS), Université de Strasbourg, Strasbourg, France; Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Illkirch, France.
  • Chelly J; Fédération de Médecine Translationnelle de Strasbourg (FMTS), Université de Strasbourg, Strasbourg, France; Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Illkirch, France; Laboratoire de Diagnostic Génétique, Nouvel Hôpital Civil, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg,
Parkinsonism Relat Disord ; 74: 50-56, 2020 05.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-32334381
ABSTRACT

INTRODUCTION:

A strategy based on targeted gene panel sequencing identifies possibly pathogenic variants in fewer than 20% of cases in early-onset and familial form of dystonia. By using Whole Exome Sequencing (WES), we aimed to identify the missing genetic causes in dystonic patients without diagnosis despite gene panel sequencing. MATERIAL AND

METHODS:

WES was applied to DNA samples from 32 patients with early-onset or familial dystonia investigated by sequencing of a 127 movement disorders-associated gene panel. Dystonia was described according to the familial history, body distribution, evolution pattern, age of onset, associated symptoms and associated movement disorders. Rate of diagnoses was evaluated for each clinical feature.

RESULTS:

We identified causative variants for 11 patients from 9 families in CTNNB1, SUCLG1, NUS1, CNTNAP1, KCNB1, RELN, GNAO1, HIBCH, ADCK3 genes, yielding an overall diagnostic rate of 34.4%. Diagnostic yield was higher in complex dystonia compared to non-complex dystonia (66.7%-5.9%; p < 0.002), especially in patients showing intellectual disability compared to the patients without intellectual disability (87.5%-16.7%; p < 0.002).

CONCLUSION:

Our approach suggests WES as an efficient tool to improve the diagnostic yield after gene panel sequencing in dystonia. Larger study are warranted to confirm a potential genetic overlap between neurodevelopmental diseases and dystonia.
Assuntos
Palavras-chave

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Testes Genéticos / Distúrbios Distônicos / Sequenciamento do Exoma Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Etiology_studies / Incidence_studies / Observational_studies / Prognostic_studies / Risk_factors_studies Limite: Adult / Aged / Child, preschool / Humans / Infant / Male Idioma: En Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Testes Genéticos / Distúrbios Distônicos / Sequenciamento do Exoma Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Etiology_studies / Incidence_studies / Observational_studies / Prognostic_studies / Risk_factors_studies Limite: Adult / Aged / Child, preschool / Humans / Infant / Male Idioma: En Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article