Pathological and Immunohistochemical Examinations in Chukar Partridge (Alectoris chukar) of Wild and Captive Population

The aim of this study was to evaluate the health situation of chukar partridges through several diagnostic methods. We investigated a total of 224 birds in eighteen populations throughout Turkey, fourteen wild and four captive. The molecular sexing method was used for gender identification. Clinically, traumatic lesions and inflammatory reactions were the most commonly observed in the eyes and extremities of the Chukar Partridges in the breeding stations. At necropsy, the most common findings were enteritis and liver lesions. At the histopathological examination, pneumonia, anthracosis, and inflammatory changes in the digestive system were among the common findings. Interestingly, liver parasites were found in wild samples. At the immunohistochemical examinations, the tissues were evaluated for Marek's disease (MD), Adenovirus, Avian mycobacteriosis (AMB), and Aspergillosis. While MD and AMB were not found in breeding stations, we determined them from wild populations. Aspergillus was found in both wild and captive populations; Adenovirus antigens were found only in breeding stations. When the captive and wild populations were evaluated together, MD 1.3%, AMB 0.9%, Aspergillosis 1.3%, Adenovirus 1.8% were found. The relation between sex and diseases was also examined. As a result, the data of this study showed that chukar partridges from both breeding stations and wild populations are not an important source of diseases, but especially released partridges from breeding stations may carry some microorganisms. For that reason, captive populations should be regularly monitored for contagious diseases.(AU)

Hepatitis C virus genotype diversity in Ningxia Hui autonomous region, Northwestern China / Diversidade genética do vírus da hepatite C na região autônoma de Ningxia Hui

Hepatitis C virus (HCV) genotypes vary greatly in different regions. The aim of this study is to investigate the distribution of HCV genotypes in HCV infected patients, in Ningxia Hui Autonomous Region. Nucleic acid extraction and amplification were performed with test kits on 153 HCV infected patients serum samples. The HCV viral load was measured using reverse transcriptase PCR (RT-PCR) and HCV genotypes were determined. Among the 153 HCV-infected patients, 56 had genotype (GT)1b (36.60%), 45 had GT2a (29.40%), 23 had GT3a (15.00%), 14 had GT3b (9.20%),13 had GT6a (8.50%), 1 had GT1g (0.70%), 1 had GT6xa (0.70%). In GT1b, 21.40% were female and 78.60% were male; in GT2a, 42.20% were female and 57.80% were male;Males were most prevalent in genotypes 1b(39.30%), while female were most prevalent in genotype 2a(46.30%). Rare GT1g and GT6xa were also detected in males. The 41-50 year age group had the highest HCV prevalence of 32.00%. HCV GT1b is the predominant HCV genotype in Ningxia Hui Autonomous Region.

Os genótipos do vírus da hepatite C (HCV) variam muito de acordo com a região. O objetivo deste estudo é investigar a distribuição do genótipo do vírus da hepatite C em pessoas infectadas pelo vírus na região autônoma de Ningxia Hui. A extração de ácido nucleico e a expansão de amostras séricas em 153 pacientes infectados com HCV foram realizadas utilizando kits de ensaio. A capacidade do vírus HCV foi medida pela reação em cadeia da polimerase retrotranscrição (RT-PCR) e o genótipo HCV foi determinado. Os genótipos (Gt) tiveram a seguinte distribuição entre os 153 casos de infecção HCV: 56 Gt 1-B (36, 60%), 45 Gt 2-A (29, 40%), 23 Gt 3-A (15, 00%), 14 Gt 3-B (9, 20%), 13 Gt 6-A (8, 50%), 1 Gt 1-G (0, 70%) e 1 Gt 6-Xa (0, 70%). Já o sexo dos indivíduos teve a seguinte distribuição: Gt 1-B, 21, 40% mulheres e 78, 60% homens; Gt 2-A, 42, 20% mulheres e 57, 80% homens. A presença de homens é mais comum no genótipo 1-B (39, 30%), enquanto as mulheres ocorrem mais comumente no genótipo 2-A (46, 30%). Gt 1-G e Gt 6-Xa raros também foram detectados em homens. A taxa de infecção com HCV para grupos etários de 41 a 50 anos é a mais alta, com 32,00%. HCV Gt 1-B é o genótipo dominante do HCV na região autônoma de Ningxia Hui.

Prevalence of gastrointestinal parasitic infection in cows and buffaloes in Lower Dir, Khyber Pakhtunkhwa, Pakistan

Abstract Gastrointestinal (GI) Parasitic infection is a hot issue for cattle management. There is variation of GI parasites effects in sex, age of cattle, drinking water condition, nutrition, and severity of infection. Studies on prevalence of GI parasites among cattle population in Dir Lower are lacking. A total of 40 farms were selected randomly in six tehsil namely Tehsil Adenzai, Tehsil Timergara, Tehsil Balambat, Tehsil Munda ,Tehsil Lalqala, Tehsil Khall. Freshly cattle fecal samples were collected randomly from the selected farms during March 2018 till December 2018. Out of 314 buffaloes and cattle examined 58.59% (184/314) were positive for eggs, cyst/oocyst of one or more species of GI Parasites. The prevalence of parasitic infection was higher in Buffaloes 63.55% (75/118) as compared to Cow 55.61% (109/196) but the difference was not significant (p>0.05) Entamoeba,spp, Moniezia spp, Haemonchus spp and Coccidian spp were found in this study. The non-treated animals indicated the highest percentage of infection in cow 57.71% (101/175) and buffalo 68.13% (62/91).GI parasite prevalence in female animal were higher female cow 62.58% (87/139) and female buffalo 77.33% (58/75) as compared to male. But the difference is non-significant (p> 0.05) Yearling calves had the lower rate of GI parasitic infection than adults. Future investigations are necessary to evaluate the economic loss due to GI parasites in cattles.

Resumo A infecção gastrointestinal (GI) parasitária é um assunto importante para o manejo do gado. Existem variações nos efeitos dos parasitas GI quanto a sexo, idade do gado, condição da água potável, nutrição e gravidade da infecção. Faltam estudos sobre a prevalência de parasitas GI entre a população de gado em Lower Dir. Um total de 40 fazendas foi selecionado aleatoriamente em seis tehsil, nomeadamente Tehsil Adenzai, Tehsil Timergara, Tehsil Balambat, Tehsil Munda, Tehsil Lalqala, Tehsil Khall. Amostras fecais de gado fresco foram coletadas aleatoriamente das fazendas selecionadas de março de 2018 até dezembro de 2018. Dos 314 búfalos e bovinos examinados, 58,59% (184/314) foram positivos para ovos, cisto/oocisto de uma ou mais espécies de parasitas GI. A prevalência de infecção parasitária foi maior em Buffaloes 63,55% (75/118) em comparação com vaca 55,61% (109/196), mas a diferença não foi significativa (p > 0,05). Entamoeba spp, Moniezia spp, Haemonchus spp e Coccidian spp foram encontrados neste estudo. Os animais não tratados indicaram a maior porcentagem de infecção em vacas 57,71% (101/175) e búfalos 68,13% (62/91). A prevalência do parasita GI em fêmeas foi maior em vacas fêmeas 62,58% (87/139) e búfalas 77,33% (58/75) em comparação ao masculino. Mas a diferença não é significativa (p > 0,05). A modelagem linear geral mostrou que o tratamento do animal estava significativamente relacionado com a prevalência de parasitas GI. Bezerros de um ano tiveram a maior taxa de infecção parasitária gastrointestinal. Futuras investigações são necessárias para avaliar a perda econômica devido aos parasitas GI em bovinos.

Spatial analysis of factors influencing bacterial leaf blight in rice production / Análise espacial dos fatores que influenciam a praga bacteriana foliar na produção de arroz

Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo) causes bacterial leaf blight that is a major threat to rice production. Crop losses in extreme situations can reach up to75%, and millions of hectares of rice are affected each year. Management of the disease required information about the spatial distribution of BLB incidence, severity, and prevalence. In this study, major rice-growing areas of Pakistan were surveyed during 2018-2019 for disease occurrence, and thematic maps were developed using geographic information system (GIS). Results showed that Narowal district had highest percentage of disease incidence (54-69%), severity (42-44%), and prevalence (72-90%) meanwhile Jhung district had the lowest incidence (21-23%), severity (18-22%), and prevalence (45-54%). To understand the environmental factors contributing to this major rice disease, the research analyze, the spatial relationships between BLB prevalence and environmental variables. Those variables include relative humidity (RH), atmospheric pressure (A.P), minimum temperature, soil organic carbon, soil pH, and elevation, which were evaluated by using GIS-based Ordinary Least Square (OLS) spatial model. The fitted model had a coefficient of determination (R2) of 65 percent explanatory power of disease development. All environmental variables showed a general trend of positive correlation between BLB prevalence and environmental variables. The results show the potential for disease management and prediction using environmental variable and assessment.

Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo) causa o crestamento bacteriano das folhas, que é uma grande ameaça à produção de arroz. As perdas de safra em situações extremas podem chegar a 75% e a milhões de hectares de arroz são afetados a cada ano. O manejo da doença exigia informações sobre a distribuição espacial da incidência, gravidade e prevalência de BLB. Neste estudo, as principais áreas de cultivo de arroz do Paquistão foram pesquisadas durante 2018 e 2019 para ocorrência de doenças, e mapas temáticos foram desenvolvidos usando o sistema de informações geográficas (GIS). Os resultados mostraram que o distrito de Narowal teve a maior porcentagem de incidência da doença (54-69%), gravidade (42-44%) e prevalência (72-90%), enquanto o distrito de Jhung teve a menor incidência (21-23%), gravidade (18-22%) e prevalência (45-54%). Para compreender os fatores ambientais que contribuem para esta importante doença do arroz, a pesquisa analisa as relações espaciais entre a prevalência de BLB e as variáveis ​​ambientais. Essas variáveis ​​incluem umidade relativa (UR), pressão atmosférica (PA), temperatura mínima, carbono orgânico do solo, pH do solo e altitude, que sendo avaliadas a partir do modelo espacial Ordinary Least Square (OLS) baseado em GIS. O modelo ajustado teve um coeficiente de determinação (R2) de 65 por cento de poder explicativo do desenvolvimento da doença. Todas as variáveis ​​ambientais apresentaram tendência geral de correlação positiva entre prevalência de BLB e variáveis ​​ambientais. Os resultados mostram o potencial de manejo e predição de doenças usando variáveis ​​e avaliações ambientais.

Prevalence of gastrointestinal parasitic infection in cows and buffaloes in Lower Dir, Khyber Pakhtunkhwa, Pakistan / Prevalência de infecções parasitárias gastrointestinais em vacas e búfalos em Lower Dir, Khyber Pakhtunkhwa, Paquistão

Gastrointestinal (GI) Parasitic infection is a hot issue for cattle management. There is variation of GI parasites effects in sex, age of cattle, drinking water condition, nutrition, and severity of infection. Studies on prevalence of GI parasites among cattle population in Dir Lower are lacking. A total of 40 farms were selected randomly in six tehsil namely Tehsil Adenzai, Tehsil Timergara, Tehsil Balambat, Tehsil Munda ,Tehsil Lalqala, Tehsil Khall. Freshly cattle fecal samples were collected randomly from the selected farms during March 2018 till December 2018. Out of 314 buffaloes and cattle examined 58.59% (184/314) were positive for eggs, cyst/oocyst of one or more species of GI Parasites. The prevalence of parasitic infection was higher in Buffaloes 63.55% (75/118) as compared to Cow 55.61% (109/196) but the difference was not significant (p>0.05) Entamoeba,spp, Moniezia spp, Haemonchus spp and Coccidian spp were found in this study. The non-treated animals indicated the highest percentage of infection in cow 57.71% (101/175) and buffalo 68.13% (62/91).GI parasite prevalence in female animal were higher female cow 62.58% (87/139) and female buffalo 77.33% (58/75) as compared to male. But the difference is non-significant (p> 0.05) Yearling calves had the lower rate of GI parasitic infection than adults. Future investigations are necessary to evaluate the economic loss due to GI parasites in cattle's.

A infecção gastrointestinal (GI) parasitária é um assunto importante para o manejo do gado. Existem variações nos efeitos dos parasitas GI quanto a sexo, idade do gado, condição da água potável, nutrição e gravidade da infecção. Faltam estudos sobre a prevalência de parasitas GI entre a população de gado em Lower Dir. Um total de 40 fazendas foi selecionado aleatoriamente em seis tehsil, nomeadamente Tehsil Adenzai, Tehsil Timergara, Tehsil Balambat, Tehsil Munda, Tehsil Lalqala, Tehsil Khall. Amostras fecais de gado fresco foram coletadas aleatoriamente das fazendas selecionadas de março de 2018 até dezembro de 2018. Dos 314 búfalos e bovinos examinados, 58,59% (184/314) foram positivos para ovos, cisto/oocisto de uma ou mais espécies de parasitas GI. A prevalência de infecção parasitária foi maior em Buffaloes 63,55% (75/118) em comparação com vaca 55,61% (109/196), mas a diferença não foi significativa (p > 0,05). Entamoeba spp, Moniezia spp, Haemonchus spp e Coccidian spp foram encontrados neste estudo. Os animais não tratados indicaram a maior porcentagem de infecção em vacas 57,71% (101/175) e búfalos 68,13% (62/91). A prevalência do parasita GI em fêmeas foi maior em vacas fêmeas 62,58% (87/139) e búfalas 77,33% (58/75) em comparação ao masculino. Mas a diferença não é significativa (p > 0,05). A modelagem linear geral mostrou que o tratamento do animal estava significativamente relacionado com a prevalência de parasitas GI. Bezerros de um ano tiveram a maior taxa de infecção parasitária gastrointestinal. Futuras investigações são necessárias para avaliar a perda econômica devido aos parasitas GI em bovinos.

The Serra Spanish mackerel fishery (Scomberomorus brasiliensis – Teleostei) in Southern Brazil: the growing landings of a high trophic level resource / A pesca da cavala, Scomberomorus brasiliensis (Teleostei), no sul do Brasil: o aumento nos desembarques de um recurso de alto nível trófico

In fisheries, the phenomenon known as fishing down food webs is supposed to be a consequence of overfishing, which would be reflected in a reduction in the trophic level of landings. In such scenarios, the resilience of carnivorous, top predator species is particularly affected, making these resources the first to be depleted. The Serra Spanish mackerel, Scomberomorus brasiliensis, exemplifies a predator resource historically targeted by artisanal fisheries on the Brazilian coast. The present work analyzes landings in three periods within a 50-year timescale on the Parana coast, Southern Brazil, aiming to evaluate whether historical production has supposedly declined. Simultaneously, the diet was analyzed to confirm carnivorous habits and evaluate the trophic level in this region. Surprisingly, the results show that from the 1970's to 2019 Serra Spanish mackerel production grew relatively to other resources, as well as in individual values. The trophic level was calculated as 4.238, similar to other Scomberomorus species, consisting of a case where landings increase over time, despite the high trophic level and large body size of the resource. The results agree with a recent global assessment that has demystified a necessary correlation between high trophic level and overexploitation, but possible factors acting on the present findings are discussed.

Na pesca, o fenômeno fishing down food webs, ou 'pescando teias tróficas abaixo', expressa a redução do nível trófico na composição das capturas, e tem origem tradicionalmente atribuída à sobrepesca. Sob intenso extrativismo, a resiliência das espécies carnívoras, predadoras de topo, é particularmente afetada, sendo seus estoques os primeiros a entrarem em depleção. A cavala, ou serra, ou sororoca, Scomberomorus brasiliensis, é exemplo de recurso predador historicamente alvo da pesca artesanal, de pequena escala, na costa brasileira. O presente trabalho analisa os valores de desembarque do recurso em três períodos ao longo de 50 anos na costa paranaense, sul do Brasil, com objetivo de avaliar se sua produção tem efetivamente diminuído. Ainda, estuda-se a dieta da espécie na região, para confirmar seus hábitos carnívoros e avaliar o nível trófico na região. Os resultados mostram que, surpreendentemente, dos anos 1970 para 2019 a produção de S. brasiliensis tem aumentado em valores absolutos, bem como relativamente à de outros recursos, em que pese o nível trófico 4,238, similar a outras espécies do gênero. Constata-se que a pesca da cavala na região de estudo constitui um caso de aumento nos desembarques a despeito de elevado nível trófico e grande tamanho corpóreo. Os resultados concordam com recente levantamento em nível mundial, que nega existir correlação necessária entre sobrepesca e nível trófico alto, mas fatores que podem explicar os resultados do presente trabalho são discutidos.

Novel Pathogenic Mutation Mapping of ASPM Gene in Consanguineous Pakistani Families with Primary Microcephaly / Novo mapeamento de mutações patogênicas do gene ASPM em famílias consanguíneas com microcefalia primária do Paquistão

Autosomal recessive primary microcephaly (MCPH) is a neurodevelopmental disorder characterized by a congenitally reduced head circumference (-3 to -5 SD) and non-progressive intellectual disability. The objective of the study was to evaluate pathogenic mutations in the ASPM gene to understand etiology and molecular mechanism of primary microcephaly. Blood samples were collected from various families across different remote areas of Pakistan from February 2017 to May 2019 who were identified to be affected with primary microcephaly. DNA extraction was performed using the salting-out method; the quality and quantity of DNA were evaluated using spectrophotometry and 1% agarose gel electrophoresis, respectively in University of the Punjab. Mutation analysis was performed by whole exome sequencing from the Cologne Center for Genomics, University of Cologne. Sanger sequencing was done in University of the Punjab to confirm the pathogenic nature of mutation. A novel 4-bp deletion mutation c.3877_3880delGAGA was detected in exon 17 of the ASPM gene in two primary microcephaly affected families (A and B), which resulted in a frame shift mutation in the gene followed by truncated protein synthesis (p.Glu1293Lysfs*10), as well as the loss of the calmodulin-binding IQ domain and the Armadillo-like domain in the ASPM protein. Using the in-silico tools Mutation Taster, PROVEAN, and PolyPhen, the pathogenic effect of this novel mutation was tested; it was predicted to be "disease causing", with high pathogenicity scores. One previously reported mutation in exon 24 (c.9730C>T) of the ASPM gene resulting in protein truncation (p.Arg3244*) was also observed in family C. Mutations in the ASPM gene are the most common cause of MCPH in most cases. Therefore, enrolling additional affected families from remote areas of Pakistan would help in identifying or mapping novel mutations in the ASPM gene of primary microcephaly.

Microcefalia primária autossômica recessiva (MCPH) é um distúrbio do neurodesenvolvimento caracterizado por uma redução congênita do perímetro cefálico (-3 a -5 DP) e deficiência intelectual não progressiva. O objetivo do estudo foi avaliar mutações patogênicas no gene ASPM a fim de compreender a etiologia e o mecanismo molecular da microcefalia primária. Amostras de sangue foram coletadas de várias famílias em diferentes áreas remotas do Paquistão de fevereiro de 2017 a maio de 2019, que foram identificadas como afetadas com microcefalia primária. A extração do DNA foi realizada pelo método salting-out; a qualidade e a quantidade de DNA foram avaliadas por espectrofotometria e eletroforese em gel de agarose a 1%, respectivamente, na Universidade de Punjab. A análise de mutação foi realizada por sequenciamento completo do exoma do Cologne Center for Genomics, University of Cologne. O sequenciamento de Sanger foi feito na Universidade do Punjab para confirmar a natureza patogênica da mutação. Uma nova mutação de deleção de 4 bp c.3877_3880delGAGA foi detectada no exon 17 do gene ASPM em duas famílias afetadas por microcefalia primária (A e B), que resultou em uma mutação de frame shift no gene seguida por síntese de proteína truncada (pGlu1293Lysfs * 10), bem como a perda do domínio IQ de ligação à calmodulina e o domínio do tipo Armadillo na proteína ASPM. Usando as ferramentas in-silico Mutation Taster, PROVEAN e PolyPhen, o efeito patogênico dessa nova mutação foi testado; foi previsto ser "causador de doenças", com altos escores de patogenicidade. Uma mutação relatada anteriormente no exon 24 (c.9730C > T) do gene ASPM, resultando em truncamento de proteína (p.Arg3244 *) também foi observada na família C. Mutações no gene ASPM são a causa mais comum de MCPH na maioria dos casos . Portanto, a inscrição de famílias afetadas adicionais de áreas remotas do Paquistão ajudaria a identificar ou mapear novas mutações no gene ASPM da microcefalia primária.

The Serra Spanish mackerel fishery (Scomberomorus brasiliensis Teleostei) in Southern Brazil: the growing landings of a high trophic level resource

Abstract In fisheries, the phenomenon known as fishing down food webs is supposed to be a consequence of overfishing, which would be reflected in a reduction in the trophic level of landings. In such scenarios, the resilience of carnivorous, top predator species is particularly affected, making these resources the first to be depleted. The Serra Spanish mackerel, Scomberomorus brasiliensis, exemplifies a predator resource historically targeted by artisanal fisheries on the Brazilian coast. The present work analyzes landings in three periods within a 50-year timescale on the Parana coast, Southern Brazil, aiming to evaluate whether historical production has supposedly declined. Simultaneously, the diet was analyzed to confirm carnivorous habits and evaluate the trophic level in this region. Surprisingly, the results show that from the 1970s to 2019 Serra Spanish mackerel production grew relatively to other resources, as well as in individual values. The trophic level was calculated as 4.238, similar to other Scomberomorus species, consisting of a case where landings increase over time, despite the high trophic level and large body size of the resource. The results agree with a recent global assessment that has demystified a necessary correlation between high trophic level and overexploitation, but possible factors acting on the present findings are discussed.

Resumo Na pesca, o fenômeno fishing down food webs, ou pescando teias tróficas abaixo, expressa a redução do nível trófico na composição das capturas, e tem origem tradicionalmente atribuída à sobrepesca. Sob intenso extrativismo, a resiliência das espécies carnívoras, predadoras de topo, é particularmente afetada, sendo seus estoques os primeiros a entrarem em depleção. A cavala, ou serra, ou sororoca, Scomberomorus brasiliensis, é exemplo de recurso predador historicamente alvo da pesca artesanal, de pequena escala, na costa brasileira. O presente trabalho analisa os valores de desembarque do recurso em três períodos ao longo de 50 anos na costa paranaense, sul do Brasil, com objetivo de avaliar se sua produção tem efetivamente diminuído. Ainda, estuda-se a dieta da espécie na região, para confirmar seus hábitos carnívoros e avaliar o nível trófico na região. Os resultados mostram que, surpreendentemente, dos anos 1970 para 2019 a produção de S. brasiliensis tem aumentado em valores absolutos, bem como relativamente à de outros recursos, em que pese o nível trófico 4,238, similar a outras espécies do gênero. Constata-se que a pesca da cavala na região de estudo constitui um caso de aumento nos desembarques a despeito de elevado nível trófico e grande tamanho corpóreo. Os resultados concordam com recente levantamento em nível mundial, que nega existir correlação necessária entre sobrepesca e nível trófico alto, mas fatores que podem explicar os resultados do presente trabalho são discutidos.

Novel Pathogenic Mutation Mapping of ASPM Gene in Consanguineous Pakistani Families with Primary Microcephaly

Abstract Autosomal recessive primary microcephaly (MCPH) is a neurodevelopmental disorder characterized by a congenitally reduced head circumference (-3 to -5 SD) and non-progressive intellectual disability. The objective of the study was to evaluate pathogenic mutations in the ASPM gene to understand etiology and molecular mechanism of primary microcephaly. Blood samples were collected from various families across different remote areas of Pakistan from February 2017 to May 2019 who were identified to be affected with primary microcephaly. DNA extraction was performed using the salting-out method; the quality and quantity of DNA were evaluated using spectrophotometry and 1% agarose gel electrophoresis, respectively in University of the Punjab. Mutation analysis was performed by whole exome sequencing from the Cologne Center for Genomics, University of Cologne. Sanger sequencing was done in University of the Punjab to confirm the pathogenic nature of mutation. A novel 4-bp deletion mutation c.3877_3880delGAGA was detected in exon 17 of the ASPM gene in two primary microcephaly affected families (A and B), which resulted in a frame shift mutation in the gene followed by truncated protein synthesis (p.Glu1293Lysfs*10), as well as the loss of the calmodulin-binding IQ domain and the Armadillo-like domain in the ASPM protein. Using the in-silico tools Mutation Taster, PROVEAN, and PolyPhen, the pathogenic effect of this novel mutation was tested; it was predicted to be disease causing, with high pathogenicity scores. One previously reported mutation in exon 24 (c.9730C>T) of the ASPM gene resulting in protein truncation (p.Arg3244*) was also observed in family C. Mutations in the ASPM gene are the most common cause of MCPH in most cases. Therefore, enrolling additional affected families from remote areas of Pakistan would help in identifying or mapping novel mutations in the ASPM gene of primary microcephaly.

Resumo Microcefalia primária autossômica recessiva (MCPH) é um distúrbio do neurodesenvolvimento caracterizado por uma redução congênita do perímetro cefálico (-3 a -5 DP) e deficiência intelectual não progressiva. O objetivo do estudo foi avaliar mutações patogênicas no gene ASPM a fim de compreender a etiologia e o mecanismo molecular da microcefalia primária. Amostras de sangue foram coletadas de várias famílias em diferentes áreas remotas do Paquistão de fevereiro de 2017 a maio de 2019, que foram identificadas como afetadas com microcefalia primária. A extração do DNA foi realizada pelo método salting-out; a qualidade e a quantidade de DNA foram avaliadas por espectrofotometria e eletroforese em gel de agarose a 1%, respectivamente, na Universidade de Punjab. A análise de mutação foi realizada por sequenciamento completo do exoma do Cologne Center for Genomics, University of Cologne. O sequenciamento de Sanger foi feito na Universidade do Punjab para confirmar a natureza patogênica da mutação. Uma nova mutação de deleção de 4 bp c.3877_3880delGAGA foi detectada no exon 17 do gene ASPM em duas famílias afetadas por microcefalia primária (A e B), que resultou em uma mutação de frame shift no gene seguida por síntese de proteína truncada (pGlu1293Lysfs * 10), bem como a perda do domínio IQ de ligação à calmodulina e o domínio do tipo Armadillo na proteína ASPM. Usando as ferramentas in-silico Mutation Taster, PROVEAN e PolyPhen, o efeito patogênico dessa nova mutação foi testado; foi previsto ser causador de doenças, com altos escores de patogenicidade. Uma mutação relatada anteriormente no exon 24 (c.9730C > T) do gene ASPM, resultando em truncamento de proteína (p.Arg3244 *) também foi observada na família C. Mutações no gene ASPM são a causa mais comum de MCPH na maioria dos casos . Portanto, a inscrição de famílias afetadas adicionais de áreas remotas do Paquistão ajudaria a identificar ou mapear novas mutações no gene ASPM da microcefalia primária.

Novel Pathogenic Mutation Mapping of ASPM Gene in Consanguineous Pakistani Families with Primary Microcephaly / Novo mapeamento de mutações patogênicas do gene ASPM em famílias consanguíneas com microcefalia primária do Paquistão

Abstract Autosomal recessive primary microcephaly (MCPH) is a neurodevelopmental disorder characterized by a congenitally reduced head circumference (-3 to -5 SD) and non-progressive intellectual disability. The objective of the study was to evaluate pathogenic mutations in the ASPM gene to understand etiology and molecular mechanism of primary microcephaly. Blood samples were collected from various families across different remote areas of Pakistan from February 2017 to May 2019 who were identified to be affected with primary microcephaly. DNA extraction was performed using the salting-out method; the quality and quantity of DNA were evaluated using spectrophotometry and 1% agarose gel electrophoresis, respectively in University of the Punjab. Mutation analysis was performed by whole exome sequencing from the Cologne Center for Genomics, University of Cologne. Sanger sequencing was done in University of the Punjab to confirm the pathogenic nature of mutation. A novel 4-bp deletion mutation c.3877_3880delGAGA was detected in exon 17 of the ASPM gene in two primary microcephaly affected families (A and B), which resulted in a frame shift mutation in the gene followed by truncated protein synthesis (p.Glu1293Lysfs*10), as well as the loss of the calmodulin-binding IQ domain and the Armadillo-like domain in the ASPM protein. Using the in-silico tools Mutation Taster, PROVEAN, and PolyPhen, the pathogenic effect of this novel mutation was tested; it was predicted to be "disease causing," with high pathogenicity scores. One previously reported mutation in exon 24 (c.9730C>T) of the ASPM gene resulting in protein truncation (p.Arg3244*) was also observed in family C. Mutations in the ASPM gene are the most common cause of MCPH in most cases. Therefore, enrolling additional affected families from remote areas of Pakistan would help in identifying or mapping novel mutations in the ASPM gene of primary microcephaly.

Resumo Microcefalia primária autossômica recessiva (MCPH) é um distúrbio do neurodesenvolvimento caracterizado por uma redução congênita do perímetro cefálico (-3 a -5 DP) e deficiência intelectual não progressiva. O objetivo do estudo foi avaliar mutações patogênicas no gene ASPM a fim de compreender a etiologia e o mecanismo molecular da microcefalia primária. Amostras de sangue foram coletadas de várias famílias em diferentes áreas remotas do Paquistão de fevereiro de 2017 a maio de 2019, que foram identificadas como afetadas com microcefalia primária. A extração do DNA foi realizada pelo método salting-out; a qualidade e a quantidade de DNA foram avaliadas por espectrofotometria e eletroforese em gel de agarose a 1%, respectivamente, na Universidade de Punjab. A análise de mutação foi realizada por sequenciamento completo do exoma do Cologne Center for Genomics, University of Cologne. O sequenciamento de Sanger foi feito na Universidade do Punjab para confirmar a natureza patogênica da mutação. Uma nova mutação de deleção de 4 bp c.3877_3880delGAGA foi detectada no exon 17 do gene ASPM em duas famílias afetadas por microcefalia primária (A e B), que resultou em uma mutação de frame shift no gene seguida por síntese de proteína truncada (pGlu1293Lysfs * 10), bem como a perda do domínio IQ de ligação à calmodulina e o domínio do tipo Armadillo na proteína ASPM. Usando as ferramentas in-silico Mutation Taster, PROVEAN e PolyPhen, o efeito patogênico dessa nova mutação foi testado; foi previsto ser "causador de doenças", com altos escores de patogenicidade. Uma mutação relatada anteriormente no exon 24 (c.9730C > T) do gene ASPM, resultando em truncamento de proteína (p.Arg3244 *) também foi observada na família C. Mutações no gene ASPM são a causa mais comum de MCPH na maioria dos casos . Portanto, a inscrição de famílias afetadas adicionais de áreas remotas do Paquistão ajudaria a identificar ou mapear novas mutações no gene ASPM da microcefalia primária.

Effect of castration and vasectomy on some oxidative stress parameters and blood hormone levels in rats / Efeito da castração e da vasectomia em alguns parâmetros de estresse oxidativo e níveis de hormônios no sangue

Vasectomy and castration are the most preferred surgical methods to control reproduction in males. While sexual functions are terminated reversibly in vasectomy, they are removed irreversibly in castration. After these processes, changes are observed in hormones and oxidative stress parameters. In this study, we investigated the effects of vasectomy and castration operations on blood follicle stimulating hormone (FSH), luteinizing hormone (LH), testosterone, nitric oxide (NO) and malondialdehyde (MDA) levels in rats. As a result of the analysis, it was determined that FSH, LH, NO, and MDA levels increased (p<0.05) and testosterone levels decreased (p<0.05) in the castration group compared to the sham and vasectomy groups. Considering the data obtained from the present study, when the two operations (vasectomy and castration) are compared in rats, which are preferred for the control of reproduction, it is thought that vasectomy is a healthier method because it is reversible, does not affect hormone levels, and does not increase oxidative stress.

A vasectomia e a castração são os métodos cirúrgicos preferidos para controlar a reprodução no sexo masculino. Enquanto as funções sexuais terminam reversivelmente na vasectomia, elas são removidas irreversivelmente na castração. Após esses processos, são observadas alterações nos hormônios e nos parâmetros de estresse oxidativo. Neste estudo, foram investigados os efeitos das operações de vasectomia e castração nos níveis sanguíneos de hormônio folículo estimulante (FSH), hormônio luteinizante (LH), testosterona, óxido nítrico (NO) e malondialdeído (MDA) em ratos. Como resultado da análise, foi determinado que os níveis de FSH, LH, NO e MDA aumentaram (P<0,05) e os níveis de testosterona diminuíram (P<0,05) no grupo de castração em comparação com os grupos sham e vasectomia. Considerando os dados obtidos no presente estudo, quando comparadas as duas operações (vasectomia e castração) em ratos, preferidas para o controle da reprodução, acredita-se que a vasectomia é um método mais saudável por ser reversível, não afetar os níveis hormonais e não aumentar o estresse oxidativo.

The Serra Spanish mackerel fishery (Scomberomorus brasiliensis - Teleostei) in Southern Brazil: the growing landings of a high trophic level resource / A pesca da cavala, Scomberomorus brasiliensis (Teleostei), no sul do Brasil: o aumento nos desembarques de um recurso de alto nível trófico

Abstract In fisheries, the phenomenon known as fishing down food webs is supposed to be a consequence of overfishing, which would be reflected in a reduction in the trophic level of landings. In such scenarios, the resilience of carnivorous, top predator species is particularly affected, making these resources the first to be depleted. The Serra Spanish mackerel, Scomberomorus brasiliensis, exemplifies a predator resource historically targeted by artisanal fisheries on the Brazilian coast. The present work analyzes landings in three periods within a 50-year timescale on the Parana coast, Southern Brazil, aiming to evaluate whether historical production has supposedly declined. Simultaneously, the diet was analyzed to confirm carnivorous habits and evaluate the trophic level in this region. Surprisingly, the results show that from the 1970's to 2019 Serra Spanish mackerel production grew relatively to other resources, as well as in individual values. The trophic level was calculated as 4.238, similar to other Scomberomorus species, consisting of a case where landings increase over time, despite the high trophic level and large body size of the resource. The results agree with a recent global assessment that has demystified a necessary correlation between high trophic level and overexploitation, but possible factors acting on the present findings are discussed.

Resumo Na pesca, o fenômeno fishing down food webs, ou 'pescando teias tróficas abaixo', expressa a redução do nível trófico na composição das capturas, e tem origem tradicionalmente atribuída à sobrepesca. Sob intenso extrativismo, a resiliência das espécies carnívoras, predadoras de topo, é particularmente afetada, sendo seus estoques os primeiros a entrarem em depleção. A cavala, ou serra, ou sororoca, Scomberomorus brasiliensis, é exemplo de recurso predador historicamente alvo da pesca artesanal, de pequena escala, na costa brasileira. O presente trabalho analisa os valores de desembarque do recurso em três períodos ao longo de 50 anos na costa paranaense, sul do Brasil, com objetivo de avaliar se sua produção tem efetivamente diminuído. Ainda, estuda-se a dieta da espécie na região, para confirmar seus hábitos carnívoros e avaliar o nível trófico na região. Os resultados mostram que, surpreendentemente, dos anos 1970 para 2019 a produção de S. brasiliensis tem aumentado em valores absolutos, bem como relativamente à de outros recursos, em que pese o nível trófico 4,238, similar a outras espécies do gênero. Constata-se que a pesca da cavala na região de estudo constitui um caso de aumento nos desembarques a despeito de elevado nível trófico e grande tamanho corpóreo. Os resultados concordam com recente levantamento em nível mundial, que nega existir correlação necessária entre sobrepesca e nível trófico alto, mas fatores que podem explicar os resultados do presente trabalho são discutidos.

Novel Pathogenic Mutation Mapping of ASPM Gene in Consanguineous Pakistani Families with Primary Microcephaly / Novo mapeamento de mutações patogênicas do gene ASPM em famílias consanguíneas com microcefalia primária do Paquistão

Autosomal recessive primary microcephaly (MCPH) is a neurodevelopmental disorder characterized by a congenitally reduced head circumference (-3 to -5 SD) and non-progressive intellectual disability. The objective of the study was to evaluate pathogenic mutations in the ASPM gene to understand etiology and molecular mechanism of primary microcephaly. Blood samples were collected from various families across different remote areas of Pakistan from February 2017 to May 2019 who were identified to be affected with primary microcephaly. DNA extraction was performed using the salting-out method; the quality and quantity of DNA were evaluated using spectrophotometry and 1% agarose gel electrophoresis, respectively in University of the Punjab. Mutation analysis was performed by whole exome sequencing from the Cologne Center for Genomics, University of Cologne. Sanger sequencing was done in University of the Punjab to confirm the pathogenic nature of mutation. A novel 4-bp deletion mutation c.3877_3880delGAGA was detected in exon 17 of the ASPM gene in two primary microcephaly affected families (A and B), which resulted in a frame shift mutation in the gene followed by truncated protein synthesis (p.Glu1293Lysfs*10), as well as the loss of the calmodulin-binding IQ domain and the Armadillo-like domain in the ASPM protein. Using the in-silico tools Mutation Taster, PROVEAN, and PolyPhen, the pathogenic effect of this novel mutation was tested; it was predicted to be "disease causing", with high pathogenicity scores. One previously reported mutation in exon 24 (c.9730C>T) of the ASPM gene resulting in protein truncation (p.Arg3244*) was also observed in family C. Mutations in the ASPM gene are the most common cause of MCPH in most cases. Therefore, enrolling additional affected families from remote areas of Pakistan would help in identifying or mapping novel mutations in the ASPM gene of primary microcephaly.(AU)

Microcefalia primária autossômica recessiva (MCPH) é um distúrbio do neurodesenvolvimento caracterizado por uma redução congênita do perímetro cefálico (-3 a -5 DP) e deficiência intelectual não progressiva. O objetivo do estudo foi avaliar mutações patogênicas no gene ASPM a fim de compreender a etiologia e o mecanismo molecular da microcefalia primária. Amostras de sangue foram coletadas de várias famílias em diferentes áreas remotas do Paquistão de fevereiro de 2017 a maio de 2019, que foram identificadas como afetadas com microcefalia primária. A extração do DNA foi realizada pelo método salting-out; a qualidade e a quantidade de DNA foram avaliadas por espectrofotometria e eletroforese em gel de agarose a 1%, respectivamente, na Universidade de Punjab. A análise de mutação foi realizada por sequenciamento completo do exoma do Cologne Center for Genomics, University of Cologne. O sequenciamento de Sanger foi feito na Universidade do Punjab para confirmar a natureza patogênica da mutação. Uma nova mutação de deleção de 4 bp c.3877_3880delGAGA foi detectada no exon 17 do gene ASPM em duas famílias afetadas por microcefalia primária (A e B), que resultou em uma mutação de frame shift no gene seguida por síntese de proteína truncada (pGlu1293Lysfs * 10), bem como a perda do domínio IQ de ligação à calmodulina e o domínio do tipo Armadillo na proteína ASPM. Usando as ferramentas in-silico Mutation Taster, PROVEAN e PolyPhen, o efeito patogênico dessa nova mutação foi testado; foi previsto ser "causador de doenças", com altos escores de patogenicidade. Uma mutação relatada anteriormente no exon 24 (c.9730C > T) do gene ASPM, resultando em truncamento de proteína (p.Arg3244 *) também foi observada na família C. Mutações no gene ASPM são a causa mais comum de MCPH na maioria dos casos . Portanto, a inscrição de famílias afetadas adicionais de áreas remotas do Paquistão ajudaria a identificar ou mapear novas mutações no gene ASPM da microcefalia primária.(AU)

The Serra Spanish mackerel fishery (Scomberomorus brasiliensis Teleostei) in Southern Brazil: the growing landings of a high trophic level resource / A pesca da cavala, Scomberomorus brasiliensis (Teleostei), no sul do Brasil: o aumento nos desembarques de um recurso de alto nível trófico

In fisheries, the phenomenon known as fishing down food webs is supposed to be a consequence of overfishing, which would be reflected in a reduction in the trophic level of landings. In such scenarios, the resilience of carnivorous, top predator species is particularly affected, making these resources the first to be depleted. The Serra Spanish mackerel, Scomberomorus brasiliensis, exemplifies a predator resource historically targeted by artisanal fisheries on the Brazilian coast. The present work analyzes landings in three periods within a 50-year timescale on the Parana coast, Southern Brazil, aiming to evaluate whether historical production has supposedly declined. Simultaneously, the diet was analyzed to confirm carnivorous habits and evaluate the trophic level in this region. Surprisingly, the results show that from the 1970's to 2019 Serra Spanish mackerel production grew relatively to other resources, as well as in individual values. The trophic level was calculated as 4.238, similar to other Scomberomorus species, consisting of a case where landings increase over time, despite the high trophic level and large body size of the resource. The results agree with a recent global assessment that has demystified a necessary correlation between high trophic level and overexploitation, but possible factors acting on the present findings are discussed.(AU)

Na pesca, o fenômeno fishing down food webs, ou 'pescando teias tróficas abaixo', expressa a redução do nível trófico na composição das capturas, e tem origem tradicionalmente atribuída à sobrepesca. Sob intenso extrativismo, a resiliência das espécies carnívoras, predadoras de topo, é particularmente afetada, sendo seus estoques os primeiros a entrarem em depleção. A cavala, ou serra, ou sororoca, Scomberomorus brasiliensis, é exemplo de recurso predador historicamente alvo da pesca artesanal, de pequena escala, na costa brasileira. O presente trabalho analisa os valores de desembarque do recurso em três períodos ao longo de 50 anos na costa paranaense, sul do Brasil, com objetivo de avaliar se sua produção tem efetivamente diminuído. Ainda, estuda-se a dieta da espécie na região, para confirmar seus hábitos carnívoros e avaliar o nível trófico na região. Os resultados mostram que, surpreendentemente, dos anos 1970 para 2019 a produção de S. brasiliensis tem aumentado em valores absolutos, bem como relativamente à de outros recursos, em que pese o nível trófico 4,238, similar a outras espécies do gênero. Constata-se que a pesca da cavala na região de estudo constitui um caso de aumento nos desembarques a despeito de elevado nível trófico e grande tamanho corpóreo. Os resultados concordam com recente levantamento em nível mundial, que nega existir correlação necessária entre sobrepesca e nível trófico alto, mas fatores que podem explicar os resultados do presente trabalho são discutidos.(AU)

The use of Artificial Intelligence in predicting Respiratory Syncytial Virus-inhibiting flavonoids / O uso da Inteligência Artificial na predição de flavonoides inibidores do Vírus Sincicial Respiratório

Human Respiratory Syncytial Virus (hRSV) infection results in death and hospitalization of thousands of people worldwide each year. Unfortunately, there are no vaccines or specific treatments for hRSV infections. Screening hundreds or even thousands of promising molecules is a challenge for science. We integrated biological, structural, and physicochemical properties to train and to apply the concept of artificial intelligence (AI) able to predict flavonoids with potential anti-hRSV activity. During the training and simulation steps, the AI produced results with hit rates of more than 83%. The better AIs were able to predict active or inactive flavonoids against hRSV. In the future, in vitro and/or in vivo evaluations of these flavonoids may accelerate trials for new anti-RSV drugs, reduce hospitalizations, deaths, and morbidity caused by this infection worldwide, and be used as input in these networks to determine which parameter is more important for their decision.

A infecção pelo Vírus Sincicial Respiratório Humano (hRSV) resulta na morte e hospitalização de milhares de pessoas em todo o mundo a cada ano. Infelizmente, não existem vacinas ou tratamentos específicos para tais infecções. A testagem de centenas, ou mesmo milhares, de moléculas promissoras é um desafio para a ciência. Neste trabalho, nós integramos propriedades biológicas, estruturais e físico-químicas para treinar e aplicar o conceito de inteligência artificial (IA) capaz de prever flavonoides com potencial atividade anti-hRSV. Durante as etapas de treinamento e simulação, a IA produziu resultados com taxas de acerto superiores a 83%, sendo capaz de prever flavonoides ativos ou inativos contra o hRSV. No futuro, avaliações in vitro e/ou in vivo desses flavonoides poderão acelerar os testes de novas drogas anti-RSV, reduzir hospitalizações, mortes e morbidade causadas por essa infecção. Além disso, a validação futura destes dados poderá determinar qual parâmetro tem maior peso na decisão da inteligência.

Spintherobolus papilliferus in the rio Ribeira de Iguape basin: implications for the biogeography and conservation of an endangered species (Ostariophysi: Characiformes)

Spintherobolus papilliferus is an endangered characid endemic of the Atlantic Rainforest, known from sparse locations in the upper rio Tietê basin around the metropolitan area of São Paulo city, and from an affluent of rio Itapanhaú, a coastal stream in Bertioga, São Paulo State. In 2020, S. papilliferus was sampled from the rio Ribeira de Iguape basin in Juquitiba, São Paulo State, representing a new distributional record. We compared 17 morphometric and six meristic characters from all specimens with data from the rios Tietê and Itapanhaú. An overlap in the morphological data from the three populations was detected, except for five measure whose values are lower in rio Ribeira de Iguape. MANOVA and LDA revealed that this population differs significantly from the other two, showing shallower body and caudal peduncle, among other features. These morphological differences may be due to environmental selective pressures since rio Ribeira de Iguape drainage is marked by fast waters which can influence the shape of fish bodies over time. DNA-barcoding of all Spintherobolus species corroborate that the rio Ribeira de Iguape population belongs to S. papilliferus. We also present a hypothesis for the disjunct distribution of S. papilliferus involving headwater capture and discuss the implications for the conservation of this endangered species.

Spintherobolus papilliferus é um caracídeo endêmico da Mata Atlântica e ameaçado de extinção, conhecido de localidades esparsas na bacia do alto rio Tietê, região metropolitana da cidade de São Paulo, e de um afluente do rio Itapanhaú, um riacho costeiro em Bertioga, Estado de São Paulo. Em 2020, S. papilliferus foi amostrada na bacia do rio Ribeira de Iguape em Juquitiba, São Paulo, representando um novo registro de distribuição. Comparamos 17 caracteres morfométricos e seis merísticos dos exemplares com dados dos rios Tietê e Itapanhaú. Houve sobreposição nos valores dos dados exceto em cinco medidas cujos valores são menores no rio Ribeira de Iguape. MANOVA e LDA revelaram que esta população difere significativamente das demais populações, sendo estes exemplares caracterizados pelas menores alturas do corpo e pedúnculo caudal, dentre outras características. Estas diferenças morfológicas possivelmente decorrem de pressões ambientais, pois a drenagem do rio Ribeira de Iguape possui ambientes de corredeiras velozes que podem influenciar no formato do corpo dos peixes. DNA-barcoding de todas as espécies de Spintherobolus corroborou que a população do rio Ribeira de Iguape pertence à S. papilliferus. Apresentamos também uma hipótese para a distribuição disjunta de S. papilliferus envolvendo captura de cabeceiras e discutimos implicações para a conservação dessa espécie ameaçada.

Fixed bilateral endo-exo prostheses in feline femur - case report / Endo-exoprótese bilateral fixa em fêmur de felino - relato de caso

The use of endo-exo prosthesis is an alternative to improve the quality of life of amputees, allowing correct distribution of body weight, reducing skin problems and pain related to the implant, and reducing lameness. The aim of this paper is to report the use of a fixed bilateral endo-exo femur prostheses in a cat with amputation prior to treatment. The endoprostheses were made with titanium and the exoprostheses were made with 3D printing technology. A longitudinal craniolateral surgical approach was used and the skin incision was made over the knee-joint, then fascia lata incision, followed by biceps femoris and vastus lateralis muscles retraction, incision through the joint capsule to expose the tibiofemoral joint, disarticulation, and tibia and fibula removal. Afterwards, a femoral leveling osteotomy and insertion of the implant in the medullary canal were performed, being attached in the cis and trans cortical bone. The patient was evaluated in the immediate post-operative and periodically thereafter, showing satisfactory results, without macroscopic signs of rejection, wound dehiscence or infection, fracture, or injury of limbs, and presented adapted walking. Furthermore, it was observed the return to common behaviors for the species.

O uso de endoexoprótese é uma alternativa para melhoria na qualidade de vida de pacientes amputados, permitindo distribuição correta do peso corporal, redução de problemas de pele e dor ligadas ao implante e redução da claudicação. Este trabalho objetivou relatar a utilização de endoexoprótese bilateral fixa em fêmur em felino com amputação prévia ao atendimento. Foram modeladas endopróteses em titânio e exopróteses projetadas e impressas em 3D. O acesso cirúrgico, em ambos os membros, foi realizado por incisão craniolateral transarticular da pele, incisão da fáscia lata, rebatimento dos músculos bíceps femoral e vasto lateral, incisão da cápsula articular para exposição da articulação femorotibial, desarticulação e remoção cirúrgica da tibia e da fibula. Em seguida, realizou-se osteotomia niveladora femoral e inserção do implante no canal medular, sendo esse fixo nas corticais cis e trans. O paciente foi avaliado no pós-cirúrgico imediato e posteriormente de forma periódica, demonstrando resultados satisfatórios, sem sinais macroscópicos de rejeição, deiscência ou infecção da ferida cirúrgica, fratura ou lesão de membros, e apresentava deambulação adaptada. Além disso, foi observado o retorno de comportamentos comuns da espécie.

Investigation of Egg Weight, Ovarian Follicles Morphology and Growth Differentiation Factor 9 mRNA Expression in Potchefstroom Koekoek Chicken Breed

The growth differentiation factor 9 (GDF9) gene plays a vital role in the growth and maturation of ovarian follicles in laying hens. However, its messenger ribonucleic acid (mRNA) expression levels in preovulatory ovarian follicles of indigenous chickens remain poorly understood. The study aimed to identify the association between egg weight and egg quality traits, ovarian follicles morphology, and mRNA expression levels of the GDF9 gene in pre-ovulatory ovarian follicles of the South African Potchefstroom Koekoek chicken breed. The correlation results showed that egg weight (EW) had a positively high significant correlation (p<0.01) with egg width (EWD), yolk weight (YW), shell surface area (SSA), albumen weight (AW), albumen ratio (AR) and egg volume (EV), and a positive significant correlation (p<0.05) with egg length (EL). The Student's T-test results revealed that the numbers of large yellow follicles were significantly lower (p<0.05) than those of small yellow follicles. ANOVA findings showed that there was a significant difference (p<0.05) in the average weight of the large yellow follicles. The quantitative Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-qPCR) findings indicated that there were significant differences (p<0.05) in the mRNA expression levels of the GDF9 gene in preovulatory ovarian follicles of the Potchefstroom Koekoek chicken breed. The mRNA expression was more abundant in F1 and F4 than in other ovarian follicles.(AU)

Equine herpesvirus myeloencephalopathy

Clinical History: A euthanized, 14-year-old, Warmblood gelding that had participated in an equine show was presented for necropsy and diagnostic workup to the San Bernardino laboratory of the California Animal Health and Food Safety Laboratory System. The animal had a 4-day history of mildly swollen limbs and hyperthermia, and developed neurologic signs shortly before euthanasia. Necropsy Findings: The urinary bladder had multifocal to coalescing hemorrhages in the mucosa and approximately 5 ml of turbid urine with sandy sludge (Figure 1). The entire spinal cord was removed and cross-sectioned serially after fixation in 10% neutral-buffered formalin during 48h. Multifocally, in multiple sections of the cervical, thoracic, and lumbar segments, there were uni- or bilateral and asymmetrical, wedge-shaped areas of gray discoloration and hemorrhage (Figures 2-4). In addition, there were extensive hemorrhages around the nerve roots of the cauda equina. Follow-up questions: Five differential diagnoses for the gross lesions in the spinal cord (Fig. 1B-1D) Microscopic description for the lesions in the spinal cord (Fig. 2A-2D) Most likely cause based on clinical history and gross and microscopic findings.

Demography and spatial distribution of a threatened species from the Atlantic Forest in southern Brazil: differences between urban and rural remnants / Demografia e distribuição espacial de uma espécie ameaçada da Floresta Atlântica no sul do Brasil: diferenças entre remanescentes urbano e rural

Logging and agricultural exploitation have led to the degradation of Araucaria Forest remnants and the alteration of its last preserved patches. This forest typology contains many endangered plant species, as is the case of the tree Oreopanax fulvus Marchal. To support conservation of this species and understand how different landscape matrices can influence its populations, we evaluated the demographic structure and spatial distribution of O. fulvus in two Araucaria Forest remnants in Paraná state. We delimited two plots (urban and rural population), each with 1 ha, subdivided them into 100 subplots (10 x 10 m), and recorded diameter at ground level (DGL), height, and coordinates of two post-germinative developmental stage of individuals. In each subplot, we measured slope, luminosity, and canopy height. We used Ripley's K function analysis to describe distribution patterns of the species and the spatial relationship between mature and juvenile trees. We performed correlations between abundance and environmental and structural variables of the O. fulvus populations. Abundance varied between remnants, from 183 individuals/ha (12 mature and 171 juvenile) to 1306 individuals/ha (10 and 1296). The remnants varied in abundance and plant frequency. The species showed an investment in seedling banks. Most juvenile had DGL up to 3.0 cm and height up to 1.0 m and presented aggregated spatial distribution, while adults had random distribution. In the rural population juvenile abundance were correlated with canopy height (positively) and distance to mature trees (negatively). The slope was correlated for both sites, but oppositely, indicating that other factors might have interfered in the regeneration abundance. The urban remnant showed a high abundance of this endangered species, calling attention for potential studies in urban arborization, management and conservation of these remnants.

A exploração madeireira e agrícola levou à degradação dos fragmentos de Floresta com Araucária e à alteração de seus últimos fragmentos preservados. Esta tipologia florestal contém muitas espécies de plantas ameaçadas, como é o caso de Oreopanax fulvus Marchal. Para apoiar a conservação desta espécie e entender como diferentes matrizes da paisagem podem influenciar suas populações, avaliamos a estrutura demográfica e a distribuição espacial de O. fulvus em dois remanescentes de Floresta com Araucária no estado do Paraná. Delimitamos duas parcelas (população urbana e rural), cada uma com 1 ha, subdivididas em 100 subparcelas (10 x 10 m), registrando-se o diâmetro ao nível do solo (DGL), a altura e as coordenadas de dois estágios de desenvolvimento pós-germinativo de indivíduos. Em cada subparcela, medimos declividade, luminosidade e altura do dossel. Utilizamos função K de Ripley para descrever os padrões espaciais da espécie e a relação espacial entre árvores maduras e juvenis. Realizamos análise de correlação entre a abundância e as variáveis ambientais e estruturais das populações de O. fulvus. A abundância variou entre os remanescentes, de 183 indivíduos/ha (12 maduros e 171 juvenis) a 1306 indivíduos/ha (10 e 1296). Os remanescentes apresentaram variações na abundância e frequência de indivíduos. A espécie demonstrou investimento na formação de banco de plântulas. A maioria dos juvenis tinha DGL até 3,0 cm e altura até 1,0 m e apresentaram distribuição espacial agregada, enquanto os adultos tiveram distribuição aleatória. Na população rural a abundância de juvenis foi correlacionada com altura do dossel (positivamente) e com a distância de árvores maduras (negativamente). A declividade foi correlacionada em ambos os locais, mas de forma oposta, indicando que outros fatores podem ter interferido na abundância da regeneração. O remanescente urbano mostrou elevada abundância desta espécie ameaçada, demonstrando um potencial para estudos de arborização urbana, manejo e conservação destes remanescentes.