Inclusion of genomic information in estimation of genetic parameters for body weights and visual scores in Nelore cattle

The aim of this study was to evaluate genomic information inclusion in genetic parameter estimation of standardized body weight at birth and at 240, 365, and 450 days of age, and visual scores for body structure, precocity, and body muscularity, measured as yearlings in Nelore cattle. We compared genetic parameters, (co)variance components (estimated from Bayesian inference and Gibbs sampling), breeding value accuracies, genetic trends, and principal component analysis (PCA) obtained through traditional GBLUP and ssGBLUP methods. For all traits analyzed, part of the phenotypic variation was explained by the additive genetic effect, thus indicating the capacity of traits to respond to the selection process. Estimates of genetic correlation, in both methodologies, between body weights and visual scores were, in general, high and positive, showing that the selection for visual scores can lead to heavier animals. Genetic trends showed genetic progress, both when estimated breeding values and genomic estimated breeding values were used. The PCA, genetic trends, and accuracy estimates on breeding values showed that inclusion of single nucleotide polymorphism information contributed towards slightly better estimates of the genetic variability of evaluated traits. Genomic information did not bring greater gains in genetic estimates, due to redundancy of kinship information from the pedigree, which already had complete animal kinship data.

Genetic study of litter size and litter uniformity in Landrace pigs

We aimed to estimate litter size and litter uniformity genetic parameters and genetic trends of Landrace pigs at birth and at three weeks by using multitrait analyses for 2,787 litters. The following litter traits were evaluated: number of piglets born alive (NBA), within-litter weight mean at birth (MBW), within-litter weight standard deviation at birth (SDB), within-litter weight coefficient of variation at birth (CVB), number of piglets at three weeks (NT), within-litter weight mean at three weeks (MT), within-litter weight standard deviation at three weeks (SDT), and within-litter weight coefficient of variation at three weeks (CVT). Heritability estimates for NBA, MBW, SDB, and CVB were 0.09±0.04, 0.31±0.08, 0.01±0.04, and 0.07±0.05, respectively, greater than those obtained at three weeks (0.06±0.04, 0.10±0.06, 0.01±0.04, and 0.02±0.04 for NT, MT, SDT, and CVT, respectively). The genetic correlations between NBA and MBW and between MBW and CVB (−0.73±0.20 and −0.93±0.21, respectively) were of moderate to high magnitudes, as well as the genetic correlations between CVT and SDT (0.85±0.39). Genetic correlations between MBW and MT, SDB and SDT, CVB and CVT, and NBA and NT were 0.73±0.16, 0.69±0.54, 0.36±0.80, and 0.95±0.06, respectively. The genetic trends were linear for NBA and CVB and quadratic for MBW and SDB, whereas for all traits at three weeks, they were close to zero. Within-litter weight coefficient of variation (CV) may be the most appropriate variation measure for application in breeding programs, especially at birth, due to its greater heritability estimate and high and negative genetic correlation with MBW. The genetic trends show that NT does not follow the increase in NBA, emphasizing the need to review the breeding goals.(AU)

Current trends in bovine abortion in Argentina / Tendências atuais do aborto bovino na Argentina

Bovine abortion is an important cause of significant economic losses in beef and dairy herds. This syndrome is usually difficult to diagnose. The aim of this study was to characterize bovine abortion causes in Argentina by standard diagnosis procedures (histology, bacterial and viral isolation) and other diagnostic tests like direct fluorescent antibody test (DFAT), fetal serology, immunohistochemistry (IHC), and PCR, showing their specific advantages and limitations. Necropsies were performed in 150 aborted bovine fetuses submitted to the diagnostic laboratories of Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) Balcarce, Argentina. Etiological diagnosis was confirmed in 78 fetuses (52% of the cases). Most causes of abortion were of infectious origin, being Neospora caninum (14.67%), Campylobacter fetus sp. (9.33%), Leptospira spp. (7.33%) and Brucella abortus (6.65%) the main microorganisms identified. Bovine viral diarrhea virus (BVDV) and bovine herpes virus (BHV) were diagnosed in 2 (1.33%) and 3 (2%) cases, respectively. This study showed a better characterization of bovine abortion compared with previous researches done on this topic.(AU)

O aborto bovino é uma causa importante de perdas econômicas significativas em rebanhos bovinos e leiteiros. Esta síndrome é geralmente difícil de diagnosticar. O objetivo deste estudo foi caracterizar o aborto bovino na Argentina por procedimentos diagnósticos de rotina (histologia, isolamento viral e bacteriana) e outros testes diagnósticos como ensaio directo de anticorpos fluorescentes (DFAT), sorologia fetal, imuno-histoquica (IHC), e PCR; mostrando suas vantagens e limitações específicas. As necropsias foram realizadas em 150 fetos bovinos abortados submetidos aos laboratórios de diagnóstico do Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuária (INTA) de Balcarce, na Argentina. O diagnóstico etiológico foi confirmado em 78 fetos (52% dos casos). A maioria das causas de aborto foram de origem infecciosa, sendo Neospora caninum (14,67%), Campylobacter fetus sp. (9,33%), Leptospira spp. (7,33%) e Brucella abortus (6,65%) os principais microrganismos identificados. O vírus da diarréia viral bovina (BVDV) e o herpesvírus bovino (BHV) foram diagnosticados em 2 (1,33%) e 3 (2%) casos, respectivamente. Este estudo mostrou uma melhor caracterização do aborto bovino em comparação com pesquisas anteriores feita sobre este tema.(AU)

Current trends in bovine abortion in Argentina / Tendências atuais do aborto bovino na Argentina

Bovine abortion is an important cause of significant economic losses in beef and dairy herds. This syndrome is usually difficult to diagnose. The aim of this study was to characterize bovine abortion causes in Argentina by standard diagnosis procedures (histology, bacterial and viral isolation) and other diagnostic tests like direct fluorescent antibody test (DFAT), fetal serology, immunohistochemistry (IHC), and PCR, showing their specific advantages and limitations. Necropsies were performed in 150 aborted bovine fetuses submitted to the diagnostic laboratories of Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) Balcarce, Argentina. Etiological diagnosis was confirmed in 78 fetuses (52% of the cases). Most causes of abortion were of infectious origin, being Neospora caninum (14.67%), Campylobacter fetus sp. (9.33%), Leptospira spp. (7.33%) and Brucella abortus (6.65%) the main microorganisms identified. Bovine viral diarrhea virus (BVDV) and bovine herpes virus (BHV) were diagnosed in 2 (1.33%) and 3 (2%) cases, respectively. This study showed a better characterization of bovine abortion compared with previous researches done on this topic.(AU)

O aborto bovino é uma causa importante de perdas econômicas significativas em rebanhos bovinos e leiteiros. Esta síndrome é geralmente difícil de diagnosticar. O objetivo deste estudo foi caracterizar o aborto bovino na Argentina por procedimentos diagnósticos de rotina (histologia, isolamento viral e bacteriana) e outros testes diagnósticos como ensaio directo de anticorpos fluorescentes (DFAT), sorologia fetal, imuno-histoquica (IHC), e PCR; mostrando suas vantagens e limitações específicas. As necropsias foram realizadas em 150 fetos bovinos abortados submetidos aos laboratórios de diagnóstico do Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuária (INTA) de Balcarce, na Argentina. O diagnóstico etiológico foi confirmado em 78 fetos (52% dos casos). A maioria das causas de aborto foram de origem infecciosa, sendo Neospora caninum (14,67%), Campylobacter fetus sp. (9,33%), Leptospira spp. (7,33%) e Brucella abortus (6,65%) os principais microrganismos identificados. O vírus da diarréia viral bovina (BVDV) e o herpesvírus bovino (BHV) foram diagnosticados em 2 (1,33%) e 3 (2%) casos, respectivamente. Este estudo mostrou uma melhor caracterização do aborto bovino em comparação com pesquisas anteriores feita sobre este tema.(AU)

Structural Attributes Dynamics of the Brazilian Broiler Production Chain

ABSTRACT Brazil is one of the worlds largest broiler meat exporters. Broiler meat is one of the most consumed meats worldwide. The most significant challenge for strategic business management when optimizing the financial returnis knowing exactly where to invest. The same happens in the broiler production chain. The present research aimed to investigate which were the most central actors in the broiler supply chain and the dynamics of the chain. The current study was done based on the poultry chain business relations, from 2000 to 2015, of the leading actors of the Brazilian broiler production chain. The centrality indicator was established through social network analysis (SNA) approach, to determine their positions in the chain as a whole. The most used indicators within network analysis are those designed to identify the extent to which one actor occupies a more central position than another. The Gephi® software was applied to calculate the structural attributes and indicators of the network. Results were estimated using the RapidMiner® software. A model was presented that shows one infrastructure indicator as an explanatory variable. The findings indicate that the centrality indicator was weakly influenced when compared to the other variables, such as market demand, wide variations on the scenario, and mergers or acquisitions.

Structural Attributes Dynamics of the Brazilian Broiler Production Chain

Brazil is one of the worlds largest broiler meat exporters. Broiler meat is one of the most consumed meats worldwide. The most significant challenge for strategic business management when optimizing the financial returnis knowing exactly where to invest. The same happens in the broiler production chain. The present research aimed to investigate which were the most central actors in the broiler supply chain and the dynamics of the chain. The current study was done based on the poultry chain business relations, from 2000 to 2015, of the leading actors of the Brazilian broiler production chain. The centrality indicator was established through social network analysis (SNA) approach, to determine their positions in the chain as a whole. The most used indicators within network analysis are those designed to identify the extent to which one actor occupies a more central position than another. The Gephi® software was applied to calculate the structural attributes and indicators of the network. Results were estimated using the RapidMiner® software. A model was presented that shows one infrastructure indicator as an explanatory variable. The findings indicate that the centrality indicator was weakly influenced when compared to the other variables, such as market demand, wide variations on the scenario, and mergers or acquisitions.(AU)

Structural Attributes Dynamics of the Brazilian Broiler Production Chain

Brazil is one of the worlds largest broiler meat exporters. Broiler meat is one of the most consumed meats worldwide. The most significant challenge for strategic business management when optimizing the financial returnis knowing exactly where to invest. The same happens in the broiler production chain. The present research aimed to investigate which were the most central actors in the broiler supply chain and the dynamics of the chain. The current study was done based on the poultry chain business relations, from 2000 to 2015, of the leading actors of the Brazilian broiler production chain. The centrality indicator was established through social network analysis (SNA) approach, to determine their positions in the chain as a whole. The most used indicators within network analysis are those designed to identify the extent to which one actor occupies a more central position than another. The Gephi® software was applied to calculate the structural attributes and indicators of the network. Results were estimated using the RapidMiner® software. A model was presented that shows one infrastructure indicator as an explanatory variable. The findings indicate that the centrality indicator was weakly influenced when compared to the other variables, such as market demand, wide variations on the scenario, and mergers or acquisitions.

Estudo genético quantitativo de características de crescimento em bovinos Nelore de acordo com a ordem de parto das matrizes

Este estudo foi desenvolvido com o objetivo de inferir sobre o efeito da ordem de parto das matrizes (OP) sobre o crescimento pré-desmama dos animais mediante a obtenção de: parâmetros genéticos para o peso ao nascer (PN), ganho de peso do nascimento à desmama (GND) e peso à desmama (PD) de acordo com a OP; associações genéticas entre as características e entre as OP dentro de cada característica; além de tendências genéticas para cada característica e considerando cada OP. As informações fenotípicas e de pedigree utilizadas integram a base de dados do programa DeltaGen. A estimação de parâmetros genéticos e a predição do mérito genético dos animais para os efeitos genético-aditivos direto e materno foi realizada em análises bicaracterísticas e de regressão aleatória via inferência Bayesiana. Existe variabilidade genética para as características estudadas e a seleção realizada nos rebanhos tem promovido mudanças significativas para o efeito genético-aditivo direto. Isso requer especial atenção quanto ao peso ao nascer, devendo-se ponderá-lo nos índices para evitar problemas de parto, principalmente, em matrizes jovens. Em 2021, o programa DeltaGen implementou essa prática e espera-se que o peso ao nascer dos animais tenda a valores próximos à média da população. Por outro lado, a habilidade materna das matrizes não sofreu mudança genética ao longo do tempo considerado neste estudo, cabendo redefinir os índices de seleção neste sentido, caso seja desejada a obtenção de animais com maior habilidade materna. Nas populações estudadas não foram encontradas evidências robustas da existência de animais geneticamente plásticos, não sendo amparada, portanto, a seleção para desenvolvimento ponderal de animais da raça Nelore de acordo com a ordem de parto das matrizes.

This study was carried out with the aim of inferring the effect of the calving order (CO) on the pre-weaning growth of animals by obtaining: genetic parameters for birth weight (BW), birth to weaning weight gain (BWG) and weaning weight (WW) according to CO; genetic associations between traits and between CO within each trait; in addition to genetic trends for each trait and considering each CO. The phenotypic and pedigree information used are part of the DeltaGen program database. The estimation of genetic parameters and the prediction of the genetic merit of animals for direct and maternal genetic-additive effects were performed in two-trait and random regression analyzes via Bayesian inference. There is genetic variability for the studied traits and the selection carried out in the herds has promoted significant changes for the direct genetic-additive effect. This requires special attention regarding BW, which should be considered in the indexes to avoid birth problems, especially in heifers. In 2021, the DeltaGen program implemented this practice and it is expected that the BW of animals will tend to values close to the population mean. On the other hand, the maternal ability of the dams did not undergo genetic change over the time considered in this study, and it is necessary to redefine the selection indices in this sense, if it is desired to obtain animals with greater maternal ability. In the studied populations, robust evidence of the existence of genetically plastic animals was not found, therefore, the selection for weight development of Nelore animals according to the CO of the dams was not supported.

Variabilidade genética do peso ao nascer e seleção para crescimento em bubalinos do Estado do Pará, Brasil / Genetic variability of birth weight and selection for growth of water buffaloes from State of Pará, Brazil

Birth weight is a performance parameter of great zootechnical importance for both meat and dairy production, as well as for breeding animals, mainly due to its relation to survival rate at weaning, and the weight of animals throughout their developmental and growth phases. Therefore, the objective of this work was to establish heritability estimates, as well as phenotypic and genetic trends of birth weight of water buffaloes from State of Pará, Brazil. Descriptive statistics were calculated and the Shapiro-Wilk Normality test was performed with a Statistical Analysis System package. Heritability estimates were established by Bayesian inference. BW was 36.6 kg in average. The statistical model considered sex, year of birth and breed composition of the animals as fixed effects, and animal, maternal and residual as random effects. Direct heritability was platykurtic (flattened) and with higher asymmetry, presenting a bimodal distribution with the first mode close to 0.10, and the second mode close to 0.30; the maternal heritability was trimodal, with peaks very close to 0.15, and another, less evident, close to 0.20. The direct genetic trend of birth weight was negative (-0.03kg year-1) and maternal genetic trend was close to zero (0.001kg ano-1), even though the phenotypic trend had been positive (0.156 kg year-1). There is genetic variability to be addressed in a breeding program, however, very little was done as far as selection for growth of water buffaloes in the State of Pará.

O peso ao nascer constitui característica produtiva de elevada importância zootécnica, devido à sua relação com a taxa de sobrevivência à desmama e com os pesos nas demais fases de desenvolvimento do animal, quer seja para a produção de carne, leite ou em animais que se destinam à reprodução. O objetivo deste trabalho foi obter estimativas de herdabilidade e tendências fenotípicas e genéticas do peso ao nascer, em bubalinos do Estado do Pará, Brasil. Foram calculadas as estatísticas descritivas e realizado o teste de Normalidade de Shapiro-Wilk por meio do pacote estatístico Statistical Analisys System. As estimativas de herdabilidade foram obtidas por inferência Bayesiana. O peso ao nascer apresentou média de 36,6 kg. O modelo de análise considerou como fixos os efeitos de sexo, ano de nascimento e composição racial do animal e como efeitos aleatórios animal, efeito materno e residual. A distribuição da herdabilidade direta apresentou-se platicúrtica (achatada) e com maior assimetria, tendo uma distribuição bimodal com a primeira moda próxima a 0,10 e a segunda próxima a 0,30; a materna apresentou-se trimodal, com picos bem próximos a 0,15 e outro menos evidente próximo a 0,20. A tendência genética direta do peso ao nascer mostrou-se negativa (-0,03kg ano-1) e a tendência genética materna próxima à zero (0,001 kg ano-1), ainda que a tendência fenotípica tenha sido positiva (0,156kg ano-1). Existe variabilidade genética possível de ser trabalhada em um programa de melhoramento, no entanto, pouco foi feito quanto à seleção para crescimento em búfalos no Estado do Pará.

Variabilidade genética do peso ao nascer e seleção para crescimento em bubalinos do Estado do Pará, Brasil / Genetic variability of birth weight and selection for growth of water buffaloes from State of Pará, Brazil

Birth weight is a performance parameter of great zootechnical importance for both meat and dairy production, as well as for breeding animals, mainly due to its relation to survival rate at weaning, and the weight of animals throughout their developmental and growth phases. Therefore, the objective of this work was to establish heritability estimates, as well as phenotypic and genetic trends of birth weight of water buffaloes from State of Pará, Brazil. Descriptive statistics were calculated and the Shapiro-Wilk Normality test was performed with a Statistical Analysis System package. Heritability estimates were established by Bayesian inference. BW was 36.6 kg in average. The statistical model considered sex, year of birth and breed composition of the animals as fixed effects, and animal, maternal and residual as random effects. Direct heritability was platykurtic (flattened) and with higher asymmetry, presenting a bimodal distribution with the first mode close to 0.10, and the second mode close to 0.30; the maternal heritability was trimodal, with peaks very close to 0.15, and another, less evident, close to 0.20. The direct genetic trend of birth weight was negative (-0.03kg year-1) and maternal genetic trend was close to zero (0.001kg ano-1), even though the phenotypic trend had been positive (0.156 kg year-1). There is genetic variability to be addressed in a breeding program, however, very little was done as far as selection for growth of water buffaloes in the State of Pará.(AU)

O peso ao nascer constitui característica produtiva de elevada importância zootécnica, devido à sua relação com a taxa de sobrevivência à desmama e com os pesos nas demais fases de desenvolvimento do animal, quer seja para a produção de carne, leite ou em animais que se destinam à reprodução. O objetivo deste trabalho foi obter estimativas de herdabilidade e tendências fenotípicas e genéticas do peso ao nascer, em bubalinos do Estado do Pará, Brasil. Foram calculadas as estatísticas descritivas e realizado o teste de Normalidade de Shapiro-Wilk por meio do pacote estatístico Statistical Analisys System. As estimativas de herdabilidade foram obtidas por inferência Bayesiana. O peso ao nascer apresentou média de 36,6 kg. O modelo de análise considerou como fixos os efeitos de sexo, ano de nascimento e composição racial do animal e como efeitos aleatórios animal, efeito materno e residual. A distribuição da herdabilidade direta apresentou-se platicúrtica (achatada) e com maior assimetria, tendo uma distribuição bimodal com a primeira moda próxima a 0,10 e a segunda próxima a 0,30; a materna apresentou-se trimodal, com picos bem próximos a 0,15 e outro menos evidente próximo a 0,20. A tendência genética direta do peso ao nascer mostrou-se negativa (-0,03kg ano-1) e a tendência genética materna próxima à zero (0,001 kg ano-1), ainda que a tendência fenotípica tenha sido positiva (0,156kg ano-1). Existe variabilidade genética possível de ser trabalhada em um programa de melhoramento, no entanto, pouco foi feito quanto à seleção para crescimento em búfalos no Estado do Pará.(AU)

Parâmetros genéticos, tendências e resposta à seleção de características produtivas da raça Nelore na Amazônia Legal / Genetic parameters, trends and productive traits response to selection of Nelore cattle from Legal Amazon region

Estudos relacionados aos rebanhos de seleção situados nas novas fronteiras agrícolas do país são escassos, porém não menos importantes aos programas de melhoramento. O objetivo deste trabalho foi estimar parâmetros genéticos, efeitos não genéticos, tendência genética e resposta à seleção para características de crescimento (pesos padronizados aos 120, 210 e 450 dias) e reprodutivas (idade ao primeiro parto e perímetro escrotal aos 450 dias) de bovinos da raça Nelore criados na Amazônia Legal. O arquivo de dados consistia em 211.744 registros do PMGRN Nelore Brasil, de animais nascidos entre 1995 e 2008 em rebanhos localizados nos Estados do AC, MA, MT, PA, RO e TO. O modelo animal considerou as cinco características simultaneamente. As herdabilidades para P120 foram: 0,24; 0,21 e 0,36 (direta, materna e total, respectivamente); para P210: 0,29; 0,16 e 0,45 e para P450, PE450 e IPP: 0,48; 0,49 e 0,22 (herdabilidades diretas). As correlações genéticas entre os pesos variaram de 0,51 a 0,78; entre os pesos e PE450 variaram de 0,26 a 0,46; entre os pesos e a IPP foram baixas e negativas, e entre PE450 e IPP foi nula. Os progressos genéticos foram superiores aos fenotípicos, com exceção da IPP. A resposta à seleção variou de 0,27 a 0,11 kg/ano; 0,49 a 0,20 kg/ano; 1,32 a 0,53 kg/ano; 0,08 a 0,03 cm/ano e 0,06 a 0,02 dias/ano para P120, P210, P450, PE450 e IPP, respectivamente. As características estudadas podem ser utilizadas como critérios de seleção.(AU)

Studies on the selection of herds located in the new agricultural borders of the country are scarce, but not less important than breeding programs. The objectives of this study were to estimate genetic parameters, non-genetic effects, genetic trends and responses to selection for growth (standardized weights at 120, 210, and 450 days) and reproductive traits (age at first calving and scrotal perimeter at 450 days) of Nelore cattle raised in the Amazon Legal region. The database consisted of 211,744 records of Nelore animals born between 1995 and 2008 from herds situated at the states of AC, MA, MT, PA, RO, and TO, participants in the PMGRN Nelore Brazil. The animal model considered the five traits simultaneously. Heritabilities for P120 were: 0.24; 0.21 and 0.36 (h²d, h²m and h²t, respectively); for P210: 0.29; 0.16 and 0.45, and for P450, PE450 and IPP: 0.48; 0.49, and 0.22 (direct heritabilities). Genetic correlations among weights ranged from 0.51 to 0.78; between weights and PE450, the values ranged from 0.26 to 0.46; between weights and IPP, correlations were low and negative, and between PE450 and IPP, correlation were null. In all traits, genetic gains were greater than phenotypic gains, except for IPP. The response to selection ranged from 0.27 to 0.11 kg/year; from 0.49 to 0.20 kg/year; from 1.32 to 0.53 kg/year; from 0.08 to 0.03 cm/year; and from 0.06 to 0.02 days/year for P120, P210, P450, PE450, and IPP, respectively. The studied traits can be used as selection criteria in breeding programs.(AU)

Parâmetros genéticos, tendências e resposta à seleção de características produtivas da raça Nelore na Amazônia Legal / Genetic parameters, trends and productive traits response to selection of Nelore cattle from Legal Amazon region

Estudos relacionados aos rebanhos de seleção situados nas novas fronteiras agrícolas do país são escassos, porém não menos importantes aos programas de melhoramento. O objetivo deste trabalho foi estimar parâmetros genéticos, efeitos não genéticos, tendência genética e resposta à seleção para características de crescimento (pesos padronizados aos 120, 210 e 450 dias) e reprodutivas (idade ao primeiro parto e perímetro escrotal aos 450 dias) de bovinos da raça Nelore criados na Amazônia Legal. O arquivo de dados consistia em 211.744 registros do PMGRN – Nelore Brasil, de animais nascidos entre 1995 e 2008 em rebanhos localizados nos Estados do AC, MA, MT, PA, RO e TO. O modelo animal considerou as cinco características simultaneamente. As herdabilidades para P120 foram: 0,24; 0,21 e 0,36 (direta, materna e total, respectivamente); para P210: 0,29; 0,16 e 0,45 e para P450, PE450 e IPP: 0,48; 0,49 e 0,22 (herdabilidades diretas). As correlações genéticas entre os pesos variaram de 0,51 a 0,78; entre os pesos e PE450 variaram de 0,26 a 0,46; entre os pesos e a IPP foram baixas e negativas, e entre PE450 e IPP foi nula. Os progressos genéticos foram superiores aos fenotípicos, com exceção da IPP. A resposta à seleção variou de 0,27 a 0,11 kg/ano; 0,49 a 0,20 kg/ano; 1,32 a 0,53 kg/ano; 0,08 a 0,03 cm/ano e 0,06 a 0,02 dias/ano para P120, P210, P450, PE450 e IPP, respectivamente. As características estudadas podem ser utilizadas como critérios de seleção.

Studies on the selection of herds located in the new agricultural borders of the country are scarce, but not less important than breeding programs. The objectives of this study were to estimate genetic parameters, non-genetic effects, genetic trends and responses to selection for growth (standardized weights at 120, 210, and 450 days) and reproductive traits (age at first calving and scrotal perimeter at 450 days) of Nelore cattle raised in the Amazon Legal region. The database consisted of 211,744 records of Nelore animals born between 1995 and 2008 from herds situated at the states of AC, MA, MT, PA, RO, and TO, participants in the PMGRN – Nelore Brazil. The animal model considered the five traits simultaneously. Heritabilities for P120 were: 0.24; 0.21 and 0.36 (h²d, h²m and h²t, respectively); for P210: 0.29; 0.16 and 0.45, and for P450, PE450 and IPP: 0.48; 0.49, and 0.22 (direct heritabilities). Genetic correlations among weights ranged from 0.51 to 0.78; between weights and PE450, the values ranged from 0.26 to 0.46; between weights and IPP, correlations were low and negative, and between PE450 and IPP, correlation were null. In all traits, genetic gains were greater than phenotypic gains, except for IPP. The response to selection ranged from 0.27 to 0.11 kg/year; from 0.49 to 0.20 kg/year; from 1.32 to 0.53 kg/year; from 0.08 to 0.03 cm/year; and from 0.06 to 0.02 days/year for P120, P210, P450, PE450, and IPP, respectively. The studied traits can be used as selection criteria in breeding programs.

Use of ecological niche models to predict the distribution of invasive species: a scientometric analysis

We conducted a scientometric analysis to determine the main trends and gaps of studies on the use of ecological niche models (ENMs) to predict the distribution of invasive species. We used the database of the Thomson Institute for Scientific Information (ISI). We found 190 papers published between 1991 and 2010 in 82 journals. The number of papers was low in the 1990s, but began to increase after 2003. One-third of the papers were published by researchers from the United States of America, and consequently, the USA was also the most studied region. The majority of studies were carried out in terrestrial environments, while only a few investigated aquatic systems, probably because important aquatic predictor variables are scarce or unavailable for most regions in the world. Species-occurrence records were mainly composed of presence-only records, and almost 70% of the studies were carried out with plants and insects. Twenty-three different distribution modelling methods were used. The Genetic Algorithm for Rule-set Production (GARP) was used most often. Our scientometric analysis showed a growing interest in the use of ENMs to predict the distribution of invasive species, especially in the last decade, which is probably related to the increase in species introductions worldwide. Among some important gaps that need to be filled, the relatively small number of studies conducted in developing countries and in aquatic environments deserves careful attention.

Conduziu-se uma análise cienciométrica para determinar as principais tendências e lacunas de estudos sobre o uso de modelos de nicho ecológico (MNEs) para predizer a distribuição de espécies invasoras. Usou-se a base de dados Thomson Institute for Scientific Information (ISI). Foram encontrados 190 artigos publicados entre 1991 e 2010, em 82 periódicos. O número de trabalhos foi baixo na década de 1990, mas começou a aumentar após 2000. Um terço dos trabalhos foi publicado por pesquisadores dos Estados Unidos da América e, consequentemente, os Estados Unidos também foram a região mais estudada. A maioria dos estudos foi realizada em ambientes terrestres. Apenas alguns sistemas aquáticos foram investigados, provavelmente porque importantes variáveis preditoras aquáticas são escassas ou inexistentes na maioria das regiões do mundo. Registros de ocorrência de espécies foram compostos principalmente por registros de presença (ou seja, sem registros de ausência) e quase 70% dos estudos foram realizados com plantas e insetos. Vinte e três diferentes métodos de modelagem foram utilizados. O Algoritmo Genético para Produção de Conjunto de Regras (GARP) foi o mais utilizado. Esta análise cienciométrica mostrou um interesse crescente no uso de MNEs para prever a distribuição de espécies invasoras, especialmente na última década, estando esse aumento provavelmente relacionado ao crescimento na introdução de espécies em todo o mundo. Entre algumas lacunas importantes que precisam ser preenchidas, destaca-se o número relativamente pequeno de estudos realizados em países em desenvolvimento e em ambientes aquáticos.

Estudo genético quantitativo de uma população de ovelhas Santa Inês

É de grande importância estudar o potencial genético da raça Santa Inês, que cada vez mais está ocupando espaço, devido a sua alta resistencia e capacidade de adaptação aos diversos ambientes. A informação consistiu de 37.735 dados de pedigree, 11.851 registros fenotípicos de cordeiros que foram usados para o estudo das características de desenvolvimento ponderal e 6.566 registros fenotípicos de 2.211 ovelhas, usados para a avaliação das caracteristicas de eficiência reprodutiva. O período de análise foi de 12 anos (2003-2014), e as informações pertencentes a 33 rebanhos distribuídos em dez estados brasileiros. O banco de dados foi gerido através do programa Microsoft Visual FoxPro, a significancia dos efeitos fixos a incluir nos modelos foi desenvolvida pelo programa estatístico R. Estimação dos componentes de variância, parâmetros e valores genéticos foram obtidos pelo método DFREML, utilizando o Programa MTDFREML em análise unicaracterística empregando o modelo animal. Foram avaliadas dez características ponderais: peso ao nascer (PN), peso ao desmama com 60 dias de idade (PD60), peso aos 180 dias de idade (P180), peso aos 270 dias de idade (P270), ganho diário de peso ao desmame (GPD), ganho diário de peso entre 60 e 180 dias (GPD180), ganho diário de peso entre 180 e 270 dias (GP180-270), ganho diário de peso entre 60 e 270 dias (GPD270), musculosidade da perna (MP) e presença de lã na pele (PL). Sete características reprodutivas: idade ao primeiro parto (IPP), intervalo de partos (IP), sobrevivência dos cordeiros ao desmame (SBV), número de cordeiros vivos ao parto/ovelha (NCP), número de cordeiros ao desmame/ovelha (NCD), peso total dos cordeiros ao parto/ovelha (PTCP) e peso total dos cordeiros ao desmame/ovelha (PTCD). Nas características de peso obteve-se um incremento nos valores dos componentes de variância conforme a idade do animal aumenta, enquanto que o efeito materno e as correlações genéticas direta-materna foram significativas no início e logo declinaram no pós-desmame, a influência do ambiente permanente materno (2) foi de magnitude alta (PN: 0,57, P60: 0,60, P180: 0,54 e GPD60: 0,48), provavelmente pelo sistema extensivo de pastagem que tem as mães, a herdabilidade total nas características avaliadas são de alta magnitude (PN: 0.38, PD60: 0.29, P180: 0.43, P270: 0.49, GPD: 0.48, GPD180: 0.43, GP180-270: 0.43, GPD270: 0.44, PL: 0.28, MP: 0.35), e as estimativas de repetitividade no desempenho das ovelhas (tm), são de alta intensidade para PN: 0.82, PD60: 0.8, P180: 0.7 e GPD: 0.61. Nas características reprodutivas encontrou-se uma notória variabilidade fenotípica e de ambiente permanente, as herdabilidades diretas foram 0.13, 0.04, 0.01, 0.12, 0.03, 0.16 e 0.18 para IPP, IP, SBV, NCP, NCD, PTCP e PTCD, respectivamente, o efeito do ambiente permanente foi de alta magnitude e variou de 0.79 a 0.97, enquanto que a grande variância ambiental e escassa variância residual das características conduzem a uma repetibilidade alta (entre 0.92 e 0.98). O ganho genético anual apresenta uma tendência irregular e de ligeiro incremento para as características ponderais, enquanto que as características reprodutivas apresentam uma tendência ligeiramente negativa em todas elas, exceto para IPP e SBV. Os resultados obtidos levam à conclusão que a seleção direta para características pre-desmama, levaram à seleção indireta para habilidade materna e, a seleção massal baseada sobre qualquer característica pós-desmama vai ter um rápido progresso genético, também as mudanças nas condições ambientais dos rebanhos, além da seleção direta para PTCP e PTCD, avaliadas ao primeiro parto, podem ser usadas como critério de seleção para a diminuição do intervalo geracional e a melhora da produtividade das ovelhas Santa Inês.

Studying genetic parameters and genetic changes in the Santa Ines sheep breed is important, as it is the most prevalent breed in Brazil and can adapt to many environments. This study included genetic data obtained from 37,735 pedigree records, of 11,851 performance records of lambs were used for the study of growth traits and 6,566 data of 2,211 registers of ewes were available to evaluate the reproductive traits. These data were collected over a period of 12 years (2003-2014) from 33 flocks in 10 Brazilian States. The database was kept and maintained using Microsoft Visual FoxPro 9.0 and the significance of fixed effects to include into the models was performed for the statistic program R. Variance components, genetic parameters and breeding values were estimated by the implementation of single-trait animal models via DFREML method, using MTDFREML software. Traits for growth as: birth weight (BW), weaning weight at 60 days of age (WW), weight at 180 days of age (W180), weight at 270 days of age (W270), average daily weight gain from birth at weaning (DGW), average daily weight gain from weaning to 6 months (DGWS), average daily weight gain from 6 months to 9 months (DGSN), average daily weight gain from weaning to 9 months (DGWN), the presence of hair in fur (HF) and leg muscularity (LM) were assessed. Reproductive traits of age at first lambing (AFL), lambing interval (LI), survivability (SU), litter size at birth (LSB), litter size at weaned (LSW), total litter weight at birth (TLWB) and total litter weight at weaning (TLWW) were also assessed. Variance components values increased in weight traits when lambs grew with age, while the maternal effect and genetic maternal-direct correlations were firstly significant which faded for post-weaning ages. Maternal permanent environment was of high magnitude (BW: 0.57, WW: 0.60, W180: 0.54 and DGW: 0.48), probably due to specific features involved in extensive livestock production systems where sheep were bred. High values were estimated for total heritability with respect to BW (0.38), WW (0.29), W180 (0.43), W270 (0.49), DGW (0.48), DGWS (0.43), DGSN (0.43), DGWN (0.44), HF (0.28), and LM (0.35), while the estimation of the repeatability of ewe performance was high for BW (0.82), WW (0.8), W180 (0.7) and DGW (0.61). For the reproductive traits, it was found pronounced phenotypic and permanent environment variances. The direct heritability estimates were 0.13, 0.04, 0.01, 0.12, 0.03, 0.16 and 0.18 for AFL, LI, SU, LSB, LSW, TLWB and TLWW, respectively. The estimated fractions of variance due to the permanent environmental effects in any traits were high magnitude (0.79 to 0.97), while the little residual variance that have the traits leading to a higher repeatability (0.92 to 0.98). The genetic trends observed for growth traits analyzed in this study were irregular and of slight increase, while by the reproductive traits has a slightly negative trend in all of them except for AFL and SU. Results obtained in the present study allow the conclusion that direct selection for pre-weaning traits conducted to an indirect selection for maternal ability. At the same time, mass selection based on post-weaning related traits would have faster results. Also, changes on environmental conditions of the flock, as well as the direct selection for TLWB and TLWW evaluated at first lambing, should be used as selection criteria for aiming reduction the generational interval and general improving the productivity of Santa Ines sheep.

The study of aquatic macrophytes in Neotropics: a scientometrical view of the main trends and gaps

Aquatic macrophytes comprises a diverse group of organisms including angiosperms, ferns, mosses, liverworts and some macroalgae that occur in seasonally or permanently wet environments. Among other implications, aquatic macrophytes are highly productive and with an important structuring role on aquatic environments. Ecological studies involving aquatic plants substantially increased in the last years. However, a precise view of researches devoted to aquatic macrophytes in Neotropics is necessary to reach a reliable evaluation of the scientific production. In the current study, we performed a scientometrics analysis of the scientific production devoted to Neotropical macrophytes in an attempt to find the main trends and gaps of researches concerning this group. The publication devoted to macrophytes in Neotropics increased conspicuously in the last two decades. Brazil, Argentina, Mexico and Chile were the most productive among Neotropical countries. Our analyses showed that the studies dealt mostly with the influences of aquatic macrophytes on organisms and abiotic features. Studies with a predictive approach or aiming to test ecological hypothesis are scarce. In addition, researches aiming to describe unknown species are still necessary. This is essential to support conservation efforts and to subsidize further investigations testing ecological hypotheses.

Macrófitas compreendem um diverso grupo de organismos macrofíticos, incluindo angiospermas, samambaias, musgos, hepáticas e algumas macroalgas que ocorrem em ambientes sazonalmente ou permanentemente inundados. Dentre outras implicações, as macrófitas aquáticas são altamente produtivas e com um importante papel na estruturação nos ambientes aquáticos. Estudos ecológicos envolvendo plantas aquáticas cresceram substancialmente nos últimos anos. Entretanto, uma visão precisa das pesquisas sobre macrófitas na região Neotropical é necessária para uma avaliação confiável da produção científica. No presente estudo, uma análise cienciométrica sobre macrófitas Neotropicais foi realizada com o intuito de identificar os principais padrões e lacunas nas pesquisas sobre esse grupo biológico. As publicações sobre macrófitas na região Neotropical cresceu conspicuamente nas últimas duas décadas. Brasil, Argentina, México e Chile foram os mais produtivos dentre os países Neotropicais. As análises mostraram que os estudos enfocaram principalmente as influências das macrófitas nos organismos e nas características abióticas. Estudos com uma abordagem preditiva ou testando hipóteses ecológicas são escassos. Adicionalmente, pesquisas com o objetivo de descrever espécies desconhecidas ainda são necessárias. Isso é essencial para subsidiar esforços de conservação e investigações futuras testando hipóteses ecológicas.

The study of aquatic macrophytes in Neotropics: a scientometrical view of the main trends and gaps

Aquatic macrophytes comprises a diverse group of organisms including angiosperms, ferns, mosses, liverworts and some macroalgae that occur in seasonally or permanently wet environments. Among other implications, aquatic macrophytes are highly productive and with an important structuring role on aquatic environments. Ecological studies involving aquatic plants substantially increased in the last years. However, a precise view of researches devoted to aquatic macrophytes in Neotropics is necessary to reach a reliable evaluation of the scientific production. In the current study, we performed a scientometrics analysis of the scientific production devoted to Neotropical macrophytes in an attempt to find the main trends and gaps of researches concerning this group. The publication devoted to macrophytes in Neotropics increased conspicuously in the last two decades. Brazil, Argentina, Mexico and Chile were the most productive among Neotropical countries. Our analyses showed that the studies dealt mostly with the influences of aquatic macrophytes on organisms and abiotic features. Studies with a predictive approach or aiming to test ecological hypothesis are scarce. In addition, researches aiming to describe unknown species are still necessary. This is essential to support conservation efforts and to subsidize further investigations testing ecological hypotheses.

Macrófitas compreendem um diverso grupo de organismos macrofíticos, incluindo angiospermas, samambaias, musgos, hepáticas e algumas macroalgas que ocorrem em ambientes sazonalmente ou permanentemente inundados. Dentre outras implicações, as macrófitas aquáticas são altamente produtivas e com um importante papel na estruturação nos ambientes aquáticos. Estudos ecológicos envolvendo plantas aquáticas cresceram substancialmente nos últimos anos. Entretanto, uma visão precisa das pesquisas sobre macrófitas na região Neotropical é necessária para uma avaliação confiável da produção científica. No presente estudo, uma análise cienciométrica sobre macrófitas Neotropicais foi realizada com o intuito de identificar os principais padrões e lacunas nas pesquisas sobre esse grupo biológico. As publicações sobre macrófitas na região Neotropical cresceu conspicuamente nas últimas duas décadas. Brasil, Argentina, México e Chile foram os mais produtivos dentre os países Neotropicais. As análises mostraram que os estudos enfocaram principalmente as influências das macrófitas nos organismos e nas características abióticas. Estudos com uma abordagem preditiva ou testando hipóteses ecológicas são escassos. Adicionalmente, pesquisas com o objetivo de descrever espécies desconhecidas ainda são necessárias. Isso é essencial para subsidiar esforços de conservação e investigações futuras testando hipóteses ecológicas.

Modernization trends in the dairy industry: milk quality monitoring by somatic cell counts / Tendências de modernização do setor lácteo: monitoramento da qualidade do leite pela contagem de células somáticas

The dairy industry suffers heavy losses as a result of mastitis, the main infection of dairy cattle. Itsmultiple etiology makes prophylaxis very difficult. The present study reflects the importance ofmastitis control, and discusses aspects of the somatic cell counts in the monitoring of the mammarygland"s health, with the objective of obtaining better quality milk, with less infection risks forconsumers, because both milk and dairy products can transmit zoonosis agents.

A mastite bovina é a principal afecção dos animais produtores de leite, que causa grandes prejuízos à indústria de laticínios. Sua etiologia é múltipla, o que dificulta sua profilaxia. O presente trabalho reflete a importância do seu controle e discute aspectos da contagem de células somáticas no monitoramento da saúde da glândula mamária, visando a obtenção de leite de melhor qualidade, com menor risco de infecção a seus consumidores, uma vez que tanto o leite como seus derivados podem veicular agentes causadores de zoonoses.

Modernization trends in the dairy industry: milk quality monitoring by somatic cell counts / Tendências de modernização do setor lácteo: monitoramento da qualidade do leite pela contagem de células somáticas

The dairy industry suffers heavy losses as a result of mastitis, the main infection of dairy cattle. Itsmultiple etiology makes prophylaxis very difficult. The present study reflects the importance ofmastitis control, and discusses aspects of the somatic cell counts in the monitoring of the mammarygland"s health, with the objective of obtaining better quality milk, with less infection risks forconsumers, because both milk and dairy products can transmit zoonosis agents.

A mastite bovina é a principal afecção dos animais produtores de leite, que causa grandes prejuízos à indústria de laticínios. Sua etiologia é múltipla, o que dificulta sua profilaxia. O presente trabalho reflete a importância do seu controle e discute aspectos da contagem de células somáticas no monitoramento da saúde da glândula mamária, visando a obtenção de leite de melhor qualidade, com menor risco de infecção a seus consumidores, uma vez que tanto o leite como seus derivados podem veicular agentes causadores de zoonoses.