A new parallel pipeline for DNA methylation analysis of long reads datasets.

Olanda, Ricardo; Pérez, Mariano; Orduña, Juan M; Tárraga, Joaquín; Dopazo, Joaquín

Olanda, Ricardo; Pérez, Mariano; Orduña, Juan M; Tárraga, Joaquín; Dopazo, Joaquín.

Afiliação

Olanda R; Departamento de Informática, Universidad de Valencia, Avda. Universidad, s/n, Burjassot Valencia, Spain.
Pérez M; Departamento de Informática, Universidad de Valencia, Avda. Universidad, s/n, Burjassot Valencia, Spain.
Orduña JM; Departamento de Informática, Universidad de Valencia, Avda. Universidad, s/n, Burjassot Valencia, Spain. Juan.Orduna@uv.es.
Tárraga J; Department of Computational Genomics, Centro de Investigación Príncipe Felipe, Eduardo Primo Yúfera, s/n, Valencia, Spain.
Dopazo J; Department of Computational Genomics, Centro de Investigación Príncipe Felipe, Eduardo Primo Yúfera, s/n, Valencia, Spain.

BMC Bioinformatics ; 18(1): 161, 2017 Mar 09.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-28274198

Assuntos

Metilação de DNA; Bases de Dados Genéticas; Software; Epigênese Genética; Regulação da Expressão Gênica; Genoma Humano; Humanos; Mutação; Sensibilidade e Especificidade; Alinhamento de Sequência; Análise de Sequência de DNA

Palavras-chave

DNA methylation; High performance computing; Parallel pipeline

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Software / Metilação de DNA / Bases de Dados Genéticas Tipo de estudo: Diagnostic_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Assunto da revista: INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article País de afiliação: Espanha País de publicação: Reino Unido

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