AmberMDrun: A Scripting Tool for Running Amber MD in an Easy Way.

Zhang, Zhi-Wei; Lu, Wen-Cai

Zhang, Zhi-Wei; Lu, Wen-Cai.

Afiliação

Zhang ZW; College of Physics, Qingdao University, Qingdao 266071, China.
Lu WC; College of Physics, Qingdao University, Qingdao 266071, China.

Biomolecules ; 13(4)2023 03 31.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-37189382

Assuntos

Âmbar; Simulação de Dinâmica Molecular; Ligantes; Ligação Proteica; Desenho de Fármacos

Palavras-chave

Amber MD inputs; MM-PB(GB)SA; NVT and NPT balancing; automatically running Amber MD; scripting tool; ten step simulation preparation

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Âmbar / Simulação de Dinâmica Molecular Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Ano de publicação: 2023 Tipo de documento: Article

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