Síndrome de apnea obstructiva del sueño y HLA en el norte de Portugal / Obstructive sleep apnoea syndrome and HLA in the North of Portugal

Introducción. El síndrome de apnea obstructiva del sueño (SAOS) es una enfermedad frecuente, compleja y poligénica, con diversas etiologías que interaccionan originando un fenotipo único. El SAOS puede ocurrir a cualquier edad del individuo y se presume la existencia de agregación familiar. Han sido descritos diversos factores de predisposición, como la edad, el sexo y la obesidad. La relación entre los polimorfismos del antígeno leucocitario humano (HLA) y trastornos del sueño está confirmada, tanto en poblaciones europeas como no europeas. No obstante, las relaciones descritas entre los alelos HLA y SAOS no han sido coherentes y carecen de valor informativo para la clasificación del trastorno del sueño. Objetivo. Explorar la asociación genética del HLA con el SAOS en una población del norte de Portugal y evaluar el papel de la obesidad en el contexto del HLA en el SAOS. Pacientes y métodos. Se estudió una cohorte de 131 pacientes con SAOS. Los pacientes fueron atendidos en una clínica del sueño ambulatoria donde se valoraron los antecedentes clínicos, se les practicó una polisomnografía nocturna, una prueba de latencia múltiple del sueño (si lo exigió el diagnóstico diferencial), analíticas y estudios demográficos. A efectos comparativos, se utilizó una población de control de 223 personas sanas. Se efectuó el genotipado del HLA-DRB1 con la reacción en cadena de la polimerasa mediante cebadores de secuencia específica. Resultados. En esta cohorte, el alelo HLA-DRB1*03 fue identificado como un factor de predisposición para el SAOS (24% del SAOS frente a 15% de la población de control; p = 0,025; odds ratio = 1,861; intervalo de confianza al 95% = 1,081-3,205). No hubo diferencias significativas en lo referente a otros alelos HLA-DBR1*. Conclusión. El HLA-DRB1*03 es un factor de predisposición para el SAOS en la población portuguesa

Introduction. The obstructive sleep apnoea syndrome (OSAS) is a common, complex and polygenic disease with diverse aetiologies interacting to produce a single phenotype. OSAS occurs throughout the entire lifespan and familial aggregation has been suggested. Several predisposing factors, as age, gender and obesity have been described. Associations between HLA polymorphisms and sleep disorders are confirmed, in European and Non-European descendent populations. However the associations found between HLA alleles and OSAS have not been consistent and have no informative value for sleep disorder classification. Aims. To explore the genetic association of HLA with OSAS in a northern Portuguese population and to evaluate the role of obesity in the context of HLA in OSAS. Patients and methods. A cohort of 131 patients with OSAS was studied. Patients followed up in an Outpatient Sleep Clinic were assessed by clinical history, night sleep polygraphic recording, multiple sleep latency test (when necessary for differential diagnosis), laboratorial and demographic studies. A control population (CP) of 223 healthy individuals was used for comparison. HLA-DRB1 genotyping was performed using a polymerase chain reaction with sequence specific primers methodology. Results. In this cohort, the HLA-DRB1*03 allele was identified as a susceptibility factor for OSAS (24% OSAS vs. 15% CP; p = 0.025; odds ratio = 1.861; 95% CI = 1.081-3.205). No significant differences were found for other HLA-DBR1* alleles. Conclusion. HLA-DRB1*03 is a susceptibility factor for OSAS in Portuguese population

A 50-gene signature is a novel scoring system for tumor-infiltrating immune cells with strong correlation with clinical outcome of stage I/II non-small cell lung cancer

Purpose: To identify a novel system for scoring intratumoral immune response that can improve prognosis and therapy decisions in early stage non-small cell lung cancer (NSCLC). Methods/patients: Eighty-four completely resected stage I/II NSCLC without adjuvant therapy were classified by expression profiling using whole genome microarrays. An external cohort of 162 tumors was used to validate the results. Immune cells present in tumor microenvironment were evaluated semiquantitatively by CD20, CD79, CD3, CD8, CD4 and CD57 immunostaining. Univariate and multivariate analyses of variables associated with recurrence-free survival were performed. Results: Initial molecular classification identified three clusters, one with significantly better RFS. A reduced two-subgroup classification and a 50-gene predictor were built and validated in an external dataset: high and low risk of recurrence patients (HR = 3.44; p = 0.001). Analysis of the predictor´s genes showed that the vast majority were related to a B/plasma cell immune response overexpressed in the low-risk subgroup. The predictor includes genes coding for unique B lineage-specific genes, functional elements or other genes that, although non-restricted to this lineage, have strong influence on B-cell homeostasis. Immunostains confirmed increased B-cells in the low-risk subgroup. Gene signature (p < 0.0001) and CD20 (p < 0.05) were predictors for RFS, while CD79 and K-RAS mutations showed a tendency. Conclusions: Favorable prognosis in completely resected NSCLC is determined by a B-cell-mediated immune response. It can be differently scored by a 50-gene expression profile or by CD20 immunostaining. That prognosis information not reflected by traditional classifications may become a new tool for determining individualized adjuvant therapies (AU)

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HLA Alleles and Dengue Virus Infection in Venezuelan Patients: A Preliminary Study

En áreas endémicas, una pequeña proporción de individuos infectados con el virus dengue desarrollan la fiebre hemorrágica del dengue (FHD),sugiriendo la existencia de factores de resistencia que pudiesen estar jugando un papel importante en el huésped. Este trabajo describe la frecuencia dealelos HLA clase I y II en pacientes con dengue y su relación con las manifestaciones clínicas de la enfermedad. El análisis de la frecuencia de especificidades HLA en los pacientes con dengue mostró frecuencias disminuidas de los alelos B*15, B*49, DRB1*02 y DRB1*03 y frecuencias incrementadas de los alelos B*57 y DRB1*15 comparado con los controles. Cuando lospacientes fueron agrupados y comparados de acuerdo a la severidad de laenfermedad, se observó una susceptibilidad incrementada a la fiebre del dengue clásico (FD) en pacientes con B*57, una susceptibilidad disminuida aldesarrollo de la FHD en pacientes A*03 y una susceptibilidad incrementada al desarrollo de la FHD en pacientes con B*40. Aunque las asociacionesobservadas proceden de un estudio poblacional caso-control relativamentepequeño y que después de la corrección por múltiples comparaciones se mantuvo únicamente la asociación con DRB1*15, los datos confirman que posiblemente los alelos HLA pueden jugar un papel en la susceptibilidad y/oresistencia a la infección por virus dengue y al desarrollo de la FHD (AU)

In endemic areas, a small proportion of individuals infected with dengue virus develop dengue hemorrhagic fever (DHF) suggesting that theremay be host specific resistance factors playing an important role. Thiswork describes the frequency of HLA class I and class II alleles in patientswith dengue and the relationship with the clinical manifestations of thedisease. The analysis of the frequency of HLA specificities in the dengue patients revealed reduced frequencies of B*15, B*49, DRB1*02 andDRB1*03 and increased frequencies of B*57 and DRB1*15 compared withcontrols. When the patients were grouped and compared according todisease severity, an association with enhanced susceptibility to denguefever (DF) in patients with B*57, an association with reduced susceptibility to DHF in patients with A*03, and an association with enhanced susceptibility to DHF in patients with B*40 was observed. Although the associations revealed in this study come from a very small case-control population and that after correction for multiple testing only the associationwith DRB1*15 is maintained, the data suggest that the HLA alleles canpossibly play a role in the susceptibility and/or resistance to dengue virusinfection and development of DHF (AU)

Teoría de unión al HLA clase II: teoría de probabilidad, combinatoria y entropía aplicadas a secuencias peptídicas / Binding to class ii hla theory: Probability, combinatory and entropy applied to peptide sequences

La presentación de péptidos antigénicos por las moléculas de histocompatibilidad a los receptores T es fundamental en la especificidad y la variabilidad de la defensa por parte del sistema inmune, por lo tanto un entendimiento físico y matemático de este fenómeno es de vital importancia para el diseño de vacunas. Se calcularon valores de probabilidad, combinatoria y entropía de 100secuencias específicas de péptidos teóricos, promiscuos, sintéticos y naturales que se unen a moléculas de HLA clase II y 61 péptidos que no se unen. Estos valores se usaron para diferenciar los péptidos seleccionados y desarrollar una caracterización física y matemática, objetiva y reproducible para el fenómeno de unión. Se desarrolló una predicción teórica del conjunto apropiado de secuencias que debe tener un péptido para que sea presentado por la molécula de HLA clase II, acertando en todos los casos. La teoría desarrollada facilita el proceso de selección de los péptidos requeridos en el diseño de vacunas sintéticas o naturales (AU)

The antigenic peptide presentation by the histocompatibility molecules to the T receptors is fundamental in the specificity and variability of the host defense by the immune system, therefore a physical and mathematical understanding of this phenomenon is of vital importance for the design of vaccines. Values of probability, combinatory and entropy from 100 specific sequences of theoretical, promiscuous, synthetic and natural peptides that bind to HLA class II molecules, as well as 61 peptides that do not bind were calculated. These values were used to differentiate the selected peptides and to develop an objective and reproducible physical and mathematical characterization of the binding phenomena. A theoretical prediction of the appropriate group of sequences that a peptide should have so that it is presented by the HLA class II molecule was developed, hitting all the cases. The developed theory facilitates the process of peptide selection required in the design of synthetic or natural vaccines (AU)

Los nuevos conocimientos sobre las moléculas HLA de clase II y una mejor asignación de los órganos para trasplante / New knowledge on class II HLA molecules and a better system for organ allocation

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Genes y espondiloartropatías / Genes and spondylarthropaties

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