Resumo
Anti-Müllerian Hormone (AMH) is a protein expressed in the gonads and related to ovarian follicular development. The aim of this study was to investigate the presence of polymorphisms in the AMH gene in a Nelore herd to analyze the genetic constitution of this population and to perform association studies with early pregnancy occurrence (EPO) and age at first calving (AFC). Phenotypic data consisted of verification of early pregnancy and age at first calving of 197 unrelated heifers exposed to the mating season and aged between 15 and 17 months (precocious group) and 24 months (non-precocious group). The precocious group consisted of 67 heifers with age at first calving of 26.5 ± 0.59 months, and the non-precocious group was composed of 130 heifers with age at first calving of 36.4 ± 0.99 months. All five exons of the AMH gene were amplified by Polymerase Chain Reaction (PCR) and sequenced. A total of three SNPs were identified in this study, all of them located in exon 5 (rs527023314, rs722016629, and rs134387246), the latter one positioned in the stop codon. All three SNPs identified in exon 5 characterized synonymous mutations. Only SNP rs134387246 exhibited a significant value (P ≤ 0.10) for EPO and AFC. The association study of SNP rs134387246 revealed an over-dominance effect (P = 0.056), and no additive effect was observed (P = 0.67). A reduction of 2.5 months (75 days) in the age at first calving of heterozygous heifers for the SNP rs134387246 was observed. For the first time, polymorphisms of the AMH gene were described in Nelore heifers and associated with sexual precocity traits.
O hormônio Anti-Mülleriano (AMH) é uma proteína expressa nas gônadas e está relacionada ao desenvolvimento folicular ovariano. O objetivo desse trabalho foi investigar a presença de polimorfismos do gene AMH em um rebanho Nelore, analisar a constituição genética da população para o gene e estudar a associação entre os polimorfismos e as características ocorrência de prenhez precoce (OPP) e idade ao primeiro parto (IPP). Os dados fenotípicos consistiram da verificação da prenhez precoce e idade ao primeiro parto de 197 novilhas, não aparentadas, expostas à estação de monta com idade entre 15 e 17 meses (grupo precoce) ou 24 meses (grupo não precoce). O grupo denominado precoce foi composto por 67 novilhas com idade ao primeiro parto de 26.5±0.59 meses, e o segundo denominado não precoce composto por 130 novilhas com idade ao primeiro parto de 36.4±0.99 meses. Os cinco éxons do gene AMH foram amplificados por meio da técnica de Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) e sequenciados. Um total de três SNPs foram identificados nesse estudo, todos localizados no éxon 5 (rs527023314, rs722016629 and rs134387246), sendo o último posicionado stop codon. Os três SNPs identificados caracterizaram mutações sinônimas. Somente o SNP rs134387246 exibiu associação significante (P ≤ 0.10) para ambas características (OPP e IPP). O estudo de associação do SNP rs134387246 revelou um efeito de sobre dominância (P=0,056), e ausência de ação gênica aditiva (P=0,67). Foi observada redução de 2,5 meses (75 dias) na idade ao primeiro parto de novilhas heterozigotas para o SNP rs134387246. Pela primeira vez na literatura, polimorfismos do gene AMH foram descritos em novilhas da raça Nelore e associados a características indicadoras de precocidade sexual.
Assuntos
Feminino , Animais , Adulto Jovem , Bovinos , Hormônio Antimülleriano/análise , Hormônio Antimülleriano/genética , Parto , Polimorfismo Genético , Prenhez/genética , Reprodução/genética , Reação em Cadeia da Polimerase/métodos , Reação em Cadeia da Polimerase/veterináriaResumo
Anti-Müllerian Hormone (AMH) is a protein expressed in the gonads and related to ovarian follicular development. The aim of this study was to investigate the presence of polymorphisms in the AMH gene in a Nelore herd to analyze the genetic constitution of this population and to perform association studies with early pregnancy occurrence (EPO) and age at first calving (AFC). Phenotypic data consisted of verification of early pregnancy and age at first calving of 197 unrelated heifers exposed to the mating season and aged between 15 and 17 months (precocious group) and 24 months (non-precocious group). The precocious group consisted of 67 heifers with age at first calving of 26.5 ± 0.59 months, and the non-precocious group was composed of 130 heifers with age at first calving of 36.4 ± 0.99 months. All five exons of the AMH gene were amplified by Polymerase Chain Reaction (PCR) and sequenced. A total of three SNPs were identified in this study, all of them located in exon 5 (rs527023314, rs722016629, and rs134387246), the latter one positioned in the stop codon. All three SNPs identified in exon 5 characterized synonymous mutations. Only SNP rs134387246 exhibited a significant value (P ≤ 0.10) for EPO and AFC. The association study of SNP rs134387246 revealed an over-dominance effect (P = 0.056), and no additive effect was observed (P = 0.67). A reduction of 2.5 months (75 days) in the age at first calving of heterozygous heifers for the SNP rs134387246 was observed. For the first time, polymorphisms of the AMH gene were described in Nelore heifers and associated with sexual precocity traits.(AU)
O hormônio Anti-Mülleriano (AMH) é uma proteína expressa nas gônadas e está relacionada ao desenvolvimento folicular ovariano. O objetivo desse trabalho foi investigar a presença de polimorfismos do gene AMH em um rebanho Nelore, analisar a constituição genética da população para o gene e estudar a associação entre os polimorfismos e as características ocorrência de prenhez precoce (OPP) e idade ao primeiro parto (IPP). Os dados fenotípicos consistiram da verificação da prenhez precoce e idade ao primeiro parto de 197 novilhas, não aparentadas, expostas à estação de monta com idade entre 15 e 17 meses (grupo precoce) ou 24 meses (grupo não precoce). O grupo denominado precoce foi composto por 67 novilhas com idade ao primeiro parto de 26.5±0.59 meses, e o segundo denominado não precoce composto por 130 novilhas com idade ao primeiro parto de 36.4±0.99 meses. Os cinco éxons do gene AMH foram amplificados por meio da técnica de Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) e sequenciados. Um total de três SNPs foram identificados nesse estudo, todos localizados no éxon 5 (rs527023314, rs722016629 and rs134387246), sendo o último posicionado stop codon. Os três SNPs identificados caracterizaram mutações sinônimas. Somente o SNP rs134387246 exibiu associação significante (P ≤ 0.10) para ambas características (OPP e IPP). O estudo de associação do SNP rs134387246 revelou um efeito de sobre dominância (P=0,056), e ausência de ação gênica aditiva (P=0,67). Foi observada redução de 2,5 meses (75 dias) na idade ao primeiro parto de novilhas heterozigotas para o SNP rs134387246. Pela primeira vez na literatura, polimorfismos do gene AMH foram descritos em novilhas da raça Nelore e associados a características indicadoras de precocidade sexual.(AU)
Assuntos
Animais , Feminino , Adulto Jovem , Bovinos , Hormônio Antimülleriano/genética , Hormônio Antimülleriano/análise , Polimorfismo Genético , Prenhez/genética , Parto , Reprodução/genética , Reação em Cadeia da Polimerase/veterinária , Reação em Cadeia da Polimerase/métodosResumo
Com o objetivo de estudar o desenvolvimento de características de carcaça obtidas por ultrassom, peso vivo, perímetro torácico e altura do posterior, dados longitudinais foram analisados por diferentes estruturas de (co)variâncias residuais que consideram homogeneidade ou heterogeneidade de (co)variâncias, para melhor representar a variabilidade entre observações e dentro de indivíduo, ao longo do tempo. As medidas foram obtidas em 120 novilhas, sendo 60 ½ Braunvieh x » Santa Gertrudes » x Nelore e 60 ½ Santa Gertrudes x ½ Nelore. As características foram avaliadas em intervalos de 28 dias, totalizando até cinco medidas em cada grupo. Foram comparados diversos modelos com o intuito de identificar estruturas de (co)variâncias residuais adequadas para melhor representar a variação das medidas dentro de indivíduos, com base no critério Schwarzs Bayesian Criterion. Posteriormente, avaliou-se o modelo mais adequado para regredir as características em função da idade, usando polinômios ordinários e verificando a necessidade de diferentes curvas para cada grupo genético. Diferentes estruturas de (co)variância residual devem ser consideradas em análise de dados longitunais, visando melhor representar a variabilidade entre observações e dentro de indivíduo. Os grupos genéticos estudados diferem entre si, ao longo do tempo, para as características peso, altura do posterior, perímetro torácico e área de olho de lombo.`ipt
The aim of this paper was to study the development of carcass traits obtained by ultrasound, weight, chest circumference and hip height by longitudinal data of two genetic groups of heifers. These data were analyzed by different structures of residual (co)variance consider homogeneity or heterogeneity of (co)variances to better represent the variability between and within individual observations over the time. The traits were obtained in 60 animals ½ Braunvieh x » Santa Gertrudes x » Nelore and 60 animals ½ Santa Gertrudes x ½ Nelore. The traits were evaluated at intervals of 28 days. The comparison was done with several models, based on the criterion SBC (Schwarzs Bayesian Criterion) with the goal of identifying structures of residual (co) variance more appropriate to best represent the variation of the measures within individuals. Later, as the animals were measured at different ages, it was evaluated the most appropriate model to regress these traits as a function of age, using ordinary polynomials and verifying the need for different curves for each genetic group. The results indicated that it should consider different structures of residual (co)variance to better represent the variability between and within individual observations. For weight, hip height, chest circumference and longissimus muscle area traits there are differences in the genetic group over the time.
Assuntos
Animais , Carne/análise , Criação de Animais Domésticos , Ovinos/classificação , UltrassonografiaResumo
Foram utilizadas 3.202 primeiras lactações de vacas da raça Holandesa de quatro fazendas da região Sudeste, para verificar a influência da estrutura de dados de produção de leite sobre os parâmetros genéticos. Foram testados quatro arquivos com diferentes estruturas: controles semanais (CS), arquivo mensal (CM), bimestral (CB) e trimestral (CT), com 122.842, 30.883, 15.837 e 12.702 controles, respectivamente. Um modelo de regressão aleatória foi empregado nas análises, considerando os efeitos genético aditivo e o de ambiente permanente de animal, como aleatórios. Os efeitos fixos, grupos de contemporâneos (GC) foram comuns para todos os arquivos de dados e foram compostos por fazenda, mês e ano do controle, além da co-variável idade da vaca ao parto (regressão linear e quadrática). As estimativas de herdabilidade apresentaram tendências mais semelhantes entre os arquivos de dados CS, CM e CB. O arquivo de dados CB apresentou estimativas de parâmetros genéticos com as mesmas tendências e magnitudes que os arquivos CS e CM, permitindo afirmar que não houve influência da estrutura dos dados sobre as estimativas dos componentes de (co)variância e que o controle leiteiro poderia ser realizado em uma estrutura CB.(AU)
A total of 3.035 lactations of Holstein cows from four farms in the Southeast, to check the influence of data structure of milk yield on the genetic parameters. Four dataset with different structures were tested, weekly controls (CW) with 122.842 controls, monthly controls (CM) 30.883, bimonthly controls (CB) with 15,837 and quarterly controls (CQ) with 12,702. The random regression model was used and was considered as random additive genetic and permanent environment effects, fixed effects of the contemporary groups (herd-year-month of test-day) and age of cow (linear and quadratic effects). Heritability estimates showed similar trends among the data files analyzed, with the greatest similarity between dataset CS, CM and CB. The dataset submitted all the CB estimates of genetic parameters analyzed with the same trend and similar magnitude to the CS and CM dataset, allowing the claim that there was no influence of the data structure on estimates of covariance components for the dataset CS, CM and CB. Thus, milk recording could be accomplished in a CB structure.(AU)
Assuntos
Animais , Feminino , Bovinos , Análise de Regressão , Perfil Genético , Leite , Análise de DadosResumo
Com o objetivo de estudar o desenvolvimento de características de carcaça obtidas por ultrassom, peso vivo, perímetro torácico e altura do posterior, dados longitudinais foram analisados por diferentes estruturas de (co)variâncias residuais que consideram homogeneidade ou heterogeneidade de (co)variâncias, para melhor representar a variabilidade entre observações e dentro de indivíduo, ao longo do tempo. As medidas foram obtidas em 120 novilhas, sendo 60 ½ Braunvieh x » Santa Gertrudes » x Nelore e 60 ½ Santa Gertrudes x ½ Nelore. As características foram avaliadas em intervalos de 28 dias, totalizando até cinco medidas em cada grupo. Foram comparados diversos modelos com o intuito de identificar estruturas de (co)variâncias residuais adequadas para melhor representar a variação das medidas dentro de indivíduos, com base no critério Schwarzs Bayesian Criterion. Posteriormente, avaliou-se o modelo mais adequado para regredir as características em função da idade, usando polinômios ordinários e verificando a necessidade de diferentes curvas para cada grupo genético. Diferentes estruturas de (co)variância residual devem ser consideradas em análise de dados longitunais, visando melhor representar a variabilidade entre observações e dentro de indivíduo. Os grupos genéticos estudados diferem entre si, ao longo do tempo, para as características peso, altura do posterior, perímetro torácico e área de olho de lombo.(AU)`ipt
The aim of this paper was to study the development of carcass traits obtained by ultrasound, weight, chest circumference and hip height by longitudinal data of two genetic groups of heifers. These data were analyzed by different structures of residual (co)variance consider homogeneity or heterogeneity of (co)variances to better represent the variability between and within individual observations over the time. The traits were obtained in 60 animals ½ Braunvieh x » Santa Gertrudes x » Nelore and 60 animals ½ Santa Gertrudes x ½ Nelore. The traits were evaluated at intervals of 28 days. The comparison was done with several models, based on the criterion SBC (Schwarzs Bayesian Criterion) with the goal of identifying structures of residual (co) variance more appropriate to best represent the variation of the measures within individuals. Later, as the animals were measured at different ages, it was evaluated the most appropriate model to regress these traits as a function of age, using ordinary polynomials and verifying the need for different curves for each genetic group. The results indicated that it should consider different structures of residual (co)variance to better represent the variability between and within individual observations. For weight, hip height, chest circumference and longissimus muscle area traits there are differences in the genetic group over the time.(AU)
Assuntos
Animais , Carne/análise , Ovinos/classificação , Criação de Animais Domésticos , UltrassonografiaResumo
Objetivou-se avaliar os efeitos das interações genótipo-ambiente sobre as estimativas de componentes de (co)variâncias e predição dos valores genéticos para o peso ao desmame de bovinos Nelore, sob enfoque bayesiano. Foram utilizados 16.644 registros de pesos ao desmame de bovinos provenientes de dez rebanhos participantes do Programa Nelore Brasil. Os parâmetros genéticos foram estimados sob modelo animal, considerando a estatística bayesiana. Para verificar o efeito da interação genótipo-ambiente, foram analisados os seguintes modelos matriciais: sem a inclusão dos efeitos de interação genótipoambiente; com a inclusão dos efeitos de interação genótipo-ambiente, em que se considerou o efeito de touro-ano, touro-rebanho e ambos os efeitos. De modo geral, verifica-se que a inclusão da interação genótipo-ambiente na análise genética para o peso ao desmame, tende a alterar as estimativas de (co)variâncias genéticas e ambientais. As correlações de Spearman entre os valores genéticos foram acima de 97%, indicando que, praticamente, não houve mudança na classificação dos animais avaliados. Pode se inferir que os efeitos de interação touro-ano e touro-rebanho não alteram as classificações dos animais, e a não-inclusão destes efeitos na avaliação genética, não afetam a seleção baseada nas predições dos valores genéticos para o peso ao desmame.
The objective was to evaluate the interactions of genotype-environment effects on the components of (co)variance estimates and the prediction of breeding values for weaning weight in Nelore cattle, using a Bayesian approach. Records of 16,644 weaning weights were used from cattle distributed in ten ranches across six Brazilian states. The genetic parameters were estimated under an animal model considering Bayesian statistics. To verify genotype-environment interaction effects, we analyzed the following matrix model: without the inclusion of genotype-environment interaction effects, and with the inclusion of genotype-environment interaction effects, which considered the effect of sire-year, sire-herd, and both effects. In general, the results suggest that the inclusion of genotype-environment interaction in genetic analysis for weight at weaning tends to alter the estimates of genetic and environment (co)variances. The Spearman correlations between the breeding values were above 97%, indicating practically no change in the classification of animals evaluated. It can be inferred that the interaction effects of sire-year and sire-herd do not change the animals rank, and if not included in the genetic evaluation, the selection based on predictions of breeding values for weaning weight will not be affected.
Assuntos
Animais , Bovinos , Desmame , Bovinos/crescimento & desenvolvimento , Meio Ambiente , GenótipoResumo
The objective was to evaluate the interactions of genotype-environment effects on the components of (co)variance estimates and the prediction of breeding values for weaning weight in Nelore cattle, using a Bayesian approach. Records of 16,644 weaning weights were used from cattle distributed in ten ranches across six Brazilian states. The genetic parameters were estimated under an animal model considering Bayesian statistics. To verify genotype-environment interaction effects, we analyzed the following matrix model: without the inclusion of genotype-environment interaction effects, and with the inclusion of genotype-environment interaction effects, which considered the effect of sire-year, sire-herd, and both effects. In general, the results suggest that the inclusion of genotype-environment interaction in genetic analysis for weight at weaning tends to alter the estimates of genetic and environment (co)variances. The Spearman correlations between the breeding values were above 97%, indicating practically no change in the classification of animals evaluated. It can be inferred that the interaction effects of sire-year and sire-herd do not change the animals rank, and if not included in the genetic evaluation, the selection based on predictions of breeding values for weaning weight will not be affected.
Objetivou-se avaliar os efeitos das interações genótipo-ambiente sobre as estimativas de componentes de (co)variâncias e predição dos valores genéticos para o peso ao desmame de bovinos Nelore, sob enfoque bayesiano. Foram utilizados 16.644 registros de pesos ao desmame de bovinos provenientes de dez rebanhos participantes do Programa Nelore Brasil. Os parâmetros genéticos foram estimados sob modelo animal, considerando a estatística bayesiana. Para verificar o efeito da interação genótipo-ambiente, foram analisados os seguintes modelos matriciais: sem a inclusão dos efeitos de interação genótipo-ambiente; com a inclusão dos efeitos de interação genótipo-ambiente, em que se considerou o efeito de touro-ano, touro-rebanho e ambos os efeitos. De modo geral, verifica-se que a inclusão da interação genótipo-ambiente na análise genética para o peso ao desmame, tende a alterar as estimativas de (co)variâncias genéticas e ambientais. As correlações de Spearman entre os valores genéticos foram acima de 97%, indicando que, praticamente, não houve mudança na classificação dos animais avaliados. Pode se inferir que os efeitos de interação touro-ano e touro-rebanho não alteram as classificações dos animais, e a não-inclusão destes efeitos na avaliação genética, não afetam a seleção baseada nas predições dos valores genéticos para o peso ao desmame.