Software and Databases for Protein-Protein Docking.

Jaronczyk, Malgorzata; Abagyan, Ruben; Totrov, Maxim

Jaronczyk, Malgorzata; Abagyan, Ruben; Totrov, Maxim.

Afiliação

Jaronczyk M; National Medicines Institute, Warsaw, Poland.
Abagyan R; Skaggs School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences, University of California San Diego, La Jolla, CA, USA.
Totrov M; Molsoft, LLC, La Jolla, CA, USA.

Methods Mol Biol ; 2780: 129-138, 2024.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-38987467

ABSTRACT

ABSTRACT

Protein-protein interactions (PPIs) provide valuable insights for understanding the principles of biological systems and for elucidating causes of incurable diseases. One of the techniques used for computational prediction of PPIs is protein-protein docking calculations, and a variety of software has been developed. This chapter is a summary of software and databases used for protein-protein docking.

Assuntos

Bases de Dados de Proteínas; Simulação de Acoplamento Molecular; Mapeamento de Interação de Proteínas; Proteínas; Software; Mapeamento de Interação de Proteínas/métodos; Proteínas/química; Proteínas/metabolismo; Biologia Computacional/métodos; Ligação Proteica; Humanos

Palavras-chave

Fast Fourier transform; Monte Carlo; PPI; Protein bioinformatics; Protein databases; Proteinprotein docking; Proteinprotein interactions; Proteinprotein interface

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Software / Proteínas / Mapeamento de Interação de Proteínas / Bases de Dados de Proteínas / Simulação de Acoplamento Molecular Limite: Humans Idioma: En Ano de publicação: 2024 Tipo de documento: Article

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