ADEPT: a domain independent sequence alignment strategy for gpu architectures.

Awan, Muaaz G; Deslippe, Jack; Buluc, Aydin; Selvitopi, Oguz; Hofmeyr, Steven; Oliker, Leonid; Yelick, Katherine

Awan, Muaaz G; Deslippe, Jack; Buluc, Aydin; Selvitopi, Oguz; Hofmeyr, Steven; Oliker, Leonid; Yelick, Katherine.

Afiliação

Awan MG; Lawrence Berkeley National Laboratory, 1 Cyclotron Road, Berkeley, USA. mgawan@lbl.gov.
Deslippe J; Lawrence Berkeley National Laboratory, 1 Cyclotron Road, Berkeley, USA.
Buluc A; Lawrence Berkeley National Laboratory, 1 Cyclotron Road, Berkeley, USA.
Selvitopi O; Lawrence Berkeley National Laboratory, 1 Cyclotron Road, Berkeley, USA.
Hofmeyr S; Lawrence Berkeley National Laboratory, 1 Cyclotron Road, Berkeley, USA.
Oliker L; Lawrence Berkeley National Laboratory, 1 Cyclotron Road, Berkeley, USA.
Yelick K; Lawrence Berkeley National Laboratory, 1 Cyclotron Road, Berkeley, USA.

BMC Bioinformatics ; 21(1): 406, 2020 Sep 15.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-32933482

Assuntos

Biologia Computacional/métodos; Alinhamento de Sequência/métodos; Algoritmos; Humanos

Palavras-chave

Alignment; Bioinformatics; DNA; GPU; Protein

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Alinhamento de Sequência / Biologia Computacional Limite: Humans Idioma: En Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article

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