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1.
Semina Ci. agr. ; 38(3): 1665-1670, maio-jun. 2017. tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-14855

Resumo

Natural populations of tambaqui (Colossoma macropomum) have significantly decreased in recent decades especially due to human extraction activities. So that the environmental impact may be reduced, the restocking of fish and increase in fish production are enhanced. Genetic evaluations using molecular markers are essential for this purpose. Current study evaluates the genetic variability of two tambaqui broodstocks used in restocking programs. Sixty-five samples (33 samples from broodstock A and 32 samples from broodstock B) were collected. DNA was extracted from caudal fin samples, with the amplification of four microsatellite loci: Cm1A11 (EU685307) Cm1C8 (EU685308) Cm1F4 (EU685311) and Cm1H8 (EU685315). Fourteen alleles in the stock of broodstock A were produced, five alleles for Cm1A11 locus (230, 255, 260, 270 and 276 bp), three alleles Cm1C8 (239, 260, and 273 bp), two alleles Cm1F4 (211 and 245 bp), four alleles for Cm1H8 (275, 290, 320 and 331 bp) and two unique alleles were found for Cm1A11 loci (alleles 270 and 276 bp) and Cm1H8 (alleles 275 and 331 bp). In broodstock B, ten alleles were produced, the same alleles of the first stock except for alleles 270 and 276 bp in Cm1A11 locus and 275 and 331 bp in Cm1H8 locus. Broodstock A revealed low frequency alleles in Cm1A11 loci, Cm1C8, Cm1F4 and Cm1H8, whereas broodstock B had no locus with low allelic frequency. Loci Cm1A11, Cm1C8 and Cm1H8 exhibited significant deficit of heterozygotes in both broodstocks, revealing changes in Hardy-Weinberg equilibrium. Genetic diversity between stocks was 0.1120, whilst genetic similarity was 0.894, with FST rate = 0.05, and Nm = 3.93, indicating gene flow between the two broodstocks. Results show that broodstocks are genetically closely related, with no great genetic variability...(AU)


A população natural do tambaqui (Colossoma macropomum) está reduzindo significativamente nas últimas décadas devido às ações antrópicas, como o extrativismo. Para diminuir este impacto ambiental, o repovoamento de peixes e aumento da produção piscícola estão sendo realizados. Para tanto, avaliações genéticas por meio de marcadores moleculares são fundamentais. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética de dois estoques de reprodutores de tambaqui utilizados em programas de repovoamento. Foram coletadas 65 amostras (33 amostras do estoque A e 32 amostras do estoque B). O DNA foi extraído de amostras da nadadeira caudal, com a amplificação de quatro loci microssatélite: Cm1A11 (EU685307), Cm1C8 (EU685308), Cm1F4 (EU685311) e Cm1H8 (EU685315). Foram produzidos 14 alelos no estoque de reprodutores A, cinco alelos para o locus Cm1A11 (230, 255, 260, 270 e 276 pb), três alelos para Cm1C8 (239, 260 e 273 pb), dois alelos para Cm1F4 (211 e 245 pb), quatro alelos para Cm1H8 (275, 290, 320 e 331 pb) e dois alelos exclusivos foram encontrados para os loci Cm1A11 (alelos 270 e 276 pb) e Cm1H8 (alelos 275 e 331 pb). Para o estoque de reprodutores B foram produzidos 10 alelos, os mesmos alelos do primeiro estoque, exceto para os alelos 270 e 276 pb no locus Cm1A11 e 275 e 331 pb no locus Cm1H8. No estoque de reprodutores A foi observado alelos de baixa frequência nos loci Cm1A11, Cm1C8, Cm1F4 e Cm1H8. Já o estoque de reprodutores B não apresentou locus com baixa frequência alélica. Os loci Cm1A11, Cm1C8 e Cm1H8 exibiram significativo défict de heterozigotos em ambos os estoques de reprodutores, indicando alteração no equilíbrio de Hardy-Weinberg. A divergência genética foi de 0,1120 entre os estoques, enquanto a similaridade genética foi de 0,894, com o valor de FST igual a 0,05, e o Nm igual a 3,93 indicando fluxo gênico entre os dois estoques de reprodutores...(AU)


Assuntos
Animais , Characidae/anatomia & histologia , Characidae/genética , Variação Genética , Marcadores Genéticos
2.
Semina ciênc. agrar ; 38(3): 1665-1670, maio-jun. 2017. tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1500777

Resumo

Natural populations of tambaqui (Colossoma macropomum) have significantly decreased in recent decades especially due to human extraction activities. So that the environmental impact may be reduced, the restocking of fish and increase in fish production are enhanced. Genetic evaluations using molecular markers are essential for this purpose. Current study evaluates the genetic variability of two tambaqui broodstocks used in restocking programs. Sixty-five samples (33 samples from broodstock A and 32 samples from broodstock B) were collected. DNA was extracted from caudal fin samples, with the amplification of four microsatellite loci: Cm1A11 (EU685307) Cm1C8 (EU685308) Cm1F4 (EU685311) and Cm1H8 (EU685315). Fourteen alleles in the stock of broodstock A were produced, five alleles for Cm1A11 locus (230, 255, 260, 270 and 276 bp), three alleles Cm1C8 (239, 260, and 273 bp), two alleles Cm1F4 (211 and 245 bp), four alleles for Cm1H8 (275, 290, 320 and 331 bp) and two unique alleles were found for Cm1A11 loci (alleles 270 and 276 bp) and Cm1H8 (alleles 275 and 331 bp). In broodstock B, ten alleles were produced, the same alleles of the first stock except for alleles 270 and 276 bp in Cm1A11 locus and 275 and 331 bp in Cm1H8 locus. Broodstock A revealed low frequency alleles in Cm1A11 loci, Cm1C8, Cm1F4 and Cm1H8, whereas broodstock B had no locus with low allelic frequency. Loci Cm1A11, Cm1C8 and Cm1H8 exhibited significant deficit of heterozygotes in both broodstocks, revealing changes in Hardy-Weinberg equilibrium. Genetic diversity between stocks was 0.1120, whilst genetic similarity was 0.894, with FST rate = 0.05, and Nm = 3.93, indicating gene flow between the two broodstocks. Results show that broodstocks are genetically closely related, with no great genetic variability...


A população natural do tambaqui (Colossoma macropomum) está reduzindo significativamente nas últimas décadas devido às ações antrópicas, como o extrativismo. Para diminuir este impacto ambiental, o repovoamento de peixes e aumento da produção piscícola estão sendo realizados. Para tanto, avaliações genéticas por meio de marcadores moleculares são fundamentais. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética de dois estoques de reprodutores de tambaqui utilizados em programas de repovoamento. Foram coletadas 65 amostras (33 amostras do estoque A e 32 amostras do estoque B). O DNA foi extraído de amostras da nadadeira caudal, com a amplificação de quatro loci microssatélite: Cm1A11 (EU685307), Cm1C8 (EU685308), Cm1F4 (EU685311) e Cm1H8 (EU685315). Foram produzidos 14 alelos no estoque de reprodutores A, cinco alelos para o locus Cm1A11 (230, 255, 260, 270 e 276 pb), três alelos para Cm1C8 (239, 260 e 273 pb), dois alelos para Cm1F4 (211 e 245 pb), quatro alelos para Cm1H8 (275, 290, 320 e 331 pb) e dois alelos exclusivos foram encontrados para os loci Cm1A11 (alelos 270 e 276 pb) e Cm1H8 (alelos 275 e 331 pb). Para o estoque de reprodutores B foram produzidos 10 alelos, os mesmos alelos do primeiro estoque, exceto para os alelos 270 e 276 pb no locus Cm1A11 e 275 e 331 pb no locus Cm1H8. No estoque de reprodutores A foi observado alelos de baixa frequência nos loci Cm1A11, Cm1C8, Cm1F4 e Cm1H8. Já o estoque de reprodutores B não apresentou locus com baixa frequência alélica. Os loci Cm1A11, Cm1C8 e Cm1H8 exibiram significativo défict de heterozigotos em ambos os estoques de reprodutores, indicando alteração no equilíbrio de Hardy-Weinberg. A divergência genética foi de 0,1120 entre os estoques, enquanto a similaridade genética foi de 0,894, com o valor de FST igual a 0,05, e o Nm igual a 3,93 indicando fluxo gênico entre os dois estoques de reprodutores...


Assuntos
Animais , Characidae/anatomia & histologia , Characidae/genética , Marcadores Genéticos , Variação Genética
3.
Semina ciênc. agrar ; 37(4): 2365-2374, 2016.
Artigo em Inglês | LILACS-Express | VETINDEX | ID: biblio-1500409

Resumo

The genetic diversity of Piaractus mesopotamicus (pacu) and Leporinus elongatus (piapara) broodstocks used in restocking programs in the rivers Paraná and Paranapanema is analyzed. One hundred and twenty specimens (two broodstocks of each species) from fish ponds in Palotina PR Brazil and in Salto Grande SP Brazil were assessed. Ten primers produced 96 fragments, comprising 68 (70.83%) and 94 (97.92%) polymorphic fragments for P. mesopotamicus and L. elongatus broodstocks, respectively. Differences (p 0.05) in the frequency of 15 and 27 fragments were detected for each species, without exclusive fragments. Shannon Index (0.347 - 0.572) and the percentage of polymorphic fragments (57.3% - 94.8%) revealed high intra-population genetic variability for all broodstocks. Results of molecular variance analyses (AMOVA) showed that most variations do not lie between the broodstocks but within each broodstock (89%). Genetic (0.088 and 0.142) and identity (0.916 and 0.868) distance rates demonstrated similarity between the broodstocks of each species, corroborated by Fst (0.1023 and 010.27) and Nm (4.18 and 4.33) rates, with a slight genetic difference due to genic flux. High intrapopulation genetic variability and similarity between the broodstocks of each species was also detected, proving a common ancestry.


O objetivo da pesquisa foi analisar a diversidade genética de estoques de Pacu (Piaractus mesopotamicus) e Piapara (Leporinus elongatus) utilizados em programas de repovoamento dos rios Paraná e Paranapanema. Foram analisados 120 exemplares (dois estoques de cada espécie) de pisciculturas das cidades de Palotina (Paraná) e da cidade de Salto Grande (São Paulo). Os 10 iniciadores produziram 96 fragmentos, dos quais 68 (70,83%) e 94 (97,92%) foram polimórficos para os estoques de P. mesopotamicus e L. elongatus, respectivamente. Foram observadas diferenças (P 0,05) na frequência de 15 e 27 fragmentos para cada espécie, sem a presença de fragmentos exclusivos. Os valores do índice de Shannon (0,347 a 0,572) e da porcentagem de fragmentos polimórficos (57,3% a 94,8%) mostraram uma alta variabilidade genética intra-populacional para todos os estoques. Os resultados das análises de variância molecular (AMOVA) mostraram que a maior parte da variação está dentro de cada estoque (89%) e não entre os estoques. Os valores da distância (0,088 e 0,142) e identidade (0,916 e 0,868) genética demonstraram que existe similaridade entre os estoques de cada espécie, sendo corroborado pelos valores de Fst (0,1023 e 010,27) e Nm (4,18 e 4,33) que mostraram uma moderada diferenciação genética com presença de fluxo gênico. Foi observada alta variabilidade genética intra-populacional e similarida

4.
Semina ciênc. agrar ; 37(4): 2521-2528, 2016.
Artigo em Inglês | LILACS-Express | VETINDEX | ID: biblio-1500414

Resumo

Weight gain and morphometric growth of the genetically improved tambaqui (Colossoma macropomum) are evaluated. Current assay was carried out on the Fish Farm Experimental Station of the Federal University of Mato Grosso, in the municipality of Santo Antonio de Leverger - MT Brazil. Seven fish families from the breeding program and a control group (not genetically improved) were evaluated. All animals were individually identified with a transmitter-responder label (transponder). Weight gain, overall and standard length, head size, height, width and body perimeter were measured. A completely randomized design was used and comparisons among families and the control group were carried out by Dunnett test at 5% significance level. The genetically improved fish families showed a 14.8% higher weight gain when compared to that of control group. Five out of seven families showed greater weight gain when compared to control group, with the best family exhibiting a 24.8% higher rate. Four families had higher growth in all evaluated morphometric characteristics when compared to control group. Only one family did not differ in any of the evaluated characteristics with regard to the control group.


Objetivou-se avaliar o ganho de peso e o crescimento morfométrico do tambaqui (Colossoma macropomum) melhorado geneticamente. O trabalho foi realizado na Estação Experimental de Piscicultura da Universidade Federal de Mato Grosso, localizada no município de Santo Antônio de Leverger - MT, Brasil. Foram avaliadas sete famílias oriundas do programa de melhoramento genético e um grupo controle (não melhorado geneticamente). Todos os animais foram individualizados com transponder. Foram mensurados o ganho de peso, comprimento total e padrão, tamanho de cabeça, altura, largura e perímetro do corpo. Utilizou-se delineamento inteiramente casualizado e as comparações entre as famílias e o grupo controle foram realizadas pelo teste de Dunnett com 5% de significância. As famílias melhoradas geneticamente apresentaram ganho de peso 14,8% superior ao grupo controle. Cinco das sete famílias avaliadas apresentaram maior ganho de peso em relação ao grupo controle, sendo que a melhor família foi superior em 24,8%. Quatro famílias apresentaram maior crescimento em todas as características morfométricas avaliadas em relação ao controle. Apenas uma família não diferiu em nenhuma das características avaliadas em relação ao grupo controle.

5.
Semina Ci. agr. ; 37(4): 2521-2528, 2016.
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-470891

Resumo

Weight gain and morphometric growth of the genetically improved tambaqui (Colossoma macropomum) are evaluated. Current assay was carried out on the Fish Farm Experimental Station of the Federal University of Mato Grosso, in the municipality of Santo Antonio de Leverger - MT Brazil. Seven fish families from the breeding program and a control group (not genetically improved) were evaluated. All animals were individually identified with a transmitter-responder label (transponder). Weight gain, overall and standard length, head size, height, width and body perimeter were measured. A completely randomized design was used and comparisons among families and the control group were carried out by Dunnett test at 5% significance level. The genetically improved fish families showed a 14.8% higher weight gain when compared to that of control group. Five out of seven families showed greater weight gain when compared to control group, with the best family exhibiting a 24.8% higher rate. Four families had higher growth in all evaluated morphometric characteristics when compared to control group. Only one family did not differ in any of the evaluated characteristics with regard to the control group.


Objetivou-se avaliar o ganho de peso e o crescimento morfométrico do tambaqui (Colossoma macropomum) melhorado geneticamente. O trabalho foi realizado na Estação Experimental de Piscicultura da Universidade Federal de Mato Grosso, localizada no município de Santo Antônio de Leverger - MT, Brasil. Foram avaliadas sete famílias oriundas do programa de melhoramento genético e um grupo controle (não melhorado geneticamente). Todos os animais foram individualizados com transponder. Foram mensurados o ganho de peso, comprimento total e padrão, tamanho de cabeça, altura, largura e perímetro do corpo. Utilizou-se delineamento inteiramente casualizado e as comparações entre as famílias e o grupo controle foram realizadas pelo teste de Dunnett com 5% de significância. As famílias melhoradas geneticamente apresentaram ganho de peso 14,8% superior ao grupo controle. Cinco das sete famílias avaliadas apresentaram maior ganho de peso em relação ao grupo controle, sendo que a melhor família foi superior em 24,8%. Quatro famílias apresentaram maior crescimento em todas as características morfométricas avaliadas em relação ao controle. Apenas uma família não diferiu em nenhuma das características avaliadas em relação ao grupo controle.

6.
Semina Ci. agr. ; 37(4): 2365-2374, 2016.
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-470650

Resumo

The genetic diversity of Piaractus mesopotamicus (pacu) and Leporinus elongatus (piapara) broodstocks used in restocking programs in the rivers Paraná and Paranapanema is analyzed. One hundred and twenty specimens (two broodstocks of each species) from fish ponds in Palotina PR Brazil and in Salto Grande SP Brazil were assessed. Ten primers produced 96 fragments, comprising 68 (70.83%) and 94 (97.92%) polymorphic fragments for P. mesopotamicus and L. elongatus broodstocks, respectively. Differences (p 0.05) in the frequency of 15 and 27 fragments were detected for each species, without exclusive fragments. Shannon Index (0.347 - 0.572) and the percentage of polymorphic fragments (57.3% - 94.8%) revealed high intra-population genetic variability for all broodstocks. Results of molecular variance analyses (AMOVA) showed that most variations do not lie between the broodstocks but within each broodstock (89%). Genetic (0.088 and 0.142) and identity (0.916 and 0.868) distance rates demonstrated similarity between the broodstocks of each species, corroborated by Fst (0.1023 and 010.27) and Nm (4.18 and 4.33) rates, with a slight genetic difference due to genic flux. High intrapopulation genetic variability and similarity between the broodstocks of each species was also detected, proving a common ancestry.


O objetivo da pesquisa foi analisar a diversidade genética de estoques de Pacu (Piaractus mesopotamicus) e Piapara (Leporinus elongatus) utilizados em programas de repovoamento dos rios Paraná e Paranapanema. Foram analisados 120 exemplares (dois estoques de cada espécie) de pisciculturas das cidades de Palotina (Paraná) e da cidade de Salto Grande (São Paulo). Os 10 iniciadores produziram 96 fragmentos, dos quais 68 (70,83%) e 94 (97,92%) foram polimórficos para os estoques de P. mesopotamicus e L. elongatus, respectivamente. Foram observadas diferenças (P 0,05) na frequência de 15 e 27 fragmentos para cada espécie, sem a presença de fragmentos exclusivos. Os valores do índice de Shannon (0,347 a 0,572) e da porcentagem de fragmentos polimórficos (57,3% a 94,8%) mostraram uma alta variabilidade genética intra-populacional para todos os estoques. Os resultados das análises de variância molecular (AMOVA) mostraram que a maior parte da variação está dentro de cada estoque (89%) e não entre os estoques. Os valores da distância (0,088 e 0,142) e identidade (0,916 e 0,868) genética demonstraram que existe similaridade entre os estoques de cada espécie, sendo corroborado pelos valores de Fst (0,1023 e 010,27) e Nm (4,18 e 4,33) que mostraram uma moderada diferenciação genética com presença de fluxo gênico. Foi observada alta variabilidade genética intra-populacional e similarida

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