Diversidade genética entre acessos de soja tipo alimento com base no algoritmo de Gower / Genetic diversity among food type soybean accessions based on Gower algorithm

A avaliação simultânea de características qualitativas e quantitativas é uma excelente ferramenta na estimação da divergência genética entre acessos de bancos de germoplasma. O presente estudo objetivou caracterizar e estimar a divergência genética entre acessos de soja tipo alimento com base em descritores qualitativos e quantitativos por meio do algoritmo de Gower, além de identificar possíveis combinações promissoras entre os acessos avaliados. Foram estudados 64 genótipos de soja, sendo 60 acessos de soja tipo alimento, dois padrões comerciais também destinados à alimentação humana e dois padrões comerciais tipo grão. Três características qualitativas e sete quantitativas foram utilizadas para estimar a divergência genética entre os genótipos. O experimento foi conduzido na área experimental da Universidade Estadual de Londrina durante a safra 2015/2016, utilizando o delineamento de blocos completos ao acaso, com quatro repetições. Foi observada a presença de variabilidade genética para todas as características avaliadas. A característica produtividade de grãos foi a mais eficiente na discriminação dos acessos avaliados, enquanto que a característica altura de planta apresentou menor contribuição. O método UPGMA apresentou o maior coeficiente de correlação cofenética, permitindo a formação de seis diferentes grupos. As hibridações AL06 × AL22 e AL07 × AL22 são promissoras para obtenção de genótipos superiores destinados ao consumo in natura e produção de leite de soja e tofu. A combinação AL13 × AL60 é considerada favorável para obtenção de genótipos destinados à produção de natto. A utilização dos acessos AL12 e AL13 como genitores é vantajosa para obtenção de genótipos destinados à produção de kuroname.

The simultaneous evaluation of qualitative and quantitative traits is an excellent tool to estimate the genetic divergence among accessions of germplasm banks. The present study aimed to characterize and estimate the genetic divergence among soybean food type accessions based on Gower algorithm and identifies promising combination among accessions evaluated. A total of 64 soybean genotypes were studied, which 60 are food type soybean accessions, two are commercial cultivars also for human consumption, and two are grain type commercial cultivars. Three qualitative and seven quantitative traits were used to estimate the genetic divergence among genotypes. The experiment was carried out in the experimental area of the Universidade Estadual de Londrina during 2015/2016 season, using a randomized complete block design with four repetitions. It was observed the presence of genetic variability to all traits evaluated. The grain yield trait was the most efficient in discriminating the evaluated accessions, while plant height showed lower contribution. The UPGMA method showed the highest coefficient of cophenetic correlation allowing the formation of six different groups. The crossings AL06 × AL22 and AL07 × AL22 are promising for obtaining superior genotypes destined to the in natura consumption and production of soy milk and tofu. The combination AL13 × AL60 is considered favorable for obtaining genotypes destined to natto production. The use of the AL12 and AL13 accessions as parents is advantageous for obtaining genotypes for the production of kuroname.

Diversidade genética entre acessos de soja tipo alimento com base no algoritmo de Gower / Genetic diversity among food type soybean accessions based on Gower algorithm

A avaliação simultânea de características qualitativas e quantitativas é uma excelente ferramenta na estimação da divergência genética entre acessos de bancos de germoplasma. O presente estudo objetivou caracterizar e estimar a divergência genética entre acessos de soja tipo alimento com base em descritores qualitativos e quantitativos por meio do algoritmo de Gower, além de identificar possíveis combinações promissoras entre os acessos avaliados. Foram estudados 64 genótipos de soja, sendo 60 acessos de soja tipo alimento, dois padrões comerciais também destinados à alimentação humana e dois padrões comerciais tipo grão. Três características qualitativas e sete quantitativas foram utilizadas para estimar a divergência genética entre os genótipos. O experimento foi conduzido na área experimental da Universidade Estadual de Londrina durante a safra 2015/2016, utilizando o delineamento de blocos completos ao acaso, com quatro repetições. Foi observada a presença de variabilidade genética para todas as características avaliadas. A característica produtividade de grãos foi a mais eficiente na discriminação dos acessos avaliados, enquanto que a característica altura de planta apresentou menor contribuição. O método UPGMA apresentou o maior coeficiente de correlação cofenética, permitindo a formação de seis diferentes grupos. As hibridações AL06 × AL22 e AL07 × AL22 são promissoras para obtenção de genótipos superiores destinados ao consumo in natura e produção de leite de soja e tofu. A combinação AL13 × AL60 é considerada favorável para obtenção de genótipos destinados à produção de natto. A utilização dos acessos AL12 e AL13 como genitores é vantajosa para obtenção de genótipos destinados à produção de kuroname.(AU)

The simultaneous evaluation of qualitative and quantitative traits is an excellent tool to estimate the genetic divergence among accessions of germplasm banks. The present study aimed to characterize and estimate the genetic divergence among soybean food type accessions based on Gower algorithm and identifies promising combination among accessions evaluated. A total of 64 soybean genotypes were studied, which 60 are food type soybean accessions, two are commercial cultivars also for human consumption, and two are grain type commercial cultivars. Three qualitative and seven quantitative traits were used to estimate the genetic divergence among genotypes. The experiment was carried out in the experimental area of the Universidade Estadual de Londrina during 2015/2016 season, using a randomized complete block design with four repetitions. It was observed the presence of genetic variability to all traits evaluated. The grain yield trait was the most efficient in discriminating the evaluated accessions, while plant height showed lower contribution. The UPGMA method showed the highest coefficient of cophenetic correlation allowing the formation of six different groups. The crossings AL06 × AL22 and AL07 × AL22 are promising for obtaining superior genotypes destined to the in natura consumption and production of soy milk and tofu. The combination AL13 × AL60 is considered favorable for obtaining genotypes destined to natto production. The use of the AL12 and AL13 accessions as parents is advantageous for obtaining genotypes for the production of kuroname.(AU)

Estimativa da divergência entre ecótipos de braquiária baseada em descritores quantitativos e qualitativos / Estimation of genetic divergence between braquiária ecotypes based on quantitative and qualitative descriptors

O presente trabalho objetivou estimar a divergência genética entre ecótipos de Urochloa brizantha com base na análise de descritores quantitativos, qualitativos e sua análise conjunta a fim de selecionar os promissores para liberação como cultivares desta espécie. Oito ecótipos (B1, B2, B3, B4, B5, B6, B8) e a cultivar 'Marandu' de U. brizantha foram implantados em piquetes, com 1000m2 cada, em duas repetições. Foram avaliados cinco descritores quantitativos e dez qualitativos no período seco e das águas. Os descritores quantitativos foram: área foliar, comprimento e largura das lâminas foliares, massa seca (MS) e proporção de lâmina foliar na MS. Os descritores qualitativos mensurados foram: resistência ao cisalhamento, volume de gás acumulado na fração rápida e lenta, proteína bruta, fibra em detergente neutro, fibra em detergente ácido, celulose, lignina em ácido sulfúrico, sílica e digestibilidade in vitro da matéria orgânica. Houve divergência genética entre os ecótipos de U. brizantha, especialmente em relação aos descritores quantitativos. Com base nos agrupamentos dos descritores quantitativos, qualitativos e sua análise conjunta, o agrupamento contendo de B1, B3 e B5 com 'Marandu' podem resultar em ecótipos promissores de U. brizantha .(AU)

This study aimed to estimate the genetic divergence between Urochloa brizantha ecotypes based on quantitative, qualitative descriptors and their joint analysis to select the promising to release as cultivars of this species. Eight ecotypes (B1, B2, B3, B4, B5, B6, B8) and cultivar 'Marandu' of U. brizantha were implanted into pickets with 1000m2 each, with two repetitions. Five quantitative descriptors were evaluated [leaf area (ALF), length and width of leaf blades (CLF and LLF, respectively), dry mass (MS), mass of dry matter (MMS) and proportion of leaf blade in MS (PLF)] in two forage samples, being a representative of rainfall, in February 2000, and another in the dry period, in August 2000. It was measured the qualitative descriptors: shear strength (RC), volume of accumulated gas in fast and slow fraction (A and B, respectively), crude protein (CP), neutral detergent fiber (NDF), acid detergent fiber (ADF ), cellulose (CEL), lignin in sulfuric acid (LIG), silica (SIL) and in vitro digestibility of organic matter (IVOMD). There was considerable genetic divergence in U. brizantha ecotypes, especially regarding to quantitative descriptors. Based on the groupings of quantitative, qualitative descriptors and their joint analysis, the grouping containing of B1, B3 and B5 with 'Marandu' can result in promising U. brizantha ecotypes.(AU)

Marcadores RAPD e caracteres morfoagronômicos na determinação da diversidade genética entre acessos de pimentas e pimentões

The genetic diversity within collections and banks of germplasm can be estimated by different methods and their choice is dependent of the available resources and the desired precision from the researcher. In the present work, RAPD markers and morph-agronomic traits were used to estimate the genetic divergence among 52 Capsicum spp. accessions. Fifty-seven binary variables from morph-agronomic characterization and 84 polymorphic markers from RAPD analysis were both separately and jointly evaluated and three dendrograms were generated. Two major groups were formed in all analyses. The clusters from the joint analysis were similar to the ones from molecular analysis. One group was formed with only C. baccatum accessions and the other one with C. chinense, C. frutescens and C. annuum accessions. These results were in agreement with the gene pool complexes proposal. The association of these methods allowed a better distinction among the accessions, a cluster formation at species level and a conclusion that there is no duplicates in the collection, showing how important is the use of different methods to characterize a germplasm bank.

A diversidade genética existente em coleções e bancos de germoplasma pode ser estimada por meio de diversos métodos, sendo que a escolha destes depende da disponibilidade dos recursos e da precisão desejada pelo pesquisador. Neste trabalho, marcadores RAPD e caracteres morfoagronômicos foram usados para estimar a divergência genética entre 52 acessos de Capsicum spp. Um total de 57 variáveis binárias geradas pela caracterização morfoagronômica e 84 bandas polimórficas obtidas a partir da análise por RAPD foram analisadas separadamente e em conjunto, permitindo a construção de três dendrogramas. Observou-se a formação de dois grupos principais, tanto na análise morfoagronômica e molecular separadamente, quanto na análise conjunta dos dados. O agrupamento dos acessos pela análise conjunta seguiu o mesmo padrão verificado para a análise molecular, que se constituiu em um grupo formado por acessos de C. baccatum e outro grupo formado pelos acessos de C. chinense, C. frutescens e C. annuum. Esse agrupamento segue a proposta vigente para a classificação de Capsicum spp. em complexos gênicos. A associação dos métodos permitiu uma melhor distinção entre os acessos, o agrupamento desses em nível de espécie e a conclusão de que não há duplicatas na coleção, demonstrando a importância do uso de diferentes técnicas na caracterização de um banco de germoplasma.

Marcadores RAPD e caracteres morfoagronômicos na determinação da diversidade genética entre acessos de pimentas e pimentões

The genetic diversity within collections and banks of germplasm can be estimated by different methods and their choice is dependent of the available resources and the desired precision from the researcher. In the present work, RAPD markers and morph-agronomic traits were used to estimate the genetic divergence among 52 Capsicum spp. accessions. Fifty-seven binary variables from morph-agronomic characterization and 84 polymorphic markers from RAPD analysis were both separately and jointly evaluated and three dendrograms were generated. Two major groups were formed in all analyses. The clusters from the joint analysis were similar to the ones from molecular analysis. One group was formed with only C. baccatum accessions and the other one with C. chinense, C. frutescens and C. annuum accessions. These results were in agreement with the gene pool complexes proposal. The association of these methods allowed a better distinction among the accessions, a cluster formation at species level and a conclusion that there is no duplicates in the collection, showing how important is the use of different methods to characterize a germplasm bank.

A diversidade genética existente em coleções e bancos de germoplasma pode ser estimada por meio de diversos métodos, sendo que a escolha destes depende da disponibilidade dos recursos e da precisão desejada pelo pesquisador. Neste trabalho, marcadores RAPD e caracteres morfoagronômicos foram usados para estimar a divergência genética entre 52 acessos de Capsicum spp. Um total de 57 variáveis binárias geradas pela caracterização morfoagronômica e 84 bandas polimórficas obtidas a partir da análise por RAPD foram analisadas separadamente e em conjunto, permitindo a construção de três dendrogramas. Observou-se a formação de dois grupos principais, tanto na análise morfoagronômica e molecular separadamente, quanto na análise conjunta dos dados. O agrupamento dos acessos pela análise conjunta seguiu o mesmo padrão verificado para a análise molecular, que se constituiu em um grupo formado por acessos de C. baccatum e outro grupo formado pelos acessos de C. chinense, C. frutescens e C. annuum. Esse agrupamento segue a proposta vigente para a classificação de Capsicum spp. em complexos gênicos. A associação dos métodos permitiu uma melhor distinção entre os acessos, o agrupamento desses em nível de espécie e a conclusão de que não há duplicatas na coleção, demonstrando a importância do uso de diferentes técnicas na caracterização de um banco de germoplasma.

Marcadores RAPD e caracteres morfoagronômicos na determinação da diversidade genética entre acessos de pimentas e pimentões

The genetic diversity within collections and banks of germplasm can be estimated by different methods and their choice is dependent of the available resources and the desired precision from the researcher. In the present work, RAPD markers and morph-agronomic traits were used to estimate the genetic divergence among 52 Capsicum spp. accessions. Fifty-seven binary variables from morph-agronomic characterization and 84 polymorphic markers from RAPD analysis were both separately and jointly evaluated and three dendrograms were generated. Two major groups were formed in all analyses. The clusters from the joint analysis were similar to the ones from molecular analysis. One group was formed with only C. baccatum accessions and the other one with C. chinense, C. frutescens and C. annuum accessions. These results were in agreement with the gene pool complexes proposal. The association of these methods allowed a better distinction among the accessions, a cluster formation at species level and a conclusion that there is no duplicates in the collection, showing how important is the use of different methods to characterize a germplasm bank.

A diversidade genética existente em coleções e bancos de germoplasma pode ser estimada por meio de diversos métodos, sendo que a escolha destes depende da disponibilidade dos recursos e da precisão desejada pelo pesquisador. Neste trabalho, marcadores RAPD e caracteres morfoagronômicos foram usados para estimar a divergência genética entre 52 acessos de Capsicum spp. Um total de 57 variáveis binárias geradas pela caracterização morfoagronômica e 84 bandas polimórficas obtidas a partir da análise por RAPD foram analisadas separadamente e em conjunto, permitindo a construção de três dendrogramas. Observou-se a formação de dois grupos principais, tanto na análise morfoagronômica e molecular separadamente, quanto na análise conjunta dos dados. O agrupamento dos acessos pela análise conjunta seguiu o mesmo padrão verificado para a análise molecular, que se constituiu em um grupo formado por acessos de C. baccatum e outro grupo formado pelos acessos de C. chinense, C. frutescens e C. annuum. Esse agrupamento segue a proposta vigente para a classificação de Capsicum spp. em complexos gênicos. A associação dos métodos permitiu uma melhor distinção entre os acessos, o agrupamento desses em nível de espécie e a conclusão de que não há duplicatas na coleção, demonstrando a importância do uso de diferentes técnicas na caracterização de um banco de germoplasma.