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Development of quantitative multiplex RT-qPCR one step assay for detection of hepatitis delta virus.
da Silva Queiroz, Jackson Alves; Roca, Tárcio Peixoto; Souza, Rutilene Barbosa; de Souza, Luiz Fellype Alves; Passos-Silva, Ana Maísa; da Silva, André Luiz Ferreira; de Castro E Silva, Eugênia; Borzacov, Lourdes Maria Pinheiro; de Cássia Pontello Rampazzo, Rita; Dos Santos Pereira, Soraya; Dantas, Thor Oliveira; Mazaro, Janaína; Villar, Lívia Melo; Salcedo, Juan Miguel Villalobos; da Matta, Daniel Archimedes; Vieira, Deusilene.
Afiliação
  • da Silva Queiroz JA; Fundação Oswaldo Cruz Rondônia FIOCRUZ/RO, Rua da Beira, 7176, Porto Velho, 76812-245, Brazil.
  • Roca TP; Programa de Pós-Graduação em Biologia Experimental, Universidade Federal de Rondônia e Fundação Oswaldo Cruz Rondônia - UNIR/FIOCRUZ/RO, 76801-974, Porto Velho, Brazil.
  • Souza RB; Fundação Oswaldo Cruz Rondônia FIOCRUZ/RO, Rua da Beira, 7176, Porto Velho, 76812-245, Brazil.
  • de Souza LFA; Programa de Pós-Graduação em Medicina Tropical, Instituto Oswaldo Cruz/IOC, FIOCRUZ, 21041-250, Rio de Janeiro, Brazil.
  • Passos-Silva AM; Centro de Infectologia Charles Merieux & Laboratório Rodolphe Merieux (FUNDHACRE), Rio Branco, 69918-340, Brazil.
  • da Silva ALF; Universidade Federal da Bahia - UFBA, Salvador, 40110-909, Brazil.
  • de Castro E Silva E; Programa de Pós-Graduação em Medicina Tropical, Instituto Oswaldo Cruz/IOC, FIOCRUZ, 21041-250, Rio de Janeiro, Brazil.
  • Borzacov LMP; Centro de Infectologia Charles Merieux & Laboratório Rodolphe Merieux (FUNDHACRE), Rio Branco, 69918-340, Brazil.
  • de Cássia Pontello Rampazzo R; Fundação Oswaldo Cruz Rondônia FIOCRUZ/RO, Rua da Beira, 7176, Porto Velho, 76812-245, Brazil.
  • Dos Santos Pereira S; Programa de Pós-Graduação em Biologia Experimental, Universidade Federal de Rondônia e Fundação Oswaldo Cruz Rondônia - UNIR/FIOCRUZ/RO, 76801-974, Porto Velho, Brazil.
  • Dantas TO; Fundação Oswaldo Cruz Rondônia FIOCRUZ/RO, Rua da Beira, 7176, Porto Velho, 76812-245, Brazil.
  • Mazaro J; Programa de Pós-Graduação em Biologia Experimental, Universidade Federal de Rondônia e Fundação Oswaldo Cruz Rondônia - UNIR/FIOCRUZ/RO, 76801-974, Porto Velho, Brazil.
  • Villar LM; Programa de Pós-Graduação em Medicina Tropical, Instituto Oswaldo Cruz/IOC, FIOCRUZ, 21041-250, Rio de Janeiro, Brazil.
  • Salcedo JMV; Centro de Pesquisa em Medicina Tropical - CEPEM, Porto Velho, 76812-329, Brazil.
  • da Matta DA; Centro de Pesquisa em Medicina Tropical - CEPEM, Porto Velho, 76812-329, Brazil.
  • Vieira D; Instituto de Biologia Molecular do Paraná - IBMP, 81350-010, Curitiba, Brazil.
Sci Rep ; 13(1): 12073, 2023 07 26.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-37495613
Hepatitis Delta is a disease caused by exposure to hepatitis B (HBV) and hepatitis D (HDV) viruses, usually with a more severe clinical outcome when compared to an HBV monoinfection. To date, the real prevalence of HDV infection is underestimated and detection methods are poorly available, especially in more endemic regions. Therefore, a one-step RT-qPCR method for quantification of HDV-RNA was developed. Biological samples were selected between 2017 and 2023 from patients at the Ambulatório Especializado em Hepatites Virais of the Centro de Pesquisa em Medicina Tropical de Rondônia and Serviço de Assistência Especializada and underwent the test developed by this study and a second quantitative RT-qPCR assay. The slope of the initial quantitative assay was - 3.321 with an efficiency of 100.04% and amplification factor equal to 2. Analysis of the repeatability data revealed a Limit of Quantification of 5 copies/reaction and Limit of Detection (95%) of 2.83 copies per reaction. In the diagnostic sensitivity tests, there was an accuracy of 97.37% when compared to the reference test. This assay proved to be highly efficient and reproducible, making it a valuable tool to monitor hepatitis Delta patients and assess the risk of disease progression, as well as the effectiveness of treatment.
Assuntos

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Hepatite D / Hepatite A / Hepatite B Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Risk_factors_studies Limite: Humans Idioma: En Ano de publicação: 2023 Tipo de documento: Article

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Hepatite D / Hepatite A / Hepatite B Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Risk_factors_studies Limite: Humans Idioma: En Ano de publicação: 2023 Tipo de documento: Article