MSV: a modular structural variant caller that reveals nested and complex rearrangements by unifying breakends inferred directly from reads.

Schmidt, Markus; Kutzner, Arne

Schmidt, Markus; Kutzner, Arne.

Afiliação

Schmidt M; Biomedical Center Munich, Department of Physiological Chemistry, Ludwig-Maximilians-Universität, Großhaderner Str. 9, 82152, Planegg-Martinsried, Germany.
Kutzner A; Department of Information Systems, College of Engineering, Hanyang University, 222 Wangsimni-Ro, Seongdong-Gu, Seoul, 133-791, Republic of Korea. kutzner@hanyang.ac.kr.

Genome Biol ; 24(1): 170, 2023 07 17.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-37461107

Assuntos

Genômica; Software; Genoma; Biologia Computacional; Análise de Sequência de DNA; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala

Palavras-chave

Alignment; Ambiguity; Complex SV; MEMs; Nested SV; Pan-genomes; Seeds

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Software / Genômica Idioma: En Ano de publicação: 2023 Tipo de documento: Article

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