Ring test in milk samples preserved with Bronopol® / Teste do anel em amostras de leite conservadas com Bronopol ®

ABSTRACT: This study evaluated if the milk ring test (MRT) used to the brucellosis diagnostic at dairy herd level can be done in milk samples with conservative (Bronopol®) collected to the somatic cell count (SCC) that is used to mastitis monitoring. It were analyzed 38 bulk tank milk samples (BTMS) from 19 dairy herds artisanal cheese producers and 36 BTMS from a brucellosis free dairy herd, used as negative control (NC) and positive control (PC), when was added serum from vaccinated animals. The milk samples were collected in two different bottles (with or without Bronopol®). All the 38 BTMS from artisanal cheese producers (samples with and without Bronopol®) were non-reagent to MRT, as all NC. All PC were reagent to MRT, without interference of Bronopol®. Results showed that the milk sample used to SCC presented the proportion of agreement of results in all milk samples (100%), that is, false positive and false negative results were not observed. Results indicated that Bronopol® did not interfere with the color in the time of MRT reading suggesting that the same milk samples could be used to monitoring mastitis and brucellosis.

RESUMO: O objetivo deste estudo foi avaliar se o teste do anel do leite (TAL), utilizado para o diagnóstico da brucelose em nível de rebanho leiteiro, pode ser realizado em amostras de leite com conservador (Bronopol®) coletado para contagem de células somáticas (CCS) que é utilizado para monitoramento de mastite. Foram analisadas 38 amostras de leite de tanques de expansão (ALTE) de 19 rebanhos leiteiros produtores de queijo artesanal e 36 ALTE de rebanho leiteiro livre de brucelose, utilizadas como controle negativo (CN) e controle positivo (CP), quando foi adicionado soro de animais vacinados. As amostras de leite foram coletadas em dois frascos diferentes (com e sem Bronopol®). Todos as 38 ALTE de produtores artesanais de queijo (amostras com e sem Bronopol®) foram não reagentes ao TAL, como todos os CN. Todos os CP foram reagentes ao TAL, sem interferência do Bronopol®. Os resultados mostraram que a amostra de leite utilizada para CCS apresentaram a proporção de concordância dos resultados em todas as amostras de leite (100%), ou seja, não foram observados resultados falso-positivos e falso-negativos. Os resultados indicam que o Bronopol® não interferiu na cor no momento da leitura do TAL, sugerindo que as mesmas amostras de leite poderiam ser usadas para monitorar mastite e brucelose.

Pesticide residues in strawberries cultivated in the state of Rio Grande do Sul, Brazil / Resíduos de agrotóxicos em morangos produzidos no estado do Rio Grande do Sul, Brasil

ABSTRACT: Strawberries are of high social and economic importance and the crop is mainly produced at small family enterprises. Strawberries are repetitively amongst products in which unauthorized pesticide residues are determined. The PARA program launched in Brazil by ANVISA has disclosed that many samples have residues above the maximum residue limit (MRL). The present study appraised the pesticide residues detected in strawberries produced in the state of Rio Grande do Sul and marketed at the CEASA / RS. Along the harvesting seasons of 2018 and 2019, 62 strawberry samples were collected at the CEASA-pavilion destined for growers from the state of Rio Grande do Sul. Each sample was tested for 238 active ingredients of pesticides. Of the 62 samples retrieved, 40% were considered satisfactory and 60% resulted as unsatisfactory. Of the 25 satisfactory samples, three samples did not present any residues, and 22 had residues below the MRL. Of the 37 samples with an unsatisfactory outcome, 11 had active ingredients not allowed (NA) for use on strawberries, 13 presented active ingredients above the MRL and 13 reports presented the sum of both: residues above the MRL and NA. Thirty five different active ingredients were detected in the samples summing up to a total of 303 detection events. The active ingredients detected most frequently were procymidone (66.13%); carbendazim (53.22%) and difenoconazole (50%).

RESUMO: A cultura do morangueiro tem grande participação econômica e social no estado do Rio Grande do Sul, especialmente devido a sua importância na agricultura familiar. No entanto, o morango está constantemente entre as principais culturas com resíduos de agrotóxicos não autorizados ou acima do limite máximo de resíduos no principal Programa de Análise de Resíduos de Agrotóxicos em Alimentos (PARA) do Brasil. O presente estudo teve por objetivo avaliar os resíduos de agrotóxicos encontrados em morangos produzidos no estado do Rio Grande do Sul comercializados na CEASA/RS. Nos anos de 2018 e 2019 foram coletadas 62 amostras de morangos no pavilhão destinado aos produtores gaúchos desta central de abastecimento. Cada amostra foi analisada para presença de 238 ingredientes ativos de agrotóxicos. Das 62 amostras, 40% foram consideradas satisfatórias e 60% apresentaram resultado insatisfatório. Das 25 amostras satisfatórias, três amostras não continham resíduos de agrotóxicos e 22 apresentaram resíduos abaixo do limite máximo de resíduos (LMR) estipulado pela ANVISA. Dos 37 casos de amostras insatisfatórias, 11 foram por ingrediente ativo não permitido para a cultura (NPC), 13 por ingrediente ativo acima do LMR e 13 laudos apresentaram o somatório de resíduos acima do LMR e NPC. Foram encontrados 35 diferentes ingredientes ativos nas 62 amostras de morango, totalizando 303 eventos de detecção. Os ingredientes ativos detectados com maior frequência nas 62 amostras de morango foram procimidona (66,13%); carbendazim (53,22%) e difenoconazol (50%).

Honey as a bioindicator of environmental organochlorine insecticides contamination

Abstract Honey is a suitable matrix for the evaluation of environmental contaminants including organochlorine insecticides. The present study was conducted to evaluate residues of fifteen organochlorine insecticides in honey samples of unifloral and multifloral origins from Dir, Pakistan. Honey samples (5 g each) were extracted with GC grade organic solvents and then subjected to Rotary Evaporator till dryness. The extracts were then mixed with n-Hexane (5 ml) and purified through Column Chromatography. Purified extracts (1l each) were processed through Gas Chromatograph coupled with Electron Capture Detector (GC-ECD) for identification and quantification of the insecticides. Of the 15 insecticides tested, 46.7% were detected while 53.3% were not detected in the honey samples. Heptachlor was the most prevalent insecticide with a mean level of 0.0018 mg/kg detected in 80% of the samples followed by -HCH with a mean level of 0.0016 mg/kg detected in 71.4% of the honey samples. Honey samples from Acacia modesta Wall. were 100% positive for Heptachlor with a mean level of 0.0048 mg/kg followed by -HCH with a mean level of 0.003 mg/kg and frequency of 83.3%. Minimum levels of the tested insecticides were detected in the unifloral honey from Ziziphus jujuba Mill. Methoxychlor, Endosulfan, Endrin and metabolites of DDT were not detected in the studied honey samples. Some of the tested insecticides are banned in Pakistan but are still detected in honey samples indicating their use in the study area. The detected levels of all insecticides were below the Maximum Residue Levels (MRLs) and safe for consumers. However, the levels detected can cause mortality in insect fauna. The use of banned insecticides is one of the main factors responsible for the declining populations of important insect pollinators including honeybees.

Resumo O mel é uma matriz adequada para a avaliação de contaminantes ambientais, incluindo inseticidas organoclorados. O presente estudo foi conduzido para avaliar resíduos de 15 inseticidas organoclorados em amostras de mel de origem unifloral e multifloral de Dir, Paquistão. Amostras de mel (5 g cada) foram extraídas com solventes orgânicos de grau GC e, em seguida, submetidas ao evaporador rotativo até a secura. Os extratos foram então misturados com n-hexano (5 ml) e purificados por cromatografia em coluna. Os extratos purificados (1l cada) foram processados através de cromatógrafo gasoso acoplado a detector de captura de elétrons (GC-ECD) para identificação e quantificação dos inseticidas. Dos 15 inseticidas testados, 46,7% foram detectados enquanto 53,3% não foram detectados nas amostras de mel. O heptacloro foi o inseticida mais prevalente com um nível médio de 0,0018 mg / kg detectado em 80% das amostras, seguido por -HCH com um nível médio de 0,0016 mg / kg detectado em 71,4% das amostras de mel. Amostras de mel da parede de Acacia modesta foram 100% positivos para heptacloro com um nível médio de 0,0048 mg / kg seguido por -HCH com um nível médio de 0,003 mg / kg e frequência de 83,3%. Níveis mínimos dos inseticidas testados foram detectados no mel unifloral de Ziziphus jujuba da usina. Metoxicloro, Endosulfan, Endrin e metabólitos do DDT não foram detectados nas amostras de mel estudadas. Alguns dos inseticidas testados são proibidos no Paquistão, mas ainda são detectados em amostras de mel, indicando seu uso na área de estudo. Os níveis detectados de todos os inseticidas estavam abaixo dos Níveis Máximos de Resíduos (MRLs) e seguros para os consumidores. No entanto, os níveis detectados podem causar mortalidade na fauna de insetos. O uso de inseticidas proibidos é um dos principais fatores responsáveis pelo declínio das populações de importantes insetos polinizadores, incluindo as abelhas.

Real-time polymerase chain reaction for detection and enumeration of Staphylococcus aureus and Streptococccus agalactiae using different milk samplings

The objective of the present study was to evaluate the qPCR for detection and enumeration of Staphylococcus aureus and Streptococcus agalactiae using different milk samplings in comparison to the conventional microbiology. Four dairy herds with a history of subclinical mastitis caused by S. aureus and S. agalactiae were selected. Sampling approach included milk samples from bulk tank (BT), cow level (composite samples, CO), and mammary quarter level (MQ) from 785 lactating cows. Three consecutive monthly milk samplings were carried out, totaling 3347 MQ milk samples, 912 CO, and 12 from BT. All collected milk samples were subjected to conventional microbiology and qPCR for detection and enumeration of S. aureus and S. agalactiae. The qPCR showed 71.5% of diagnostic sensitivity for S. aureus isolated from MQ milk samples, 71.8% for CO, and 50% for BT milk samples compared with conventional microbiology methodology. Taken together, the diagnostic sensitivity for S. agalactiae isolated from MQ milk samples was 90.2, 87.7 for CO, and 90.9% for BT milk samples. In general, the qPCR methodology enabled the detection of S. aureus and S. agalactiae, regardless of the type of milk sampling. The direct use of milk samples to estimate the counting of S. aureus by qPCR demonstrated lower sensitivity than the counting of S. agalactiae, which can be explained by the pathogen infection dynamics and differences in milk sample type.

Measuring water retention in undisturbed samples of stony soils

Stony soils have been increasingly used for agriculture production; however, little is known about their hydraulic properties due to problems, such as sample deformation and hydraulic continuity between samples and suction devices when the sampling and measurements are accomplished with traditional techniques. In this study, the traditional ring sampling technique was replaced by the sampling of undisturbed soil blocks coated with paraffin wax to preserve their structure. A saturated paste of fine-grained mineral particles was used to ensure contact and hydraulic continuity between samples and suction devices (sand table and ceramic plates). This allowed us to determine 30 water retention curves for three stony soils with coarse particle contents (> 2 mm) ranging from zero to 69 %. The van Genuchten model was fitted to the measured retention data and the root mean square errors were between 0.0034 and 0.0331 m3 m­3, with no outliers or odd behavior in the retention curves. These results showed that consistent water retention curves for stony soils can be determined with the technique proposed. Fine-grained minerals sandwiched between the surface of suctions sources and sampled blocks improve hydraulic continuity between them. These techniques can be applied to determine water retention properties in structured soil samples with coarse particles where it is unfeasible to collect structured soil samples with metal sampling rings.(AU)

Assessments of some trace metals in water samples of nursery pond of Grass Carp (Ctenopharyngodon idella, Valenciennes, 1844) in Bannu Fish Hatchery of Khyber Pakhtunkhwa, Pakistan

Abstract The present investigation was aimed to examine the concentrations of trace metals including e.g copper (Cu), manganese (Mn), nickel (Ni), and zinc (Zn) in water samples collected from nursery pond of grass carp (Ctenopharyngodon idella) in Bannu Hatchery of Khyber Pakhtunkhwa during the period from April 2018 to January 2019. The temperature and pH of each water sample were measured for the whole study duration. The concentration of Copper (Cu), Manganese (Mn), Nickel (Ni), and Zinc (Zn) in collected water samples were measured in mg/liter by using Atomic Absorption Spectrophotometer. The blank and standard solutions for device calibration Standard solutions i.e., 2.0 mg, 4.0 mg, and 6.0 were used to measure the concentration of these metals in water samples to verify the measurements. The data was statistically analyzed on descriptive statistics (estimation of proportions and standard deviation) used to summarize mean concentration. The results obtained of both temperature and pH of water samples were found in ranged 10 to 36 0C and 7.0 to 8.44; whereas the size of fry stages was ranged from 4.0 to 56.0 mm in total length. The results of investigated metals found in pond water samples are in order of Zn>Mn>Ni>Cu, respectively. As optimum temperature and pH for grass carp were mostly between 15 0C and 30 0C and pH 6.5 to 8.0. It was concluded from obtained results that temperature, pH, and trace metals were found appropriate for the growth of Ctenopharyngodon idella from fry to fingerling stages, but the highest amount of zinc can cause its mortality. It is a preliminary study on grass carp culturing in Bannu fish hatchery so, it would provide useful information for model fish seed production unit in a hatchery.

Resumo A presente investigação teve como objetivo examinar as concentrações de metais traço, incluindo cobre (Cu), manganês (Mn), níquel (Ni) e zinco (Zn) em amostras de água coletadas de viveiro de carpa-capim (Ctenopharyngodon idella) em Incubatório de Bannu de Khyber Pakhtunkhwa durante o período de abril de 2018 a janeiro de 2019. A temperatura e o pH de cada amostra de água foram medidos durante todo o período do estudo. A concentração de cobre (Cu), manganês (Mn), níquel (Ni) e zinco (Zn) nas amostras de água coletadas foi medida em mg / litro usando espectrofotômetro de absorção atômica. As soluções em branco e padrão para as soluções padrão de calibração do dispositivo, ou seja, 2,0 mg, 4,0 mg e 6,0, foram usadas para medir a concentração desses metais em amostras de água para verificar as medições. Os dados foram analisados estatisticamente em estatística descritiva (estimativa de proporções e desvio padrão) usada para resumir a concentração média. Os resultados obtidos tanto de temperatura quanto de pH das amostras de água variaram de 10 a 36 0C e 7,0 a 8,44, enquanto o tamanho dos estágios de alevinos variou de 4,0 a 56,0 mm no comprimento total. Os resultados dos metais investigados encontrados em amostras de água de lagoas são da ordem de Zn > Mn > Ni > Cu, respectivamente. A temperatura e o pH ótimos para a carpa-capim foram principalmente entre 15 0C e 30 0C e pH 6,5 a 8,0. Concluiu-se, a partir dos resultados obtidos, que temperatura, pH e traços de metais foram considerados adequados para o crescimento de Ctenopharyngodon idella desde os estágios de alevinos até alevinos, mas a maior quantidade de zinco pode causar sua mortalidade. É um estudo preliminar sobre a cultura da carpa-capim em incubatório de peixes Bannu, portanto forneceria informações úteis para modelo de unidade de produção de sementes de peixes em um incubatório.

Real-time PCR quantification and histopathological findings of Mycoplasma hyopneumoniae infection in the lungs of pigs slaughtered in São Luís, Maranhão, Brazil / Quantificação por PCR em tempo real e achados histopatológicos da infecção por Mycoplasma hyopneumoniae em pulmão de suínos abatidos na cidade de São Luís, Maranhão, Brasil

ABSTRACT: Porcine enzootic pneumonia (PES), mainly caused by the bacteria Mycoplasma hyopneumoniae, is the main cause of respiratory problems in pigs. Infection by M. hyopneumoniae leads to production losses and the predisposition of affected animals to secondary infections, which may result in the condemnation of carcasses and organs due to lung lesions at the time of slaughter. The objective of the research was to evaluate the infection by M. hyopneumoniae in pigs submitted to slaughter in São Luís Island/MA, using molecular and histopathological diagnostic methods. One hundred fifty lung samples were collected from inspected (n=65) and non-inspected (n=85) slaughter pigs on São Luís Island, Maranhão, from July 2019 to August 2021. Of the 150 DNA samples collected, 121 showed an amplified product for Cyt B in the PCR assay. Thus, 121 samples were submitted to qPCR of M. hyopneumoniae, of which 44 (36.36%) showed positive results. The mean amount of bacterial load ranged from 1.20 × 101 to 7.20 × 104, with a mean of 1.73 × 104 copies. Of the reagent samples, 81.81% (36 samples) were obtained from non-inspected slaughter, while 18.18% (8 samples) were obtained from slaughterhouses. In the histopathological analysis, 44 positive qPCR samples were evaluated, of which 28 (63.63%) presented results compatible with the main inflammatory process associated with the presence of M. hyopneumoniae, that is, bronchial-associated lymphoid tissue hyperplasia (BALT). Three samples that showed the highest bacterial load (qPCR: 5.63 × 10³, 2.19 × 104 and 7.23 × 104) showed more evident lesions in this study. The microscopic findings associated with the quantifications indicated a relationship between the amount of bacterial load and the presence of microscopic lesions; higher bacterial load in lung tissue is associated with increased histopathologic staining for BALT hyperplasia. In conclusion, the results point to the circulation of the etiological agent in the sampled animals and the need for preventive measures on pig farms in Maranhão with the involvement of producers, sanitary defense and inspection agencies.

RESUMO: A pneumonia enzoótica suína (PES), causada principalmente pela bactéria Mycoplasma hyopneumoniae, é a principal causa de problemas respiratórios em suínos. A infecção por M. hyopneumoniae leva a perdas produtivas e a predisposição dos animais acometidos a infecções secundárias, o que pode resultar em condenação de carcaças e órgãos por lesões pulmonares no momento do abate. O objetivo da pesquisa foi avaliar a infecção por M. hyopneumoniae em suínos submetidos ao abate na Ilha de São Luís, por meio de métodos diagnósticos moleculares e histopatológicos. Para isso, foram coletadas 150 amostras de pulmão de suínos de abate inspecionado (n=65) e não inspecionado (n=85) na Ilha de São Luís/Maranhão, no período de julho de 2019 a agosto de 2021. Das 150 amostras de DNA coletadas, 121 apresentaram produto amplificado para Cyt B no ensaio de PCR. Assim, 121 amostras foram submetidas à qPCR de M. hyopneumoniae, das quais 44 (36,36%) apresentaram resultados positivos. A quantidade média de carga bacteriana variou de 1,20 × 101 a 7,20 × 104, com média de 1,73 × 104 cópias. Das amostras reagentes, 81,81% (36 amostras) foram obtidas de abate não inspecionado, enquanto 18,18% (8 amostras) foram obtidas em abatedouro. Na análise histopatológica, foram avaliadas 44 amostras positivas para qPCR, das quais 28 (63,63%) apresentaram resultados compatíveis com o principal processo inflamatório associado à presença de M. hyopneumoniae, ou seja, hiperplasia do tecido linfóide associado ao brônquio (BALT). Três amostras que apresentaram maior carga bacteriana (qPCR: 5,63 × 10³, 2,19 × 104 e 7,23 × 104) foram mais evidentes neste estudo. Os achados microscópicos associados às quantificações indicaram uma relação entre a quantidade de carga bacteriana e a presença de lesão microscópica; a maior carga bacteriana no tecido pulmonar está associada a maior alteração histopatológica para hiperplasia BALT. Em conclusão, os resultados obtidos sinalizam para a circulação do agente etiológico nos animais amostrados e a necessidade de medidas preventivas nas criações de suínos do estado do Maranhão com envolvimento dos produtores, órgãos de defesa sanitária e inspeção.

Cobalt availability in the soil plant and animal food chain: a study under a peri-urban environment / Disponibilidade de cobalto no solo na cadeia alimentar vegetal e animal: um estudo em ambiente periurbano

Cobalt metal is considered as an essential trace element for the animals. Present investigation was undertaken in the peri-urban area to analyze the cobalt availability in animal food chain by using different indices. Cow, buffalo and sheep samples along with forage and soil samples were collected from the three different sites of District Jhang and analyzed through atomic absorption spectrophotometer. Cobalt values differed in soil samples as 0.315-0.535 mg/kg, forages as 0.127-0.333 mg/kg and animal samples as 0.364-0.504 mg/kg. Analyzed cobalt concentration in soil, forage and animal samples was found to be deficient in concentration with respect to standard limits. Soil showed the minimum cobalt level in Z. mays while maximum concentration was examined in the forage C. decidua samples. All indices examined in this study has values lesser than 1, representing the safer limits of the cobalt concentration in these samples. Enrichment factor (0.071-0.161 mg/kg) showed the highly deficient amount of cobalt enrichment in this area. Bio-concentration factor (0.392-0.883) and pollution load index (0.035-0.059 mg/kg) values were also lesser than 1 explains that plant and soil samples are not contaminated with cobalt metal. The daily intake and health risk index ranged from 0.00019-0.00064 mg/kg/day and 0.0044-0.0150 mg/kg/day respectively. Among the animals, cobalt availability was maximum (0.0150 mg/kg/day) in the buffaloes that grazed on the C. decidua fodder. Results of this study concluded that cobalt containing fertilizers must be applied on the soil and forages. Animal feed derived from the cobalt containing supplements are supplied to the animals, to fulfill the nutritional requirements of livestock.

O metal cobalto é considerado um oligoelemento essencial para os animais. A presente investigação foi realizada na área periurbana para analisar a disponibilidade de cobalto na cadeia alimentar animal usando diferentes índices. Amostras de vacas, búfalos e ovelhas, juntamente com amostras de forragem e solo foram coletadas em três locais diferentes do Distrito Jhang e analisadas por meio de espectrofotômetro de absorção atômica. Os valores de cobalto diferiram em amostras de solo como 0,315-0,535mg/kg, forragens como 0,127-0,333 mg/kg e amostras de animais como 0,364-0,504 mg/kg. A concentração de cobalto analisada no solo, forragem e amostras de animais foi considerada deficiente em relação aos limites padrão. O solo apresentou o teor mínimo de cobalto em Z. mays enquanto a concentração máxima foi examinada nas amostras de forragem C. decidua. Todos os índices examinados neste estudo possuem valores menores que 1, representando os limites mais seguros da concentração de cobalto nestas amostras. O fator de enriquecimento (0,071-0,161 mg/kg) mostrou a quantidade altamente deficiente de enriquecimento de cobalto nesta área. Os valores do fator de bioconcentração (0,392-0,883) e do índice de carga de poluição (0,035-0,059 mg/kg) também foram menores que 1, o que explica que as amostras de plantas e solo não estão contaminadas com cobalto metálico. A ingestão diária e o índice de risco à saúde variaram de 0,00019-0,00064 mg/kg/dia e 0,0044-0,0150 mg/kg/dia, respectivamente. Entre os animais, a disponibilidade de cobalto foi máxima (0,0150 mg/kg/dia) nos búfalos que pastaram na forragem de C. decidua. Os resultados deste estudo concluíram que fertilizantes contendo cobalto devem ser aplicados no solo e nas forragens. A ração animal derivada dos suplementos contendo cobalto é fornecida aos animais, para atender às necessidades nutricionais do gado.

Ring test in milk samples preserved with Bronopol® / Teste do anel em amostras de leite conservadas com Bronopol®

This study evaluated if the milk ring test (MRT) used to the brucellosis diagnostic at dairy herd level can be done in milk samples with conservative (Bronopol®) collected to the somatic cell count (SCC) that is used to mastitis monitoring. It were analyzed 38 bulk tank milk samples (BTMS) from 19 dairy herds artisanal cheese producers and 36 BTMS from a brucellosis free dairy herd, used as negative control (NC) and positive control (PC), when was added serum from vaccinated animals. The milk samples were collected in two different bottles (with or without Bronopol®). All the 38 BTMS from artisanal cheese producers (samples with and without Bronopol®) were non-reagent to MRT, as all NC. All PC were reagent to MRT, without interference of Bronopol®. Results showed that the milk sample used to SCC presented the proportion of agreement of results in all milk samples (100%), that is, false positive and false negative results were not observed. Results indicated that Bronopol® did not interfere with the color in the time of MRT reading suggesting that the same milk samples could be used to monitoring mastitis and brucellosis.

O objetivo deste estudo foi avaliar se o teste do anel do leite (TAL), utilizado para o diagnóstico da brucelose em nível de rebanho leiteiro, pode ser realizado em amostras de leite com conservador (Bronopol®) coletado para contagem de células somáticas (CCS) que é utilizado para monitoramento de mastite. Foram analisadas 38 amostras de leite de tanques de expansão (ALTE) de 19 rebanhos leiteiros produtores de queijo artesanal e 36 ALTE de rebanho leiteiro livre de brucelose, utilizadas como controle negativo (CN) e controle positivo (CP), quando foi adicionado soro de animais vacinados. As amostras de leite foram coletadas em dois frascos diferentes (com e sem Bronopol®). Todos as 38 ALTE de produtores artesanais de queijo (amostras com e sem Bronopol®) foram não reagentes ao TAL, como todos os CN. Todos os CP foram reagentes ao TAL, sem interferência do Bronopol®. Os resultados mostraram que a amostra de leite utilizada para CCS apresentaram a proporção de concordância dos resultados em todas as amostras de leite (100%), ou seja, não foram observados resultados falso-positivos e falso-negativos. Os resultados indicam que o Bronopol® não interferiu na cor no momento da leitura do TAL, sugerindo que as mesmas amostras de leite poderiam ser usadas para monitorar mastite e brucelose.

Pesticide residues in strawberries cultivated in the state of Rio Grande do Sul, Brazil / Resíduos de agrotóxicos em morangos produzidos no estado do Rio Grande do Sul, Brasil

Strawberries are of high social and economic importance and the crop is mainly produced at small family enterprises. Strawberries are repetitively amongst products in which unauthorized pesticide residues are determined. The PARA program launched in Brazil by ANVISA has disclosed that many samples have residues above the maximum residue limit (MRL). The present study appraised the pesticide residues detected in strawberries produced in the state of Rio Grande do Sul and marketed at the CEASA / RS. Along the harvesting seasons of 2018 and 2019, 62 strawberry samples were collected at the CEASA-pavilion destined for growers from the state of Rio Grande do Sul. Each sample was tested for 238 active ingredients of pesticides. Of the 62 samples retrieved, 40% were considered satisfactory and 60% resulted as unsatisfactory. Of the 25 satisfactory samples, three samples did not present any residues, and 22 had residues below the MRL. Of the 37 samples with an unsatisfactory outcome, 11 had active ingredients not allowed (NA) for use on strawberries, 13 presented active ingredients above the MRL and 13 reports presented the sum of both: residues above the MRL and NA. Thirty five different active ingredients were detected in the samples summing up to a total of 303 detection events. The active ingredients detected most frequently were procymidone (66.13%); carbendazim (53.22%) and difenoconazole (50%).

A cultura do morangueiro tem grande participação econômica e social no estado do Rio Grande do Sul, especialmente devido a sua importância na agricultura familiar. No entanto, o morango está constantemente entre as principais culturas com resíduos de agrotóxicos não autorizados ou acima do limite máximo de resíduos no principal Programa de Análise de Resíduos de Agrotóxicos em Alimentos (PARA) do Brasil. O presente estudo teve por objetivo avaliar os resíduos de agrotóxicos encontrados em morangos produzidos no estado do Rio Grande do Sul comercializados na CEASA/RS. Nos anos de 2018 e 2019 foram coletadas 62 amostras de morangos no pavilhão destinado aos produtores gaúchos desta central de abastecimento. Cada amostra foi analisada para presença de 238 ingredientes ativos de agrotóxicos. Das 62 amostras, 40% foram consideradas satisfatórias e 60% apresentaram resultado insatisfatório. Das 25 amostras satisfatórias, três amostras não continham resíduos de agrotóxicos e 22 apresentaram resíduos abaixo do limite máximo de resíduos (LMR) estipulado pela ANVISA. Dos 37 casos de amostras insatisfatórias, 11 foram por ingrediente ativo não permitido para a cultura (NPC), 13 por ingrediente ativo acima do LMR e 13 laudos apresentaram o somatório de resíduos acima do LMR e NPC. Foram encontrados 35 diferentes ingredientes ativos nas 62 amostras de morango, totalizando 303 eventos de detecção. Os ingredientes ativos detectados com maior frequência nas 62 amostras de morango foram procimidona (66,13%); carbendazim (53,22%) e difenoconazol (50%).

Studies on parasitic prevalence in pet birds from Punjab, Pakistan

Abstract During this one year study, blood and fecal samples of doves (Zenaida asiatica), ducks (Anas platyrhynchos), pigeons (Columba livia), partridges (Alectoris chukar), turkeys (Meleagris gallopavo) and goose (Chen caerulescens) were collected to assess the parasitic prevalence in these birds. The birds were kept at Avian Conservation and Research Center, Department of Wildlife and Ecology, University of Veterinary and Animal Sciences, Lahore. All these avian species were kept in separate cages and their entire body was inspected on regularly basis to record external parasites. For internal parasites, 100 blood and 100 fecal samples for each species were analyzed. During present study, two species of ectoparasites i.e. fowl ticks (Args persicus) and mite (Dermanyssus gallinae) while 17 species of endoparasites; three from blood and 14 from fecal samples were identified. Prevalence of blood parasites was Plasmodium juxtanucleare 29.3%, Aegyptinella pullorum 15% and Leucoctoyzoon simond 13%. Parasitic species recorded from fecal samples included 6 species of nematodes viz. Syngamus trachea with parasitic prevalence of 50%, Capillaria anatis 40%, Capillaria annulata 37.5%, Heterakis gallinarum 28.3%, Ascardia galli 24% and Allodpa suctoria 2%. Similarly, two species of trematodes viz. Prosthogonimus ovatus having parasitic prevalence of 12.1% and Prosthogonimus macrorchis 9.1% were also recorded from fecal samples of the birds. Single cestode species Raillietina echinobothrida having parasitic prevalence of 27% and 3 protozoan species i.e. Eimeria maxima having prevalence 20.1%, Histomonas meleagridis 8% and Giardia lamblia 5.3% were recorded. In our recommendation, proper medication and sanitation of the birds houses and cages is recommended to avoid parasites.

Resumo Durante este estudo de um ano, amostras de sangue e fezes de pombos (Zenaida asiatica), patos (Anas platyrhynchos), pombos (Columba livia), perdizes (Alectoris chukar), perus (Meleagris gallopavo) e ganso (Chen caerulescens) foram coletados para avaliar a prevalência de parasitas nessas aves. As aves foram mantidas no Centro de Conservação e Pesquisa de Aves, Departamento de Vida Selvagem e Ecologia, Universidade de Veterinária e Ciências Animais, Lahore. Todas essas espécies de aves foram mantidas em gaiolas separadas e todo o seu corpo foi inspecionado regularmente para registrar parasitas externos. Para parasitas internos, foram analisadas 100 amostras de sangue e 100 amostras fecais de cada espécie. Durante o presente estudo, duas espécies de ectoparasitas, ou seja, carrapatos de aves (Args persicus) e ácaros (Dermanyssus gallinae), enquanto 17 espécies de endoparasitas, três de sangue e 14 de amostras fecais, foram identificadas. Os parasitas sanguíneos prevalentes foram Plasmodium juxtanucleare, 29,3%, Aegyptinella pullorum, 15%, e Leucoctoyzoon simond, 13%. As espécies parasitas registradas em amostras fecais incluíram 6 espécies de nematoides viz. Syngamus traqueia com prevalência parasitária de 50%, Capillaria anatis, 40%, Capillaria annulata, 37,5%, Heterakis gallinarum, 28,3%, Ascardia galli, 24% e Allodpa suctoria, 2%. Da mesma forma, duas espécies de trematódeos viz. Prosthogonimus ovatus com prevalência parasitária de 12,1% e Prosthogonimus macrorchis, 9,1%, também foram registrados nas amostras fecais das aves. Espécies de cestoide único Raillietina echinobothrida com prevalência parasitária de 27% e 3 espécies de protozoários, ou seja, Eimeria maxima tendo prevalência de 20,1%, Histomonas meleagridis, 8%, e Giardia lamblia, 5,3%, foram registradas. Em nossa recomendação, são indicados medicação adequada e saneamento das casas e gaiolas dos pássaros para evitar parasitas.

Short communication: psychrotrophic microorganism count in raw milk samples preserved with azidiol

The study aimed to evaluate the use of the azidiol® preservative for psychrotrophic microorganism count (PMC) in cooled raw milk. Two studies were carried out, one under controlled conditions (experiment 1) and the other under field conditions (experiment 2), in which samples of raw milk were taken with and without the use of the azidiol® preservative and analyzed at predefined times (0, 6, 12 and 24 hours -experiment 1) and at varying times (experiment 2). Analysis of variance and regression analysis using SAS were applied for data statistical analysis. Milk samples without azidiol®showed higher PMC with increasing time between sampling and analysis, while in samples preserved with azidiol®, this count remained constant. Samples of cooled raw milk intended for PMC should be collected in flasks containing the azidiol®preservative.(AU)

Soybean extracts can improve plant development

ABSTRACT: Microbial biodiversity of an environment can contribute to plant growth and increase crop yield. Plant extracts from soybean (Glycine max (L.) Merrill) were investigated on soybean plants grown after inoculation with these extracts. Soil samples were collected from two important Brazilian soybean-growing regions to produce the extracts used in the experiments. The extracts were produced with material collected from aboveground biomass and rhizosphere of soybean plants cultivated in a controlled greenhouse (phase 1). The extracts produced in phase 1 were applied in a sequential experiment (phase 2). Phase 2 was conducted to examine the plant microbiome after the microbial alteration process in the greenhouse through seed inoculation with the extracts produced previously. Samples of aboveground biomass were collected to determine root dry matter and crop yield. Bacterial 16S rRNA sequences were processed to determine the final microbial content of soybean. The inoculated treatments had lower species diversity; however, the phyla Firmicutes and Bacteroidetes were more abundant in the treatments than in the non-inoculated treatment. The soybean plant stem in the inoculated treatment also had a positive response to enrichment of the bacterial classes Betaproteobacteria, Bacilli and Flavobacteria. Inoculation affected the microbial composition of soybean plants. The alteration of microbiome changes revealed differences for crop yield between the inoculated and non-inoculated treatments, with up to 93.5 % higher crop yields per plant according to the extract applied.

Honey as a bioindicator of environmental organochlorine insecticides contamination / Mel como bioindicador de contaminação ambiental de inseticidas organoclorados

Honey is a suitable matrix for the evaluation of environmental contaminants including organochlorine insecticides. The present study was conducted to evaluate residues of fifteen organochlorine insecticides in honey samples of unifloral and multifloral origins from Dir, Pakistan. Honey samples (5 g each) were extracted with GC grade organic solvents and then subjected to Rotary Evaporator till dryness. The extracts were then mixed with n-Hexane (5 ml) and purified through Column Chromatography. Purified extracts (1μl each) were processed through Gas Chromatograph coupled with Electron Capture Detector (GC-ECD) for identification and quantification of the insecticides. Of the 15 insecticides tested, 46.7% were detected while 53.3% were not detected in the honey samples. Heptachlor was the most prevalent insecticide with a mean level of 0.0018 mg/kg detected in 80% of the samples followed by β-HCH with a mean level of 0.0016 mg/kg detected in 71.4% of the honey samples. Honey samples from Acacia modesta Wall. were 100% positive for Heptachlor with a mean level of 0.0048 mg/kg followed by β-HCH with a mean level of 0.003 mg/kg and frequency of 83.3%. Minimum levels of the tested insecticides were detected in the unifloral honey from Ziziphus jujuba Mill. Methoxychlor, Endosulfan, Endrin and metabolites of DDT were not detected in the studied honey samples. Some of the tested insecticides are banned in Pakistan but are still detected in honey samples indicating their use in the study area. The detected levels of all insecticides were below the Maximum Residue Levels (MRLs) and safe for consumers. However, the levels detected can cause mortality in insect fauna. The use of banned insecticides is one of the main factors responsible for the declining populations of important insect pollinators including honeybees.

O mel é uma matriz adequada para a avaliação de contaminantes ambientais, incluindo inseticidas organoclorados. O presente estudo foi conduzido para avaliar resíduos de 15 inseticidas organoclorados em amostras de mel de origem unifloral e multifloral de Dir, Paquistão. Amostras de mel (5 g cada) foram extraídas com solventes orgânicos de grau GC e, em seguida, submetidas ao evaporador rotativo até a secura. Os extratos foram então misturados com n-hexano (5 ml) e purificados por cromatografia em coluna. Os extratos purificados (1μl cada) foram processados através de cromatógrafo gasoso acoplado a detector de captura de elétrons (GC-ECD) para identificação e quantificação dos inseticidas. Dos 15 inseticidas testados, 46,7% foram detectados enquanto 53,3% não foram detectados nas amostras de mel. O heptacloro foi o inseticida mais prevalente com um nível médio de 0,0018 mg / kg detectado em 80% das amostras, seguido por β-HCH com um nível médio de 0,0016 mg / kg detectado em 71,4% das amostras de mel. Amostras de mel da parede de Acacia modesta foram 100% positivos para heptacloro com um nível médio de 0,0048 mg / kg seguido por β-HCH com um nível médio de 0,003 mg / kg e frequência de 83,3%. Níveis mínimos dos inseticidas testados foram detectados no mel unifloral de Ziziphus jujuba da usina. Metoxicloro, Endosulfan, Endrin e metabólitos do DDT não foram detectados nas amostras de mel estudadas. Alguns dos inseticidas testados são proibidos no Paquistão, mas ainda são detectados em amostras de mel, indicando seu uso na área de estudo. Os níveis detectados de todos os inseticidas estavam abaixo dos Níveis Máximos de Resíduos (MRLs) e seguros para os consumidores. No entanto, os níveis detectados podem causar mortalidade na fauna de insetos. O uso de inseticidas proibidos é um dos principais fatores responsáveis pelo declínio das populações de importantes insetos polinizadores, incluindo as abelhas.

Honey as a bioindicator of environmental organochlorine insecticides contamination / Mel como bioindicador de contaminação ambiental de inseticidas organoclorados

Honey is a suitable matrix for the evaluation of environmental contaminants including organochlorine insecticides. The present study was conducted to evaluate residues of fifteen organochlorine insecticides in honey samples of unifloral and multifloral origins from Dir, Pakistan. Honey samples (5 g each) were extracted with GC grade organic solvents and then subjected to Rotary Evaporator till dryness. The extracts were then mixed with n-Hexane (5 ml) and purified through Column Chromatography. Purified extracts (1μl each) were processed through Gas Chromatograph coupled with Electron Capture Detector (GC-ECD) for identification and quantification of the insecticides. Of the 15 insecticides tested, 46.7% were detected while 53.3% were not detected in the honey samples. Heptachlor was the most prevalent insecticide with a mean level of 0.0018 mg/kg detected in 80% of the samples followed by β-HCH with a mean level of 0.0016 mg/kg detected in 71.4% of the honey samples. Honey samples from Acacia modesta Wall. were 100% positive for Heptachlor with a mean level of 0.0048 mg/kg followed by β-HCH with a mean level of 0.003 mg/kg and frequency of 83.3%. Minimum levels of the tested insecticides were detected in the unifloral honey from Ziziphus jujuba Mill. Methoxychlor, Endosulfan, Endrin and metabolites of DDT were not detected in the studied honey samples. Some of the tested insecticides are banned in Pakistan but are still detected in honey samples indicating their use in the study area. The detected levels of all insecticides were below the Maximum Residue Levels (MRLs) and safe for consumers. However, the levels detected can cause mortality in insect fauna. The use of banned insecticides is one of the main factors responsible for the declining populations of important insect pollinators including honeybees.(AU)

O mel é uma matriz adequada para a avaliação de contaminantes ambientais, incluindo inseticidas organoclorados. O presente estudo foi conduzido para avaliar resíduos de 15 inseticidas organoclorados em amostras de mel de origem unifloral e multifloral de Dir, Paquistão. Amostras de mel (5 g cada) foram extraídas com solventes orgânicos de grau GC e, em seguida, submetidas ao evaporador rotativo até a secura. Os extratos foram então misturados com n-hexano (5 ml) e purificados por cromatografia em coluna. Os extratos purificados (1μl cada) foram processados através de cromatógrafo gasoso acoplado a detector de captura de elétrons (GC-ECD) para identificação e quantificação dos inseticidas. Dos 15 inseticidas testados, 46,7% foram detectados enquanto 53,3% não foram detectados nas amostras de mel. O heptacloro foi o inseticida mais prevalente com um nível médio de 0,0018 mg / kg detectado em 80% das amostras, seguido por β-HCH com um nível médio de 0,0016 mg / kg detectado em 71,4% das amostras de mel. Amostras de mel da parede de Acacia modesta foram 100% positivos para heptacloro com um nível médio de 0,0048 mg / kg seguido por β-HCH com um nível médio de 0,003 mg / kg e frequência de 83,3%. Níveis mínimos dos inseticidas testados foram detectados no mel unifloral de Ziziphus jujuba da usina. Metoxicloro, Endosulfan, Endrin e metabólitos do DDT não foram detectados nas amostras de mel estudadas. Alguns dos inseticidas testados são proibidos no Paquistão, mas ainda são detectados em amostras de mel, indicando seu uso na área de estudo. Os níveis detectados de todos os inseticidas estavam abaixo dos Níveis Máximos de Resíduos (MRLs) e seguros para os consumidores. No entanto, os níveis detectados podem causar mortalidade na fauna de insetos. O uso de inseticidas proibidos é um dos principais fatores responsáveis pelo declínio das populações de importantes insetos polinizadores, incluindo as abelhas.(AU)

Molecular detection of Mycoplasma gallisepticum in different poultry breeds of Abbottabad and Rawalpindi, Pakistan

Abstract The poultry sector in Pakistan is contributing mainly in bridging gap between demand and supply for protein. Mycoplasma gallisepticum is an emerging bacterium causing serious problems in poultry industry of Pakistan. A cross-sectional study was conducted to evaluate the M. gallisepticum load in poultry populated regions of Pakistan. Total 600 serum and 600 swab samples were collected, 200 from each broiler, layers and breeders poultry in Rawalpindi and Abbottabad districts. Serum samples were analyzed through ELISA for seroprevalence. Swabs were cultured on Freys medium followed by PCR and partial mgc2 gene sequencing. Results of seroprevalence of M. gallisepticum showed that layers (75%, n=150) are more positive as compared to breeders (70%, n=140) and broilers (50%, n=100). Typical colonies of the M. gallisepticum were observed in breeder (26.5%), followed by layer (21%) and broilers (9%). A total of 37.1% (n=42) samples were identified positive through PCR out of total 113 cultured based positive samples. A total of six M. gallisepticum isolates of current study showed 98-99 percent similarity with previously reported isolates on the basis of mgc2 gene partial sequencing. The M. gallisepticum was found highly prevalent in different poultry breads. Results of this study would add into basic data and provide a direction for livestock sector to strengthen a control strategy for mycoplasmosis in poultry farms.

Resumo O setor avícola do Paquistão está contribuindo principalmente para preencher a lacuna entre a demanda e a oferta de proteína. Mycoplasma gallisepticum é uma bactéria emergente que causa sérios problemas na indústria avícola do Paquistão. Um estudo transversal foi conduzido para avaliar a carga de M. gallisepticum em regiões de avicultura do Paquistão. Um total de 600 amostras de soro e 600 amostras de esfregaço foi coletado, 200 de cada frango de corte, poedeiras e aves reprodutoras nos distritos de Rawalpindi e Abbottabad. Amostras de soro foram analisadas por ELISA para soroprevalência. As zaragatoas foram cultivadas em meio Frey, seguido de PCR e sequenciação parcial do gene mgc2. Os resultados da soroprevalência de M. gallisepticum mostraram que as poedeiras (75%, n = 150) são mais positivas em comparação com matrizes (70%, n = 140) e frangos de corte (50%, n = 100). Colônias típicas de M. gallisepticum foram observadas em reprodutoras (26,5%), seguidas de poedeiras (21%) e frangos de corte (9%). Um total de 37,1% (n = 42) das amostras foi identificado como positivas por PCR de um total de 113 amostras positivas baseadas em cultura. Um total de seis isolados de M. gallisepticum do estudo atual mostrou 98-99% de similaridade com isolados relatados anteriormente com base no sequenciamento parcial do gene mgc2. O M. gallisepticum foi encontrado com alta prevalência em diferentes pães de aves. Os resultados deste estudo acrescentariam dados básicos e forneceriam orientação para o setor pecuário fortalecer uma estratégia de controle da micoplasmose em granjas avícolas.

Fixation of pfcrt chloroquine resistance alleles in Plasmodium falciparum clinical isolates collected from unrest tribal agencies of Pakistan

Abstract Plasmodium falciparum resistance to Chloroquine (CQ) is a significant cause of mortality and morbidity worldwide. There is a paucity of documented data on the prevalence of CQ-resistant mutant haplotypes of Pfcrt and Pfmdr1 genes from malaria-endemic war effected Federally Administered Tribal Areas of Pakistan. The objective of this study was to investigate the prevalence of P. falciparum CQ-resistance in this area. Clinical isolates were collected between May 2017 and May 2018 from North Waziristan and South Waziristan agencies of Federally Administrated Trial Area. Subsequently, Giemsa-stained blood smears were examined to detect Plasmodium falciparum. Extraction of malarial DNA was done from microscopy positive P. falciparum samples, and P. falciparum infections were confirmed by nested PCR (targeting Plasmodium small subunit ribosomal ribonucleic acid (ssrRNA) genes). All PCR confirmed P. falciparum samples were sequenced by pyrosequencing to find out mutation in Pfcrt gene at codon K76T and in pfmdr1 at codons N86Y, Y184F, N1042D, and D1246Y. Out of 121 microscopies positive P. falciparum cases, 109 samples were positive for P. falciparum by nested PCR. Pfcrt K76T mutation was found in 96% of isolates, Pfmdr1 N86Y mutation was observed in 20%, and 11% harboured Y184F mutation. All samples were wild type for Pfmdr1 codon N1042D and D1246Y. In the FATA, Pakistan, the frequency of resistant allele 76T remained high despite the removal of CQ. However, current findings of the study suggest complete fixation of P. falciparum CQ-resistant genotype in the study area.

Resumo A resistência do Plasmodium falciparum à cloroquina (CQ) é uma causa significativa de mortalidade e morbidade em todo o mundo. Há uma escassez de dados documentados sobre a prevalência de haplótipos mutantes CQ-resistentes dos genes Pfcrt e Pfmdr1 da guerra endêmica da malária em áreas tribais administradas pelo governo federal do Paquistão. O objetivo deste estudo foi investigar a prevalência de resistência a CQ de P. falciparum nesta área. Isolados clínicos foram coletados entre maio de 2017 e maio de 2018 nas agências do Waziristão do Norte e do Waziristão do Sul da Área de Ensaio Administrada Federalmente. Posteriormente, esfregaços de sangue corados com Giemsa foram examinados para detectar Plasmodium falciparum. A extração do DNA da malária foi feita a partir de amostras de P. falciparum positivas para microscopia, e as infecções por P. falciparum foram confirmadas por nested PCR (visando genes de ácido ribonucleico ribossômico de subunidade pequena de Plasmodium (ssrRNA)). Todas as amostras de P. falciparum confirmadas por PCR foram sequenciadas por pirosequenciamento para descobrir a mutação no gene Pfcrt no códon K76T e em pfmdr1 nos códons N86Y, Y184F, N1042D e D1246Y. De 121 microscopias de casos positivos de P. falciparum, 109 amostras foram positivas para P. falciparum por nested PCR. A mutação Pfcrt K76T foi encontrada em 96% dos isolados, a mutação Pfmdr1 N86Y foi observada em 20% e 11% abrigou a mutação Y184F. Todas as amostras eram do tipo selvagem para o códon N1042D e D1246Y de Pfmdr1. No FATA, Paquistão, a frequência do alelo resistente 76T permaneceu alta apesar da remoção de CQ. No entanto, as descobertas atuais do estudo sugerem a fixação completa do genótipo resistente a CQ de P. falciparum na área de estudo.

Molecular detection and prevalence of Rotavirus with acute gastroenteritis among the children of rural and urban areas

Abstract Rotavirus is the main infective agent of acute gastroenteritis (AGE) in children under the age of five years and causing significant morbidity as well as mortality throughout the world. The study was carried out to detect the prevalence rate, genotypes strain and risk factors of Rotavirus among the children of rural and urban areas of district Bannu Khyber Pakhtunkhwa Pakistan. A total of 180 stool samples were collected from children under the age of 5 years from two major hospitals of Bannu from January to December (2015). The samples were analyzed by Reverse-transcriptase Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) for the detection of Rotavirus, positive samples were further processed for genotyping (G and P type) through specific PCR. Of the total, 41 (23%) samples were positive for Rotavirus. The most prevalent G genotypes found were: G3, G8, G9 (each 29%), followed by G10 (15%), and G11 (10%). Whereas the prevalent P genotypes were: P-8 (25%), P-4 and P-10 (each 20%), P-9 (15%), followed by P-6 and P-11 (each 10%). Moreover, Rotavirus infection was more prevalent in summer (23.73%) and winter (22.7%) than spring (20%) and autumn (21.4%). Rotavirus infection exhibited high frequency in June (14%), October (8%) and November (6%). It is concluded that Rotavirus is more prevalent in children and various genotypes (G and P) of Rotavirus are present in the study area. Lack of studies, awareness and rarer testing of Rotavirus are the principal reasons of virus prevalence in district Bannu, Pakistan.

Resumo O rotavírus é o principal agente infeccioso da gastroenterite aguda (AGE) em crianças menores de 5 anos e causa de morbidade e mortalidade significativas em todo o mundo. O estudo foi realizado para detectar a taxa de prevalência, cepa de genótipos e fatores de risco de rotavírus entre as crianças de áreas rurais e urbanas do distrito de Bannu Khyber Pakhtunkhwa, Paquistão. Um total de 180 amostras de fezes foi coletada de crianças menores de 5 anos de dois grandes hospitais de Bannu de janeiro a dezembro (2015). As amostras foram analisadas por reação em cadeia da polimerase transcriptase reversa (RT-PCR) para detecção de rotavírus; as amostras positivas foram posteriormente processadas para genotipagem (tipo G e P) através de PCR específica. Do total, 41 (23%) amostras foram positivas para rotavírus. Os genótipos G mais prevalentes encontrados foram: G3, G8, G9 (cada 29%), seguidos de G10 (15%) e G11 (10%). Considerando que os genótipos P prevalentes foram: P-8 (25%), P-4 e P-10 (cada 20%), P-9 (15%), seguido por P-6 e P-11 (cada 10%). Além disso, a infecção por rotavírus foi mais prevalente no verão (23,73%) e inverno (22,7%) do que na primavera (20%) e no outono (21,4%). A infecção por rotavírus apresentou alta frequência em junho (14%), outubro (8%) e novembro (6%). Conclui-se que o rotavírus é mais prevalente em crianças e vários genótipos (G e P) do rotavírus estão presentes na área de estudo. A falta de estudos, conhecimento e testes mais raros de rotavírus são as principais razões da prevalência do vírus no distrito de Bannu, Paquistão.

Diversity of fungi obtained from bats captured in urban forest fragments in Sinop, Mato Grosso, Brazil

Abstract Bats are important for the homeostasis of ecosystems and serve as hosts of various microorganisms including bacteria, viruses, and fungi with pathogenic potential. This study aimed to isolate fungi from biological samples obtained from bats captured in the city of Sinop (state of Mato Grosso, Brazil), where large areas of deforestation exist due to urbanization and agriculture. On the basis of the flow of people and domestic animals, 48 bats were captured in eleven urban forest fragments. The samples were processed and submitted to microbiological cultures, to isolate and to identify the fungal genera. Thirty-four (70.83%) of the captured bats were positive for fungi; 18 (37.5%) and 16 (33.33%) of these bats were female and male, respectively. Penicillium sp., Scopulariopsis sp., Fusarium sp., Aspergillus sp., Alternaria sp., Cryptococcus sp., Trichosporon sp., and Candida sp., which may cause opportunistic infections, were isolated. The bat species with the highest number of fungal isolates was Molossus molossus: 21 isolates (43.8%). According to our results, bats captured in urban forest fragments in Sinop harbor pathogenic fungi, increasing the risk of opportunistic fungal infections in humans and domestic animals.

Resumo Os morcegos apresentam grande importância na homeostasia dos ecossistemas e são hospedeiros de uma rica diversidade de micro-organismos como bactérias, vírus e fungos com potencial patogênico. Portanto, este estudo visou isolar fungos presentes em amostras biológicas de morcegos na cidade de Sinop - MT, que possui grandes áreas de desmatamento devido à urbanização e agricultura. Foram capturados 48 morcegos de diferentes espécies, em onze fragmentos florestais urbanos definidos de acordo com fluxo de pessoas e animais domésticos, para obtenção de amostras biológicas. Essas amostras foram processadas e submetidas aos cultivos microbiológicos, para isolamento e identificação dos gêneros dos fungos. Dos 48 morcegos, 34 (70,83%) foram positivos para pelos menos um gênero de fungo, sendo 18 (37,5%) fêmeas e 16 (33,33%) machos, e os gêneros isolados a partir das amostras biológicas foram Penicillium sp., Scopulariopsis sp., Fusarium sp., Aspergillus sp., Alternaria sp., Cryptococcus sp., Trichosporon sp. e Candida sp., que podem ser causadores de infecções oportunistas. Desse total, a espécie que apresentou maior positividade para pelo menos um gênero de fungo foi Molossus molossus com 21 (43,8%). Nossos resultados demonstram que os morcegos capturados nos fragmentos florestais urbanos na cidade de Sinop - MT, podem atuar como agentes veiculadores de fungos com potencial patogênico, aumentando assim o risco de exposição e aquisição de infecções fúngicas oportunistas por pessoas e animais domésticos.

Isolation and characterization of bacteria residing in the oral, gut, and fecal samples of different pheasant species

Abstract There is a paucity of research conducted on microbial prevalence in pheasants. The microbiota of captive birds has zoonotic significance and must be characterize. Present study is therefore planned to assess the microbiota from oral, fecal and gut content of captive avian species. It will be helpful in characterization of harmful microbes. Different samples taken from oral, gut and feces of ring-necked pheasants (Phasianus colchicus), green pheasants (Phasianus versicolor), golden pheasant (Chrysolophus pictus) and silver pheasant (Lophura nycthemera). Samples were collected, diluted, and inoculated onto different agar plates (MacConkey, SS agar, MSA and nutrient agar) for cultivation of bacterial species. Colonies of E.coli, Staphylococcus spp. Brachyspira spp. and Campylobacter spp were observed based on colony morphology. Colony forming unit showed E. coli as frequently found bacteria in fecal, oral and gut contents of all the above pheasants. The overall significance difference was found among bacterial species of golden pheasants, green pheasant, ring-necked pheasant, and silver pheasants. It was concluded that E.coli is predominant isolated from heathy pheasants followed by Campylobacter, Staphylococcus and Brachyspira.

Resumo Há uma escassez de pesquisas realizadas sobre a prevalência microbiana em faisões. A microbiota de aves em cativeiro tem significado zoonótico e deve ser caracterizada. O presente estudo está, portanto, planejado para avaliar a microbiota do conteúdo oral, fecal e intestinal de espécies aviárias em cativeiro. Será útil na caracterização de micróbios nocivos. Diferentes amostras retiradas da boca, intestino e fezes de faisões de pescoço redondo (Phasianus colchicus), faisões verdes (Phasianus versicolor), faisões dourados (Chrysolophus pictus) e faisão prateado (Lophura nycthemera). As amostras foram coletadas, diluídas e inoculadas em diferentes placas de ágar (MacConkey, ágar SS, MSA e ágar nutriente) para o cultivo de espécies bacterianas. Colônias de E. coli, Staphylococcus spp., Brachyspira spp. e Campylobacter spp foram observados com base na morfologia da colônia. A unidade formadora de colônia mostrou E. coli como bactéria frequentemente encontrada no conteúdo fecal, oral e intestinal de todos os faisões acima. A diferença de significância geral foi encontrada entre as espécies bacterianas de faisões dourados, faisões verdes, faisões de pescoço anelado e faisões prateados. Verificou-se que a E.coli é predominantemente isolada de faisões saudáveis, seguida por Campylobacter, Staphylococcus e Brachyspira.