Random walks in a free energy landscape combining augmented molecular dynamics simulations with a dynamic graph neural network model.

Kamberaj, Hiqmet

Kamberaj, Hiqmet.

Afiliação

Kamberaj H; International Balkan University, Department of Computer Engineering, Makedonsko-Kosovska Brigada BB, Skopje, Republic of North Macedonia. Electronic address: kamberaj@yahoo.co.uk.

J Mol Graph Model ; 114: 108199, 2022 07.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-35462186

Assuntos

Simulação de Dinâmica Molecular; Dobramento de Proteína; Entropia; Redes Neurais de Computação; Peptídeos; Conformação Proteica; Solventes; Termodinâmica; Água

Palavras-chave

Dynamic neural network graph; Enhanced sampling; Folding and unfolding; Free energy landscape; Local transfer entropy; Transition pathways

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Dobramento de Proteína / Simulação de Dinâmica Molecular Tipo de estudo: Clinical_trials Idioma: En Ano de publicação: 2022 Tipo de documento: Article

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google