Molecular identification of native oysters on the coast of Maranhão, Brazil / Identificação molecular de ostras nativas na costa do Maranhão, Brasil
Lopes, Rodolf Gabriel Prazeres Silva; Antonio, Ícaro Gomes; Tchaika, Lígia; Barros, Maria Claudene; Fraga, Elmary.
B. Inst. Pesca;
44(4): e377-e377, Oct.-Dec. 2018. ilus, tab
Artigo
em Inglês
| VETINDEX
| ID: vti-735235
Resumo
Oysters are found along the whole coast of Brazil. The phenotypes of the species vary considerably according to the characteristics of the habitat. The present study investigated the existence of different oyster species of the genus Crassostrea on the coast of Maranhão, using the Multiplex PCR technique and DNA Barcoding. The results of the Multiplex PCR revealed two distinct bands characteristic of the species C. gasar and C. rhizophorae in a total of 135 samples analyzed. The sequencing of the COI gene of 98 samples produced a 695 bp fragment and 15 haplotypes for C. gasar and 640 bp and eight haplotypes for C. rhizophorae. The haplotype tree divided the two species clearly into different clades with 100% bootstrap support. Intraspecific genetic divergence was 0.2% in both species, while interspecific divergence was 23.6%. The similarity between the sequences generated and those available in BoldSystems ranged from 97.01% to 98.37% for C. rhizophorae and from 97.55% to 99.84% for both C. gasar and C. brasiliana, reinforcing the taxonomic problems in this group, which supports the synonymization of these species. The DNA barcoding permitted the reliable identification of the samples and confirmed the existence of two species of oyster in the study area.(AU)As ostras são encontradas ao longo de toda a costa do Brasil. Os fenótipos das espécies variam consideravelmente de acordo com as características do habitat. O presente estudo investigou a existência de diferentes espécies de ostra do gênero Crassostrea no litoral do Maranhão, utilizando a técnica de PCR Multiplex e DNA barcoding. Os resultados da PCR Multiplex revelaram duas bandas distintas, características das espécies C. gasar e C. rhizophorae num total de 135 amostras analisadas. No sequenciamento do gene COI de 98 amostras obteve-se fragmentos de 695 pb e 15 haplótipos para C. gasar e de 640 pb e oito haplótipos para C. rhizophorae. A árvore haplótipica agrupou fortemente as duas espécies em clados diferentes com 100% de bootstrap. Divergências intraespecíficas foram de 0,2% para ambas, e a interespecífica de 23,6%. A similaridade das sequencias deste estudo com sequências presentes no BoldSystems variou de 97,01 a 98,37 para C. rhizophorae e de 97,55 a 99,84 tanto para C. gasar como para C. brasiliana, reforçando uma problemática na taxonomia do grupo, que apontam para a sinonimia dessas espécies. Portanto, o DNA barcoding permitiu identificar as amostras coletadas e confirmou a existência de duas espécies de ostras.(AU)
Biblioteca responsável:
BR68.1
Localização: BR68.1
Texto completo