Unraveling the stereochemical and dynamic aspects of the catalytic site of bacterial peptidyl-tRNA hydrolase.

Kabra, Ashish; Shahid, Salman; Pal, Ravi Kant; Yadav, Rahul; Pulavarti, S V S Rama Krishna; Jain, Anupam; Tripathi, Sarita; Arora, Ashish

Kabra, Ashish; Shahid, Salman; Pal, Ravi Kant; Yadav, Rahul; Pulavarti, S V S Rama Krishna; Jain, Anupam; Tripathi, Sarita; Arora, Ashish.

Afiliação

Kabra A; Molecular and Structural Biology Division, CSIR-Central Drug Research Institute, Lucknow 226031, India.
Shahid S; Molecular and Structural Biology Division, CSIR-Central Drug Research Institute, Lucknow 226031, India.
Pal RK; Academy of Scientific and Innovative Research, New Delhi 110025, India.
Yadav R; X-ray Crystallography Facility, National Institute of Immunology, New Delhi 110067, India.
Pulavarti SV; Molecular and Structural Biology Division, CSIR-Central Drug Research Institute, Lucknow 226031, India.
Jain A; Molecular and Structural Biology Division, CSIR-Central Drug Research Institute, Lucknow 226031, India.
Tripathi S; Molecular and Structural Biology Division, CSIR-Central Drug Research Institute, Lucknow 226031, India.
Arora A; Molecular and Structural Biology Division, CSIR-Central Drug Research Institute, Lucknow 226031, India.

RNA ; 23(2): 202-216, 2017 02.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-28096445

Assuntos

Proteínas de Bactérias/química; Hidrolases de Éster Carboxílico/química; Aminoacil-RNA de Transferência/química; Vibrio cholerae/química; Motivos de Aminoácidos; Proteínas de Bactérias/genética; Proteínas de Bactérias/metabolismo; Biocatálise; Hidrolases de Éster Carboxílico/genética; Hidrolases de Éster Carboxílico/metabolismo; Domínio Catalítico; Clonagem Molecular; Cristalografia por Raios X; Estabilidade Enzimática; Escherichia coli/genética; Escherichia coli/metabolismo; Expressão Gênica; Cinética; Simulação de Dinâmica Molecular; Ligação Proteica; Conformação Proteica em alfa-Hélice; Conformação Proteica em Folha beta; Domínios e Motivos de Interação entre Proteínas; Aminoacil-RNA de Transferência/metabolismo; Proteínas Recombinantes/química; Proteínas Recombinantes/genética; Proteínas Recombinantes/metabolismo; Especificidade por Substrato; Termodinâmica; Vibrio cholerae/enzimologia

Palavras-chave

MD simulations; catalytic mechanism; peptidyl-tRNA hydrolase; protein structure; relaxation dynamics; thermostability

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Proteínas de Bactérias / Vibrio cholerae / Hidrolases de Éster Carboxílico / Aminoacil-RNA de Transferência Idioma: En Revista: RNA Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article País de afiliação: Índia País de publicação: Estados Unidos

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