High titers of anti-Leishmania spp. antibodies in apparently healthy dogs in the North Pioneer Mesoregion of the state of Paraná, Brazil / Títulos altos de anticorpos anti-Leishmania spp. em cães aparentemente saudáveis da Mesoregião Norte Pioneiro do estado do Paraná, Brasil

Leishmaniasis is an anthropozoonosis with vector transmission, and knowledge regarding the occurrence of this parasitosis in sentinels can contribute to infection and disease control measures in humans. The objectives of this study were to evaluate the occurrence of Leishmania exposure and infection in dogs from urban and rural areas in the North Pioneer Mesoregion of the state of Paraná, to evaluate possible risk factors, and to analyze the statistical agreement between the serological techniques that were used. Using a convenience sampling, serum and whole blood samples were collected to perform serological and molecular assays, respectively. The enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) and indirect fluorescent antibody test (IFAT) identified 29/204 (14.2%) and 20/204 (9.8%) seropositive dogs, respectively. Five dogs (2.4%) were seropositive for both serological tests, and four dogs presented high titers in the IFAT. None of the samples tested positive for Leishmania spp. DNA according to polymerase chain reaction analysis. No factors were significantly associated with infection. Leishmania parasites circulate in urban and rural dogs in the North Pioneer Mesoregion of the state of Paraná. Despite the absence of clinical cases, seropositive animals with high antibody titers should serve as a warning to the local population that should be properly informed regarding the prevention.(AU)

A Leishmaniose é uma antropozoonose e sua transmissão ocorre através da picada de flebotomíneos de diferentes gêneros, dependendo da localização geográfica. O conhecimento sobre a ocorrência desta parasitose nos reservatórios pode colaborar com medidas de controle da infecção e doença nos humanos. Os objetivos deste estudo foram: avaliar a ocorrência da infecção por Leishmania, em cães de áreas urbanas e rurais, na região da mesorregião Norte Pioneiro do Paraná; avaliar possíveis fatores de risco à infecção e analisar a concordância estatística entre as técnicas sorológicas utilizadas. Para tanto, foram colhidas 204 amostras de soro e sangue total de cães escolhidos aleatoriamente de municípios da mesorregião Norte Pioneiro do Paraná para a detecção de anticorpos anti-Leishmania spp., pelo ensaio imunoenzimático (ELISA) e reação de imunofluorescência indireta (RIFI), e para a detecção de DNA de Leishmania spp. pela reação em cadeia pela polimerase (PCR). Dos 204 cães testados, 29 (14,2%) e 20 (9,8%) foram soropositivos pelo ELISA e RIFI, respectivamente. Cinco cães (2,4%) foram soropositivos em ambos os testes sorológicos. Não foram observados fatores abióticos e bióticos associados à infecção. A concordância entre as técnicas diagnósticas calculada por Kappa foi de 0,34. Conclui-se que, apesar da baixa ocorrência de positividade para leishmaniose e da ausência de casos sintomáticos, os resultados deste estudo devem ser um alerta para a população local por se tratar de uma importante zoonose e, portanto, medidas de prevenção e controle não devem ser negligenciadas.(AU)

Molecular diagnostic for a screening investigation method of tick-borne pathogens in Didelphis albiventris road-killed in north of Paraná, Brazil

The synanthropization of wild animals puts public health at risk by promoting the circulation of zoonotic agents, found naturally in the wild, in the anthropic environment. The objective of this work was to carry out screening by molecular detection of pathogens of the Anaplasmatacea family in Didelphis albiventris, a specie characterized as having a synanthropic habit. Opossums that were dead (n = 25) after being road-killed were collected in the North of Paraná state, southern Brazil during the 2016 and 2018 years, through active search. A questionnaire was filled out with information about the animal and collected place. Biological samples of spleen and liver were collected. The genetic material extracted from the spleen and liver was submitted to molecular diagnosis through PCR for amplification of dsb of Ehrlichia and 16S genes for the other agents of the Anaplasmataceae family. One animal was positive for the genus Ehrlichia in semi-nested PCR for amplification of the 349 bp fragment of the dsb gene in extracted from the liver samples. In PCR for the 16S target no animal was positive. These are preliminary results that reinforce the circulation of Ehrlichia in opossums. To improve the knowledge of these agents in opossums more studies are necessary.(AU)

A sinantropização de animais silvestres coloca em risco a saúde pública por propiciar a circulação de agentes zoonóticos, encontrados naturalmente em ambiente silvestre, no ambiente antrópico. O trabalho teve como objetivo realizar a triagem por detecção molecular de patógenos da família Anaplasmataceae em Didelphis albiventris, espécie caracterizada como de hábito sinantrópico. Gambás mortos (n=25) por atropelamento durante os anos de 2016 e 2018 foram coletados na região norte do Paraná, sul do Brasil, por meio de busca ativa. Realizou-se o preenchimento de formulário com informações sobre a espécie do animal e o local do atropelamento. Foi realizada a necrópsia e coleta de amostras biológicas, de baço e fígado. O material genético extraído de baço e fígado foi submetido a diagnóstico molecular, por meio de PCR, para amplificação dos genes dsb de Ehrlichia sp. e 16S para os demais agentes da família Anaplasmataceae. Um animal foi positivo para o gênero Ehrlichia em semi-nested PCR para a amplificação do fragmento de 349 pb do gene dsb, extraído de fígado. Na PCR para detecção do gene 16S nenhum dos animais foi positivo. Esses resultados preliminares reforçam a circulação de Ehrlichias em gambás. Para melhorar o conhecimento desses agentes em gambás mais estudos são necessários.(AU)

Neorickettsia sp. in coatis (Nasua nasua) in Brazil / Neorickettsia sp. em quatis (Nasua nasua) no Brasil

The genus Neorickettsia comprises trematode-associated bacteria that can cause diseases in animals and humans. Despite detection of Neorickettsia antigens in the intestine of coatis kept in captivity in southern Brazil through immunohistochemistry, the molecular identity of the bacteria in South American procyonids remains elusive. The aim of the present study was to investigate the occurrence of Neorickettsia sp. in blood samples from coatis in central-western Brazil. Between March 2018 and January 2019, animals were captured and recaptured in two areas of the Cerrado (Parque Estadual do Prosa, PEP; and Vila da Base Aérea, VBA) located in the city of Campo Grande, state of Mato Grosso do Sul, central-western Brazil. All captures were performed according to convenience. DNA from 97 blood samples was subjected to nested PCR (nPCR) targeting a fragment of the 16S rRNA gene of Neorickettsia sp. Six samples (3.6%; five from VBA and one from PEP) from different coatis were positive in nPCR based on the 16S rRNA. The sequences obtained (~500 bp) showed ˃ 99% similarity to N. risticii. Phylogenetic analysis clustered the sequences detected in the present study in a clade with N. risticii. This is the first molecular detection of Neorickettsia sp. in coatis in Brazil.(AU)

O gênero Neorickettsia compreende bactérias associadas a trematódeos que podem causar doenças em animais e humanos. Apesar da detecção de antígenos de Neorickettsia por imuno-histoquímica no intestino de quatis mantidos em cativeiro no sul do Brasil, a identidade molecular da bactéria em procionídeos da América do Sul permanece indefinida. O presente trabalho teve como objetivo investigar a ocorrência de Neorickettsia sp. em amostras de sangue de quatis do Centro-Oeste do Brasil. Entre março de 2018 e janeiro de 2019, os animais foram capturados em duas áreas de Cerrado (Parque Estadual do Prosa PEP e Vila da Base Aérea VBA) localizadas na cidade de Campo Grande, Mato Grosso do Sul, Centro-Oeste do Brasil. Todas as capturas e recapturas foram realizadas por conveniência. O DNA de 97 amostras de sangue foi submetido a "nested" (nPCR), baseada em um fragmento do gene 16S rRNA de Neorickettsia sp. Seis (3,6% - 5 de VBA e 1 de PEP) amostras de quatis diferentes foram positivas na nPCR, baseada no rRNA 16S. As sequências obtidas (~500 pb) apresentaram ˃99% de identidade com N. risticii. A inferência filogenética agrupou as sequencias detectadas no presente estudo em um clado com N. risticii. Esta é a primeira detecção molecular de Neorickettsia sp. em quatis do Brasil.(AU)

Molecular survey of hemotropic mycoplasmas in crab-eating raccoons (Procyon cancrivorus) in southern Brazil / Levantamento molecular de micoplasma hemotrópico em mão-pelada (Procyon cancrivorus) do sul do Brasil

Hemoplasmas are non-cultivable bacterial parasites of erythrocytes that infect domestic and wild animals, as well as humans. Their means of transmission and pathogenesis remain contentious issues and difficult to evaluate in wild animals. Procyon cancrivorus is a South American carnivore and occurs in all Brazilian biomes. In this study, we aimed to investigate occurrences of hemoplasmas infecting P. cancrivorus and to identify their 16S rRNA gene, in southern Brazil. DNA was extracted from spleen and blood samples of P. cancrivorus (n = 9) from different locations. Hemoplasma DNA was detected in six samples, based on 16S rRNA gene amplification and phylogenetic analysis. Four of the six sequences belonged to the "Mycoplasma haemofelis group", which is closely related to genotypes detected in Procyon lotor from the USA; one was within the "Mycoplasma suis group", closely related to "Candidatus Mycoplasma haemominutum"; and one was within the intermediate group between these clusters. Thus, these sequences showed that the molecular identity of hemoplasmas in the population studied was very variable. In five positive animals, Amblyomma aureolatum ticks and a flea (Ctenocephalides felis felis) were collected. The present study describes the first molecular detection of mycoplasmas in P. cancrivorus.(AU)

Os micoplasmas hemotrópicos (hemoplasmas) são parasitas bacterianos não-cultiváveis de eritrócitos que infectam tanto animais domésticos e selvagens, como seres humanos. A transmissão e a patogênese são discutíveis e difíceis de avaliar em animais selvagens. O mão pelada (Procyon cancrivorus) é um carnívoro Sul-americano, que ocorre em todos os biomas brasileiros. O objetivo do presente estudo é o de investigar a ocorrência de hemoplasmas infectando P. cancrivorus e identificar seu gene 16S rRNA no Sul do Brasil. O DNA foi extraído do baço e amostras de sangue de P. cancrivorus (n= 9). O DNA de hemoplasma foi detectado em seis amostras, com base na amplificação do gene 16S rRNA e na análise filogenética. Quatro das seis sequências pertencem ao "Grupo Mycoplasma haemofelis", que estão intimamente relacionadas aos genótipos detectados no Procyon lotor dos EUA; uma dentro do "Grupo Mycoplasma suis", que está intimamente relacionado ao "Candidatus Mycoplasma haemominutum", e uma dentro do grupo intermediário entre esses clusters, mostrando assim que há uma diversidade genética de hemoplasmas na população estudada. Em cinco animais positivos, foram coletados carrapatos Amblyomma aureolatum e uma pulga Ctenocephalides felis. O presente estudo traz a primeira detecção molecular de micoplasmas em P. cancrivorus.(AU)

Occurrence of Salmonella spp. in fecal samples from foals with and without diarrhea in the state of São Paulo: microbiological diagnosis, antimicrobial susceptibility profile, and molecular detection / Ocorrência de Salmonella spp. em amostras fecais de potros com e sem diarreia no estado de São Paulo: diagnóstico microbiológico, perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos e detecção molecular

ABSTRACT: The present study investigated Salmonella spp. in the feces of 200 foals up to one year of age (100 with clinical signs of diarrhea and 100 without clinical signs of diarrhea). Bacteriological culture, serotyping, antimicrobial susceptibility, and real-time PCR (qPCR SYBR® Green or a TaqMan®) for detecting the invA gene (with and without a selective pre-enrichment step in tetrathionate broth) were performed. Bacterial culture revealed 15% (n=30) of positive animals (21 animals with diarrhea and nine without diarrhea). Among the 30 isolates, 13 different serovars were identified: S. Infantis, S. Minnesota, S. I.4,5,12:i:-; S. Anatum, S. Cerro, S. Oranienburg, S. Braenderup, S. Give, S. Newport, S. IIIb 61:c:z35, S. 109:-:1.5, S. I.4.12:d:-, S. I.6.8:-:-. Multidrug resistance was found in 43.33% (n=13) of the isolates, with one isolate obtained from animals without diarrhea and 12 isolates from animals with diarrhea. All qPCR techniques used in the study classified more samples as positive for Salmonella spp. than the bacterial culture of feces. In addition, all qPCR techniques detected more positive animals in the diarrhea group than in the diarrhea-free group. The results confirm the utility of the qPCR method without the pre-enrichment step in tetrathionate as a rapid test for Salmonella spp. in carrier animals. In animals with clinical signs of diarrhea, it can be combined with bacterial culture (antimicrobial susceptibility testing and serotyping). The isolation of Salmonella spp. in nine animals without diarrhea confirms the importance of asymptomatic carrier animals in the epidemiology of the disease. The multidrug resistance observed highlights the importance of rational antimicrobial use in horses and adopting biosecurity protocols that are efficacious in controlling the spread of infections between animals and zoonotic transmission in farms.

RESUMO: O presente estudo investigou a ocorrência de Salmonella spp. em fezes de 200 potros com até um ano de idade (100 com sinais clínicos de diarreia e 100 sem sinais clínicos de diarreia), utilizando as técnicas de cultivo bacteriológico e PCR em tempo real (qPCR) pelos métodos de corante fluorescente (SYBR® Green) e sonda específica (Taqman®) para a detecção do gene invA com e sem etapa de pré-enriquecimento seletivo em caldo de tetrationato. O cultivo bacteriológico revelou 15% (n=30) de animais positivos (21 animais com diarreia e nove animais sem diarreia). Dentre esses 30 isolados, 13 sorovares diferentes foram identificados: S. Infantis, S. Minnesota, S. I.4,5,12:i:-; S. Anatum, S. Cerro, S. Oranienburg, S. Braenderup, S. Give, S. Newport, S. IIIb 61:c:z35, S. 109:-:1.5, S. I.4.12:d:-, S. I.6.8:-:-. Multirresistência foi constatada em 43,33% (n=13) dos isolados, sendo um isolado obtido de animal sem diarreia e 12 isolados de animais com diarreia. Todas as técnicas de qPCR empregadas no estudo apresentaram maior número de amostras classificadas como positivas para Salmonella spp. comparadas ao cultivo bacteriológico de fezes. Adicionalmente, em todas as técnicas de qPCR houve maior número de animais detectados como positivos no grupo de animais com diarreia em relação aos animais sem diarreia. Os resultados confirmaram a utilidade do método qPCR sem a etapa de pré-enriquecimento em tetrationato, como um teste rápido para detecção de Salmonella spp. em animais portadores ou em animais com sinais clínicos de diarreia. O cultivo bacteriológico deve ser associado para a realização do teste de sensibilidade aos antimicrobianos e sorotipificação. O isolamento de Salmonella spp. em nove animais sem diarreia, confirma a importância dos animais portadores assintomáticos na epidemiologia da doença. A multirresistência observada evidencia a importância do uso racional de antimicrobianos em equinos e a importância da adoção de protocolos de biossegurança que sejam eficazes para controlar a disseminação de infecções entre animais e a transmissão zoonótica nas fazendas.

Prevalence and association of mycoplasma infection in the development of coronary artery disease

Abstract Coronary heart disease (CHD) has been associated with significant morbidity and mortality worldwide. Although remain controversial, several studies have demonstrated the association of M. pneumoniae infections with atherosclerosis. We evaluated the possible association of mycoplasma infections in patients diagnosed with atherosclerosis by ELISA and PCR methods. Atherosclerotic tissue samples and blood samples were collected for the detection of mycoplasma antibodies (IgA) by ELISA from the 97 patients with coronary artery disease (CAD). M. pneumoniae specific IgA, IgG and IgM were measured by using the Anti-M. pneumoniae IgA/IgG/IgM ELISA. Detection of M. pneumoniae targeting the P1 adhesion gene was performed by PCR Acute infection of M. pneumoniae was diagnosed in 43.3% (42) of patients by PCR. The M. pneumoniae specific antibodies were detected in 36.1% (35) of patients. Twenty-five (25.8%) cases had IgG antibodies, 15 (15.5%) cases had IgM antibodies, 3 (3.1%) cases had IgA antibodies, 10 (10.3%) cases had both IgM + IgG antibodies and 1 (1%) case of each had IgM + IgA and IgG + IgA antibodies. None of the cases was positive for all three antibodies. A Pearson correlation coefficient analysis revealed an excellent correlation between the PCR and the serological results (r=0.921, p 0.001). A majority (17, 40.5%) of the M. pneumoniae positive patients are within the 41-50 years of age group, followed by 10 (23.8%) patients in the age group of 61-70 years and 2 (4.8%) patients were >70 years of age. Our study reported an unusually higher prevalence of M. pneumoniae by serological tests (36.1%) and PCR (43.3%). Although the hypothesis of the association of M. pneumoniae and CAD is yet to be proven, the unusually high prevalence of M. pneumoniae in CAD patients indicates an association, if not, in the development of atherosclerosis.

Resumo A doença coronariana (DCC) tem sido associada a significativa morbidade e mortalidade em todo o mundo. Embora ainda sejam controversos, vários estudos têm demonstrado a associação de infecções por M. pneumoniae com aterosclerose. Avaliamos a possível associação de infecções por micoplasma em pacientes com diagnóstico de aterosclerose pelos métodos ELISA e PCR. Amostras de tecido aterosclerótico e amostras de sangue foram coletadas para a detecção de anticorpos contra micoplasma (IgA) por ELISA de 97 pacientes com doença arterial coronariana (DAC). IgA, IgG e IgM específicos para M. pneumoniae foram medidos usando o Anti-M. pneumoniae IgA / IgG / IgM ELISA. A detecção de M. pneumoniae visando o gene de adesão P1 foi realizada por PCR. A infecção aguda por M. pneumoniae foi diagnosticada em 43,3% (42) dos pacientes pela PCR. Os anticorpos específicos para M. pneumoniae foram detectados em 36,1% (35) dos pacientes. Vinte e cinco (25,8%) casos tinham anticorpos IgG, 15 (15,5%) casos tinham anticorpos IgM, 3 (3,1%) casos tinham anticorpos IgA, 10 (10,3%) casos tinham anticorpos IgM + IgG e 1 (1%) caso de cada um tinha anticorpos IgM + IgA e IgG + IgA. Nenhum dos casos foi positivo para os três anticorpos. A análise do coeficiente de correlação de Pearson revelou uma excelente correlação entre o PCR e os resultados sorológicos (r = 0,921, p 0,001). A maioria (17, 40,5%) dos pacientes positivos para M. pneumoniae está na faixa etária de 41-50 anos, seguida por 10 (23,8%) pacientes na faixa etária de 61-70 anos e 2 (4,8%) pacientes tinham > 70 anos de idade. Nosso estudo relatou uma prevalência incomumente maior de M. pneumoniae por testes sorológicos (36,1%) e PCR (43,3%). Embora a hipótese da associação de M. pneumoniae e DAC ainda não tenha sido comprovada, a prevalência incomumente alta de M. pneumoniae em pacientes com DAC indica uma associação, se não, no desenvolvimento de aterosclerose.

Molecular detection of Toxoplasma gondii, Neospora caninum and Sarcocystis spp in tissues of Sus scrofa slaughtered in southern Brazil / Detecção molecular de Toxoplasma gondii, Neospora caninum e Sarcocystis spp. em tecidos de Sus scrofa abatidos no Sul do Brasil

The aim of this study was to determine the presence of deoxyribonucleic acid (DNA) from Toxoplasma gondii, Sarcocystis spp. and Neospora caninum, in tissues of wild boars slaughtered in southern Brazil. A total of 156 samples were collected from different organs of 25 wild boars, and DNA from at least one of the protozoa investigated was detected in 79 samples. To differentiate between infectious agents, restriction fragment length polymorphism was performed using the restriction enzymes DdeI and HpaII. For N. caninum, conventional PCR was performed with specific primers. The DNA of at least one of the studied pathogens was detected in each animal: 26.58% for T. gondii, 68.36% for Sarcocystis spp. and 5.06% for N. caninum. Coinfection between T. gondii and Sarcocystis spp. occurred in 14 animals, between T. gondii and N. caninum in only one male animal, between Sarcocystis spp. and N. caninum in a female, while co-infection with the three agents was equally observed in only one male animal. Considering the high frequency of detection and its zoonotic risk, especially T. gondii, it appears that wild boars can be potential sources of transmission of infectious agents and the adoption of monitoring measures in these populations should be prioritized.(AU)

O objetivo deste estudo foi determinar a presença de ácido desoxirribonucléico (DNA) de Toxoplasma gondii, Sarcocystis spp. e Neospora caninum, em tecidos de javalis abatidos no sul do Brasil. Foram coletadas 156 amostras de diferentes órgãos de 25 javalis, sendo detectado o DNA de pelo menos um dos protozoários pesquisados em 79 amostras. Para diferenciar entre os agentes infecciosos, o polimorfismo do comprimento do fragmento de restrição, foi realizado usando-se as enzimas de restrição DdeI e HpaII. Para N. caninum, a PCR convencional foi realizada com "primers" específicos. O DNA de pelo menos um dos patógenos estudados foi detectado em cada animal: 26,58% para T. gondii, 68,36% para Sarcocystis spp. e 5,06% para N. caninum. Coinfecção entre T. gondii e Sarcocystis spp. ocorreu em 14 animais; entre T. gondii e N. caninum em apenas um animal macho; entre Sarcocystis spp. e N. caninum em uma fêmea, enquanto a coinfecção com os três agentes foi observada igualmente em apenas um animal macho. Considerando-se a alta frequência de detecção e seu risco zoonótico, especialmente T. gondii, constata-se que os javalis podem ser potenciais fontes de transmissão de agentes infecciosos, e a adoção de medidas de monitoramento nessas populações devem ser priorizadas.(AU)

Molecular detection of Sarcocystis spp. in the breast muscle of captive birds from the southern region of Brazil / Detecção molecular de Sarcocystis spp. no músculo peitoral de aves de cativeiro da região sul do Brasil

Studies on diseases of wild birds are essential in the context of public health, as these animals act as sentinels, allowing information regarding a determined geographic area. In addition, birds are food protein sources for animals, and therefore play an important role in the life cycle of the protozoan Sarcocystis spp. This study aimed to identify the Sarcocystis spp. in breast muscle samples of naturally infected captive birds. The breast muscle of 89 birds were sampled, and the DNA amplified by PCR targeting the 18S ribosomal RNA gene to detect Sarcocystis spp. PCR products were sequenced and 5.61% (5/89) samples showed 100% similarity with Sarcocystis spp. (one Cyanoliseus patagonus, one Psittacula krameri, two Pyrrhura frontalis, and one Ramphastos dicolorus). The large number of naturally infected species analyzed by molecular methods allowed the detection of Sarcocystis spp. in different bird species, corroborating the epidemiology of Sarcocystis spp.

Estudos sobre doenças de aves silvestres são essenciais no contexto da saúde pública, pois esses animais atuam como sentinelas, permitindo obter informações sobre uma determinada área geográfica. Além disso, as aves são fontes de proteína alimentar para os animais e, portanto, desempenham um papel importante no ciclo de vida do Sarcocystis. Este estudo teve como objetivo identificar Sarcocystis spp. nos músculos do peito de aves de cativeiro naturalmente infectadas. Os músculos do peito de 89 aves foram coletados, e o DNA amplificado pela PCR do gene RNA ribossômico 18S para detecção de Sarcocystis spp. Os produtos da PCR foram sequenciados e 5,61% (5/89) amostras apresentaram 100% de similaridade com o Sarcocystis spp. (um Cyanoliseus patagonus, um Psittacula krameri, dois Pyrrhura frontalis e um Ramphastos dicolorus). O grande número de espécies naturalmente infectadas analisadas por métodos moleculares permitiu a detecção de Sarcocystis spp. em diferentes espécies de aves, corroborando a epidemiologia de Sarcocystis spp.

Overview of the use of genomic data in animal breeding / Panorama do uso de dados genômicos no melhoramento genético animal

ABSTRACT: The use of molecular information in breeding programs contributed to important advances in the improvement of traits of economic interest in livestock production. The advent of single nucleotide polymorphism (SNP) panels applied to genome-wide selection (GWS) and genome-wide association studies (GWAS), along with computational advances (e.g., use of powerful software and robust analyses) allowed a better understanding of the genetic architecture of farm animals and increased the selection efficiency. In this context, the statistic method single-step GBLUP has been frequently used to perform GWS, and more recently GWAS analyses, providing accurate predictions and QTL detection, respectively. Nevertheless, in developing countries, species such as sheep and goats, whose genomic data are more difficult to be obtained, the use of data simulation has been efficient in the study of the major factors involved in the selection process, such as size of training population, density of SNP chips, and genotyping strategies. The effects of these factors are directly associated with the prediction accuracy of genomic breeding values. In this review we showed important aspects of the use of genomics in the genetic improvement of production traits of animals, the main methods currently used for prediction and estimation of molecular marker effects, the importance of data simulation for validation of those methods, as well as the advantages, challenges and limitations of the use of GWS and GWAS in the current scenario of livestock production.

RESUMO: Em programas de melhoramento genético, o uso de informações moleculares garantiu importantes avanços para a melhoria de características de interesse econômico, no âmbito da produção animal. O advento da tecnologia de painéis de SNPs aplicados à seleção genômica ampla (GWS) e associação genômica ampla (GWAS), aliado ao avanço computacional, com o uso de softwares e análises robustas, permitiram melhor compreensão sobre a arquitetura genética dos animais de produção e, consequentemente, maior eficiência na seleção. Nesse contexto, o método estatístico single-step GBLUP tem sido utilizado, frequentemente, na execução da GWS e, mais recentemente, em GWAS, possibilitando predições acuradas e detecção de QTLs, respectivamente. No entanto, em países em desenvolvimento e, em espécies como os ovinos e caprinos, que existe maior dificuldade para a aquisição de dados genômicos, o uso da simulação de dados tem se mostrado eficiente para estudar os principais fatores envolvidos no processo de seleção, como o tamanho da população de treinamento, densidade de chipde SNPs e estratégias de genotipagem, cujos efeitos estão diretamente associados à acurácia da predição de valores genéticos genômicos. Nesta revisão, serão abordados pontos importantes sobre o uso da genômica no melhoramento genético de características produtivas em animais, principais métodos de predição e estimação de efeitos de marcadores moleculares na atualidade, a importância da simulação de dados para a validação desses métodos, bem como as vantagens, os desafios e as limitações no cenário atual da produção animal com o uso da seleção e associação genômica ampla.

Diagnóstico ultrassonográfico intrauterino de cardiomegalia fetal em felino / Intrauterine ultrasound diagnosis of fetal cardiomegaly in a feline

A ultrassonografia é um dos principais métodos de diagnóstico gestacional, no qual se realiza: biometria, monitoramento de batimentos e organogênese, detecção de anormalidades e avaliação da circulação sanguínea materno-fetal. Nesse quesito, o diagnóstico ultrassonográfico intrauterino de anormalidades fetais vem adquirindo espaço com o desenvolvimento de equipamentos mais avançados, tendo potencial para se tornar uma ferramenta de triagem para tal. Baseado na escassez observada nesse aspecto, visa-se relatar o diagnóstico ultrassonográfico intrauterino de uma alteração fetal em uma felina gestante. Foi atendida uma felina da raça persa, 3 anos, com histórico de monta natural há 40 dias. Na ultrassonografia visibilizou-se quatro fetos vivos com aproximadamente 38 dias. Uma segunda avaliação ultrassonográfica ocorreu após 12 dias, notando-se um feto com cardiomegalia, oscilação da frequência cardíaca e sofrimento fetal, enquanto os demais fetos apresentavam-se dentro da normalidade. O terceiro exame foi feito após quatro dias, visibilizando ausência de batimento cardíaco e presença de líquido em espaço pleural no feto em questão, confirmando o óbito. O parto natural ocorreu após uma semana, com nascimento de três filhotes vivos e um natimorto. Ao exame necroscópico do natimorto, confirmou-se cardiomegalia generalizada. Conclui-se que a ultrassonografia é um método padrão-ouro para diagnóstico de anormalidades fetais, permitindo planejar o parto e interceder de maneira precoce conforme a situação. Assim, esse trabalho enriquece a literatura com maiores informações relacionadas a malformações fetais observadas antes do parto, contribuindo assim com as condutas obstétricas em pequenos animais.(AU)

Ultrasonography is one of the main methods of gestational diagnosis, in which it performs: biometry, monitoring of beats and organogenesis, detection of abnormalities and evaluation of maternal-fetal blood circulation. In this regard, intrauterine sonographic diagnosis of fetal abnormalities has been gaining space with the development of more advanced equipment, and has the potential to become a screening tool for this purpose. Based on the scarcity observed in this aspect, this study aimsto report the intrauterine ultrasound diagnosis of a fetal abnormality in a pregnant feline. The patient was a 3-year-old Persian female with a history of natural mounting for 40 days. At ultrasonography, four live fetuses were visualized at approximately38 days of age. Asecond ultrasonographic evaluation was performed after 12 days, and one fetus with cardiomegaly, heart rate oscillation and fetal distress was observed, while the other fetuses were within normal limits. The third scan was performed after four days, showing absence of heartbeat and presence of fluid in the pleural space in the fetus in question, confirming the death. Natural delivery occurred after one week, with the birth of three live pups and one stillborn. At necroscopic examination of the stillborn, generalized cardiomegaly was confirmed. We conclude that ultrasonography is a gold standard method for diagnosing fetal abnormalities, allowing birth planning and early intervention according to the situation. Thus, this study enriches theliterature with more information related to fetal malformations observed before delivery, thus contributing to obstetric management in small animals.(AU)

Overview of the use of genomic data in animal breeding / Panorama do uso de dados genômicos no melhoramento genético animal

The use of molecular information in breeding programs contributed to important advances in the improvement of traits of economic interest in livestock production. The advent of single nucleotide polymorphism (SNP) panels applied to genome-wide selection (GWS) and genome-wide association studies (GWAS), along with computational advances (e.g., use of powerful software and robust analyses) allowed a better understanding of the genetic architecture of farm animals and increased the selection efficiency. In this context, the statistic method single-step GBLUP has been frequently used to perform GWS, and more recently GWAS analyses, providing accurate predictions and QTL detection, respectively. Nevertheless, in developing countries, species such as sheep and goats, whose genomic data are more difficult to be obtained, the use of data simulation has been efficient in the study of the major factors involved in the selection process, such as size of training population, density of SNP chips, and genotyping strategies. The effects of these factors are directly associated with the prediction accuracy of genomic breeding values. In this review we showed important aspects of the use of genomics in the genetic improvement of production traits of animals, the main methods currently used for prediction and estimation of molecular marker effects, the importance of data simulation for validation of those methods, as well as the advantages, challenges and limitations of the use of GWS and GWAS in the current scenario of livestock production.

Em programas de melhoramento genético, o uso de informações moleculares garantiu importantes avanços para a melhoria de características de interesse econômico, no âmbito da produção animal. O advento da tecnologia de painéis de SNPs aplicados à seleção genômica ampla (GWS) e associação genômica ampla (GWAS), aliado ao avanço computacional, com o uso de softwares e análises robustas, permitiram melhor compreensão sobre a arquitetura genética dos animais de produção e, consequentemente, maior eficiência na seleção. Nesse contexto, o método estatístico single-step GBLUP tem sido utilizado, frequentemente, na execução da GWS e, mais recentemente, em GWAS, possibilitando predições acuradas e detecção de QTLs, respectivamente. No entanto, em países em desenvolvimento e, em espécies como os ovinos e caprinos, que existe maior dificuldade para a aquisição de dados genômicos, o uso da simulação de dados tem se mostrado eficiente para estudar os principais fatores envolvidos no processo de seleção, como o tamanho da população de treinamento, densidade de chipde SNPs e estratégias de genotipagem, cujos efeitos estão diretamente associados à acurácia da predição de valores genéticos genômicos. Nesta revisão, serão abordados pontos importantes sobre o uso da genômica no melhoramento genético de características produtivas em animais, principais métodos de predição e estimação de efeitos de marcadores moleculares na atualidade, a importância da simulação de dados para a validação desses métodos, bem como as vantagens, os desafios e as limitações no cenário atual da produção animal com o uso da seleção e associação genômica ampla.

Non-invasive monitoring of intracranial pressure waveforms using Braincare® BCMM 2000 monitor in dogs with myelopathies undergoing myelography / Monitoramento não invasivo do formato das ondas de pressão intracraniana usando o monitor Braincare® BCMM 2000 em cães com mielopatias submetidos à mielografia

ABSTRACT: Intracranial pressure (ICP) monitoring is considered the gold standard for optimizing the treatment of humans in intensive care units. However, this procedure is not commonly performed in veterinary medicine because of the limitations and complications of the method. There are some new promising non-invasive techniques for monitoring ICP, but they have not been validated in veterinary medicine. This study aimed to correlate the non-invasive intracranial pressure (NI-ICP) waveforms obtained with the BCMM-2000 Brain4care monitor during myelography in dogs with myelopathies undergoing this exam for diagnostic purposes with the waveforms obtained through invasive monitoring of the subarachnoid pressure (SP). The NI-ICP waveform was monitored in six dogs with myelopathies before (M1), during (M2), and after (M3) contrast medium injection into the subarachnoid space. Cerebrospinal fluid (CSF) was collected before contrast injection. The SP waveform was simultaneously monitored in three of the six dogs. Correlations between the two methods were performed using Pearson's coefficient. The analysis of the morphology and amplitude of the waves at each moment was performed, and at M2, an increase in the P2:P1 ratio (p<0.05) was observed in both monitoring methods. In M3, the values were similar to those of M1, demonstrating the return of cerebral compliance. The comparison of the NI-ICP and SP had a positive correlation in those moments (Pearson's coefficient r=0.76; p=0.027). The speed of contrast administration, degree of spinal cord compression, and volume of CSF previously collected may affect P2:P1 and ICP dynamics. The BCMM-2000 Brain4care monitor was effective in detecting changes in ICP dynamics and abnormal pulse waveforms in dogs with meningoencephalitis of unknown origin, vertebral neoplasm and intervertebral disc disease with and without hemorrhagic myelomalacia, suggesting increased ICP induced by myelography.

RESUMO: A monitorização da pressão intracraniana (PIC) é considerada o padrão ouro para otimizar o tratamento de humanos em unidades de terapia intensiva, entretanto, esse procedimento não é comumente realizado na medicina veterinária devido às limitações e complicações do método. Existem algumas técnicas não invasivas promissoras de monitoramento da PIC, mas elas não foram validadas na medicina veterinária. Este estudo teve como objetivo correlacionar os formatos das ondas não invasivas da PIC (NI-PIC), obtidas com o monitor BCMM-2000 Brain4care, antes e após a injeção de meio de contraste no espaço subaracnóideo de cães com mielopatias submetidos à mielografia para fins diagnósticos, com as formas de onda obtidas por meio de monitoração invasiva da pressão subaracnóidea (PS). O formato das ondas NI-PIC foram monitoradas em seis cães com mielopatias antes (M1), durante (M2) e após (M3) injeção de meio de contraste no espaço subaracnóideo. O líquido cefalorraquidiano (LCR) foi coletado antes da injeção de contraste. A forma da onda da PS foi monitorada simultaneamente em três dos seis cães. As correlações entre os dois métodos foram feitas usando o coeficiente de Pearson. Foi realizada a análise da morfologia e amplitude das ondas em cada momento, e em M2 observou-se aumento da relação P2:P1 (p<0,05) em ambos os métodos de monitoramento. Em M3, os valores foram semelhantes aos de M1, demonstrando o retorno da complacência cerebral. A comparação do NI-PIC e PS apresentou correlação positiva nesses momentos (coeficiente de Pearson r=0,76; p=0,027). A velocidade de administração do contraste, o grau de compressão da medula espinhal e o volume de LCR coletado anteriormente podem afetar a dinâmica P2:P1 e PIC. O monitor BCMM-2000 Brain4care foi eficaz na detecção de alterações na dinâmica da PIC e dos formatos das ondas de pulso anormais em cães com meningoencefalite de origem desconhecida, neoplasia vertebral e doença do disco intervertebral com e sem mielomalácia hemorrágica, sugerindo aumento da PIC induzida pela mielografia.

Prevalence and association of mycoplasma infection in the development of coronary artery disease / Prevalência e associação de infecção por micoplasma no desenvolvimento de doença arterial coronariana

Coronary heart disease (CHD) has been associated with significant morbidity and mortality worldwide. Although remain controversial, several studies have demonstrated the association of M. pneumoniae infections with atherosclerosis. We evaluated the possible association of mycoplasma infections in patients diagnosed with atherosclerosis by ELISA and PCR methods. Atherosclerotic tissue samples and blood samples were collected for the detection of mycoplasma antibodies (IgA) by ELISA from the 97 patients with coronary artery disease (CAD). M. pneumoniae specific IgA, IgG and IgM were measured by using the Anti-M. pneumoniae IgA/IgG/IgM ELISA. Detection of M. pneumoniae targeting the P1 adhesion gene was performed by PCR Acute infection of M. pneumoniae was diagnosed in 43.3% (42) of patients by PCR. The M. pneumoniae specific antibodies were detected in 36.1% (35) of patients. Twenty-five (25.8%) cases had IgG antibodies, 15 (15.5%) cases had IgM antibodies, 3 (3.1%) cases had IgA antibodies, 10 (10.3%) cases had both IgM + IgG antibodies and 1 (1%) case of each had IgM + IgA and IgG + IgA antibodies. None of the cases was positive for all three antibodies. A Pearson correlation coefficient analysis revealed an excellent correlation between the PCR and the serological results (r=0.921, p70 years of age. Our study reported an unusually higher prevalence of M. pneumoniae by serological tests (36.1%) and PCR (43.3%). Although the hypothesis of the association of M. pneumoniae and CAD is yet to be proven, the unusually high prevalence of M. pneumoniae in CAD patients indicates an association, if not, in the development of atherosclerosis.

A doença coronariana (DCC) tem sido associada a significativa morbidade e mortalidade em todo o mundo. Embora ainda sejam controversos, vários estudos têm demonstrado a associação de infecções por M. pneumoniae com aterosclerose. Avaliamos a possível associação de infecções por micoplasma em pacientes com diagnóstico de aterosclerose pelos métodos ELISA e PCR. Amostras de tecido aterosclerótico e amostras de sangue foram coletadas para a detecção de anticorpos contra micoplasma (IgA) por ELISA de 97 pacientes com doença arterial coronariana (DAC). IgA, IgG e IgM específicos para M. pneumoniae foram medidos usando o Anti-M. pneumoniae IgA / IgG / IgM ELISA. A detecção de M. pneumoniae visando o gene de adesão P1 foi realizada por PCR. A infecção aguda por M. pneumoniae foi diagnosticada em 43,3% (42) dos pacientes pela PCR. Os anticorpos específicos para M. pneumoniae foram detectados em 36,1% (35) dos pacientes. Vinte e cinco (25,8%) casos tinham anticorpos IgG, 15 (15,5%) casos tinham anticorpos IgM, 3 (3,1%) casos tinham anticorpos IgA, 10 (10,3%) casos tinham anticorpos IgM + IgG e 1 (1%) caso de cada um tinha anticorpos IgM + IgA e IgG + IgA. Nenhum dos casos foi positivo para os três anticorpos. A análise do coeficiente de correlação de Pearson revelou uma excelente correlação entre o PCR e os resultados sorológicos (r = 0,921, p 70 anos de idade. Nosso estudo relatou uma prevalência incomumente maior de M. pneumoniae por testes sorológicos (36,1%) e PCR (43,3%). Embora a hipótese da associação de M. pneumoniae e DAC ainda não tenha sido comprovada, a prevalência incomumente alta de M. pneumoniae em pacientes com DAC indica uma associação, se não, no desenvolvimento de aterosclerose.

Sarcocystis spp. detection in cattle using different diagnostic methods / Detecção de Sarcocystis spp. em bovinos usando diferentes métodos de diagnóstico

Cattle are considered intermediate hosts of Sarcocystis, which can cause clinical signs and lower performance in the acute phase of infection. Sarcocystis spp. are usually not visible to the naked eye during the post mortem inspection. Moreover, fresh microscopic examination and transmission electron microscopy techniques are difficult to apply to large samples. Therefore, extensive studies on Sarcocystis infection in cattle using molecular and serological methods are required. Here, we investigated Sarcocystis spp. infection in cattle using fresh microscopic examination and polymerase chain reaction of myocardium samples and compared the results with the presence of antibodies against Sarcocystis spp. in corresponding serum samples detected using indirect fluorescent antibody test. Microscopic Sarcocystis were observed in 100% of the myocardial samples, and Sarcocystis DNA was present in 86% (43/50) of these samples. Antibodies against Sarcocystis spp. were detected in 96% (48/50) and 80% (40/50) of the serum samples at 1:25 and 1:200 dilutions, respectively. The three associated methods (fresh microscopic examination, PCR and serology) showed good sensitivity and detection for Sarcocystis spp. compared with fresh microscopic examination (only), and they may facilitate diagnosis in live animals on a large scale as well as monitoring of the herd status.

Os bovinos são considerados hospedeiros intermediários de Sarcocystis, podendo causar sinais clínicos e menor desempenho na fase aguda da infecção. Sarcocystis spp. geralmente não são visíveis a olho nu durante a inspeção post mortem. Além disso, o exame microscópico a fresco e as técnicas de microscopia eletrônica de transmissão são difíceis de aplicar a uma amostras de grande tamanho. Portanto, são necessários extensos estudos sobre a infecção por Sarcocystis em bovinos usando métodos moleculares e sorológicos. Aqui, investigamos a infecção de Sarcocystis spp. em bovinos por meio de exame microscópico a fresco e reação em cadeia da polimerase de amostras de miocárdio e comparado os resultados com a presença de anticorpos contra Sarcocystis spp. em amostras de soro correspondentes detectadas usando o teste de anticorpos fluorescentes indiretos. Sarcocistos microscópicos foram observados em 100% das amostras de miocárdio, e o DNA de Sarcocystis estava presente em 86% (43/50) dessas amostras. Anticorpos contra Sarcocystis spp. foram detectados em 96% (48/50) e 80% (40/50) das amostras de soro nas diluições 1:25 e 1:200, respectivamente. Os três métodos associados (exame microscópico a fresco, PCR e sorologia) mostraram boa sensibilidade e detecção para Sarcocystis spp. em comparação com o exame microscópico fresco (apenas) e podem facilitar o diagnóstico em animais vivos em larga escala, bem como o monitoramento do status do rebanho.

Cross-genera amplification and identification of Colpodella sp. with Cryptosporidium primers in fecal samples of zoo felids from northeast China / Amplificação cruzada de gêneros e identificação de Colpodella sp. com iniciadores de Cryptosporidium em amostras fecais de zoofilia do nordeste da China

Abstract The protozoans include many intracellular human pathogens. Accurate detection of these pathogens is necessary to treat the diseases. In clinical epidemiology, molecular identification of protozoan is considered a more reliable and rapid method for identification than microscopy. Among these protozoans, Cryptosporidium considered being one of the important water-borne zoonotic pathogens and a major cause of a diarrheal disease named cryptosporidiosis in humans, domestic animals, and wild animals. This study was aimed to identify Cryptosporidium in zoo felids (N= 56) belonging to different zoo of China, but accidentlly Colpodella was encountered in the zoo felids sample and phylogenetic data confirmed this unexpected amplification from fecal samples using two-step nested-PCR. Phylogenetic analysis revealed the fact about the specific primers used previously by many researchers and cross-genera amplification. We came to know that genetically sequenced amplicon gives more accurate identification of species. This study suggests more investigation on Colpodella which has been neglected previously but gains the attention of researchers after identified from humans and animals and has been known to correlate with neurological symptoms in patients.

Resumo Os protozoários incluem muitos patógenos humanos intracelulares. A detecção acurada desses patógenos é necessária para tratar as doenças. Na epidemiologia clínica, a identificação molecular de protozoários é considerada o método de identificação mais confiável e rápido do que a microscopia. Entre esses protozoários, o Cryptosporidium é considerado um dos importantes patógenos zoonóticos transmitidos pela água e uma das principais causas de uma doença diarreica denominada criptosporidiose em humanos, animais domésticos e selvagens. Este estudo teve como objetivo identificar Cryptosporidium em zoofelídeos (N = 56) pertencentes a diferentes zoológicos da China, mas acidentalmente Colpodella foi encontrada na amostra de zoofelídeos e os dados filogenéticos confirmaram essa amplificação inesperada de amostras fecais usando nested-PCR em duas etapas. A análise filogenética revelou o fato sobre os primers específicos usados ​​anteriormente por muitos pesquisadores e a amplificação entre gêneros. Ficamos sabendo que o amplicon sequenciado geneticamente fornece uma identificação mais acurada das espécies. Este estudo sugere mais investigação sobre Colpodella, que foi negligenciada anteriormente, mas ganha a atenção dos pesquisadores depois de identificada em humanos e animais e é conhecida por se correlacionar com sintomas neurológicos em pacientes.

Prevalence and association of mycoplasma infection in the development of coronary artery disease / Prevalência e associação de infecção por micoplasma no desenvolvimento de doença arterial coronariana

Abstract Coronary heart disease (CHD) has been associated with significant morbidity and mortality worldwide. Although remain controversial, several studies have demonstrated the association of M. pneumoniae infections with atherosclerosis. We evaluated the possible association of mycoplasma infections in patients diagnosed with atherosclerosis by ELISA and PCR methods. Atherosclerotic tissue samples and blood samples were collected for the detection of mycoplasma antibodies (IgA) by ELISA from the 97 patients with coronary artery disease (CAD). M. pneumoniae specific IgA, IgG and IgM were measured by using the Anti-M. pneumoniae IgA/IgG/IgM ELISA. Detection of M. pneumoniae targeting the P1 adhesion gene was performed by PCR Acute infection of M. pneumoniae was diagnosed in 43.3% (42) of patients by PCR. The M. pneumoniae specific antibodies were detected in 36.1% (35) of patients. Twenty-five (25.8%) cases had IgG antibodies, 15 (15.5%) cases had IgM antibodies, 3 (3.1%) cases had IgA antibodies, 10 (10.3%) cases had both IgM + IgG antibodies and 1 (1%) case of each had IgM + IgA and IgG + IgA antibodies. None of the cases was positive for all three antibodies. A Pearson correlation coefficient analysis revealed an excellent correlation between the PCR and the serological results (r=0.921, p<0.001). A majority (17, 40.5%) of the M. pneumoniae positive patients are within the 41-50 years of age group, followed by 10 (23.8%) patients in the age group of 61-70 years and 2 (4.8%) patients were >70 years of age. Our study reported an unusually higher prevalence of M. pneumoniae by serological tests (36.1%) and PCR (43.3%). Although the hypothesis of the association of M. pneumoniae and CAD is yet to be proven, the unusually high prevalence of M. pneumoniae in CAD patients indicates an association, if not, in the development of atherosclerosis.

Resumo A doença coronariana (DCC) tem sido associada a significativa morbidade e mortalidade em todo o mundo. Embora ainda sejam controversos, vários estudos têm demonstrado a associação de infecções por M. pneumoniae com aterosclerose. Avaliamos a possível associação de infecções por micoplasma em pacientes com diagnóstico de aterosclerose pelos métodos ELISA e PCR. Amostras de tecido aterosclerótico e amostras de sangue foram coletadas para a detecção de anticorpos contra micoplasma (IgA) por ELISA de 97 pacientes com doença arterial coronariana (DAC). IgA, IgG e IgM específicos para M. pneumoniae foram medidos usando o Anti-M. pneumoniae IgA / IgG / IgM ELISA. A detecção de M. pneumoniae visando o gene de adesão P1 foi realizada por PCR. A infecção aguda por M. pneumoniae foi diagnosticada em 43,3% (42) dos pacientes pela PCR. Os anticorpos específicos para M. pneumoniae foram detectados em 36,1% (35) dos pacientes. Vinte e cinco (25,8%) casos tinham anticorpos IgG, 15 (15,5%) casos tinham anticorpos IgM, 3 (3,1%) casos tinham anticorpos IgA, 10 (10,3%) casos tinham anticorpos IgM + IgG e 1 (1%) caso de cada um tinha anticorpos IgM + IgA e IgG + IgA. Nenhum dos casos foi positivo para os três anticorpos. A análise do coeficiente de correlação de Pearson revelou uma excelente correlação entre o PCR e os resultados sorológicos (r = 0,921, p < 0,001). A maioria (17, 40,5%) dos pacientes positivos para M. pneumoniae está na faixa etária de 41-50 anos, seguida por 10 (23,8%) pacientes na faixa etária de 61-70 anos e 2 (4,8%) pacientes tinham > 70 anos de idade. Nosso estudo relatou uma prevalência incomumente maior de M. pneumoniae por testes sorológicos (36,1%) e PCR (43,3%). Embora a hipótese da associação de M. pneumoniae e DAC ainda não tenha sido comprovada, a prevalência incomumente alta de M. pneumoniae em pacientes com DAC indica uma associação, se não, no desenvolvimento de aterosclerose.

Prevalence and association of mycoplasma infection in the development of coronary artery disease / Prevalência e associação de infecção por micoplasma no desenvolvimento de doença arterial coronariana

Coronary heart disease (CHD) has been associated with significant morbidity and mortality worldwide. Although remain controversial, several studies have demonstrated the association of M. pneumoniae infections with atherosclerosis. We evaluated the possible association of mycoplasma infections in patients diagnosed with atherosclerosis by ELISA and PCR methods. Atherosclerotic tissue samples and blood samples were collected for the detection of mycoplasma antibodies (IgA) by ELISA from the 97 patients with coronary artery disease (CAD). M. pneumoniae specific IgA, IgG and IgM were measured by using the Anti-M. pneumoniae IgA/IgG/IgM ELISA. Detection of M. pneumoniae targeting the P1 adhesion gene was performed by PCR Acute infection of M. pneumoniae was diagnosed in 43.3% (42) of patients by PCR. The M. pneumoniae specific antibodies were detected in 36.1% (35) of patients. Twenty-five (25.8%) cases had IgG antibodies, 15 (15.5%) cases had IgM antibodies, 3 (3.1%) cases had IgA antibodies, 10 (10.3%) cases had both IgM + IgG antibodies and 1 (1%) case of each had IgM + IgA and IgG + IgA antibodies. None of the cases was positive for all three antibodies. A Pearson correlation coefficient analysis revealed an excellent correlation between the PCR and the serological results (r=0.921, p<0.001). A majority (17, 40.5%) of the M. pneumoniae positive patients are within the 41-50 years of age group, followed by 10 (23.8%) patients in the age group of 61-70 years and 2 (4.8%) patients were >70 years of age. Our study reported an unusually higher prevalence of M. pneumoniae by serological tests (36.1%) and PCR (43.3%). Although the hypothesis of the association of M. pneumoniae and CAD is yet to be proven, the unusually high prevalence of M. pneumoniae in CAD patients indicates an association, if not, in the development of atherosclerosis.(AU)

A doença coronariana (DCC) tem sido associada a significativa morbidade e mortalidade em todo o mundo. Embora ainda sejam controversos, vários estudos têm demonstrado a associação de infecções por M. pneumoniae com aterosclerose. Avaliamos a possível associação de infecções por micoplasma em pacientes com diagnóstico de aterosclerose pelos métodos ELISA e PCR. Amostras de tecido aterosclerótico e amostras de sangue foram coletadas para a detecção de anticorpos contra micoplasma (IgA) por ELISA de 97 pacientes com doença arterial coronariana (DAC). IgA, IgG e IgM específicos para M. pneumoniae foram medidos usando o Anti-M. pneumoniae IgA / IgG / IgM ELISA. A detecção de M. pneumoniae visando o gene de adesão P1 foi realizada por PCR. A infecção aguda por M. pneumoniae foi diagnosticada em 43,3% (42) dos pacientes pela PCR. Os anticorpos específicos para M. pneumoniae foram detectados em 36,1% (35) dos pacientes. Vinte e cinco (25,8%) casos tinham anticorpos IgG, 15 (15,5%) casos tinham anticorpos IgM, 3 (3,1%) casos tinham anticorpos IgA, 10 (10,3%) casos tinham anticorpos IgM + IgG e 1 (1%) caso de cada um tinha anticorpos IgM + IgA e IgG + IgA. Nenhum dos casos foi positivo para os três anticorpos. A análise do coeficiente de correlação de Pearson revelou uma excelente correlação entre o PCR e os resultados sorológicos (r = 0,921, p < 0,001). A maioria (17, 40,5%) dos pacientes positivos para M. pneumoniae está na faixa etária de 41-50 anos, seguida por 10 (23,8%) pacientes na faixa etária de 61-70 anos e 2 (4,8%) pacientes tinham > 70 anos de idade. Nosso estudo relatou uma prevalência incomumente maior de M. pneumoniae por testes sorológicos (36,1%) e PCR (43,3%). Embora a hipótese da associação de M. pneumoniae e DAC ainda não tenha sido comprovada, a prevalência incomumente alta de M. pneumoniae em pacientes com DAC indica uma associação, se não, no desenvolvimento de aterosclerose.(AU)

Mastocitoma cutâneo canino após mastocitose acidental induzida por opioide: Relato de caso / Canine cutaneous mastocytoma after accidental opioid-induced mastocytosis: Case report

A aproximação entre petse tutores está cada vez mais presente na rotina atual das residências familiares. Essa aproximação aumenta a observação de quaisquer alterações físicas ou comportamentais dos animais levando-o a buscar um médico veterinário quando necessário. O papel do clínico, oncologista e do patologista veterinário vem a ser de extrema importância para detecção das neoplasias em suas fases iniciais. A utilização dos meios de diagnósticos complementares para os casos de neoplasias é de fundamental importância para ter ciência do prognóstico do animal e de qual tratamento será o melhor tratamento para os casos abordados. O mastocitoma é a neoplasia cutânea mais frequente do cão, é uma neoplasia maligna e sua etiologia é pouco compreendida. Independente do sexo, atingem machos e fêmeas, porém se apresentam de forma mais agressiva em machos. O diagnóstico, geralmente é estabelecido por meio de exames complementares, associados aos sinaisclínicos, devendo sempre prezar pelo diagnóstico precoce para que haja maior êxito no tratamento.O exame citológico para o diagnóstico de mastocitoma é um dos métodos mais eficientes e de baixo custo, sendo complementado pelo exame histopatológico para agraduação de malignidade e estadiamento da doença. Preconiza-se a associação da cirurgia com o tratamento quimioterápico com terapia antiblástica e eletroquimioterapia para um melhor prognóstico. O objetivo deste trabalho foi relatar um caso de mastocitoma cutâneo após um erro primário de manejo clinico, em um canino, macho, nove anos, da raça American Pitbull Terrier, trazendo sua complexidade e bases dos meios de diagnóstico(AU)

The approximation between pets and tutors is increasingly present in the current routine of family homes. This approach increases the observation of physical or behavioral changes in animals, leading them to seek a veterinarian when necessary. The role of the clinician, oncologist and veterinary pathologist is extremely important for the detection of neoplasms in their early stages. The use of complementary diagnostic means for cases of neoplasms is of fundamental importance to be aware of the animal's prognosis and which treatment will be the best treatment for the cases examined. Mastocytoma is the most frequent skin neoplasm in dogs, it is a malignant neoplasm and its etiology is poorly understood. Regardless of gender, they affect males and females, but are more aggressive in males. The diagnosis is usually established through complementary exams, associated with clinical signs. Cytological examination for the diagnosis of mast cell tumor is an inexpensive method and one of the most efficient methods, being complemented by histopathological examination for its evolution of malignancy and disease staging, recommended the association of surgery with chemotherapy treatment with antiblastic therapy and electrochemotherapy for better prognoses. The aim of this study was to report a case of cutaneous mastocytoma after a primary error in clinical management, in a canine, male, nine years old, of the American Pitbull Terrier breed, bringing its complexity and bases of the means of diagnosis(AU)

Current understanding of an Emerging Coronavirus usingin silico approach: Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) / Compreensão atual de um coronavírus emergente usando abordagem in silico: síndrome respiratória aguda grave - coronavírus-2 (SARS-CoV-2)

Novel coronavirus (nCoV) namely "SARS-CoV-2" is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the "SARS-CoV-2" although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among "SARS-CoV-2" and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that "SARS-CoV-2" has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.

O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente "SARS-CoV-2", foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o "SARS-CoV-2", embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre "SARS-CoV-2" e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que "SARS-CoV-2" tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.

Current understanding of an Emerging Coronavirus usingin silico approach: Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) / Compreensão atual de um coronavírus emergente usando abordagem in silico: síndrome respiratória aguda grave - coronavírus-2 (SARS-CoV-2)

Novel coronavirus (nCoV) namely "SARS-CoV-2" is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the "SARS-CoV-2" although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among "SARS-CoV-2" and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that "SARS-CoV-2" has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.(AU)

O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente "SARS-CoV-2", foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o "SARS-CoV-2", embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre "SARS-CoV-2" e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que "SARS-CoV-2" tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.(AU)