Oxford nanopore sequencing in clinical microbiology and infection diagnostics.

Sheka, Dropen; Alabi, Nikolay; Gordon, Paul M K

Sheka, Dropen; Alabi, Nikolay; Gordon, Paul M K.

Afiliação

Sheka D; Department of Biochemistry & Molecular Biology, Faculty of Medicine, University of Calgary, Calgary, Alberta, Canada.
Alabi N; Department of Biochemistry & Molecular Biology, Faculty of Medicine, University of Calgary, Calgary, Alberta, Canada.
Gordon PMK; Cumming School of Medicine Centre for Health Genomics and Informatics, University of Calgary.

Brief Bioinform ; 22(5)2021 09 02.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-33483726

Assuntos

Bactérias/genética; Infecções Bacterianas/diagnóstico; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Sequenciamento por Nanoporos/métodos; RNA Ribossômico 16S/genética; RNA Ribossômico 23S/genética; Antibacterianos/farmacologia; Bactérias/classificação; Bactérias/efeitos dos fármacos; Bactérias/crescimento & desenvolvimento; Infecções Bacterianas/tratamento farmacológico; Infecções Bacterianas/microbiologia; Farmacorresistência Bacteriana/genética; Humanos; Testes de Sensibilidade Microbiana; Testes Imediatos; Software

Palavras-chave

antimicrobial resistance prediction; bacterial pathogen identification; point-of-care diagnostics; single molecule sequencing

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Bactérias / Infecções Bacterianas / RNA Ribossômico 16S / RNA Ribossômico 23S / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala / Sequenciamento por Nanoporos Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Prognostic_studies Limite: Humans Idioma: En Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article

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