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1.
Ciênc. rural (Online) ; 53(2): 1-8, 2023. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1410779

Resumo

Canonical correlation analysis based on genotypic correlations allows determining the associations between groups of traits and carrying out the direct or indirect selection of superior genotypes. This study investigated the existence of linear and multivariate relationships between high and low heritability traits via canonical correlation analysis based on genotypic correlations. The experiment was conducted at the Professor Diogo Alves de Melo Experimental Field at the Universidade Federal de Viçosa, in Viçosa, MG. 90 wheat cultivars were evaluated under a 9 × 10 alpha-lattice design, with three replications and plots consisting of four rows of three meters spaced at 0.20 meters. Canonical groups were established between spike height and plant height, days for heading, number of spikelets per spike, and number of grains per spike (Group I) and, spike weight, spike grain mass, 100-grain mass, hectoliter weight, and grain yield (Group II). There was dependence between the established groups, which allowed the investigation of the relationships between traits based on their genotypic values. The traits cycle and plant height can be used for indirect selection of genotypes superior in hectoliter weight and grain yield, which are important factors for industries and farmers.


As análises de correlações canônicas baseadas nas correlações genotípicas, permitem determinar associações entre grupos de caracteres e realizar a seleção direta ou indireta de genótipos superiores. Objetivou-se com este trabalho investigar a existência de relações lineares e multivariadas entre caracteres de alta e baixa herdabilidade via análise de correlações canônicas com base nas correlações genotípicas. O experimento foi conduzido no Campo Experimental Professor Diogo Alves de Melo da Universidade Federal de Viçosa, em Viçosa, Minas Gerais. 90 cultivares de trigo foram avaliadas sob o delineamento alpha-lattice 9 × 10, com três repetições e parcelas constituídas por quatro linhas de três metros espaçadas a 0.20 metros. Os grupos canônicos foram estabelecidos entre altura de espiga e planta, dias para o espigamento, número de espiguetas por espiga e número de grãos por espiga (Grupo I) e, peso de espiga, massa de grãos da espiga, massa de 100 grãos, peso hectolitro e produtividade de grãos (Grupo II). Houve dependência entre os grupos estabelecidos, o que permitiu a investigação das relações entre os caracteres com base em seus valores genotípicos. Os caracteres ciclo e altura de plantas podem ser utilizados para a seleção indireta de genótipos superiores em peso hectolitro e produtividade, fatores estes importantes para indústrias e produtores.


Assuntos
Triticum , Análise de Correlação Canônica , Genótipo
2.
Braz. j. biol ; 83: e274152, 2023. tab, graf, ilus
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1447648

Resumo

Selenicereus megalanthus Haw. It is an exotic fruit tree, with productive and nutritional potential. In Colombia, there is a great phenotypic and genotypic diversity, but its genetic studies are scarce. The objective was to characterize morphologically 15 selected yellow pitahaya genotypes, under two productive systems in the open field and under cover, in the municipalities of Miraflores and Zetaquira, in Boyacá, Colombia. Quantitative characters were evaluated: plant height (PH), number of vegetative sprouts (NVS), sub-sprouts (SS), longest sprouts length (LSL), distance between areoles (DBA), width of the ribs in the apical region (WRA), width of the ribs in the middle region (WRM), width of the ribs in the basal region (WRB), height of undulations between successive areoles in a rib (HUA), number of spines per areole (NSA) and longest spine length (LSP). The results showed under the two productive systems and the evaluated localities that the variables with the highest coefficient of variation (greater than 90%) were the number of sub-sprouts, height of the undulations between successive areoles (HUA) and the longest spine length (LSP). High positive correlations were obtained between the distances areoles, the width of the ribs and the length of the spines (r>0.7). The conglomerate showed that the characteristics that define the groupings are height of the plant, the texture of the cladodes, the width of the ribs and the height of the undulations. Characters associated with the shoots and cladodes were identified, which directly influence the vegetative propagation and therefore the yield of the yellow pitahaya.


Selenicereus megalanthus Haw é uma fruteira exótica, com potencial produtivo e nutricional. Na Colômbia existe uma grande diversidade fenotípica e genotípica, mas seus estudos genéticos são escassos. O objetivo deste trabalho foi caracterizar morfologicamente 15 genótipos selecionados de pitaya amarela, a partir de dois sistemas produtivos em campo aberto e sob cobertura, nos municípios de Miraflores e Zetaquira, em Boyacá, Colômbia. Foram avaliados os caracteres quantitativos: altura da planta (PH), número de brotos vegetativos (NVS), sub-brotos (SS), maior comprimento dos brotos (LSL), distância entre aréolas (DBA), largura das nervuras na região apical (WRA), largura das costelas na região média (WRM), largura das costelas na região basal (WRB), altura das ondulações entre aréolas sucessivas em uma costela (HUA), número de espinhos por aréola (NSA) e maior espinha comprimento (LSL). Os resultados mostraram nos dois sistemas produtivos e nas localidades avaliadas que as variáveis com maior coeficiente de variação (maior que 90%) foram o número de sub-brotos, altura das ondulações entre aréolas sucessivas (HUA) e o maior comprimento do espinho (LSL). Altas correlações positivas foram obtidas entre as distâncias entre as aréolas, a largura das costelas e o comprimento dos espinhos (r > 0.07). O conglomerado mostrou que as características que definem os agrupamentos são a altura da planta, a textura dos cladódios, a largura das nervuras e a altura das ondulações. Foram identificados caracteres associados à brotação e aos cladódios, que influenciam diretamente na propagação vegetativa e, consequentemente, na produção da pitaya-amarela.


Assuntos
Cactaceae/genética , Frutas/genética , Genótipo , Colômbia
3.
Braz. j. biol ; 83: e267641, 2023. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1439642

Resumo

Hepatitis C virus (HCV) genotypes vary greatly in different regions. The aim of this study is to investigate the distribution of HCV genotypes in HCV infected patients, in Ningxia Hui Autonomous Region. Nucleic acid extraction and amplification were performed with test kits on 153 HCV infected patients serum samples. The HCV viral load was measured using reverse transcriptase PCR (RT-PCR) and HCV genotypes were determined. Among the 153 HCV-infected patients, 56 had genotype (GT)1b (36.60%), 45 had GT2a (29.40%), 23 had GT3a (15.00%), 14 had GT3b (9.20%),13 had GT6a (8.50%), 1 had GT1g (0.70%), 1 had GT6xa (0.70%). In GT1b, 21.40% were female and 78.60% were male; in GT2a, 42.20% were female and 57.80% were male;Males were most prevalent in genotypes 1b(39.30%), while female were most prevalent in genotype 2a(46.30%). Rare GT1g and GT6xa were also detected in males. The 41-50 year age group had the highest HCV prevalence of 32.00%. HCV GT1b is the predominant HCV genotype in Ningxia Hui Autonomous Region.


Os genótipos do vírus da hepatite C (HCV) variam muito de acordo com a região. O objetivo deste estudo é investigar a distribuição do genótipo do vírus da hepatite C em pessoas infectadas pelo vírus na região autônoma de Ningxia Hui. A extração de ácido nucleico e a expansão de amostras séricas em 153 pacientes infectados com HCV foram realizadas utilizando kits de ensaio. A capacidade do vírus HCV foi medida pela reação em cadeia da polimerase retrotranscrição (RT-PCR) e o genótipo HCV foi determinado. Os genótipos (Gt) tiveram a seguinte distribuição entre os 153 casos de infecção HCV: 56 Gt 1-B (36, 60%), 45 Gt 2-A (29, 40%), 23 Gt 3-A (15, 00%), 14 Gt 3-B (9, 20%), 13 Gt 6-A (8, 50%), 1 Gt 1-G (0, 70%) e 1 Gt 6-Xa (0, 70%). Já o sexo dos indivíduos teve a seguinte distribuição: Gt 1-B, 21, 40% mulheres e 78, 60% homens; Gt 2-A, 42, 20% mulheres e 57, 80% homens. A presença de homens é mais comum no genótipo 1-B (39, 30%), enquanto as mulheres ocorrem mais comumente no genótipo 2-A (46, 30%). Gt 1-G e Gt 6-Xa raros também foram detectados em homens. A taxa de infecção com HCV para grupos etários de 41 a 50 anos é a mais alta, com 32,00%. HCV Gt 1-B é o genótipo dominante do HCV na região autônoma de Ningxia Hui.


Assuntos
Variação Genética , Hepacivirus/genética , Genótipo
4.
Ciênc. rural (Online) ; 53(9): e20220262, 2023. tab, ilus, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1418330

Resumo

This research determined the adaptability and stability of soybean yield for organic systems in different environments. Grain yield data (GY, kg ha-1) from experiments with six soybean genotypes evaluated in six environments in Brazil and one environment in Paraguay were used. The experimental design used was randomized blocks, organized in an incomplete factorial scheme, with six environments in Brazil (Toledo- PR, Palotina- PR, Mangueirinha- PR, Três Passos- RS, Passo Fundo- RS, Major Vieira- SC) and one in Paraguay (Bela Vista do Norte- PY) with six soybean genotypes (BRS 284, BRS 391, BRS 511, BRS 523, BRS 525, BRS 535) arranged in four replications per environment. BRS 511 genotype was characterized by high average grain yield and stability by the AMMI method. BRS 284 genotype was identified as the ideal genotype in the GGE biplot method. WAASBY and BLUP index selected BRS511 and BRS284 genotypes.


O objetivo deste trabalho foi determinar a adaptabilidade e estabilidade da produtividade da soja para sistemas orgânicos em diferentes ambientes. Foram utilizados dados de produtividade de grãos (GY, kg ha-1) de experimentos com seis genótipos de soja avaliados em seis ambientes no Brasil e um ambiente no Paraguai. O delineamento experimental utilizado foi blocos casualizados, organizados em esquema fatorial incompleto, com seis ambientes no Brasil (Toledo - PR, Palotina - PR, Mangueirinha - ​​PR, Três Passos - RS, Passo Fundo - RS, Major Vieira - SC) e um no Paraguai (Bela Vista do Norte - PY) com seis genótipos de soja (BRS 284, BRS 391, BRS 511, BRS 523, BRS 525, BRS 535) dispostos em quatro repetições por ambiente. O genótipo BRS 511 foi caracterizado por alta produtividade média de grãos e estabilidade pelo método AMMI. O genótipo BRS 284 foi identificado como o genótipo ideal pelo método GGE biplot. Os índices WAASBY e BLUP selecionaram os genótipos BRS511 e BRS284.


Assuntos
Glycine max/crescimento & desenvolvimento , 24444 , Genótipo
5.
Braz. j. biol ; 83: e247181, 2023. graf
Artigo em Inglês | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1339388

Resumo

Abstract The protozoans include many intracellular human pathogens. Accurate detection of these pathogens is necessary to treat the diseases. In clinical epidemiology, molecular identification of protozoan is considered a more reliable and rapid method for identification than microscopy. Among these protozoans, Cryptosporidium considered being one of the important water-borne zoonotic pathogens and a major cause of a diarrheal disease named cryptosporidiosis in humans, domestic animals, and wild animals. This study was aimed to identify Cryptosporidium in zoo felids (N= 56) belonging to different zoo of China, but accidentlly Colpodella was encountered in the zoo felids sample and phylogenetic data confirmed this unexpected amplification from fecal samples using two-step nested-PCR. Phylogenetic analysis revealed the fact about the specific primers used previously by many researchers and cross-genera amplification. We came to know that genetically sequenced amplicon gives more accurate identification of species. This study suggests more investigation on Colpodella which has been neglected previously but gains the attention of researchers after identified from humans and animals and has been known to correlate with neurological symptoms in patients.


Resumo Os protozoários incluem muitos patógenos humanos intracelulares. A detecção acurada desses patógenos é necessária para tratar as doenças. Na epidemiologia clínica, a identificação molecular de protozoários é considerada o método de identificação mais confiável e rápido do que a microscopia. Entre esses protozoários, o Cryptosporidium é considerado um dos importantes patógenos zoonóticos transmitidos pela água e uma das principais causas de uma doença diarreica denominada criptosporidiose em humanos, animais domésticos e selvagens. Este estudo teve como objetivo identificar Cryptosporidium em zoofelídeos (N = 56) pertencentes a diferentes zoológicos da China, mas acidentalmente Colpodella foi encontrada na amostra de zoofelídeos e os dados filogenéticos confirmaram essa amplificação inesperada de amostras fecais usando nested-PCR em duas etapas. A análise filogenética revelou o fato sobre os primers específicos usados ​​anteriormente por muitos pesquisadores e a amplificação entre gêneros. Ficamos sabendo que o amplicon sequenciado geneticamente fornece uma identificação mais acurada das espécies. Este estudo sugere mais investigação sobre Colpodella, que foi negligenciada anteriormente, mas ganha a atenção dos pesquisadores depois de identificada em humanos e animais e é conhecida por se correlacionar com sintomas neurológicos em pacientes.


Assuntos
Humanos , Animais , Criptosporidiose/epidemiologia , Cryptosporidium/genética , Filogenia , China , Fezes , Genótipo
6.
Braz. j. biol ; 83: e252594, 2023. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1339400

Resumo

Abstract The present trial explained the effect of alternative production systems on growth, morphometric and carcass traits of four different chicken genotypes. The second generation of two genotypes RNN (Rhode Island Red × Naked Neck) and BNN (Black Australorp × Naked Neck) obtained by two self-crosses (RNN × RNN = RR and BNN × BNN = BB) and two reciprocal crosses (RNN × BNN = RB and BNN × RNN = BR) were evaluated in three alternative production systems (conventional cages, enriched cages, and aviary). At the 6th week of age after sexing, a total of 600 birds, comprising 150 from each crossbred with a total of 300 pullets and 300 cockerels were divided into conventional cages, enriched cages, and aviary systems having 200 birds in each.Birds were organized into 3×4 factorial arrangements under Completely Randomized Design (3 production systems × 4 genotypes × 2 sexes × 25 birds = 600 birds). Regarding genotypes, RB and BR males showed higher (p < 0.01) carcass yield, drumstick weight, breast weight, and thigh weight than BB and RR genotypes. Females of BR genotype showed higher (p < 0.01) breast weight, thigh weight and drumstick weight. As far as production systems are concerned, higher (p < 0.01) liver weight, heart weight, breast weight, intestinal weight, drumstick weight, and thigh weight were observed in the males reared in enriched cages compared with conventional cages and aviary system. Females reared in enriched cages showed higher (p < 0.01) heart weight, breast weight, intestinal weight, drumstick weight, and thigh weight when compared with those reared in conventional cages and aviary. It is concluded that chickens (both sexes) of BR and RB genotypes had better morphological measurements and carcass traits than those of RR and BB genotype chickens. Among alternative production systems, chickens reared in enriched cages had better traits than those of reared in conventional cages and aviary during the growing phase.


Resumo O presente estudo explicou o efeito de sistemas alternativos de produção sobre o crescimento, características morfométricas e carcaças de quatro genótipos de frango diferentes. A segunda geração de dois genótipos RNN (Rhode Island Red × Naked Neck) e BNN (Black Australorp × Naked Neck) obtida por duas autocruzes (RNN × RNN = RR e B ANN × BNN = BB) e duas cruzes recíprocas (RNN × BNN = RB e BNN × RNN = BR) foi avaliada em três sistemas de produção alternativos (gaiolas convencionais, gaiolas enriquecidas e aviário). Na 6ª semana de idade após o sexo, um total de 600 aves, compostas por 150 de cada raça cruzada com um total de 300 pullets e 300 galos, foi dividido em gaiolas convencionais, gaiolas enriquecidas e sistemas aviários com 200 aves em cada. As aves foram organizadas em 3×4 arranjos fatoriais sob projeto completamente randomizado (3 sistemas de produção × 4 genótipos × 2 sexos × 25 aves = 600 aves). Em relação aos genótipos, os machos RB e BR apresentaram maior rendimento de carcaça (p < 0,01), peso da baqueta, peso mamário e peso da coxa do que os genótipos BB e RR. As fêmeas do genótipo BR apresentaram maior (p < 0,01) peso mamário, peso da coxa e peso da baqueta. No que diz respeito aos sistemas de produção, maior (p < 0,01) peso hepático, peso cardíaco, peso mamário, peso intestinal, peso da baqueta e peso da coxa foram observados nos machos criados em gaiolas enriquecidas em comparação com gaiolas convencionais e sistema aviário. As fêmeas criadas em gaiolas enriquecidas apresentaram maior (p < 0,01) peso cardíaco, peso mamário, peso intestinal, peso da baqueta e peso da coxa quando comparadas com as criadas em gaiolas convencionais e aviárias. Conclui-se que as galinhas (ambos os sexos) dos genótipos BR e RB apresentaram melhores medidas morfológicas e traços de carcaça do que os de frangos genótipos RR e BB. Entre os sistemas de produção alternativos, as galinhas criadas em gaiolas enriquecidas tinham características melhores do que as criadas em gaiolas convencionais e aviárias durante a fase de cultivo.


Assuntos
Animais , Masculino , Feminino , Galinhas/genética , Hibridização Genética , Rhode Island , Genótipo
7.
Ciênc. rural (Online) ; 53(6): 1-8, 2023. tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1413089

Resumo

Genotype x environment interactions represent a major challenge in identifying and selecting genotypes responsive to different climate and soil conditions. This research evaluated and selected pre-cultivars of carioca bean and early carioca bean based on adaptability, stability, and grain yield. In the 2014 crop season, two regional competition trials were conducted in the state of Pernambuco: carioca beans (14 genotypes in Arcoverde, Belém de São Francisco, Caruaru and São João) and early carioca beans (11 genotypes in Araripina, Arcoverde, and Caruaru) and, in the 2015 crop season, with early carioca beans (11 genotypes in Araripina, Arcoverde, and Brejão). Parameters were estimated by mixed models, and the selection was performed using the Harmonic Mean of Relative Performance of Genetic Values (HMRPGV) method following three strategies: i) selection based on predicted genetic value with no interaction; ii) selection according to predicted genetic value considering each location; and iii) simultaneous selection for grain yield, adaptability, and stability. The environments influenced the phenotypic expression of the carioca and early carioca bean genotypes, representing a specific adaptation. The genotypes BRS Notável, BRS Estilo and BRS Pérola, of carioca beans, and CNFC 15875, BRS Notável and CNFC 15630, of early carioca beans, had the best results in the environments tested, regarding, simultaneously, adaptability to different soil and climate conditions, performance stability, and grain yield.


A interação genótipo x ambiente representa um grande desafio na identificação e seleção de genótipos responsivos às diversas condições de clima e solo. O objetivo deste trabalho foi avaliar e selecionar pré-cultivares de feijão carioca e feijão carioca precoce com base na adaptabilidade, estabilidade e produtividade de grãos. Na safra 2014 foram conduzidos dois ensaios regionais de competição no estado de Pernambuco: feijão carioca (14 genótipos em Arcoverde, Belém de São Francisco, Caruaru e São João) e feijão carioca precoce (11 genótipos em Araripina, Arcoverde e Caruaru) e na safra de 2015 com feijão carioca precoce (11 genótipos, em Araripina, Arcoverde e Brejão). Os parâmetros foram estimados por meio de modelos mistos e a seleção foi realizada pelo método da Média Harmônica do Desempenho Relativo dos Valores Genéticos (MHPRVG), adotando-se três estratégias: i) seleção com base no valor genético predito, sem interação; ii) seleção com base no valor genético predito, considerando cada local; iii) seleção simultânea quanto à produtividade de grãos, adaptabilidade e estabilidade. Observou-se que os ambientes influenciaram na expressão fenotípica dos genótipos de feijão carioca e carioca precoce, configurando adaptação específica. Os genótipos BRS Notável, BRS Estilo e BRS Pérola, de feijão carioca, e CNFC 15875, BRS Notável e CNFC 15630, de feijão carioca precoce, apresentaram os melhores desempenhos nos ambientes testados, considerando-se, simultaneamente, a adaptabilidade a diferentes condições edafoclimáticas, estabilidade de desempenho e produtividade de grãos


Assuntos
Seleção Genética , Phaseolus/genética , Perfil Genético , Genótipo
8.
Braz. j. biol ; 83: e244977, 2023. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1285621

Resumo

Abstract Hepatitis C virus (HCV) is the serious global public health burden of liver disease. Approximately 170 million people in the world are infected with (HCV). In Pakistan, where the disease has high occurrence rate. The present study envisages an up-to-date prevalence of HCV and genotypic distribution in the general population of Mardan District, Khyber Pakhtunkhwa (KP), Pakistan. The blood samples from 6,538 individuals including 3,263 males and 3,275 females were analyzed for hepatitis C surface antigen by Immuno-chromatographic test (ICT), Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), and reverse transcription-polymerase chain reaction (PCR). It was found that 396 (12.13%) out of 3263 individuals contained antibodies in their blood against HCV, while among the different age groups, the highest incidences of HCV antibodies were found in the 31-40 age group (11.01%). The ICT positive samples were further screened by nested PCR to determine the existence of active HCV-RNA. It was identified that 7.11% (3263) of the total population (6538) tested was positive, among which the 461 (14.07%) females possessed antibodies in their blood against HCV. Our data showed total HCV infection in the investigated population was 5.78%. Higher percentage of HCV prevalence was detected in males than females in the age group 31-40 and 41-50. To compare the prevalence of HCV genotypes age-wise in male and female genotype 3a was found most prevalent genotype followed by 1a, 2a and 3b, respectively.


Resumo O vírus da hepatite C (HCV) é o grave problema de saúde pública das doenças hepáticas. Aproximadamente 170 milhões de pessoas no mundo estão infectadas com HCV; no Paquistão, a doença tem alto índice de ocorrência. O presente estudo prevê uma prevalência atualizada do HCV e distribuição genotípica na população geral do distrito de Mardan, Khyber Pakhtunkhwa (KP), Paquistão. As amostras de sangue de 6.538 indivíduos, incluindo 3.263 homens e 3.275 mulheres, foram analisadas para o antígeno de superfície da hepatite C por teste imunocromatográfico (ICT), ensaio imunoenzimático (ELISA) e reação em cadeia da polimerase de transcrição reversa (PCR). Verificou-se que 396 (12,13%) de 3.263 indivíduos continham anticorpos no sangue contra o HCV, enquanto entre as diferentes faixas etárias as maiores incidências de anticorpos anti-HCV foram encontradas na faixa etária de 31 a 40 anos (11,01%). As amostras positivas para ICT foram posteriormente rastreadas por nested PCR para determinar a existência de HCV-RNA ativo. Identificou-se que 7,11% (3.263) do total da população (6.538) testada foram positivos, dentre os quais 461 (14,07%) mulheres possuíam anticorpos no sangue contra o HCV. Nossos dados mostraram que a infecção total pelo HCV na população investigada foi de 5,78%. Maior porcentagem de prevalência de HCV foi detectada em homens do que em mulheres nas faixas etárias de 31-40 e 41-50. Para comparar a prevalência de genótipos de HCV com relação à idade no genótipo masculino e feminino 3a foi encontrado o genótipo mais prevalente seguido por 1a, 2a e 3b, respectivamente.


Assuntos
Humanos , Masculino , Feminino , Hepatite C/epidemiologia , Hepacivirus/genética , Paquistão/epidemiologia , Prevalência , Genótipo
9.
Acta sci. vet. (Impr.) ; 51: Pub. 1916, 2023. ilus, tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1443923

Resumo

Background: Cryptosporidium spp. is a zoonotic protozoan parasite that affects the gastrointestinal tract of humans and animals. The disease can cause acute and chronic diarrhoea and even death in both humans and animals. In this study, it was aimed to determine the prevalence and genotype distribution of Cryptosporidiosis in shelter dogs in Diyarbakir province located in the Southeastern Anatolia Region of Turkey. Materials, Methods & Results: The animal material of the study consisted of 100 dogs of different breeds and sexes. Faecal samples were collected from the rectum with disposable latex gloves and placed in individual sample containers. All of the samples were examined for Cryptosporidium spp. by Kinyoun Acid Fast and Nested PCR methods. In the Kinyoun Acid Fast staining method, firstly, smear preparations were prepared from fresh faecal samples, fixed in pure methanol for 1 min and allowed to dry. The slides were kept in Kinyoun Carbol-Fuxin for 5 min, dipped in 50% ethyl alcohol, shaken, washed in tap water, kept in 1% sulphuric acid for 2 min and washed in tap water. The slides were kept in methylene blue for 1 min, washed in tap water and allowed to dry. After drying, immersion oil was dripped and examined under a microscope at 100 magnification. DNA extraction was performed from all samples using GeneMATRIX Stool DNA Purification Kit according to the manufacturer's protocol. After Nested PCR analysis was performed. In the PCR step, primers 5'-TTCTAGAGCTAATACATGCG-3' and 5'- CCCATTTCCTTCCTTCGAAACAGGA-3' were used to amplify the 1325 bp gene region. In the nested PCR step, primers 5'- GGAAGGGTTGTATTTATTTATTAGATAAAG-3' and 5'-AAGGAGTAAGGAACAACCTCCA-3' were used to amplify the 826-864 bp gene region. As a result of both methods, a prevalence of 3% was determined. The infection rate was higher in males (3.57%) than females (2.27%) and in younger than 1 year (5.56%) than in older than 1 year (1.56%). The DNA sequences obtained from the sequence analysis of 3 positive PCR samples were analysed in BioEdit software. A phylogenetic tree was constructed with the data set created by using the 18s rRNA gene sequences obtained from the NCBI genbank database and the DNA sequences obtained as a result of the study, and it was shown which Cryptosporidium species the study samples were related to. Today, many Cryptosporidium species have been identified and most of these species have host adaptation. Although C. canis is the most common species in dogs, C. muris, C. meleagridis, and C. parvum have also been detected. Among these species, C. parvum is recognized as a zoonotic species infecting a wide range of mammals. In this study, DNA sequencing of nested PCR positive samples revealed that 3 samples were zoonotic C. parvum. Discussion: This suggests that dogs may be a reservoir for zoonotic transmission of Cryptosporidium. Consequently, it is recommended that people should be informed about the potential for transmission of this protozoan to humans and animals and that control programmes should be implemented, including the prevention of free entry of stray dogs into public places and homes.


Assuntos
Animais , Cães , Cryptosporidium parvum/isolamento & purificação , Criptosporidiose/epidemiologia , Genótipo , Turquia/epidemiologia , Reação em Cadeia da Polimerase/veterinária
10.
Acta sci., Anim. sci ; 44: e54986, 2022. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1370438

Resumo

This study investigated whether genotype influences the establishment of Pennisetum purpureum Schumach. The experimental design was a randomized complete blocks with four treatments and eight replications (n=8). The treatments were four genotypes of P. purpureum, two classified as tall sizes: P. purpureum cv. Elephant B and cv. IRI 381; and two as dwarf types: P. purpureum cv. Mott and Taiwan A-146 2.37. They were planted in a tropical wet and dry region of Brazil. Tall genotypes showed superior field sprouting rates (p < 0.05), ranging between 95-99%, while dwarfs varied between 88-90%, however, Elephant B and IRI 381 produced a much lower average number of tillers (31 and 32 linear m-1, respectively), than Taiwan A-146 2.37 and Mott (56 and 41 linear m-1, respectively) (p < 0.05). Dwarf genotypes produced lower biomass yields (p < 0.05), but this was genotype-dependent and did not impact on their establishment. The levels of non-structural carbohydrates (NSC) (>10%) in the planted stems were associated with satisfactory field sprouting of the elephantgrass genotypes. Despite some variations between the genotypes in terms of sprouting, tillering, and growth rates, the kind of genotype had no major significance on the establishment of the elephantgrass.(AU)


Assuntos
Pastagens/análise , Biomassa , Pennisetum/genética , Genótipo
11.
Arq. Inst. Biol. (Online) ; 89: e00212021, 2022. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX, LILACS | ID: biblio-1393890

Resumo

Lettuce bacterial leaf spot caused by Xanthomonas campestris pv. vitians is an aggressive disease that is difficult to control. So far there are no reports of the reaction of biofortified lettuce genotypes to different isolates of the bacteria. Thus, the objective was to evaluate the aggressiveness of X. campestris pv. vitians, as well as the reaction of biofortified lettuce genotypes to bacterial spot. Two experiments were performed in two distinct seasons (winter and summer), in greenhouse at the Vegetable Experimental Station of the Federal University of Uberlândia (UFU). The experimental design in both experiments was a randomized block design, in a factor scheme of 5 × 4 (five genotypes and four strains), with four repetitions. Were evaluated the severity and the area under the disease progress curve. In general, the biofortified lettuce 'Uberlândia 10000' was more resistant to most bacterial strains in the summer cultivation, and in the winter period UFU 'Crespa 206'. The commercial cultivar Robusta was the most susceptible to the strains during both seasons. The UFU E125 strain was the most aggressive for most genotypes in both seasons.


Assuntos
Xanthomonas campestris/genética , Lactuca/genética , Genótipo , Verduras
12.
Braz. j. biol ; 82: e242596, 2022. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1278487

Resumo

Hops is a new culture in Brazil. Tissue culture can be an important technique for rapid hop propagation. This paper aims to characterize responses from different genotypes under different growth regulators through the interrelationship of response variables important to hop in vitro growth. Three genotypes were cultivated in six culture media with different combinations of growth regulators, BAP (6-benzylaminopurine), IAA (3-indolacetic acid) and GA3 (gibberellic acid). The means were compared by orthogonal contrasts and the interrelationship of the response variables was performed by path analysis. American genotypes showed favorable root development under the BAP + IAA combination, while the use of IAA improved shoot development. The origin of genotypes was important for defining the best protocol for in vitro cultivation. The path coefficient showed that the variable number of shoots has stronger direct effect on the number of nodal segments. Additionally, in tissue culture assays, the use of a covariable and proper error distribution significantly increased experimental accuracy.


O lúpulo é uma nova cultura no Brasil. A cultura de tecidos pode ser uma técnica importante para a propagação rápida do lúpulo. Este artigo tem como objetivo caracterizar respostas de diferentes genótipos sob diferentes reguladores de crescimento através da inter-relação de variáveis de resposta importantes para o crescimento in vitro. Três genótipos foram cultivados em seis meios de cultura com diferentes combinações de reguladores de crescimento, BAP (6-benzilaminopurina), AIA (ácido 3-indolacético) e GA3 (ácido giberélico). As médias foram comparadas por contrastes ortogonais e a inter-relação das variáveis de resposta foi realizada por análise de trilha. Os genótipos americanos apresentaram desenvolvimento radicular favorável sob a combinação BAP + AIA, enquanto o uso do AIA melhorou o desenvolvimento da parte aérea. A origem dos genótipos foi importante para definir o melhor protocolo para o cultivo in vitro. O coeficiente de trilha mostrou que a variável número de brotos tem um efeito direto mais forte no número de segmentos nodais. Adicionalmente, em experimentos com cultura de tecidos, o uso de uma covariável e distribuição de erro adequada aumentou significativamente a precisão experimental.


Assuntos
Reguladores de Crescimento de Plantas , Brasil , Brotos de Planta/genética , Meios de Cultura , Genótipo
13.
Ciênc. rural (Online) ; 52(10): e20210403, 2022. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1364724

Resumo

The plants physiological processes such as transpiration and photosynthetic efficiency are directly related to leaf area, which is difficult to quantify in a nondestructive manner. To generate a model to estimate the total leaf area of plants of banana cv. Vitória, simple and multiple linear regressions utilizing the length and width of the third leaf, the product of length and width of the third leaf, and the total number of leaves of 'Vitória' plants, were tested. The data to develop the model were obtained from 'Vitória' banana plants from different edafoclimatic conditions and management. The best performance of the model was obtained using stepwise multiple regression with r2=0.93 and r2= 0.94. Validation of the model resulted in an r2 of 0.74.


Processos fisiológicos das plantas como transpiração e eficiência fotossintética estão diretamente relacionados à área foliar, a qual é difícil quantificar de forma não destrutiva. Para gerar um modelo para estimar a área foliar total de plantas da cv. Vitória, foram testadas regressões lineares simples e múltiplas utilizando comprimento e largura da terceira folha, o produto comprimento e largura da terceira folha e número total de folhas. Os dados para desenvolver o modelo foram obtidos de cultivos com diferentes condições edafoclimáticas e de manejo. O melhor modelo foi obtido por meio de regressão múltipla stepwise com r2 = 0,93 e r2 = 0,94. A validação do modelo resultou em r2 de 0,74.


Assuntos
Folhas de Planta/anatomia & histologia , Musa/anatomia & histologia , Genótipo , Análise de Regressão
14.
Semina ciênc. agrar ; 43(4): 1517-1540, jul.-ago. 2022. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1369727

Resumo

This study aimed to select and classify sunflower genotypes tolerant to lead (Pb) stress and evaluate their capacity of phytoextraction based on physiological, nutritional, and biochemical responses. Two experiments were carried out under lead stress. In the first experiment, out of 21 genotypes studied three showed higher relative biomass yield and were characterized as Pb-tolerant and five showed lower relative biomass production and were considered Pb-sensitive. In the second experiment, one Pb-tolerant (BRS-G27) and two Pb-sensitive (H251 and AG963) genotypes were studied. In this experiment, Pb stress reduced the growth and contents photosynthetic pigments in all genotypes, but more pronouncedly in sensitive genotypes. There were no substantial changes in micronutrient levels in the leaves and stem, but the levels of Cu and Mn in the stressed roots of sensitive genotypes were much lower than in BRS-G27. The contents of organic solutes in the roots suggest that sensitive genotypes have higher energy costs for osmoregulation by carbohydrates and amino acids synthesis. However, the accumulation of proline may be related to a greater Pb tolerance. Considering the results of dry mass yield, transfer coefficient, translocation factor, and tolerance index, the BRS-G27 genotype can be recommended for use in phytoremediation of Pb-contaminated soils.(AU)


Este estudo teve como objetivo selecionar e classificar genótipos de girassol tolerantes ao estresse por chumbo (Pb) e avaliar sua capacidade de fitoextração com base nas respostas fisiológicas, nutricionais e bioquímicas. Dois experimentos foram realizados sob estresse de Pb. No primeiro experimento, dos 21 genótipos estudados, três apresentaram maior produção relativa de biomassa e foram caracterizados como tolerantes ao Pb e cinco apresentaram menor produção relativa de biomassa e foram considerados sensíveis ao Pb. No segundo experimento foram estudados um genótipo tolerante ao Pb (BRS-G27) e dois sensíveis ao Pb (H251 e AG963). Neste experimento, o estresse por Pb reduziu o crescimento e os teores de pigmentos fotossintéticos em todos os genótipos, porém, mais pronunciado em genótipos sensíveis. Não houve mudanças substanciais nos níveis de micronutrientes nas folhas e no caule, mas os níveis de Cu e Mn nas raízes estressadas de genótipos sensíveis foram muito mais baixos do que o BRS-G27. Os conteúdos de solutos orgânicos nas raízes sugerem que genótipos sensíveis apresentam maiores custos energéticos para osmorregulação por carboidratos e síntese de aminoácidos. No entanto, o acúmulo de prolina pode estar relacionado a uma maior tolerância ao Pb. Considerando os resultados de produção de massa seca, coeficiente de transferência, fator de translocação e índice de tolerância, o genótipo BRS-G27 pode ser recomendado para uso em fitorremediação de solos contaminados com Pb.(AU)


Assuntos
Micronutrientes , Osmorregulação , Genótipo , Helianthus , Indicadores e Reagentes , Chumbo
15.
Acta sci., Anim. sci ; 44: e54975, 2022. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1370322

Resumo

The objective was to evaluate the production of Megathyrsus maximusgenotypes (Syn. Panicum maximum), under different levels of water in the soil. This was a 5x5 factorial completely randomized design conducted in a greenhouse, combining five genotypes of M. maximus(B55, C10 and PM30, cv. Massai and cv. BRS Tamani) and five levels of soil field capacities (20%, 40%, 60%, 100% and 140%), with three replications. Dry matter production was evaluated: leaf, stem, dead material, root, shoot and total dry matters, as well as the number of tillers and leaf:stem and aboveground:root ratios. The qualitative factor (genotypes) was subjected to Duncan test at 5% probability. The quantitative factor (% field capacity) was subjected to regression, adopting 5% as a critical level of probability. There was no interaction between the factors for any of the evaluated characteristics. Significant differences amongthe genotypes were detected for tiller number, dead material dry mass, root and total dry mass and leaf:stem ratio. There was no significant effect of the percentage of field capacity on most of the characteristics, except for leaf:stem and aboveground:root ratios. Cultivar Massai showed the best forage production compared to the other genotypes, regardless of the percentage of field capacity evaluated. In general, the evaluated genotypes were more tolerant to excess water stress than to water deficit.(AU)


Assuntos
Desidratação/diagnóstico , Inundações , Genótipo , Panicum/genética
16.
Colloq. Agrar ; 18(2): 42-53, mar.-abr. 2022. ilus, tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1399119

Resumo

Drought stress consists of a significant productivity constraint in tomatoes. Two contrasting crosses were performed to estimate physiological and morphological traits in response to drought stress during the vegetative stage, aiming to identify superior genotypes for drought tolerance. Two genotypes (GBT_2037 - sensitive drought-sensitive and GBT_2016 - intermediate drought-tolerant) were used as female parentals, and a commercial hybrid (drought tolerant) was used as a pollen source in both crosses: C1 (GBT_2037 × Commercial hybrid) and C2 (GBT_2016 x Commercial hybrid). The populations of parentals (P), the first generation of descendants (F1), backcrosses (BC), and the second generation of self-pollination (F2) were exposed to drought stress for 20 days when they were analyzed: physiological traits (relative water content of leaves, proline, and relative chlorophyll content) and morphological (plant height, stem diameter, number of leaves, fresh and dry matter of roots and shoot and classification by wilt scale). The means of chlorophyll, root/shoot ratio, and water content in leaves for the F2 generation of C2 were higher than C1, indicating that C2 resulted in plants with greater capacity to maintain turgor under conditions of water stress and presented minor damage to the photosynthetic structures, consequently showing greater tolerance to drought stress.


O estresse hídrico consiste em uma importante restrição à produtividade do tomateiro. Dois cruzamentos contrastantes foram realizados para estimar características fisiológicas e morfológicas envolvidas na resposta ao estresse hídrico durante a fase vegetativa, visando identificar genótipos superiores para tolerância à seca. Dois genótipos (GBT_2037 - sensível à seca e GBT_2016 - intermediário tolerante à seca) foram utilizadas como parentais femininos e um híbrido comercial (tolerante à seca) foi usado como fonte de pólen em ambos os cruzamentos: C1 (GBT_2037 x Híbrido comercial) e C2 (GBT_2016 x Comercial híbrido). As populações de parentais (P), primeira geração de descendentes (F1), retrocruzamentos (BC) e segunda geração de autopolinização (F2) foram expostas ao estresse hídrico durante 20 dias, quando foram analisadas: características fisiológicas (conteúdo relativo de água das folhas, prolina e teor relativo de clorofila) e morfológicos (altura da planta, diâmetro do caule, número de folhas, matéria fresca e seca de raízes e parte aérea e classificação por nivel de murcha). As médias de clorofila, razão raiz/parte aérea e teor de água nas folhas para a geração F2 de C2 foram superiores a C1, indicando que C2 resultou em plantas com maior capacidade de manter o turgor sob condições de estresse hídrico e apresentou menos danos nas estruturas fotossintéticas, consequentemente apresentando maior tolerância ao estresse hídrico.


Assuntos
Recursos Hídricos , Solanum lycopersicum/classificação , Genótipo , Estação Seca
17.
Ciênc. rural (Online) ; 52(2): e20201054, 2022. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX, LILACS | ID: biblio-1286057

Resumo

Understanding the genetic diversity and overcoming genotype-by-environment interaction issues is an essential step in breeding programs that aims to improve the performance of desirable traits. This study estimated genetic diversity and applied genotype + genotype-by-environment (GGE) biplot analyses in cotton genotypes. Twelve genotypes were evaluated for fiber yield, fiber length, fiber strength, and micronaire. Estimation of variance components and genetic parameters was made through restricted maximum likelihood and the prediction of genotypic values was made through best linear unbiased prediction. The modified Tocher and principal component analysis (PCA) methods, were used to quantify genetic diversity among genotypes. GGE biplot was performed to find the best genotypes regarding adaptability and stability. The Tocher technique and PCA allowed for the formation of clusters of similar genotypes based on a multivariate framework. The GGE biplot indicated that the genotypes IMACV 690 and IMA08 WS were highly adaptable and stable for the main traits in cotton. The cross between the genotype IMACV 690 and IMA08 WS is the most recommended to increase the performance of the main traits in cotton crops.


Compreender a diversidade genética e contornar os problemas causados pela interação genótipos por ambientes é uma etapa importante em programas de melhoramento. Este estudo teve como objetivo estimar a diversidade genética e aplicar a metodologia de biplot genótipo + genótipo por ambiente (GGE biplot) em doze genótipos de algodão avaliados quanto ao rendimento da fibra, comprimento da fibra, resistência da fibra e micronaire. A estimativa dos componentes de variância e dos parâmetros genéticos foi feita através do método da máxima verossimilhança restrita e a predição dos valores genotípicos por meio da melhor predição linear não enviesada. Os métodos de Tocher modificado e análise de componentes principais (PCA) foram utilizados para quantificar a diversidade genética entre os genótipos. O método GGE biplot foi conduzido para encontrar os melhores genótipos em relação à adaptabilidade e estabilidade. As técnicas de Tocher e PCA permitiram a formação de clusters de genótipos semelhantes com base em uma estrutura multivariada. O GGE biplot indicou que os genótipos IMACV 690 e IMA08 WS foram altamente adaptáveis e estáveis para as principais características do algodão. O cruzamento dentre os genótipos IMACV 690 e IMA08 WS é o mais recomendado para aumentar o desempenho das principais características na cultura do algodão.


Assuntos
Gossypium/genética , Fibra de Algodão/análise , Interação Gene-Ambiente , Genótipo , Melhoramento Vegetal/métodos
18.
Braz. j. biol ; 82: e234780, 2022. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1180735

Resumo

Summer apples are one of the most important plant community in Artvin province located Northeastern part of Turkey. In present study 22 local apple genotypes were characterized by phenological, morphological, biochemical and sensory properties. Harvest date was the main phenological data. Morphological measurements included fruit weight, fruit shape, fruit ground color, fruit over color, fruit over color coverage and fruit firmness, respectively. Sensory measurements were as juiciness and aroma and biochemical characteristics included organic acids, SSC (Soluble Solid Content), vitamin C, total phenolic content and antioxidant capacity. Genotypes exhibited variable harvest dates ranging from 11 July to 13 August and cv. Summered harvested 30 July 2017. The majority of genotypes were harvested before cv. Summered. Fruit weight were also quite variable among genotypes which found to be between 89 g and 132 g, and most of the genotypes had bigger fruits than cv. Summered. Pink, red, yellow and green fruit skin color was evident and main fruit shape were determined as round, conic and oblate among genotypes. ART08-9, ART08-4, ART08-21 and ART08-22 had distinct bigger fruits and ART08-1, ART08-2, ART08-5, ART08-12 and ART08-17 had higher total phenolic content and antioxidant capacity. The results of the study showed significant differences for most of the phenological, morphological, sensory and biochemical characteristics. Thus, the phonological, morphological, sensory and biochemical characteristics of summer apple genotypes were distinguishable and these results suggest that phonological, morphological, sensory and biochemical differences of the summer apple genotypes can be attributed to differences in genetic background of genotypes which placed different groups by PCoA analysis.


As maçãs cultivadas no verão são uma das culturas vegetais mais importantes da província de Artvin, localizada no nordeste da Turquia. No presente estudo, 22 genótipos locais de maçã foram caracterizados quanto às suas propriedades morfológicas, bioquímicas e sensoriais. As características analisadas foram peso do fruto, data da colheita, forma do fruto, coloração da casca, firmeza do fruto, suculência, aroma, teor de ácidos orgânicos e de sólidos solúveis, vitamina C, teor fenólico total e capacidade antioxidante. Os genótipos exibiram datas de colheita que variaram de 11 de julho a 13 de agosto, e a cultivar de verão foi colhida em 30 de julho 2017. A maioria dos genótipos foi colhida antes da cultivar de verão. O peso dos frutos também foi bastante variável entre os genótipos, apresentando entre 89 e 132 g, e a maioria dos genótipos apresentou frutos maiores que a cultivar de verão. As colorações rosa, vermelho, amarelo e verde da casca dos frutos foram as mais evidentes, e a forma principal dos frutos foi determinada como redonda, cônica e oblata entre os genótipos. ART08-9, ART08-4, ART08-21 e ART08-22 apresentaram frutos maiores distintos, e ART08-1, ART08-2, ART08-5, ART08-12 e ART08-17 apresentaram maior conteúdo fenólico total e capacidade antioxidante. Os resultados do estudo mostraram diferenças significativas para a maioria das características morfológicas, sensoriais e bioquímicas. Assim, essas características dos genótipos da maçã cultivadas no verão foram distintos, e esses resultados podem ser atribuídos a diferenças no contexto genético dos genótipos.


Assuntos
Malus/genética , Ácido Ascórbico , Frutas/genética , Genótipo , Antioxidantes
19.
Arq. bras. med. vet. zootec. (Online) ; 74(4): 723-730, July-Aug. 2022. tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1393916

Resumo

The objective was to study the productive and biological traits of young cattle of the Kalmyk breed and its crosses. The experiment was conducted on 4 groups of steers, 10 heads each, at OAO Shurupovskoe, Frolovsky District, Volgograd Region. The experimental steers were kept in rooms separately in groups on a deep bed of straw and had free access to walking yards with mounds. The hemoglobin content and the numbers of erythrocytes and leukocytes were determined on a Medonic CA 530 hematological analyzer. The total protein in blood serum and protein fractions were found on an automatic biochemical analyzer Stat Faks 1904. The digital experimental data were processed by the variation statistics method in terms of the significance of the compared parameters using the Student's test accepted in biology and animal science. The study evidenced that the contents of morphological elements and proteins in blood reflected the metabolism and potential for crossbred steers to gain muscle mass.


O objetivo era estudar os traços produtivos e biológicos do gado jovem da raça Kalmyk e seus cruzamentos. A experiência foi conduzida em 4 grupos de bois, 10 cabeças cada, na OAO Shurupovskoe, Distrito de Frolovsky, Região de Volgograd. Os bois experimentais foram mantidos em quartos separados em grupos em uma cama de palha profunda e tiveram livre acesso a pátios de caminhada com montes. O conteúdo de hemoglobina e o número de eritrócitos e leucócitos foram determinados em um analisador hematológico Medonic CA 530. A proteína total em soro sanguíneo e frações proteicas foram encontradas em um analisador bioquímico automático Stat Faks 1904. Os dados experimentais digitais foram processados pelo método de estatística de variação em termos da significância dos parâmetros comparados usando o teste de Student aceito em biologia e ciência animal. O estudo evidenciou que o conteúdo de elementos morfológicos e proteínas no sangue refletia o metabolismo e o potencial de bois cruzados para ganhar massa muscular.


Assuntos
Animais , Bovinos , Hemoglobinas , Grupos Raciais , Eritrócitos , Gado , Genótipo , Leucócitos
20.
Braz. j. biol ; 82: e241110, 2022. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1278500

Resumo

Plasmodium vivax is the most common human malaria parasite in Asian countries including Pakistan. Present study was designed to explore the genetic diversity of plasmodium vivax genotypes based on Pvmsp-3α and Pvmsp-3ßgenes using allelic specific nested PCR and RFLP assays markers from field isolates in district Mardan, Pakistan. Blood samples of 200 P. vivax malarial patients were collected after taking their written informed consent. Genetic diversity in nested PCR products was determined by Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) utilizing Alu1 and PstI restriction enzymes for alpha and beta gene products digestion, respectively. For analysis the genetic diversity of the sub allelic variants of Pvmsp3α and Pvmsp3ß genes, Chi-Square test was performed by utilizing Minitab programming software 18. The P value 0.05 was considered as statistically significant. For Pvmsp3α genes after gel electrophoresis of digested products, four distinct genotypes were obtained from total of 50 samples; type A: 35 (70%) (1.5-2.0 kb), 12 of type B (24%) (1.5-1.7 kb), 2 of type C (4%) (0.5-1.5) and one for type D (2%) (0.5-0.65 kb) which could be characterized into 9 allelic pattern (A1-A4, B1-B3, C1, D), in which A3 remained the most predominant. For Pvmsp-3ßgenes, three distinct genotypes were obtained from 50 samples; 40(80%) of type A (1.5-2.5 kb), 9 (18%) of type B (1.0-1.5kb) and 1(2%) of type C (0.65 kb) which could be characterized into 6 allelic patterns (A1-A3, B1-B2, and C1). Most dominant one in Type A was A1 alleles which were noted (46%), while in Type B, the most dominant were B1 (10%).This study is the first ever report of molecular epidemiology and genetic variation in Pvmsp-3α and Pvmsp-3ß genes of P. vivax isolates by using PCR/RFLP from District Mardan and showed a remarkable level of genetic diversity in the studied genes of circulating parasites in the study area. The results of this study will contribute in future studies about the genetic structure of parasite and vaccine development against the malaria.


O Plasmodium vivax é o parasita da malária humana mais comum nos países asiáticos, incluindo o Paquistão. O presente estudo foi desenhado para explorar a diversidade genética de genótipos de Plasmodium vivax baseados nos genes Pvmsp-3α e Pvmsp-3ß, usando marcadores de ensaios alélicos nested PCR e RFLP de isolados de campo no distrito de Mardan, Paquistão. Amostras de sangue de 200 pacientes com malária por P. vivax foram coletadas após assinatura do termo de consentimento livre e esclarecido. A diversidade genética em produtos de PCR nested foi determinada por polimorfismo de fragmento de restrição (RFLP) utilizando as enzimas de restrição Alu1 e PstI para a digestão dos produtos dos genes alfa e beta, respectivamente. Para análise da diversidade genética das variantes subalélicas dos genes Pvmsp3α e Pvmsp3ß, o teste Qui-quadrado foi realizado utilizando o software de programação Minitab 18. O valor P = 0,05 foi considerado estatisticamente significativo. Para os genes Pvmsp3α, após eletroforese em gel de produtos digeridos, quatro genótipos distintos foram obtidos de um total de 50 amostras; tipo A: 35 (70%) (1,5-2,0 kb), 12 do tipo B (24%) (1,5-1,7 kb), 2 do tipo C (4%) (0,5-1,5) e um para o tipo D (2%) (0,5-0,65 kb), que podem ser caracterizados em nove padrões alélicos (A1-A4, B1-B3, C1, D), em que A3 permaneceu como o mais predominante. Para Pvmsp-3ßgenes, três genótipos distintos foram obtidos a partir de 50 amostras; 40 (80%) do tipo A (1,5-2,5 kb), 9 (18%) do tipo B (1,0-1,5 kb) e 1 (2%) do tipo C (0,65 kb), que podem ser caracterizados em seis padrões alélicos (A1-A3, B1-B2 e C1). Os mais dominantes no tipo A foram o alelo A1, observados em 46%, enquanto, no tipo B, os mais dominantes foram B1 (10%). Este estudo é o primeiro relato de epidemiologia molecular e variação genética em Pvmsp-3α. Os genes Pvmsp-3ß de isolados de P. vivax utilizando PCR/RFLP do Distrito Mardan mostraram um nível notável de diversidade genética nos genes estudados de parasitas circulantes na área de estudo. Os resultados desse estudo contribuirão em estudos futuros sobre a estrutura genética do parasita e o desenvolvimento de vacinas contra a malária.


Assuntos
Humanos , Plasmodium vivax/genética , Proteínas de Protozoários/genética , Paquistão , Variação Genética , Polimorfismo de Fragmento de Restrição , Reação em Cadeia da Polimerase , Genótipo
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