2-kupl: mapping-free variant detection from DNA-seq data of matched samples.

Wang, Yunfeng; Xue, Haoliang; Pourcel, Christine; Du, Yang; Gautheret, Daniel

Wang, Yunfeng; Xue, Haoliang; Pourcel, Christine; Du, Yang; Gautheret, Daniel.

Afiliação

Wang Y; Institute of Integrative Cell Biology (I2BC), Université Paris-Saclay, CNRS, CEA, 1 avenue de la Terrasse, 91190, Gif-sur-Yvette, France.
Xue H; Annoroad Gene Technology Co., Ltd, Beijing, 100176, China.
Pourcel C; Institute of Integrative Cell Biology (I2BC), Université Paris-Saclay, CNRS, CEA, 1 avenue de la Terrasse, 91190, Gif-sur-Yvette, France.
Du Y; Institute of Integrative Cell Biology (I2BC), Université Paris-Saclay, CNRS, CEA, 1 avenue de la Terrasse, 91190, Gif-sur-Yvette, France.
Gautheret D; Annoroad Gene Technology Co., Ltd, Beijing, 100176, China.

BMC Bioinformatics ; 22(1): 304, 2021 Jun 05.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-34090332

Assuntos

Genômica; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; DNA; Genoma Humano; Humanos; Análise de Sequência de DNA

Palavras-chave

Contigs; DNAseq; Mapping-free; PRAD; Recurrent variants; WES; WGS; k-mers

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Genômica / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala Tipo de estudo: Diagnostic_studies Limite: Humans Idioma: En Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article

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