Reliability of species detection in 16S microbiome analysis: Comparison of five widely used pipelines and recommendations for a more standardized approach.

Hiergeist, Andreas; Ruelle, Jean; Emler, Stefan; Gessner, André

Hiergeist, Andreas; Ruelle, Jean; Emler, Stefan; Gessner, André.

Afiliação

Hiergeist A; Institute of Clinical Microbiology and Hygiene, University Hospital Regensburg, Regensburg, Germany.
Ruelle J; SmartGene Services SARL, Lausanne, Switzerland.
Emler S; SmartGene Services SARL, Lausanne, Switzerland.
Gessner A; Institute of Clinical Microbiology and Hygiene, University Hospital Regensburg, Regensburg, Germany.

PLoS One ; 18(2): e0280870, 2023.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-36795699

Assuntos

Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Microbiota; Reprodutibilidade dos Testes; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Microbiota/genética; Bactérias/genética; Sequência de Bases; RNA Ribossômico 16S/genética; Análise de Sequência de DNA/métodos

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala / Microbiota Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Guideline Idioma: En Ano de publicação: 2023 Tipo de documento: Article

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