Genetic profiles of Mycobacterium bovis from a cattle herd in southernmost Brazil / Perfis genéticos de Mycobacterium bovis em um rebanho bovino no extremo sul do Brasil

Mycobacterium bovis is the agent of bovine tuberculosis, a disease endemic to all Brazilian states. Molecular typing techniques help to stratify and refine data, providing information that facilitates epidemiological research. In this study, MIRU-VNTR, targeting 24 loci, was employed to identify and characterize the genetic groups of M. bovis isolates obtained from an outbreak of bovine tuberculosis. Eighteen acid-fast bacilli isolates, obtained from bovine tissue samples, and reactive to the comparative cervical tuberculin test, were identified as species of the M. tuberculosis complex, and were genotyped by MIRU-VNTR with 24 primer pairs. Genotyping revealed three genetic profiles comprising one with 15 isolates (83.3%), one with two isolates (11.1%), and one profile with one unique isolate (5.6%). This distinction was achieved with the MIRU 31 primer, which resulted in clustering of two isolates into the same profile, and ETR A, B, and C, which discriminated the isolate with a unique profile. The occurrence of clustered isolates is indicative of recent transmission, whereas isolates with a unique profile suggest reactivation of latent infection. The presence of different M. bovis genotypes in the same herd suggests movement of infected animals or different sources of intra-herd infection. Use of the MIRU-VNTR molecular epidemiology technique in M. bovis isolates obtained from an outbreak of bovine tuberculosis in Rio Grande do Sul state demonstrated the genetic diversity of circulating strains, despite the presence of a predominant group.

Mycobacterium bovis é o agente da tuberculose bovina, enfermidade endêmica diagnosticada em todos os estados brasileiros. As técnicas de tipagem molecular auxiliam a estratificar e refinar dados, fornecendo informações que facilitam as atividades epidemiológicas. Neste estudo aplicou-se a técnica MIRU-VNTR com 24 loci para caracterizar e identificar os agrupamentos genéticos de isolados de M. bovis oriundos de um foco de tuberculose bovina. Dezoito isolados de bacilos álcool-ácido resistentes, obtidos de amostras de tecido de bovinos reagentes ao teste cervical comparativo e identificados como espécies do complexo M. tuberculosis, foram genotipados por meio de MIRU-VNTR com 24 pares de iniciadores. A genotipagem revelou três perfis genéticos distintos: um para 15 isolados (83,3%); um para dois isolados (11,1%) e, por fim, um isolado com perfil único (5,6%). Os iniciadores responsáveis por essa distinção foram MIRU 31, que agrupou dois isolados em um perfil, e ETR A, B e C, que discriminaram o isolado de perfil único. A ocorrência de agrupamentos de isolados é indicativa de transmissão recente, ao passo que isolados de perfil único sugerem reativação de infecção latente. A presença de diferentes genótipos de M. bovis no mesmo rebanho sugere haver circulação de animais doentes ou existirem diferentes fontes de infecção intrarrebanho. A aplicação da técnica de epidemiologia molecular MIRU-VNTR a isolados de M. bovis obtidos a partir de um foco de tuberculose bovina no Rio Grande do Sul demonstrou haver diversidade genética entre as estirpes em circulação, embora exista um agrupamento predominante.

Genetic profiles of Mycobacterium bovis from a cattle herd in southernmost Brazil / Perfis genéticos de Mycobacterium bovis em um rebanho bovino no extremo sul do Brasil

Mycobacterium bovis is the agent of bovine tuberculosis, a disease endemic to all Brazilian states. Molecular typing techniques help to stratify and refine data, providing information that facilitates epidemiological research. In this study, MIRU-VNTR, targeting 24 loci, was employed to identify and characterize the genetic groups of M. bovis isolates obtained from an outbreak of bovine tuberculosis. Eighteen acid-fast bacilli isolates, obtained from bovine tissue samples, and reactive to the comparative cervical tuberculin test, were identified as species of the M. tuberculosis complex, and were genotyped by MIRU-VNTR with 24 primer pairs. Genotyping revealed three genetic profiles comprising one with 15 isolates (83.3%), one with two isolates (11.1%), and one profile with one unique isolate (5.6%). This distinction was achieved with the MIRU 31 primer, which resulted in clustering of two isolates into the same profile, and ETR A, B, and C, which discriminated the isolate with a unique profile. The occurrence of clustered isolates is indicative of recent transmission, whereas isolates with a unique profile suggest reactivation of latent infection. The presence of different M. bovis genotypes in the same herd suggests movement of infected animals or different sources of intra-herd infection. Use of the MIRU-VNTR molecular epidemiology technique in M. bovis isolates obtained from an outbreak of bovine tuberculosis in Rio Grande do Sul state demonstrated the genetic diversity of circulating strains, despite the presence of a predominant group.(AU)

Mycobacterium bovis é o agente da tuberculose bovina, enfermidade endêmica diagnosticada em todos os estados brasileiros. As técnicas de tipagem molecular auxiliam a estratificar e refinar dados, fornecendo informações que facilitam as atividades epidemiológicas. Neste estudo aplicou-se a técnica MIRU-VNTR com 24 loci para caracterizar e identificar os agrupamentos genéticos de isolados de M. bovis oriundos de um foco de tuberculose bovina. Dezoito isolados de bacilos álcool-ácido resistentes, obtidos de amostras de tecido de bovinos reagentes ao teste cervical comparativo e identificados como espécies do complexo M. tuberculosis, foram genotipados por meio de MIRU-VNTR com 24 pares de iniciadores. A genotipagem revelou três perfis genéticos distintos: um para 15 isolados (83,3%); um para dois isolados (11,1%) e, por fim, um isolado com perfil único (5,6%). Os iniciadores responsáveis por essa distinção foram MIRU 31, que agrupou dois isolados em um perfil, e ETR A, B e C, que discriminaram o isolado de perfil único. A ocorrência de agrupamentos de isolados é indicativa de transmissão recente, ao passo que isolados de perfil único sugerem reativação de infecção latente. A presença de diferentes genótipos de M. bovis no mesmo rebanho sugere haver circulação de animais doentes ou existirem diferentes fontes de infecção intrarrebanho. A aplicação da técnica de epidemiologia molecular MIRU-VNTR a isolados de M. bovis obtidos a partir de um foco de tuberculose bovina no Rio Grande do Sul demonstrou haver diversidade genética entre as estirpes em circulação, embora exista um agrupamento predominante.(AU)

Molecular typing of Argentinian Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis isolates by multiple-locus variable number-tandem repeat analysis

Multiple-locus variable number-tandem repeat analysis (MLVA) of Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis (MAP) isolates may contribute to the knowledge of strain diversity in Argentina. Although the diversity of MAP has been previously investigated in Argentina using IS900-RFLP, a small number of isolates were employed, and a low discriminative power was reached. The aim of the present study was to test the genetic diversity among MAP isolates using an MLVA approach based on 8 repetitive loci. We studied 97 isolates from cattle, goat and sheep and could describe 7 different patterns: INMV1, INMV2, INMV11, INMV13, INMV16, INMV33 and one incomplete pattern. INMV1 and INMV2 were the most frequent patterns, grouping 76.3% of the isolates. We were also able to demonstrate the coexistence of genotypes in herds and co-infection at the organism level. This study shows that all the patterns described are common to those described in Europe, suggesting an epidemiological link between the continents.(AU)

Caracterização genética de isolados de Mycobacterium bovis no Estado de Mato Grosso, Brasil

Técnicas de genotipificação do Mycobacterium bovis baseadas na amplificação do DNA via PCR como MIRU-VNTR constituem importantes ferramentas na investigação epidemiológica da tuberculose bovina (TB) em áreas de baixa prevalência, como no Estado de Mato Grosso. Isto posto e diante de limitadas informações a respeito dos genótipos grassantes no Estado, foi realizado monitoramento nas linhas de inspeção sanitária pós-abate em 35 matadouros-frigoríficos sob inspeção oficial para detectar lesões granulomatosas sugestivas de TB e proceder a coleta e análise de amostras. Foram processadas e analisadas 167 amostras mediante isolamento bacteriano e técnicas moleculares. Através do método de genotipagem MIRU-VNTR, 49 isolados de M. bovis foram analisados aplicando-se 24 pares de primers diferentes. Desses, 20 marcadores de VNTR mostraram polimorfismo genético. O locus QUB26 apresentou alto poder discriminatório (h=0,66) enquanto ETRC (0,54), Mtub21 (0,5), QUB11b (0,33) e Mtub34 (0,31) mostraram moderada diversidade alélica. Os outros 15 loci (Mtub 04, 29 e 39; MIRU 04, 16, 23, 24, 26, 27, 31, 39 e 40; ETR A; ETR B; QUB 4156) revelaram baixo poder discriminatório (h=0,02 - 0,27). Quatro loci (MIRU 2, 10 e 20; Mtub30) não apresentaram diversidade alélica. Foram observados 28 perfis genéticos (V1-V28) nos isolados de M. bovis obtidos em 35 propriedades rurais. Dentre essas, 30 (85,71%) apresentaram somente 1 tipo de perfil genético. Apenas 19 amostras (38,77%) apresentaram perfil MIRU-VNTR único revelando a existência de isolados com o mesmo perfil MIRU-VNTR entre diferentes regiões geográficas no Estado. O isolamento, seguido da identificação molecular e discriminação genotípica por MIRU-VNTR em isolados de M. bovis constituíram fontes de relevantes informações auxiliares no desenvolvimento de estratégias de erradicação da TB na região de estudo.

Mycobacterium bovis genotyping techniques based on PCR amplification as MIRU-VNTR are important tools in the epidemiological investigation of bovine tuberculosis in areas of low prevalence, such as in the state of Mato Grosso. Based on limited information about the genotypes in state, post-slaughter sanitary inspection lines were monitored in 35 slaughterhouses under official inspection to detect granulomatous lesions suggestive of TB and to collect and analyze samples. 167 Samples were processed and analyzed by bacterial isolation and molecular techniques. Through the MIRU-VNTR genotyping method, 49 M. bovis isolates were analyzed by applying 24 different primer pairs. Of these, 20 VNTR markers showed genetic polymorphism. The QUB26 locus presented high discriminatory power (h = 0.66) while ETRC (0.54), Mtub21 (0.5), QUB11b (0.33) and Mtub34 (0.31) showed moderate allelic diversity. The other 15 loci (Mtub 04, 29 e 39; MIRU 04, 16, 23, 24, 26, 27, 31, 39 e 40; ETR A; ETR B; QUB 4156) showed low discriminatory power (h = 0.02 - 0.27). Four loci (MIRU2, MIRU10, MIRU20 and Mtub30) did not present allelic diversity. Twenty-eight genotypes (V1-V28) were observed in the M. bovis isolates obtained from 35 rural properties. Among these, 30 (85.71%) presented only 1 genotype type. Only 19 samples (38.77%) presented a single MIRU-VNTR profile revealing the existence of isolates with the same MIRU-VNTR profile among different geographic regions in the State. Isolation, followed by molecular identification and genotypic discrimination by MIRU-VNTR in M. bovis isolates were sources of relevant auxiliary information in the development of strategies to eradicate TB in the study region

Mycobacterium tuberculosis belonging to family LAM and sublineage RD Rio: common strains in Southern Brazil for over 10 years

A sublineage of Mycobacterium tuberculosis called RD Rio was described in 2007. Although only recently described, this strain may have been present previously in the population, and its identification in clinical isolates will elucidate bacterial transmission dynamics and host-pathogen interactions. This study evaluated the clonal diversity of the RD Rio sublineage in clinical isolates from Rio Grande-RS obtained between 1998 and 2001. Among the 45 samples analyzed by the MIRU-VNTR method, there were six clusters with two samples each and 33 orphan strains with unique pattern. The strains were distributed across several different lineages including LAM (34.04%), X (14.89%), Haarlem (12.77%), UgandaI (10.64%), S (4.26%), NEW-1 (2.13%) and Cameroon (2.13%); 14.89% of the strains matched to multiple lineages. RD Rio strains were present in 28.9% of the samples and 81.25% of the identified strains belonged to the LAM family. The high clonal diversity observed in this study is a constant feature in this region. The RD Rio sublineage has been in Rio Grande-RS since 1998. The continued monitoring of RD Rio in clinical isolates will enhance the understanding of its epidemiological significance.

Mapeamento e distribuição dos isolados do complexo Mycobacterium tuberculosis provenientes de casos de tuberculose bovina em Moçambique

A tuberculose bovina (bTB) é um problema sanitário importante em Moçambique e ainda a espera de uma ação organizada por parte dos Serviços Veterinários Oficiais. O presente estudo teve por objetivo investigar e mapear os genótipos de Mycobacterium bovis circulantes no país e paralelamente maximizar a utilização de abatedouros como fonte de informação epidemiológica da bTB. Durante o período de outubro de 2016 a abril de 2017 foram colhidas um total de 90 amostras de lesões sugestivas de tuberculose bovina nos abatedouros Municipais de Maputo e Maxixe e dois abatedouros privados da província de Maputo. Essas amostras, juntamente com outras 10, disponibilizadas pelo Laboratório Central de Veterinária e 72 do banco de amostras de Faculdade de Veterinária de Moçambique foram processadas para isolamento, identificação e discriminação molecular (MIRU-VNTR e spoligotyping) de micobactérias. Nos abatedouros foram coletados dados para calcular as prevalências de carcaças com lesões sugestivas de tuberculose e foi estimada em 0,63% e 80% das carcaças condenadas por tuberculose apresentaram lesões compatíveis com generalização da infecção. Foram obtidos 104 isolados identificados como gênero Mycobacterium, dos quais 80 foram compatíveis com o MTBC e 10 MNT. Destes 80 MTBC, 70 foram identificados como M. bovis. O MIRU-VNTR discriminou os 70 isolados de M. bovis em 47 perfis, agrupados em 3 complexos clonais e cinco singletons. Dos 24 loci estudados, os que apresentaram maiores polimorfismos foram MIRU 960, 2996 e QUB-4052. Em relação ao spoligotyping, foram identificados cinco perfis, dos quais o mais prevalente foi o SB0961, seguido do SB0140, SB2306, SB2481 (novo) e SB1099. Dos 70 isolados submetidos a análises dos complexos clonais africano 1, africano 2, europeu 1 e europeu 2, foram detectados apenas 18,5% de europeu. O distrito de Machanga foi o que apresentou maior diversidade de isolados e o Govuro maior número de isolados de M. bovis. Quando comparados as técnicas, o MIRU-VNTR apresentou maior poder de discriminação em relação ao spoligotyping. O complexo clonal europeu 1 está relacionado com o SB0140 que por sua vez é característico de isolados do Reino Unido e de países que tiveram trocas comerciais de bovinos com o país, incluindo os circunvizinhos a Moçambique e de onde há registros da importação de animais para Moçambique. A não identificação precisa dos complexos clonais dos spoligotyping SB0961, SB2306, SB2481 relacionados, podem ser derivados do BCG, que é sugestivo de evolução clonal própria de Moçambique e os complexos clonais até hoje existentes não são suficientes para discriminar os isolados de Moçambique. Embora os dados de abatedouros sugeriram que a prevalência da tuberculose bovina em Moçambique está entre as mais baixas dos países africanos, a predominância de carcaças com lesões generalizadas significa alto risco de exposição de animais e humanos, sobretudo das populações rurais que têm estreito contato com esses animais. Esse risco é ampliado em função da alta prevalência de humanos que vivem com HIV/AIDS no país. Assim, recomenda-se que Moçambique estruture programa de controle da doença nos animais e métodos de diagnóstico que detectem a infecção por M. bovis na população humana.

Bovine tuberculosis (bTB) is a major sanitary problem in Mozambique and awaits organized action by the Official Veterinary Services. The aim of this work was to investigate and map the circulating Mycobacterium bovis genotypes in the country and to maximize the use of slaughterhouses as a source of epidemiological information for bTB. During the period from October 2016 to April 2017, a total of 90 samples with lesions suggestive of bovine tuberculosis were collected from Maputo and Maxixe Municipal abattoirs and two private abattoirs from the province of Maputo. These samples, together with 10 others provided by the Central Veterinary Laboratory and 72 from the Veterinary Faculty sample bank were processed for isolation, identification and molecular discrimination (MIRU-VNTR and spoligotyping) of mycobacteria. Samples collected in the slaughterhouses were analyzed by calculating the prevalence of carcasses with lesions suggestive of bTB, which was estimated at 0.63% and 80% of carcasses condemned for tuberculosis presented lesions compatible with generalized infection. A total of 104 isolates were identified as M. bovis as Mycobacterium genus were obtained, of which 80 were compatible with MTBC and 10 MNT. Of these 80 MTBC, 70 were identified as M. bovis. The MIRU-VNTR discriminated the 70 isolates of M. bovis in 47 profiles, grouped in 3 clonal complexes and 5 singletons. Of the 24 loci studied, the ones with the highest polymorphisms were MIRU 960, 2996 and QUB-4052. In relation to spoligotyping, five profiles were identified; SB0961 was the most prevalent, being SB0961, followed by SB0140, SB2306, SB2481 (new) and SB1099. Of the 70 isolates submitted to analyzes of the clonal complexes African 1, African 2, European 1 and European 2, only 18.5% of European complex were detected. Machanga district presented the greatest diversity of isolates, while Govuro district had largest number of isolates of M. bovis. The MIRU-VNTR presented greater power of discrimination in relation to spoligotyping. The European clonal complex 1 was related to SB0140 which in turn is characteristic of isolates from the United Kingdom and from countries that have had commercial trade in cattle with UK including those surrounding Mozambique and where there are records of imports of animals for Mozambique. The precise identification of the clonal complexes of the SB0961, SB2306 and SB2481 related spoligotypings subject to the BCG derivatives, is suggestive of the clonal evolution of Mozambique and that the clonal complexes to date are not sufficient to discriminate against the isolates from Mozambique. Although data from slaughterhouses suggested that the prevalence of bovine tuberculosis in Mozambique is among the lowest in African countries, the predominance of carcasses with generalized lesions means a high risk of animal and human exposure, especially of rural populations that have close contact with these animals. This risk is amplified due to the high prevalence of people that living with HIV/AIDS in the country. Thus, it is recommended that Mozambique structure a disease control program in animals and diagnostic methods that detect M. bovis infection in the human population.

GENOTIPAGEM E PESQUISA DE RESISTÊNCIA FENOTÍPICA E GENÉTICA À RIFAMPICINA E ISONIAZIDA EM LINHAGENS DE MYCOBACTERIUM BOVIS ISOLADAS DE LINFONODOS DE BOVINOS DE ABATEDOURO NA REGIÃO CENTRO-OESTE DO ESTADO DE SÃO PAULO

A tuberculose causada por Mycobacterium bovis (bTB) é uma zoonose de distribuição mundial com ampla gama de hospedeiros. Nos países onde a bTB é prevalente, 10 a 20% dos casos de tuberculose humana são causados por M. bovis. São escassos em todo o mundo estudos que investigam a resistência à isoniazida (INH) e rifampicina (RMP) em linhagens de M. bovis de origem bovina, reservatórios silvestres, e em casos humanos de tuberculose. Foi investigada a diversidade genotípica de 67 linhagens de M. bovis isoladas de bovinos de abatedouro, obtidas de 100 linfonodos com lesão caseosa, pelas técnicas de Spoligotyping e MIRU-VNTR, bem como foi determinado o perfil fenotípico de resistência à INH e RMP pela técnica de REMA, e pesquisadas possíveis bases genéticas para resistência aos antimicrobianos. Dentre os isolados, 11 (16%) foram classificados como MDR-TB, 8 (12%) resistentes à INH e 2 (3%) resistentes à RMP. A pesquisa pelo GenoType MTBDRplus ver. 2.0 não acusou a presença de mutações em nenhum dos isolados fenotipicamente resistentes. Foram identificados 16 spoligotipos entre as linhagens. A subfamília BOV_1 predominou com 52 (77,6%) isolados, com os SIT 481, 482, 594, 665, 691, 698, 1021, 1667, 1852, 2141 e dois isolados sem shared type. A BOV_2 foi identificada em 8 (11,9%) isolados, com o SIT 683. Os SIT 982, 1851 e 1853 foram agrupados na família BOV. Dois isolados não foram classificados em família ou subfamília. A análise de MIRU-VNTR com painel de 12 MIRUs, identificou 31 isolados pertencentes ao MIT 49, um ao MIT 5 e 35 órfãos. A junção das análises de Spoligotyping e MIRU-VNTR possibilitou o agrupamento dos isolados em 12 clusters (contendo, ao todo, 46 isolados) e 21 isolados diferenciados em perfis únicos. Ressalta-se a elevada frequência de M. bovis nos linfonodos processados, e a multirresistência de certas linhagens a fármacos de primeira linha utilizados no tratamento humano da tuberculose, fato que gera preocupações em saúde pública. Futuros estudos são necessários para elucidar as bases da resistência aos fármacos e a ocorrência da diversidade genotípica em linhagens de M. bovis de origem bovina.

Tuberculosis caused by Mycobacterium bovis (bTB) is a zoonosis of worldwide distribution with broad host range. In countries where bTB is prevalent, 10-20% of the human cases of tuberculosis are caused by M. bovis. All over the world there are few studies investigating the resistance to isoniazid (INH) and rifampicin (RMP) in M. bovis strains from cattle, wild reservoirs, and human cases of tuberculosis. The genotypic diversity of 67 M. bovis strains obtained out of 100 lymph nodes with caseous lesions from slaughtered animals was investigated by Spoligotyping and MIRU-VNTR techniques, as well as the assessment of their phenotypic profile of resistance to INH and RMP by REMA method and the search of possible genetic basis for antimicrobial resistance. Among the obtained isolates, 11 (16%) were classified as MDR-TB, 8 (12%) INH-resistant and 2 (3%) RMP-resistant. The use of GenoType MTBDRplus ver. 2.0 did not pointed the presence of genetic mutations in any of the phenotypically resistant isolates. Sixteen different spoligotype patterns were identified. The BOV_1 subfamily predominated with 52 (77.6%) isolates, with SITs 481, 482, 594, 665, 691, 698, 1021, 1667, 1852, 2141 and two isolates without a given SIT. BOV_2 was identified in 8 (11.9%) isolates, within SIT 683. The SITs 982, 1851 and 1853 were grouped in BOV family. Two isolates were not classified in family or subfamily. The MIRU-VNTR analysis using the 12 classical MIRUs, identified a cluster of 31 isolates belonging to the MIT 49, one on MIT 5 and 35 orphans isolates. The combination of Spoligotyping and MIRU-VNTR analysis allowed the grouping of the isolates in 12 clusters (containing, in total, 46 isolates) and 21 isolates with unique profiles. The study highlights the high frequency of M. bovis among the sampled lymph nodes, emphasizing the impact of the pathogen as the causal agent of lymphadenitis and tuberculosis in cattle herds in the study area. In addition, points up the multidrug-resistance of M. bovis lineages to first-line drugs used in the human treatment of tuberculosis, a fact that raises public health concerns. Further studies are required to elucidate the basis of drug resistance and the occurrence of genotypic diversity in M. bovis strains.

Sistema de detecção de focos de tuberculose bovina no Estado de São Paulo utilizando métodos moleculares e epidemiológicos / A molecular and epidemiological based-work system for detection of bovine tuberculosis focus in the state of São Paulo

Foi estabelecida uma parceria entre o Departamento de Medicina Veterinária Preventiva e Saúde Animal (VPS) da FMVZ-USP, a Coordenadoria de Defesa Agropecuária do Estado de São Paulo e o Serviço de Inspeção Federal (SIF) para organizar um sistema capaz de detectar focos de tuberculose bovina no Estado, com base nas rotinas de inspeção de carcaças em abatedouros, cujos objetivos foram: 1) conhecer a diversidade genética de isolados de Mycobacterium bovis em bovinos no Estado de São Paulo; 2) estudar a distribuição espacial desses focos; 3) estudar a tipologia das unidades de criação de bovinos caracterizadas como focos de tuberculose; 4) verificar se é possível, com a atual infra-estrutura existente em São Paulo, operar um sistema de vigilância para detecção de focos de tuberculose bovina. Assim, foi estruturado um sistema de coleta, envolvendo as redes SISP (Sistema de Inspeção do Estado de São Paulo) e SIF, que realizou as coletas de materiais e informações de maio de 2002 a janeiro de 2004. Todo o material seguiu para o VPS, onde foram processados. As propriedades caracterizadas como focos foram rastreadas e delas foi coletada outro conjunto de informações. Seguem os resultados alcançados: 1) foram identificados 33 diferentes espoligotipos dentre os 248 isolados de M. bovis de bovinos no Estado de São Paulo. Os isolados do espoligotipo SB0295 foram re-discriminados em 13 novos perfis genéticos de M. bovis pela técnica MIRU-VNTR; 2) dentre os dois espoligotipos mais prevalentes estudados (SB0295 e SB0121), apenas o SB0295 apresentou-se de forma agrupada nas análises espaciais; 3) foram geradas várias informações sobre a tipologia e o manejo das unidades de criação de bovinos caracterizadas como focos de tuberculose; 4) a atual infra-estrutura existente no Estado de São Paulo foi capaz de operar um sistema de detecção de focos de tuberculose bovina

A partnership between the Department of Preventive Veterinary Medicine and Animal Health (VPS) of the FMVZ-USP, the Coordination of Agriculture and Animal Defense of the State of São Paulo, and the Federal Inspection Service (SIF) was established to organize a work system for detection of bovine tuberculosis focus in the state, based on routine methods of carcass inspection in the abattoir, with the following objectives: 1) to determine the genetic diversity of the isolates of Mycobacterium bovis from bovines in the state of São Paulo; 2) to study the spatial distribution of the focuses; 3) to study the typology of the bovine breading units (farms), which were characterized as tuberculosis focus; 4) to verify the possibility of operating a surveillance system for detection of bovine tuberculosis focus based on the current network in the state of São Paulo. Thus, it was performed a system for data collection involving the current systems SISP (System of Inspection of the State of São Paulo) and SIF, who performed the collection of biological samples and information from May 2002 to January 2004. All samples were addressed to the VPS, where they were processed. Farms characterized as focus were traced to obtain new information. The results obtained in this study follow: 1) A total of 33 different spoligotypes were determined out of 248 bovine isolates of M. bovis in the state of São Paulo. The spoligotype SB0295 isolates were re-discriminated into 13 new M. bovis genetic profiles by the MIRU-VNTR technique; 2) From the two most prevalent spoligotypes analyzed in this study (SB0295 e SB0121), only SB0295 showed a cluster presentation by the spatial analyses; 3) Several information about typology and bovine breeding unit management were generated regarding the status of tuberculosis focus; 4) the current network in the state of São Paulo was capable of operating a system for detection of bovine tuberculosis focus