cDNA-detector: detection and removal of cDNA contamination in DNA sequencing libraries.

Qi, Meifang; Nayar, Utthara; Ludwig, Leif S; Wagle, Nikhil; Rheinbay, Esther

Qi, Meifang; Nayar, Utthara; Ludwig, Leif S; Wagle, Nikhil; Rheinbay, Esther.

Afiliação

Qi M; Center for Cancer Research, Massachusetts General Hospital, Charlestown, MA, 02129, USA.
Nayar U; Harvard Medical School, Boston, MA, 02115, USA.
Ludwig LS; Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, 02142, USA.
Wagle N; Harvard Medical School, Boston, MA, 02115, USA.
Rheinbay E; Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, 02142, USA.

BMC Bioinformatics ; 22(1): 611, 2021 Dec 24.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-34952565

Assuntos

Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Simulação por Computador; DNA Complementar/genética; Biblioteca Gênica; Análise de Sequência de DNA

Palavras-chave

Contamination; Genomics; Quality control; Software; cDNA

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Prognostic_studies Idioma: En Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article

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