Preprocessing choices affect RNA velocity results for droplet scRNA-seq data.

Soneson, Charlotte; Srivastava, Avi; Patro, Rob; Stadler, Michael B

Soneson, Charlotte; Srivastava, Avi; Patro, Rob; Stadler, Michael B.

Afiliação

Soneson C; Friedrich Miescher Institute for Biomedical Research, Basel, Switzerland.
Srivastava A; SIB Swiss Institute of Bioinformatics, Basel, Switzerland.
Patro R; New York Genome Center, New York, United States of America.
Stadler MB; Center for Genomics and Systems Biology, New York University, New York, United States of America.

PLoS Comput Biol ; 17(1): e1008585, 2021 01.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-33428615

Assuntos

Biologia Computacional/métodos; Perfilação da Expressão Gênica/métodos; RNA Mensageiro; RNA Citoplasmático Pequeno; Análise de Sequência de RNA/métodos; Algoritmos; Animais; Bases de Dados Genéticas; Camundongos; RNA Mensageiro/análise; RNA Mensageiro/genética; RNA Mensageiro/metabolismo; RNA Citoplasmático Pequeno/análise; RNA Citoplasmático Pequeno/genética; RNA Citoplasmático Pequeno/metabolismo; Análise de Célula Única/métodos

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: RNA Mensageiro / Análise de Sequência de RNA / Biologia Computacional / RNA Citoplasmático Pequeno / Perfilação da Expressão Gênica Limite: Animals Idioma: En Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article

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