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Int. microbiol ; 7(3): 219-227, sept. 2004. ilus, tab
Artigo em Inglês | IBECS | ID: ibc-98766

RESUMO

Information on the structure of bacterioplankton communities is continuously increasing, while knowledge of their metabolic capabilities remains limited. In this study, the metabolic capacity of bacterioplankton was investigated, as such information is necessary to fully understand carbon cycling and other biogeochemical processes. The diversity of dominant culturable chemoorganotrophic bacteria from one estuarine and three marine environments was analyzed by random isolation of colony-forming units on solid media, taxonomical identification by partial 16S rRNA gene sequence analysis, and functional characterization of the isolates. A total of 76 16S rRNA gene sequences, representing 19 different genotypes, were obtained from the four sampling localities, including Bacillus, Pseudomonas, Pseudoalteromonas, Vibrio, and Erythrobacter as the most frequently isolated genera. The range of metabolic functions possessed by the cultured bacterial assemblages differed significantly between sites. Similarly, the percentage at each sampling station of bacteria capable of performing a specific function was significantly different for 18 of the 25 investigated metabolic functions. At two localities, the bacterial assemblages were dominated by a single genus (Pseudoalteromonas or Erythrobacter) and appeared to be functionally specialized. More than 95% of the isolates were capable of utilizing dissolved free amino acids and protein as their sole nitrogen sources, and all isolates of the specialized assemblages expressed beta-glucosidase. Furthermore, only some of the isolates were able to utilize NH4+, while up to two thirds of the isolates of the two marine sites were able to grow on NO3- (AU)


La información sobre la estructura del bacterioplancton aumenta continuamente, mientras que el conocimiento de sus capacidades metabólicas sigue siendo limitado. En este estudio se investigó la capacidad metabólica del bacterioplancton, dado que dicha información es necesaria para comprender completamente el ciclo del carbono y otros procesos biogeoquímicos. La diversidad de las bacterias quimioorganotrofas cultivables que predominaban en un ambiente de estuario y en tres ambientes marinos se estudió aislando al azar unidades formadoras de colonias en medios sólidos, realizando la identificación taxonómica por medio del análisis de secuencias de genes del 16S rRNA, y mediante la caracterización funcional de los aislados. A partir de las cuatro localidades de muestreo se obtuvieron 76 secuencias de genes del 16S rRNA, que representaban 19 genotipos diferentes. Los géneros aislados con mayor frecuencia fueron Bacillus, Pseudomonas, Pseudoalteromonas, Vibrio y Erythrobacter. El margen de las funciones metabólicas que tenían los conjuntos (assemblages) de bacterias cultivadas difería notablemente entre las distintas localidades de muestreo. De manera similar, en cada estación de muestreo el porcentaje de bacterias que podían realizar alguna función específica era muy diferente para 18 de las 25 funciones metabólicas investigadas. En dos localidades predominaba un sólo género (Pseudoalteromonas o Erythrobacter) y parecían desempeñar funciones especializadas. Más del 95% de los aislados podían utilizar como única fuente de nitrógeno aminoácidos libres y proteínas disueltos, y todos los aislados de los conjuntos especializados expresaban β-glucosidasa. Además, sólo algunos de los aislados podían usar NH4+, mientras que hasta un tercio de los aislados en las dos localidades marinas podían crecer con NO3- (AU)


Assuntos
Plâncton/microbiologia , Bactérias/isolamento & purificação , beta-Glucosidase/isolamento & purificação , Poluição de Estuários/análise , Técnicas de Cultura de Células , Microbiologia da Água
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