Identifying gene expression programs of cell-type identity and cellular activity with single-cell RNA-Seq.

Kotliar, Dylan; Veres, Adrian; Nagy, M Aurel; Tabrizi, Shervin; Hodis, Eran; Melton, Douglas A; Sabeti, Pardis C

Kotliar, Dylan; Veres, Adrian; Nagy, M Aurel; Tabrizi, Shervin; Hodis, Eran; Melton, Douglas A; Sabeti, Pardis C.

Afiliação

Kotliar D; Department of Systems Biology, Harvard Medical School, Boston, United States.
Veres A; Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, United States.
Nagy MA; Harvard-MIT Division of Health Sciences and Technology, Massachusetts Institute of Technology, Cambridge, United States.
Tabrizi S; Department of Systems Biology, Harvard Medical School, Boston, United States.
Hodis E; Harvard-MIT Division of Health Sciences and Technology, Massachusetts Institute of Technology, Cambridge, United States.
Melton DA; Harvard Stem Cell Institute, Harvard University, Cambridge, United States.
Sabeti PC; Harvard-MIT Division of Health Sciences and Technology, Massachusetts Institute of Technology, Cambridge, United States.

Elife ; 82019 07 08.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31282856

Assuntos

Encéfalo/metabolismo; Perfilação da Expressão Gênica/métodos; RNA-Seq/métodos; Análise de Célula Única/métodos; Córtex Visual/metabolismo; Algoritmos; Animais; Encéfalo/citologia; Simulação por Computador; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Humanos; Camundongos; Modelos Genéticos; Organoides/citologia; Organoides/metabolismo; Reprodutibilidade dos Testes; Córtex Visual/citologia

Palavras-chave

brain organoids; computational biology; gene expression programs; genetics; genomics; human; matrix factorization; mouse; single-cell Rna-Seq; synaptogenesis; systems biology; visual cortex

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Córtex Visual / Encéfalo / Perfilação da Expressão Gênica / Análise de Célula Única / RNA-Seq Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Animals / Humans Idioma: En Revista: Elife Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos País de publicação: Reino Unido

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