Pathogenic potential assessment of the Shiga toxin-producing <i>Escherichia coli</i> by a source attribution-considered machine learning model.

Im, Hanhyeok; Hwang, Seung-Ho; Kim, Byoung Sik; Choi, Sang Ho

Pathogenic potential assessment of the Shiga toxin-producing Escherichia coli by a source attribution-considered machine learning model.

Im, Hanhyeok; Hwang, Seung-Ho; Kim, Byoung Sik; Choi, Sang Ho.

Afiliação

Im H; National Research Laboratory of Molecular Microbiology and Toxicology, Seoul National University, 08826 Seoul, Republic of Korea.
Hwang SH; Department of Agricultural Biotechnology and Center for Food Safety and Toxicology, Seoul National University, 08826 Seoul, Republic of Korea.
Kim BS; National Research Laboratory of Molecular Microbiology and Toxicology, Seoul National University, 08826 Seoul, Republic of Korea.
Choi SH; Department of Agricultural Biotechnology and Center for Food Safety and Toxicology, Seoul National University, 08826 Seoul, Republic of Korea.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 118(20)2021 05 18.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-33986113

Assuntos

Proteínas de Escherichia coli/genética; Aprendizado de Máquina; Toxina Shiga II/genética; Escherichia coli Shiga Toxigênica/genética; Máquina de Vetores de Suporte; Infecções por Escherichia coli/diagnóstico; Infecções por Escherichia coli/microbiologia; Proteínas de Escherichia coli/metabolismo; Humanos; Curva ROC; Reprodutibilidade dos Testes; Toxina Shiga II/metabolismo; Escherichia coli Shiga Toxigênica/classificação; Escherichia coli Shiga Toxigênica/patogenicidade; Virulência/genética; Sequenciamento Completo do Genoma/métodos

Palavras-chave

STEC; machine learning; pathogenic potential; risk assessment

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Toxina Shiga II / Proteínas de Escherichia coli / Escherichia coli Shiga Toxigênica / Máquina de Vetores de Suporte / Aprendizado de Máquina Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Etiology_studies / Prognostic_studies / Risk_factors_studies Limite: Humans Idioma: En Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article

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