Resumo
Several protocols to extract plant DNA exist, which can provide varying concentrations and quality of DNA due to the interaction between the protocol components and plant tissue compounds that affect the extraction, such as polyphenols and proteins. The objective of this study was to test the efficiency of different protocols for extracting DNA from apple tree leaves. Three DNA extraction protocols were tested: FastDNA® SPIN Kit - MP Biomedicals; adaptation from Qiagen DNeasy® Plant Mini Kit; adapted CTAB. Fresh and frozen young leaves of the genotypes M-10/09, SCS426 Venice and SCS427 Elenise were used. The purity and concentration of the DNA were analyzed using a spectrophotometer. The DNA extracted was tested using PCR with one primer related to regions of the genome that access transcription factors in apples (SAND). The highest concentrations of DNA were provided by the adapted CTAB protocol. Regarding purity, the adaptation from Qiagen DNeasy® Plant Mini Kit and the adapted CTAB protocols were considered satisfactory. Regarding DNA quality verified by PCR, all protocols were efficient for amplification of the target fragments. Therefore, all three protocols can be used for DNA extraction from apple leaves; however, the use of the adapted CTAB protocol showed high efficiency, due to the higher quality and concentration of DNA,with the lowest relative cost in the process of DNA extraction.(AU)
Existem diversos protocolos para a extração de DNA vegetal, que proporcionam concentrações e qualidade variáveis de DNA em função da interação entre os componentes das soluções de extração e os compostos dos tecidos vegetais interferentes, como polifenois e proteínas. O objetivo da realização do trabalho foi testar a eficiência de protocolos de extração de DNA a partir de folhas de macieira. Testou-se três protocolos de extração de DNA: Kit FastDNA® SPIN da MP Biomedicals; adaptação a partir do Mini Kit DNeasy® Plant da Qiagen; adaptação do protocolo CTAB. Foram utilizadas folhas jovens frescas e congeladas dos genótipos M-10/09, SCS426 Venice e SCS427 Elenise. A pureza e a concentração das amostras de DNA obtidas foram analisadas em espectrofotômetro. O DNA foi testado via reações de PCR com o iniciador SAND, que acessa uma região do genoma da macieira associada a um fator de transcrição. As maiores concentrações de DNA foram proporcionadas pelo protocolo CTAB adaptado. Já quanto à pureza, considerou-se satisfatório o protocolo adaptado a partir do Mini Kit DNeasy® Plant e o CTAB adaptado, enquanto que todos os protocolos foram eficientes para a amplificação dos fragmentos alvo via reações de PCR. Dessa forma, os três protocolos podem ser utilizados para a extração de DNA de macieira a partir de folhas. Contudo, com a utilização do protocolo with the lowest relative cost in the process of DNA extraction.(AU)
Resumo
Several protocols to extract plant DNA exist, which can provide varying concentrations and quality of DNA due to the interaction between the protocol components and plant tissue compounds that affect the extraction, such as polyphenols and proteins. The objective of this study was to test the efficiency of different protocols for extracting DNA from apple tree leaves. Three DNA extraction protocols were tested: FastDNA® SPIN Kit - MP Biomedicals; adaptation from Qiagen DNeasy® Plant Mini Kit; adapted CTAB. Fresh and frozen young leaves of the genotypes M-10/09, SCS426 Venice and SCS427 Elenise were used. The purity and concentration of the DNA were analyzed using a spectrophotometer. The DNA extracted was tested using PCR with one primer related to regions of the genome that access transcription factors in apples (SAND). The highest concentrations of DNA were provided by the adapted CTAB protocol. Regarding purity, the adaptation from Qiagen DNeasy® Plant Mini Kit and the adapted CTAB protocols were considered satisfactory. Regarding DNA quality verified by PCR, all protocols were efficient for amplification of the target fragments. Therefore, all three protocols can be used for DNA extraction from apple leaves; however, the use of the adapted CTAB protocol showed high efficiency, due to the higher quality and concentration of DNA,with the lowest relative cost in the process of DNA extraction.
Existem diversos protocolos para a extração de DNA vegetal, que proporcionam concentrações e qualidade variáveis de DNA em função da interação entre os componentes das soluções de extração e os compostos dos tecidos vegetais interferentes, como polifenois e proteínas. O objetivo da realização do trabalho foi testar a eficiência de protocolos de extração de DNA a partir de folhas de macieira. Testou-se três protocolos de extração de DNA: Kit FastDNA® SPIN da MP Biomedicals; adaptação a partir do Mini Kit DNeasy® Plant da Qiagen; adaptação do protocolo CTAB. Foram utilizadas folhas jovens frescas e congeladas dos genótipos M-10/09, SCS426 Venice e SCS427 Elenise. A pureza e a concentração das amostras de DNA obtidas foram analisadas em espectrofotômetro. O DNA foi testado via reações de PCR com o iniciador SAND, que acessa uma região do genoma da macieira associada a um fator de transcrição. As maiores concentrações de DNA foram proporcionadas pelo protocolo CTAB adaptado. Já quanto à pureza, considerou-se satisfatório o protocolo adaptado a partir do Mini Kit DNeasy® Plant e o CTAB adaptado, enquanto que todos os protocolos foram eficientes para a amplificação dos fragmentos alvo via reações de PCR. Dessa forma, os três protocolos podem ser utilizados para a extração de DNA de macieira a partir de folhas. Contudo, com a utilização do protocolo with the lowest relative cost in the process of DNA extraction.
Resumo
The stay-green character has been related to greater stress tolerance and yield through longer activity of the photosynthetic apparatus. Association of this character with grain yield may be linked to a network of features other than the grain mass. This study aimed to shed light on the actual contribution of stay-green character in Brazilian wheats and the associations between grain yield components in different environmental conditions. The experiment was conducted in a randomized block design with three replications in the years 2003, 2004 and 2005. Sibling lines with and without the stay-green character were evaluated analyzing the phenotypic correlation and path analysis separately by year and maturity group. Under favorable growing conditions, the contribution of stay-green character in wheat is obtained by the increased ear fertility and number of grains. In a more restrictive scenario, it favors an increase in grain mass by longer filling time at the end of the cycle.
O caráter stay-green tem sido relacionado à maior tolerância a estresses e a produtividade pela manutenção mais prolongada do aparato fotossintético. A relação deste caráter com a produtividade de grãos talvez esteja associada a uma rede de características que não somente a massa de grãos. O objetivo do estudo é trazer à luz a real contribuição do caráter stay-green em trigos brasileiros, na relação entre os caracteres definidores da produtividade de grãos, em diferentes condições de ambiente. O experimento foi conduzido em delineamento experimental de blocos casualizados com três repetições, nos anos de 2003, 2004 e 2005. Foram avaliadas linhagens-irmãs com presença e ausência do caráter stay-green, analisando a correlação fenotípica e trilha separadamente por ano e grupo de maturação. Em condições favoráveis de cultivo, a contribuição do caráter stay-green em trigo se dá pelo aumento da fertilidade de espiga, incrementando o número de grãos. Num cenário mais restritivo, favorece a massa de grãos pelo maior tempo de enchimento no final do ciclo.
Assuntos
Desenvolvimento Vegetal/fisiologia , Desenvolvimento Vegetal/genética , Fatores de Tempo , Triticum/crescimento & desenvolvimento , Estatística como Assunto , Fertilidade/genéticaResumo
The stay-green character has been related to greater stress tolerance and yield through longer activity of the photosynthetic apparatus. Association of this character with grain yield may be linked to a network of features other than the grain mass. This study aimed to shed light on the actual contribution of stay-green character in Brazilian wheats and the associations between grain yield components in different environmental conditions. The experiment was conducted in a randomized block design with three replications in the years 2003, 2004 and 2005. Sibling lines with and without the stay-green character were evaluated analyzing the phenotypic correlation and path analysis separately by year and maturity group. Under favorable growing conditions, the contribution of stay-green character in wheat is obtained by the increased ear fertility and number of grains. In a more restrictive scenario, it favors an increase in grain mass by longer filling time at the end of the cycle.(AU)
O caráter stay-green tem sido relacionado à maior tolerância a estresses e a produtividade pela manutenção mais prolongada do aparato fotossintético. A relação deste caráter com a produtividade de grãos talvez esteja associada a uma rede de características que não somente a massa de grãos. O objetivo do estudo é trazer à luz a real contribuição do caráter stay-green em trigos brasileiros, na relação entre os caracteres definidores da produtividade de grãos, em diferentes condições de ambiente. O experimento foi conduzido em delineamento experimental de blocos casualizados com três repetições, nos anos de 2003, 2004 e 2005. Foram avaliadas linhagens-irmãs com presença e ausência do caráter stay-green, analisando a correlação fenotípica e trilha separadamente por ano e grupo de maturação. Em condições favoráveis de cultivo, a contribuição do caráter stay-green em trigo se dá pelo aumento da fertilidade de espiga, incrementando o número de grãos. Num cenário mais restritivo, favorece a massa de grãos pelo maior tempo de enchimento no final do ciclo.(AU)
Assuntos
Triticum/crescimento & desenvolvimento , Fatores de Tempo , Desenvolvimento Vegetal/fisiologia , Desenvolvimento Vegetal/genética , Fertilidade/genética , Estatística como AssuntoResumo
Improvement of quality-related traits of grains is a constant concern in white oat breeding programs, which challenges breeders to understand their dynamics. The performance of different genetic combinations must be thoroughly evaluated to make high nutritional quality cultivars available. This study aimed to estimate the heterosis on F1 and F2 generations, vigor loss, due to inbreeding, and correlation between the grain chemical components to understand the dynamics of these traits, considering two segregating oat progenies. The populations Albasul × UPF 15 (population 1) and IAC 7 × UFRGS 19 (population 2) were developed. Both populations showed transgressive segregant individuals. The combination Albasul × UPF 15 provided significant heterosis for traits -glucan total and soluble fiber contents, while the population obtained by crossing IAC 7 × UFRGS 19 generated significant gain by heterosis for total fiber, insoluble fibers and non-structural carbohydrate contents. Considering the F2 average for each population, one can observe that population 1 presents higher -glucan and lipid contents than population 2. On the other hand, population 2 has higher protein content than population 1. In both populations, the non-structural carbohydrate content is strongly and negatively correlated whith protein, total and insoluble fibers. Correlations between total fibers and lipids and between total fibers and insoluble fibers were both positive and high in both populations.(AU)
Assuntos
Vigor Híbrido/genética , Avena , Padrão de Identidade e Qualidade para Produtos e Serviços , Endogamia , Hibridização GenéticaResumo
Improvement of quality-related traits of grains is a constant concern in white oat breeding programs, which challenges breeders to understand their dynamics. The performance of different genetic combinations must be thoroughly evaluated to make high nutritional quality cultivars available. This study aimed to estimate the heterosis on F1 and F2 generations, vigor loss, due to inbreeding, and correlation between the grain chemical components to understand the dynamics of these traits, considering two segregating oat progenies. The populations Albasul × UPF 15 (population 1) and IAC 7 × UFRGS 19 (population 2) were developed. Both populations showed transgressive segregant individuals. The combination Albasul × UPF 15 provided significant heterosis for traits -glucan total and soluble fiber contents, while the population obtained by crossing IAC 7 × UFRGS 19 generated significant gain by heterosis for total fiber, insoluble fibers and non-structural carbohydrate contents. Considering the F2 average for each population, one can observe that population 1 presents higher -glucan and lipid contents than population 2. On the other hand, population 2 has higher protein content than population 1. In both populations, the non-structural carbohydrate content is strongly and negatively correlated whith protein, total and insoluble fibers. Correlations between total fibers and lipids and between total fibers and insoluble fibers were both positive and high in both populations.