Association Analysis Between Polymorphism of Gonadotrophin Releasing Hormone Genes and Growth Traits of Quail (Coturnix Coturnix)

This study investigated SNP mutation sites of Gonadotrophin releasing hormone (GnRH) gene in China yellow quail, Beijing white quail and Korean quail through PCR amplification and DNA sequencing technologies. Moreover, polymorphism of GnRH gene and its association with growth traits of quail were analyzed, aiming to get molecular markers associated to growth traits of quail, which could provide references for breeding of new quail species. According to research results, a total of 14 SNP mutation sites of GnRH were detected in China yellow quail, Beijing white quail and Korean quail, which were C71T, C108T, C168T, C178T, A184G, C206T, A209C, C215T, A252G, A279T, C281T, C293G, C339T and C458T. Except that only 2 genotypes were detected for A209C and C281T in China yellow quail and Beijing white quail, 3 genotypes were detected for all of the remaining 12 SNP mutation sites in three quail species. Of the 14 SNP sites, C71T, A209C, C215T, C281T, C293G, C339T and C458T were significantly associated with body weight (p 0.05), C71T, C108T, C168T, C178T, A184G, C206T, C215T, A252G, C293G, C339T and C458T were significantly associated with shank length (p 0.05), C71T, C215T, C293G and C458T were significantly associated with breastbone length (p 0.05), A209C and C281T were significantly associated with shank circumference (p 0.05).(AU)

Association Analysis Between Polymorphism of Gonadotrophin Releasing Hormone Genes and Growth Traits of Quail (Coturnix Coturnix)

This study investigated SNP mutation sites of Gonadotrophin releasing hormone (GnRH) gene in China yellow quail, Beijing white quail and Korean quail through PCR amplification and DNA sequencing technologies. Moreover, polymorphism of GnRH gene and its association with growth traits of quail were analyzed, aiming to get molecular markers associated to growth traits of quail, which could provide references for breeding of new quail species. According to research results, a total of 14 SNP mutation sites of GnRH were detected in China yellow quail, Beijing white quail and Korean quail, which were C71T, C108T, C168T, C178T, A184G, C206T, A209C, C215T, A252G, A279T, C281T, C293G, C339T and C458T. Except that only 2 genotypes were detected for A209C and C281T in China yellow quail and Beijing white quail, 3 genotypes were detected for all of the remaining 12 SNP mutation sites in three quail species. Of the 14 SNP sites, C71T, A209C, C215T, C281T, C293G, C339T and C458T were significantly associated with body weight (p 0.05), C71T, C108T, C168T, C178T, A184G, C206T, C215T, A252G, C293G, C339T and C458T were significantly associated with shank length (p 0.05), C71T, C215T, C293G and C458T were significantly associated with breastbone length (p 0.05), A209C and C281T were significantly associated with shank circumference (p 0.05).

Identification of novel single nucleotide polymorphisms in the growth hormone ( GH ) gene in Anatolian water buffalo ( Bubalus bubalis ) populations in Turkey

This study was conducted to investigate the growth hormone (GH; somatotropin-like) gene polymorphisms in 150 water buffalo (Bubalus bubalis) from different regions of Turkey. 404 bp long partial intron 4, exon 5, 3' UTR regions of the GH gene (also called GH/AluI locus) and 347 bp long exon-intron 3 and partial exon 4 regions of the GH gene (also called GH/MspI locus) were amplified, and their PCR products analyzed via DNA sequencing method. Seven genotypes due to twenty single nucleotide polymorphisms (SNP) and one deletion/insertion were identified in a 347 bp long region of the GH/MspI locus. A missense mutation from glycine to glutamate amino acid and four silent mutations in the serine, threonine, and asparagine amino acids were determined in the exon 3 region of the GH gene. Four genotypes due to eight SNP were identified in a 404 bp long region of the GH/AluI locus. A missense mutation from lysine to arginine amino acid and six silent mutations in Leucine, aspartate, histidine, lysine, arginine, and cysteine amino acids were revealed in the exon 5 region of the GH gene. The partial DNA sequence of the GH gene in water buffalos was reported, and these sequences were deposited at the NCBI Genbank database with the accession numbers MN266903-MN266909 and MN530973-MN530976. These SNP may have an effect on economic (such as body composition) and carcass traits, reproduction, and milk yield and content in water buffalo populations and may prove to be useful for water buffalo breeding.(AU)

Phylogeny of the Trichogramma endosymbiont Wolbachia, an alpha-proteobacteria (Rickettsiae) / Filogenia do endosimbionte Wolbachia em Trichogramma, an alpha-proteobacteria (Rickettsiae)

Wolbachia (Hertig) endosymbionts are extensively studied in a wide range of organisms and are known to be transmitted through the egg cytoplasm to the offsping. Wolbachia may cause several types of reproductive modifications in arthropods. In Trichogramma species, parthenogenesis-inducing Wolbachia bacteria allow females wasps to produce daughters from unfertilized eggs and these bacteria are present in at least 9% of all Trichogramma species. Phylogenetic studies have led to the subdivision of the Wolbachia clade in five supergroups (A, B, C, D and E) and Wolbachia from Trichogramma belong to supergroup B. Here, using the wsp gene, four groups of Wolbachia that infect Trichogramma species were distinguished and the addition of a new group Ato was suggested due to the addition of Wolbachia from Trichogramma atopovirilia (Oatman and Platner). Specific primers were designed and tested for the Ato group. Seventy-five percent of all evaluated Wolbachia strains from Trichogramma fell within Sib group.(AU)

Endosimbiontes do gênero Wolbachia (Hertig) são extensivamente estudados em uma ampla gama de organismos e são conhecidos por serem transmitidos via citoplasma do ovo hospedeiro para seu descendente. Wolbachia pode causar vários tipos de alterações reprodutivas nos artrópodes. Nas espécies de Trichogramma, a reprodução partenogenética induzida por Wolbachia, possibilita as fêmeas dos parasitoides a produção de fêmeas a partir de ovos não fertilizados e estas bactérias estão presentes em pelo menos 9% de todas as espécies de Trichogramma. Estudos filogenéticos têm levado a subdivisão do clado Wolbachia em cinco supergrupos (A, B, C, D and E). Wolbachia em Trichogramma pertence ao supergrupo B. Com o gene wsp foi possível se distinguir quatro grupos de Wolbachia que infectam Trichogramma e adicionar um novo grupo (Ato) devido a inclusão de Wolbachia detectada em Trichogramma atopovirilia (Oatman and Platner, 1983). Primers específicos foram construídos e testados para o grupo Ato. Setenta e cinco por cento de todas as linhagens de Wolbachia que infectam Trichogramma se enquadraram dentro do grupo Sib.(AU)

Phylogeny of the Trichogramma endosymbiont Wolbachia, an alpha-proteobacteria (Rickettsiae)

Abstract Wolbachia (Hertig) endosymbionts are extensively studied in a wide range of organisms and are known to be transmitted through the egg cytoplasm to the offsping. Wolbachia may cause several types of reproductive modifications in arthropods. In Trichogramma species, parthenogenesis-inducing Wolbachia bacteria allow females wasps to produce daughters from unfertilized eggs and these bacteria are present in at least 9% of all Trichogramma species. Phylogenetic studies have led to the subdivision of the Wolbachia clade in five supergroups (A, B, C, D and E) and Wolbachia from Trichogramma belong to supergroup B. Here, using the wsp gene, four groups of Wolbachia that infect Trichogramma species were distinguished and the addition of a new group Ato was suggested due to the addition of Wolbachia from Trichogramma atopovirilia (Oatman and Platner). Specific primers were designed and tested for the Ato group. Seventy-five percent of all evaluated Wolbachia strains from Trichogramma fell within Sib group.

Resumo Endosimbiontes do gênero Wolbachia (Hertig) são extensivamente estudados em uma ampla gama de organismos e são conhecidos por serem transmitidos via citoplasma do ovo hospedeiro para seu descendente. Wolbachia pode causar vários tipos de alterações reprodutivas nos artrópodes. Nas espécies de Trichogramma, a reprodução partenogenética induzida por Wolbachia, possibilita as fêmeas dos parasitoides a produção de fêmeas a partir de ovos não fertilizados e estas bactérias estão presentes em pelo menos 9% de todas as espécies de Trichogramma. Estudos filogenéticos têm levado a subdivisão do clado Wolbachia em cinco supergrupos (A, B, C, D and E). Wolbachia em Trichogramma pertence ao supergrupo B. Com o gene wsp foi possível se distinguir quatro grupos de Wolbachia que infectam Trichogramma e adicionar um novo grupo (Ato) devido a inclusão de Wolbachia detectada em Trichogramma atopovirilia (Oatman and Platner, 1983). Primers específicos foram construídos e testados para o grupo Ato. Setenta e cinco por cento de todas as linhagens de Wolbachia que infectam Trichogramma se enquadraram dentro do grupo Sib.

Phylogeny of the Trichogramma endosymbiont Wolbachia, an alpha-proteobacteria (Rickettsiae)

Abstract Wolbachia (Hertig) endosymbionts are extensively studied in a wide range of organisms and are known to be transmitted through the egg cytoplasm to the offsping. Wolbachia may cause several types of reproductive modifications in arthropods. In Trichogramma species, parthenogenesis-inducing Wolbachia bacteria allow females wasps to produce daughters from unfertilized eggs and these bacteria are present in at least 9% of all Trichogramma species. Phylogenetic studies have led to the subdivision of the Wolbachia clade in five supergroups (A, B, C, D and E) and Wolbachia from Trichogramma belong to supergroup B. Here, using the wsp gene, four groups of Wolbachia that infect Trichogramma species were distinguished and the addition of a new group Ato was suggested due to the addition of Wolbachia from Trichogramma atopovirilia (Oatman and Platner). Specific primers were designed and tested for the Ato group. Seventy-five percent of all evaluated Wolbachia strains from Trichogramma fell within Sib group.

Resumo Endosimbiontes do gênero Wolbachia (Hertig) são extensivamente estudados em uma ampla gama de organismos e são conhecidos por serem transmitidos via citoplasma do ovo hospedeiro para seu descendente. Wolbachia pode causar vários tipos de alterações reprodutivas nos artrópodes. Nas espécies de Trichogramma, a reprodução partenogenética induzida por Wolbachia, possibilita as fêmeas dos parasitoides a produção de fêmeas a partir de ovos não fertilizados e estas bactérias estão presentes em pelo menos 9% de todas as espécies de Trichogramma. Estudos filogenéticos têm levado a subdivisão do clado Wolbachia em cinco supergrupos (A, B, C, D and E). Wolbachia em Trichogramma pertence ao supergrupo B. Com o gene wsp foi possível se distinguir quatro grupos de Wolbachia que infectam Trichogramma e adicionar um novo grupo (Ato) devido a inclusão de Wolbachia detectada em Trichogramma atopovirilia (Oatman and Platner, 1983). Primers específicos foram construídos e testados para o grupo Ato. Setenta e cinco por cento de todas as linhagens de Wolbachia que infectam Trichogramma se enquadraram dentro do grupo Sib.

Hemoparasitos em mamíferos silvestres oriundos da Mata Atlântica-Bahia: Um estudo de revisão sistemática, meta-análise e detecção molecular.

DE ALMEIDA, P.H.A. Hemoparasitos em mamíferos silvestres oriundos da Mata Atlântica-Bahia: Um estudo de revisão sistemática, meta-análise e detecção molecular. 2020, 93p. Tese (Doutorado em Ciência Animal nos Trópicos) - Escola de Medicina Veterinária e Zootecnia Universidade Federal da Bahia. A Mata Atlântica é um bioma que apresenta uma grande diversidade de espécies endêmicas, como também a que possui o maior índice de espécies com perigo de extinção, fato este que torna o bioma como um hotspot para a preservação da biodiversidade. O desequilíbrio ambiental possui um forte poder na difusão e no aparecimento de doenças parasitárias em mamíferos silvestres, e dentre as parasitoses encontradastem-se aquelas causadas por protozoários. Dessa forma, o objetivo deste trabalho foi avaliar as taxas de infecção entre diferentes ordens de mamíferos no Brasil, através da revisão sistemática e meta-análise e conhecer a diversidade de protozoários em pequenos mamíferos oriundos do litoral Sul baiano no Estado da Bahia. Para a revisão foi realizada uma busca nas bases de dados Pubmed, Medline, Lilacs, Science direct e Scielo, sem filtro de idioma e com filtro de tempo de 2000-2020. Para condução desse processo, adotou-se a ferramenta StArt. Com base nos critérios de seleção todos os estudos que relatavam a infecção de T. cruzi em mamíferos silvestres no Brasil foram escolhidos. Para análises estatísticas foi utilizada a estatística descritiva e a meta-análise do evento dicotômico com a distribuição binominal, conduzida em Microsoft Excel. Para avaliar a heterogeneidade entre os estudos foi utilizado o cálculo das estatísticas Q e I 2 . Depois de ler todos os resumos e com base nos critérios de seleção, 35 estudos continha informações importantes da infecção em mamíferos silvestres. Entre as nove ordens de mamíferos silvestres identificadas como reservatório para o T. cruzi, três dessas ordens apresentaram maior frequência combinada: Chiroptera (55,57%); Carnívora (38,10%) e Primata (27,85%), pelo diagnóstico molecular. A detecção de protozoários foi realizada a partir de amostras de tecidos de mamíferos silvestres das ordens Rodentia e Didelphimorphia, em pool de órgãos (coração, encéfalo, pulmão, fígado e baço) de cada animal, que foram macerados e armazenados a -20oC. Para a detecção de T. cruzi foi realizada extração de DNA utilizando kit comercial e quantificação em NanoDrop®, seguida de nested-PCR para amplificação de sequências de kDNA com uso dos iniciadores S17 e S18. Dos 153 mamíferos silvestres identificados na ordem Didelphimorphia e Rodentia, foram examinados exemplares de seis e treze espécies de cada ordem, respectivamente. Um Didelphis aurita apresentou amplificação de DNA compatível com Trypanosoma ssp, correspondendo a 0,65% das amostras examinadas. Para a análise dos pools obtidos foi utilizada a técnica de sequenciamento de nova geração a partir da Plataforma Ion Torrent, foram retiradas as suspensões de tecidos que compuseram pools de até 25 amostras, agrupadas considerando as espécies de mamíferos e o seu local de origem: Una, Ilhéus, Belmonte e Mascote, resultando num total de 15 pools. Os pools obtidos foram sequenciados na Plataforma Ion Torren, sendo detectados Plasmodium berghei e P. yeolli yeolli em roedores (Hylaeamys laticeps e Thaptomys nigrita) e marsupiais (Marmosa murina) e Besnoitia besnoiti em marsupiais (Marmosa demerarae) e roedores (Akodon cursor). Nesse estudo, não houve associação entre a espécie de protozoário detectado e o município de origem da amostra, bem como a espécie. O presente estudo permitiu verificar a presença de protozoários em mamíferos silvestres no litoral Sul do Estado da Bahia, utilizando técnicas moleculares. Além disso, a revisão sistemática e meta-análise servirão como base para informar o atual contexto da infecção de T. cruzi em mamíferos silvestres noBrasil.

DE ALMEIDA, P.H.A. Molecular detection of protozoa in wild animals from Atlantic Forest. 2020, 92p. Thesis (PhD in Animal Science in the Tropics) - Escola de Medicina Veterinária e Zootecnia Universidade Federal da Bahia. The Atlantic Forest is a biome that presents a great diversity of endemic species, as well asthe one that has the highest index of endangered species, a fact that makes the biome a hotspot for the preservation of biodiversity. The environmental imbalance has a strong power in the diffusion and the appearance of parasitic diseases in wild mammals, and among the parasites found there are those caused by protozoa. Thus, the objective of this work was to evaluate the infection rates among different orders of mammals in Brazil, through systematic review and meta-analysis and to know the diversity of protozoa in small mammals from the south coast of Bahia in the State of Bahia. For the review, a search was carried out in the databases Pubmed, Medline, Lilacs, Science direct and Scielo, without language filter and with 2000-2020 time filter. To conduct this process, the StArt tool was adopted. Based on the selection criteria, all studies that reported T. cruzi infection in wild mammals in Brazil were chosen. For statistical analysis, descriptive statistics, and meta-analysis of the dichotomous event with binomial distribution were used, conducted in Microsoft Excel. To assess the heterogeneity between the studies, the calculation of the Q and I 2 statistics was used. After reading all the abstracts and based on the selection criteria, 35 studies contained important information on infection in wild mammals. Among the nine orders of wild mammals identified as a reservoir for T. cruzi, three of these orders had the highest combined frequency: Chiroptera (55.57%); Carnivorous (38.10%) and Primate (27.85%), due to molecular diagnosis. The detection of protozoa was performed using tissue samples from wild mammals of the orders Rodentia and Didelphimorphia, in an organ pool (heart, brain, lung, liver and spleen) of each animal, which were macerated and stored at -20oC. For the detection of T. cruzi, DNA extraction was performed using a commercial kit and quantification in NanoDrop®, followed by nested-PCR for amplification of kDNA sequences using primers S17 and S18. Of the 153 wild mammals identified in the order Didelphimorphia and Rodentia, specimens of six and thirteen species of each order, respectively, were examined. A Didelphis aurita showed amplification of DNA compatible with Trypanosoma ssp, corresponding to 0.65% of the samples examined. For the analysis of the pools obtained, the new generation sequencing technique was used from the Ion Torrent Platform, the suspensions of tissues that composed pools of up to 25 samples were removed, grouped considering the mammal species and their place of origin: Una , Ilhéus, Belmonte and Mascote, resulting in a total of 15 pools. The pools obtained were sequenced on the Ion Torren Platform, with Plasmodium berghei and P. yeolli yeolli being detected in rodents (Hylaeamys laticeps and Thaptomys nigrita) and marsupials (Marmosa murina) and Besnoitia besnoiti in marsupials (Marmosa demerarae) and rodents (Akodon cursor). In this study, there was no association between the detected protozoan species and the municipality of origin of the sample, as well as the species. The present study allowed to verify the presence of protozoa in wild mammals on the southern coast of the State of Bahia, using molecular techniques. In addition, the systematic review and meta-analysis will serve as a basis to inform the current context of T. cruzi infection in wild mammals in Brazil.

Helmintoses de ruminantes: i. Viabilidade econômica do tratamento anti-helmíntico; ii. Perfil da resistência anti-helmíntica de nematódeos gastrointestinais de ruminantes

A resistência de nematódeos do trato gastrintestinal é um problema emergente dentro da produção de ruminantes no Brasil e outras regiões do mundo, sendo amplamente relacionada a déficits nos índices produtivos devido aos seus efeitos no bem-estar e saúde destes animais. No entanto, alguns aspectos como o impacto econômico decorrente desta problemática, por exemplo, ainda necessitam de maior investigação. Portanto, os objetivos deste estudo foram: (1) verificar a relação custo/benefício do tratamento com diferentes compostos anti-helmínticos na produtividade de animais naturalmente infectados em propriedades de sistema extensivo de criação de bovinos de corte com diferentes estratégias nutricionais após o desmame; (2) avaliar a população de nematódeos em bovinos e ovinos que compartilham áreas de pastejo antes e após o tratamento com diferentes anti-helmínticos, e avaliar a eficácia destes tratamentos nestas espécies de ruminantes em animais naturalmente infectados oriundos de sete propriedades. Adicionalmente, para os grupos de bovinos e ovinos tratados com um benzimidazole, investigar a presença de co-infecções por Haemonchus através de avaliações via reação em cadeia da polimerase (PCR). No Capítulo 1, avaliamos a eficácia de 5 anti-helmínticos diferentes e sua relação com o ganho de peso de terneiros sob regimes alimentares diferentes após o desmame, realizando uma análise econômica com os dados obtidos após 150 dias de avaliação em quatro propriedades do estado do Rio Grande do Sul. Em duas destas fazendas, 1 e 3, o anti-helmíntico mais eficaz resultou no maior retorno financeiro e nas demais (propriedades 2 e 4) o grupo ivermectina 3.15% e grupo controle, respectivamente, obtiveram os melhores resultados. No Capítulo 2, primeiramente, avaliamos 6 compostos anti-helmínticos diferentes no tratamento de bovinos e ovinos e a população de nematódeos presentes nestes ruminantes em áreas de pastejo compartilhadas. Os resultados obtidos revelaram certa similaridade tanto nos status de eficácia dos produtos como nos helmintos infetando nestes animais. Em uma segunda etapa, através de PCR observamos a presença de co-infecção nos bovinos e ovinos por espécies de Haemonchus, principalmente nas culturas de fezes pré-tratamento, bem como a possibilidade da infecção causada por híbridos deste parasito em uma das propriedades avaliadas.

Resistance of gastrointestinal nematodes is an emerging problem in ruminant production in Brazil and other regions of the world, and is largely related to deficits in productive indexes due to its effects on the welfare and health of these animals. However, some aspects such as the economic impact resulting from this problem, for example, still need further investigation. Thus, the aims of this study were: (1) to verify the cost / benefit of the treatment with different anthelmintic compounds in the productivity of naturally infected animals in extensive system farms of beef cattle with different nutritional strategies after weaning; (2) to evaluate nematode populations in cattle and sheep that share grazing areas before and after treatment with different anthelmintics, and to evaluate the efficacy of these treatments on naturally infected ruminants from seven different farms. Additionally, for groups of cattle and sheep treated with a benzimidazole, we investigated the presence of co-infections by Haemonchus through polymerase chain reaction (PCR) evaluations. In Chapter 1, we evaluated the efficacy of five different anthelmintics and their relationship to the weight gain of calves under different diets after weaning by performing an economic analysis with the data obtained from 150 days of evaluation at four farms from Rio Grande do Sul state. In two of these properties, farms1 and 3, the most effective anthelmintic resulted in the highest financial return and in the others (farms 2 and 4) the ivermectin group 3.15% and control group, respectively, obtained the best results. In Chapter 2, we first evaluated six different anthelmintic compounds in the treatment of cattle and sheep and the nematode population present in these ruminants in shared grazing areas. The results obtained revealed a certain similarity both in the efficacy status of the products and in the helminths presents in these animals. In a second moment, we observed the presence of co-infection in cattle and sheep by Haemonchus species, especially in pre-treatment feces cultures, as well as the possibility of infection caused by hybrids of this parasite in one of the evaluated properties

Diagnóstico laboratorial de Sarcocystis spp. em bovinos

Testes sorológicos são frequentemente utilizados para confirmar a infecção por Sarcocystis spp. e também são úteis para avaliação de um grande número de amostras. Testes moleculares proporcionam a detecção e caracterização de espécies de Sarcocystis. Portanto, os objetivos deste estudo foram: (1) investigar a infecção por Sarcocystis spp. em corações de bovinos, através de exame microscópico direto, reação em cadeia pela polimerase (PCR), polimorfismo no comprimento do fragmento de restrição (PCR-RFLP) e sequenciamento de DNA; (2) investigar a infecção por Sarcocystis spp. em bovinos pelo exame microscópico direto, confirmar a identidade dos sarcocistos por PCR e avaliar e correlacionar seus resultados com o diagnóstico sorológico dos bovinos pela imunofluorescência indireta; (3) comparar a imunofluorescência indireta (RIFI) e método de Dot-Blot para diagnóstico sorológico de infecção por Sarcocystis spp. em camundongos experimentalmente infectados e detectar possíveis reações sorológicas cruzadas com N. caninum e T. gondii. No Capítulo 1 desta tese apresenta-se um estudo no qual amostras de miocárdio de 314 bovinos foram coletadas de um frigorífico e analisados quanto a ocorrência de sarcocistos por microscopia óptica. Sarcocistos isolados de 134 destes corações foram submetidos à extração de DNA e PCR. O DNA amplificado foi digerido com enzimas de restrição BclI e RsaI para diferenciação entre S. cruzi, S. hirsuta e S. hominis. A espécie de Sarcocystis identificada foi confirmada por sequenciamento de DNA. Sarcocistos foram detectados em todas as amostras de miocárdio de bovinos avaliadas. A PCR-RFLP e sequenciamnto de DNA resultaram na identificação de S. cruzi. No estudo apresentado no Capítulo 2 foram coletadas amostras de miocárdio e sangue de 50 bovinos adultos de um frigorífico. Cada miocárdio foi submetido a exame microscópico a fresco para pesquisa de cistos compatíveis com Sarcocystis spp. Dez sarcocistos foram coletados de cada amostra e processados para extração de DNA seguida de PCR para diagnóstico molecular de Sarcocystis spp. A presença de anticorpos contra o parasito foi testada pela RIFI no soro sanguíneo. A frequência de detecção de sarcocistos pelo exame a fresco foi de 100% (50/50). Anticorpos específicos contra Sarcocystis spp. foram detectados em 96% (48/50) e 80% (40/50) das amostras de soro testadas na diluição de 1:25 e 1:200, respectivamente. DNA de Sarcocystis spp. foi amplificado pela PCR em 86% (43/50) dos cistos coletados. Os métodos empregados permitiram detectar a infecção por Sarcocystis spp. e a RIFI mostrou uma sensibilidade satisfatória em comparação com exame microscópico a fresco. No estudo apresentado no Capítulo 3, foram realizados exames sorológicos (RIFI e Dot-blot) de camundongos inoculados com Sarcocystis spp. ou N. caninum ou T. gondii. Dot-Blot demonstrou mesma sensibilidade e especificidade que a RIFI para diagnóstico sorológico de Sarcocystis em camundongos experimentalmente infectados e este teste não demonstrou reação sorológica cruzada com N. caninum e T. gondii.

Serological tests are frequently performed to confirm Sarcocystis spp. infection and they also are suitable to evaluate a large number of samples. Molecular tests provide detection and characterization of species. Therefore, the aims of the study were: (1) investigate Sarcocystis spp. infection in cattle hearts through direct microscopic examination, polymerase chain reaction (PCR), restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) and DNA sequencing (2) detect Sarcocystis spp. infection in cattle through direct microscopic examination, confirm sarcocysts identity by PCR and evaluate and correlate these results with the serological diagnosis of cattle by indirect immunofluorescence (3) compare indirect imunnofluorescence (IFAT) and Dot-Blot method for serological diagnosis of Sarcocystis spp. in experimentally infected mice and detect serological cross-reactions with N. caninum and T. gondii. Chapter 1 of this thesis presents a study that myocardium samples were collected from 314 bovine in an abattoir and analyzed for the occurrence of sarcocysts by light microscopy. Sarcocysts isolated from 134 of these hearts were submitted to DNA extraction and PCR. PCR-amplified DNA fragments were digested with the restriction enzymes BclI and RsaI aiming the differentiation among S. cruzi, S. hirsuta, and S. hominis and the identified Sarcocystis species was confirmed by DNA sequencing. Sarcocysts were detected in all bovine myocardium samples. PCR-RFLP and DNA sequencing resulted in identification of S. cruzi. In the study presented in Chapter 2, myocardium and blood samples from 50 adult beef cattle were collected from a slaughterhouse. Each myocardium was submitted to fresh microscopic examination for investigation of compatible cysts to Sarcocystis spp. Ten sarcocysts were collected of each sample and processed to DNA extraction followed by PCR for molecular diagnosis of Sarcocystis spp. The presence of antibodies against the parasite was tested by IFAT in the blood serum. The frequency of sarcocysts detection by fresh examination was 100% (50/50). Specific antibodies against Sarcocystis spp. were detected in 96% (48/50) and 80% (40/50) of serum samples examined at 1:25 and 1:200 dilutions, respectively. DNA from Sarcocystis spp. was amplified by PCR in 86% (43/50) of the collected cysts. The methods employed allowed to detect the infection by Sarcocystis spp. and RIFI showed good sensitivity compared to fresh microscopic examination. In the study presented in Chapter 3, serological tests (RIFI and Dot-blot) of mice inoculated with Sarcocystis spp. or N. caninum or T. gondii. Dot-Blot showed same specificity and sensibility as IFAT for immunological diagnostic of Sarcocystis spp. in experimentally infected mice and this immunoblot test did not demonstrate serological cross-reactions with N. caninum and T. gondii.

Caracterização molecular de Cryptosporidium spp. e ocorrência dos principais parasitas gastrointestinais em amostras fecais de cães e gatos naturalmente infectados

Cães e gatos são hospedeiros definitivos de inúmeros parasitas do trato gastrointestinal e propiciam a mantença do ciclo biológico, uma vez que, eliminam nas fezes ovos de helmintos e cistos e oocistos de protozoário, favorecendo a contaminação do ambiente e a propagação de doenças. O estreitamento no convívio entre os animais de companhia e o homem intensifica a exposição humana a parasitas com potencial zoonótico como, por exemplo, Ancylostoma spp., Toxocara spp., Giardia duodenalis e Cryptosporidium spp. Considerando o papel dos animais de companhia nas zoonoses parasitárias, o objetivo deste trabalho foi investigar o parasitismo gastrointestinal e caracterizar as espécies de Cryptosporidium spp. encontradas em cães e gatos naturalmente infectados. Para isso foram coletadas 177 amostras de fezes, sendo 128 coletadas de cães e 49 de gatos de ambos os sexos e idades variadas. As amostras de fezes foram obtidas de animais atendidos no Hospital Veterinário Universitário (HVU) da Universidade Federal de Santa Maria (UFSM), Santa Maria, Rio Grande do Sul, no período de fevereiro a abril de 2017. Nas análises utilizando as técnicas de Sheather e Faust e coloração de Ziehl Neelsen, verificou-se a ocorrência de um ou mais parasitas do trato gastrointestinal em 56,2% das amostras fecais de cães examinadas, e 53,0% amostras de fezes de gatos. Nos cães Ancylostoma spp. (36,7 %) foi o parasita mais frequente, seguido por Cryptosporidium spp. (22,6%), Giardia spp. (4,6%), Cystoisospora spp. (3,1%), Taenia spp. (3,1%), Toxocara canis (3,1%), Trichuris spp. (1,5%) e Dipylidium caninum (0,7%). Nos gatos, Cryptosporidium spp. (22,4%) foi mais frequente, seguido de Ancylostoma spp. (18,3%), Cystoisospora spp. (16,3%), Toxocara cati (12,2%), Giardia spp. (4,0%), Spirometra spp. (4,0%), Taenia spp. (4,0%) e Toxascaris leonina (4,0%). A monoinfecção foi identificada em 70,8% dos cães e 46,1% dos gatos. Observou-se a presença de multi-infecção, com ocorrências de 29,2% nos cães e 53,8% nos gatos. Nos cães não houve diferença significativa na faixa etária entre os grupos. Quanto aos gatos, 57,8% dos animais parasitados encontravam-se com idades entre 1 a 4 anos, sendo o fator de risco idade significativo (p<0,05). O gene SSU rRNA de Cryptosporidium spp. foi amplificado em 5,6% (10/177) das amostras fecais analisadas utilizando a técnica de Nested PCR, sendo detectado em 4,6% (6/128) das amostras de fezes de cães e 8,2% (4/49) das amostras de gatos. As amostras positivas foram caracterizadas utilizando o sequenciamento de DNA. Nos cães foram encontradas as espécies C. canis (66,6% - 4/6) e C. parvum (33,3% - 2/6) e nos gatos C. felis (75% - 3/4) e C. parvum (25% - 1/4). Os parasitas gastrointestinais mais frequentes neste estudo são agentes de importância em saúde pública. Desta forma, deve-se ressaltar a importância do controle e prevenção das parasitoses gastrointestinais através do diagnóstico correto e o uso de drogas eficazes.

Dogs and cats are definitive hosts of innumerable parasites of the gastrointestinal tract and promote the maintenance of the biological cycle, since they eliminate eggs from helminths and cysts and protozoan oocysts, favoring the contamination of the environment and the spread of diseases. The narrowing of the interaction between pets and humans enhances human exposure to parasites with zoonotic potential, such as Ancylostoma spp., Toxocara spp., Giardia duodenalis and Cryptosporidium spp. Considering the role of companion animals in parasitic zoonoses, the objective of this work was to investigate the gastrointestinal parasitism and to characterize the species of Cryptosporidium spp. found in naturally infected dogs and cats. For this, 177 samples of feces were collected, 128 were collected from dogs and 49 from cats of both sexes and varied ages. Feces samples were obtained from animals attended at the University Veterinary Hospital (HVU) of the Federal University of Santa Maria (UFSM), Santa Maria, Rio Grande do Sul, from February to April 2017. In the analyzes using the techniques of Sheather and Faust and Ziehl Neelsen staining, one or more parasites of the gastrointestinal tract were found in 56.2% of fecal samples from dogs examined, and 53.0% of cat feces samples. In dogs Ancylostoma spp. (36.7%) was the most frequent parasite, followed by Cryptosporidium spp. (22.6%), Giardia spp. (4.6%), Cystoisospora spp. (3.1%), Taenia spp. (3.1%), Toxocara canis (3.1%), Trichuris spp. (1.5%) and Dipylidium caninum (0.7%). In cats, Cryptosporidium spp. (22.4%) was more frequent, followed by Ancylostoma spp. (18.3%), Cystoisospora spp. (16.3%), Toxocara cati (12.2%), Giardia spp. (4.0%), Spirometra spp. (4.0%), Taenia spp. (4.0%) and Toxascaris leonine (4.0%). Mononfection was identified in 70.8% of dogs and 46.1% of cats. The presence of multi-infection was observed, with occurrences of 29.2% in dogs and 53.8% in cats. In dogs there was no significant difference in the age group between groups. As for cats, 57.8% of the parasitized animals were aged between 1 and 4 years, and the risk factor was significant (p <0.05). The SSU rRNA gene of Cryptosporidium spp. was amplified in 5.6% (10/177) of the fecal samples analyzed using the Nested PCR technique and was detected in 4.6% (6/128) of the feces samples of dogs and 8.2% (4 / 49) of the cat samples. Positive samples were characterized using DNA sequencing. In dogs, C. canis (66.6% - 4/6) and C. parvum (33.3% - 2/6) and C. felis (75% - 3/4) and C. parvum (25% - 1/4). The most frequent gastrointestinal parasites in this study are agents of public health importance. In this way, the importance of the control and prevention of gastrointestinal parasitoses should be emphasized through the correct diagnosis and the use of effective drugs.

Detection of genetic diversity of Anaplasma marginale isolates in Minas Gerais, Brazil / Detecção de diversidade genética de isolados Anaplasma marginale em Minas Gerais, Brasil

Bovine anaplasmosis, caused by the tick-borne rickettsiaAnaplasma marginale, is endemic in tropical and subtropical regions of the world and results in economic losses in the cattle industry. Major surface proteins (MSPs) have been used as markers for the genetic characterization of A. marginale strains and demonstrate that many isolates may occur in a given geographic area. However, in Brazil, little is known about the genetic diversity of A. marginale isolates within individual herds. This study was designed to examine the genetic variation among A. marginale infecting calves in a farm in the south of Minas Gerais State, Brazil. Blood samples collected from 100 calves were used to prepare Giemsastained smears that were microscopically examined for the presence of A. marginale. From each blood sample, DNA was extracted and analyzed by a polymerase chain reaction (PCR), followed by sequencing to determine diversity among the isolates. Examination of blood smears showed that 48% of the calves were infected with A. marginale, while the real-time PCR detected 70.2% positivity. Congenital infections were found in four calves. The microsatellite and tandem repeat analyses showed high genetic diversity among the isolates.

A anaplasmose bovina, causada pela rickettsia Anaplasma marginale e transmitida por carrapatos, é endêmica em regiões tropicais e subtropicais no mundo e causa grandes perdas econômicas na indústria de bovinos. Proteínas principais de superfície (MSPs) foram usados como marcadores para a caracterização genética de amostras de A. marginale, demonstrando que diferentes isolados podem ocorrer numa certa região geográfica. Porém, no Brasil pouco se sabe sobre a variedade genética de isolados de A. marginale em rebanhos individuais. Este estudo teve como objetivo investigar a ocorrência de variação genética entre bezerros infectados com A. marginale numa fazenda do sul de Minas Gerais, Brasil. Amostras de sangue coletadas de 100 bezerros foram utilizadas para o preparo de esfregaços sanguíneos, corados pelo Giemsa, para detecção da infecção por A. marginale. Amostras de DNA extraídas de cada amostra foram analisadas através de PCR seguido de sequenciamento. O exame dos esfregaços demonstrou que 48% dos bezerros estavam infectados com A. marginale, enquanto que o PCR detectou 70,2% de positividade. Infecção congênita foi detectada em quatro bezerros. As análises de microsatélites e 'tandem repeats' comprovaram uma grande diversidade genética entre os isolados.

Detection of genetic diversity of Anaplasma marginale isolates in Minas Gerais, Brazil

Bovine anaplasmosis, caused by the tick-borne rickettsiaAnaplasma marginale, is endemic in tropical and subtropical regions of the world and results in economic losses in the cattle industry. Major surface proteins (MSPs) have been used as markers for the genetic characterization of A. marginale strains and demonstrate that many isolates may occur in a given geographic area. However, in Brazil, little is known about the genetic diversity of A. marginale isolates within individual herds. This study was designed to examine the genetic variation among A. marginale infecting calves in a farm in the south of Minas Gerais State, Brazil. Blood samples collected from 100 calves were used to prepare Giemsastained smears that were microscopically examined for the presence of A. marginale. From each blood sample, DNA was extracted and analyzed by a polymerase chain reaction (PCR), followed by sequencing to determine diversity among the isolates. Examination of blood smears showed that 48% of the calves were infected with A. marginale, while the real-time PCR detected 70.2% positivity. Congenital infections were found in four calves. The microsatellite and tandem repeat analyses showed high genetic diversity among the isolates.

A anaplasmose bovina, causada pela rickettsia Anaplasma marginale e transmitida por carrapatos, é endêmica em regiões tropicais e subtropicais no mundo e causa grandes perdas econômicas na industria de bovinos. Proteínas principais de superfície (MSPs) foram usados como marcadores para a caracterização genética de amostras de A. marginale, demonstrando que diferentes isolados podem ocorrer numa certa região geográfica. Porém, no Brasil pouco se sabe sobre a variedade genética de isolados de A. marginale em rebanhos individuais. Este estudo teve como objetivo investigar a ocorrência de variação genética entre bezerros infectados com A. marginale numa fazenda do sul de Minas Gerais, Brasil. Amostras de sangue coletadas de 100 bezerros foram utilizadas para o preparo de esfregaços sanguíneos, corados pelo Giemsa, para detecção da infecção por A. marginale. Amostras de DNA extraídas de cada amostra foram analisadas através de PCR seguido de sequenciamento. O exame dos esfregaços demonstrou que 48% dos bezerros estavam infectados comA. marginale, enquanto que o PCR detectou 70,2% de positividade. Infecção congênita foi detectada em quatro bezerros. As análises de microsatélites e tandem repeats comprovaram uma grande diversidade genética entre os isolados.

Polimorfismos de nucleotídeos únicos em 15 códons do gene da proteína priônica em um rebanho Suffolk afetado com scrapie no Brasil / Single nucleotide polymorphisms at 15 codons of the prion protein gene from a scrapie-affected herd of Suffolk sheep in Brazil

Scrapie is a transmissible spongiform encephalopathy of sheeps and goats, associated with the deposition of a isoform of the prion protein (PrPsc). This isoform presents an altered conformation that leads to aggregation in the host's central nervous and lymphoreticular systems. Predisposition to the prion agent infection can be influenced by specific genotypes related to mutations in amino acids of the PrPsc gene. The most characterized mutations occur at codons 136, 154 and 171, with genotypes VRQ being the most susceptible and ARR the most resistant. In this study we have analyzed polymorphisms in 15 different codons of the PrPsc gene in sheeps from a Suffolk herd from Brazil affected by an outbreak of classical scrapie. Amplicons from the PrPsc gene, encompassing the most relevant altered codons in the protein, were sequenced in order to determine each animal's genotype. We have found polymorphisms at 3 of the 15 analyzed codons (136, 143 and 171). The most variable codon was 171, where all described alleles were identified. A rare polymorphism was found at the 143 codon in 4 percent of the samples analyzed, which has been described as increasing scrapie resistance in otherwise susceptible animals. No other polymorphisms were detected in the remaining 12 analyzed codons, all of them corresponding to the wild-type prion protein. Regarding the risk degree of developing scrapie, most of the animals (96 percent) had genotypes corresponding to risk groups 1 to 3 (very low to moderate), with only 4 percent in the higher risks group. Our data is discussed in relation to preventive measures involving genotyping and positive selection to control the disease.(AU)

Scrapie é uma encefalopatia espongiforme transmissível de ovinos e caprinos, associado a deposição da isoforma da proteína priônica (PrPsc). Essa isoforma apresenta uma alteração conformacional que leva ao acúmulo da proteína no sistema nervoso central e linforeticular do hospedeiro. A predisposição a infecção pelo agente priônico pode ser influenciado por genótipos específicos relacionados a mutações na sequência de aminoácidos do gene PrPsc. As principais mutações caracterizadas ocorrem nos códons 136, 154 e 171, sendo o genótipo VRQ o mais suscetível e o genótipo ARR o mais resistente. Nesse estudo nós analisamos os polimorfismos de 15 códons diferentes da gene PrPsc em ovinos de um rebanho da raça Suffolk no Brasil afetado com scrapie clássico. Os amplicons do gene da PrPsc, que contem os códons mais frequentemente encontrados foram sequenciados para determinar o genótipo de cada animal. Nós encontramos 3 polimorfismos do 15 códons analisados (136, 143 e 171). O códon que mais teve variações foi o códon 171, onde todos os alelos foram identificados. Um polimorfismo raro foi encontrado no códon 143, em 4 por cento das amostras analisadas, o qual tem sido descrito por aumentar a resistência a scrapie em animais suscetíveis. Nenhum outro polimorfismo foi detectado nos 12 códons restantes, todos então, correspondendo à proteína priônica selvagem. De acordo com a grau de risco a desenvolver scrapie, a maioria dos animais (96 por cento) tiveram genótipo correspondentes aos grupos de risco 1 a 3 (muito baixo a moderado), e somente 4 por cento no grupo de risco alto. Nossos dados discutem a relação das medidas de prevenção envolvendo a genotipagem e a seleção positiva para o controle da doença.(AU)

Atrofia progressiva de retina associada a mutação no gene PRCD - método de detecção genética em cães / Atrofia progesiva de retina asociada con la mutación en el gen PRCD-metodo de detección genética en los caninos / Progressive retinal atrophy caused by a PRCD gene mutation-genetic-based detection method in dogs

Nos cães, a atrofia progressiva de retina é uma doença causada por uma mutação pontual no gene PRCD, que leva à cegueira no seu estágio final. Na Argentina, o diagnóstico é realizado atualmente por meio de exame clínico e de eletrorretinografia. Essa enfermidade apresenta herança recessiva, com portadores assintomáticos capazes de transmitir a mutação para os seus filhotes, o que evidencia a necessidade de um diagnóstico por meio de teste genético, que permita a detecção precoce de portadores e doentes. No presente trabalho, descreve-se uma técnica para a detecção genética da APR-PRCD, por meio de método de sequenciamento, que determina a sucessão de nucleotídeos na região de PRCD onde se localiza a mutação. Foram utilizadas amostras de suabe bucal de dezoito cães (quinze poodles e três cockers) com atrofia de retina diagnosticada por exame clínico. Como controle foram utilizadas amostras de dez animais das mesmas raças, que não possuíam alterações oftalmológicas.

Canine progressive retinal atrophy is a disease caused by a mutation in the PRCD gene, which progresses toward end-stage blindness. In Argentina, the current method of diagnosis is by clinical examination and electroretinography. The fact that this condition is a recessive trait, with unaffected carriers that can transmit the mutation to their offspring, highlights the importance of a genetic screening procedure to detect carriers and affected individuals. This paper shows a PRA-PRCD genetic test based on sequencing the nucleotides around the PRCD mutation, allowing the most accurate diagnosis. Oral swab samples from eighteen dogs (fifteen poodles and three cockers) clinically diagnosed with retinal atrophy were studied. The control group consisted of ten animals of the same breeds without ophthalmic diseases.

La atrofia progresiva de retina en los perros es una enfermedad causada por una mutación puntual en el gen PRCD que conduce en su estadio final a la ceguera. En Argentina el diagnóstico se realiza actualmente a través el examen clínico y la electroretinografía. Presenta herencia recesiva, con portadores asintomáticos capaces de trasmitir la mutación a sus crías, esto torna necesario el desarrollo de un test genético para realizar la detección temprana de portadores y afectados. En el siguiente trabajo se describe una técnica para la detección genética de APR-PRCD a través del método de secuenciación, que determina la sucesión de nucleótidos en la región de PRCD que contiene la mutación. Se emplearon muestras de hisopado bucal provenientes de dieciocho caninos (quince caniches y tres cockers) con atrofia de retina diagnosticada clínicamente y como control se estudiaron muestras de diez animales de las mismas razas sin enfermedad oftalmológica.

Atrofia progressiva de retina associada a mutação no gene PRCD - método de detecção genética em cães / Atrofia progesiva de retina asociada con la mutación en el gen PRCD-metodo de detección genética en los caninos / Progressive retinal atrophy caused by a PRCD gene mutation-genetic-based detection method in dogs

Nos cães, a atrofia progressiva de retina é uma doença causada por uma mutação pontual no gene PRCD, que leva à cegueira no seu estágio final. Na Argentina, o diagnóstico é realizado atualmente por meio de exame clínico e de eletrorretinografia. Essa enfermidade apresenta herança recessiva, com portadores assintomáticos capazes de transmitir a mutação para os seus filhotes, o que evidencia a necessidade de um diagnóstico por meio de teste genético, que permita a detecção precoce de portadores e doentes. No presente trabalho, descreve-se uma técnica para a detecção genética da APR-PRCD, por meio de método de sequenciamento, que determina a sucessão de nucleotídeos na região de PRCD onde se localiza a mutação. Foram utilizadas amostras de suabe bucal de dezoito cães (quinze poodles e três cockers) com atrofia de retina diagnosticada por exame clínico. Como controle foram utilizadas amostras de dez animais das mesmas raças, que não possuíam alterações oftalmológicas.(AU)

Canine progressive retinal atrophy is a disease caused by a mutation in the PRCD gene, which progresses toward end-stage blindness. In Argentina, the current method of diagnosis is by clinical examination and electroretinography. The fact that this condition is a recessive trait, with unaffected carriers that can transmit the mutation to their offspring, highlights the importance of a genetic screening procedure to detect carriers and affected individuals. This paper shows a PRA-PRCD genetic test based on sequencing the nucleotides around the PRCD mutation, allowing the most accurate diagnosis. Oral swab samples from eighteen dogs (fifteen poodles and three cockers) clinically diagnosed with retinal atrophy were studied. The control group consisted of ten animals of the same breeds without ophthalmic diseases.(AU)

La atrofia progresiva de retina en los perros es una enfermedad causada por una mutación puntual en el gen PRCD que conduce en su estadio final a la ceguera. En Argentina el diagnóstico se realiza actualmente a través el examen clínico y la electroretinografía. Presenta herencia recesiva, con portadores asintomáticos capaces de trasmitir la mutación a sus crías, esto torna necesario el desarrollo de un test genético para realizar la detección temprana de portadores y afectados. En el siguiente trabajo se describe una técnica para la detección genética de APR-PRCD a través del método de secuenciación, que determina la sucesión de nucleótidos en la región de PRCD que contiene la mutación. Se emplearon muestras de hisopado bucal provenientes de dieciocho caninos (quince caniches y tres cockers) con atrofia de retina diagnosticada clínicamente y como control se estudiaron muestras de diez animales de las mismas razas sin enfermedad oftalmológica.(AU)

Identificação diferencial de Rhodococcus equi e Dietzia maris em bubalinos / Differential identification of Rhodococcus equi and Dietzia maris in buffaloes

Foram analisados 24 isolados bacterianos oriundos de leite e pele de búfalas (Bubalus bubalis), os quais foram previamente identificados como Rhodococcus equi com o auxílio de fenotipia concisa. Testes fenotípicos complementares e ferramentas moleculares foram utilizados com o objetivo de caracterizar esses isolados, bem como diferenciá-los de outros microrganismos intimamente relacionados. Observaram-se três fenótipos distintos, porém a identificação dos isolados foi inconclusiva. Apenas um dos isolados foi comprovado como sendo R. equi com a realização da PCR espécie-específica, sequenciamento e análise dos fragmentos de DNA. Os demais isolados só foram identificados pelo sequenciamento de fragmento do gene que codifica a região 16S do rRNA universal de bactérias, indicando tratar-se de Dietzia maris. O perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos revelou maior resistência dos isolados de D. maris para oxacilina (96 por cento) e rifampicina (87 por cento). O isolado de R. equi apresentou resistência à amicacina, oxacilina, penicilina, rifampicina e tetraciclina. Alerta-se para o risco da incorreta identificação dos isolados baseados em testes fenotípicos concisos e para a necessidade de utilização de testes complementares para diferenciação entre R. equi e D. maris.(AU)

Twenty-four bacterial isolates from milk and skin of buffalo females (Bubalus bubalis), which previously had been identified as Rhodococcus equi by using a restricted number of phenotypical tests for bacterial characterization, were analyzed. The goal of this study was to perform the characterization of these isolates, as well as the differentiation of other microorganisms closely related by using additional phenotypical tests and molecular tools. Based on the phenotypical results, three different biotypes were obtained. However, the identification of the isolates was inconclusive. Only one of the isolates was confirmed as R. equi by the PCR specifically for this species, as well DNA sequencing and DNA fragment analysis. All the other isolates only could be precisely identified after the DNA sequencing, and they were characterized as Dietzia maris. The sensitivity profile to antimicrobials demonstrated the highest resistance of D. maris to oxacillin and rifampin, 96 percent and 87 percent, respectively. R. equi isolate, presented resistance to amikacin, oxacillin, penicillin, rifampin, and tetracycline. Thus, it is important to alert for the risk of the incorrect identification of the bacterial isolates by using diagnostic analysis based on phenotypical tests in order to differentiate R. equi and D. maris, besides the necessity to use complementary tests for differentiation of these microorganisms.(AU)

Análise filogenética do gene da miogenina / Phylogenetic analysis of the myogenin gene

Estudou-se a filogenia do gene da miogenina, um membro da família MyoD, reguladora da miogênese, que ocorre durante o desenvolvimento embrionário, e sua história evolutiva em espécies domésticas que apresentem seqüências de DNA depositadas no Genbank, comparando-se o índice de substituição de nucleotídeos não-sinônimos pelo índice de substituição sinônima. Valores maiores do que um (1) indicaram que o gene sofreu mudanças que tornaram o organismo mais adaptado ao ambiente. As árvores filogenéticas foram obtidas por máxima verossimilhança, e os índices de substituição sinônima e não-sinônima foram analisadas pelo método de parcimônia. Os resultados indicaram que, provavelmente, o gene sofreu evolução adaptativa no grupo Ruminantia, Bos taurus e Ovis aries, depois que essas espécies divergiram do ancestral comum. Para as outras espécies analisadas, o gene parece ter evoluído de modo conservativo.(AU)

The myogenin gene, a member of the MyoD gene family, is a regulator of the myogenesis that takes place during the embryonic development. The objective of this study was to perform a phylogenic analysis of the myogenin gene to study its evolutionary history in the domestic species that have the sequencing data deposited in the Genbank. One common method to detect a gene evolution is made by comparing the ratio of nonsynonymous nucleotide substitution by the ratio of synonymous substitutions. Values greater than one (1) means that the gene has gone through changes that made the organism more adapted to the environment. The phylogenetic trees were obtained by maximum likelihood and the synonymous and nonsynonymous substitution rates were analyzed by the parsimony method. The results point out that probably the gene suffered an adaptive evolution in the Ruminantia group, Bos Taurus and Ovis aries, after these species diverged from their common ancestral. In the other species, the gene seems to be evolved in a conservative way.(AU)

Association of the heart fatty acid-binding protein gene with quality of carcass and meat traits in pigs / Associação entre o gene da proteína de ligação de ácidos graxos - coração com características de carcaça e qualidade da carne em suínos

The heart fatty acid-binding protein (HFABP) gene was sequenced in parental animals of a F2 crossing of boars of the Brazilian native Piau breed with commercial sows (Landrace x Large White Pietrain). Primers used for PCR were designed to amplify four exons of the gene. The PCR products were sequenced and compared with the GenBank sequences. Differences between the generated sequences and the GenBank sequences were observed for both genetic groups. A total of 246 F2 animals were genotyped using the Hinf I restriction enzyme. Two genotypes were identified, 198 being animals HH and 48 Hh. The Hinf I SNP was significantly associated with weights of loin (bone-in) (P<0.05), jowl (P<0.05), sirloin (P<0.10), and kidneys (P<0.01). These results showed the potential of the H-FABP gene in marker-assisted selection programs for carcass traits in pigs.(AU)

O gene da proteína de ligação de ácidos graxos - coração foi seqüenciado em animais parentais de um cruzamento F2 entre varrões da raça nativa brasileira Piau e fêmeas comerciais (Landrace x Large White x Pietrain). Os primers utilizados na reação em cadeia da polimerase foram desenhados para amplificarem os quatro éxons do gene. Os fragmentos amplificados foram seqüenciados e comparados com a seqüência do gene depositada no GenBank. Foram observadas divergências entre as seqüências geradas e as do GenBank para ambos os grupos genéticos. Foram genotipados 246 animais F2 utilizando-se a enzima Hinf I. Dois genótipos foram identificados, sendo 198 animais HH e 48 animais Hh. O polimorfismo apresentou efeito sobre o peso total do carré (P<0,05), o peso da papada (P<0,05), o peso do filezinho (P<0,10) e o peso dos rins (P<0,01). Os resultados indicam que o gene da H-FABP apresenta potencial para aplicação em programas de seleção assistida por marcadores moleculares em suínos.(AU)