Updating knowledge in estimating the genetics parameters: Multi-trait and Multi-Environment Bayesian analysis in rice

Among the multi-trait models selected to study several traits and environments jointly, the Bayesian framework has been a preferred tool when constructing a more complex and biologically realistic model. In most cases, non-informative prior distributions are adopted in studies using the Bayesian approach. However, the Bayesian approach presents more accurate estimates when informative prior distributions are used. The present study was developed to evaluate the efficiency and applicability of multi-trait multi-environment (MTME) models within a Bayesian framework utilizing a strategy for eliciting informative prior distribution using previous data on rice. The study involved data pertaining to rice (Oryza sativa L.) genotypes in three environments and five crop seasons (2010/2011 until 2014/2015) for the following traits: grain yield (GY), flowering in days (FLOR) and plant height (PH). Variance components, genetic and non-genetic parameters were estimated using the Bayesian method. In general, the informative prior distribution in Bayesian MTME models provided higher estimates of individual narrow-sense heritability and variance components, as well as minor lengths for the highest probability density interval (HPD), compared to their respective non-informative prior distribution analyses. More informative prior distributions make it possible to detect genetic correlations between traits, which cannot be achieved with non-informative prior distributions. Therefore, this mechanism presented to update knowledge for an elicitation of an informative prior distribution can be efficiently applied in rice breeding programs.

The impact of heterogeneity of variances on the genetic evaluation of performance traits in Nellore cattle

The objective was to evaluate the existence of heterogeneity of variances and its impact on the genetic evaluation of ponderal performance in sires of the Nellore breed. We used records of adjusted body weights at 210 (W210), 365 (W365), and 450 (W450) days of age. Both W365 and W450 were combined by principal component analyses using the first component (PC). Average daily gain (ADG) was obtained by difference between W450 and W210. The classes of standard deviations (SD) for W210, PC, and ADG were obtained by the standardization of means of herd-year means subclasses, with positive values composing the high SD and values equal and less than zero composing the SD. The model included the fixed effects of contemporary group and age at calving as a covariate, random genetic additive, and maternal genetic (except for PC) effects, and the permanent maternal environment. Variance components were obtained by Gibbs sampling. Posterior means of heritability in analyses without considering heterogeneity of variances ranged from 0.15±0.01 to 0.31±0.01. Posterior means of genetic correlations between the two classes of SD for W210, PC, and ADG were equal to 0.85±0.04, 0.83±0.03, and 0.71±0.08, respectively. Spearman correlation to breeding values of sires for ADG as the selection intensity increased in them, and the correlations between breeding values in general analyses were more correlated with those predicted in the high DP. Therefore, when there is a higher selection intensity on the sires only for the ADG criterion, there is a significant presence of the heterogeneity of variances and impact on the genetic evaluation of the sires. Thus, for ADG, the predictions of breeding values obtained by the genetic evaluation model in which the heterogeneity of variances are not considered are more weighted by the class of greater heterogeneity.(AU)

Avaliações genéticas para altura de cernelha e funcionalidade da marcha em equinos da raça Campolina / Genetic evaluations for withers height and gait functionality in Campolina horses

As avaliações genéticas permitem compreender a evolução da raça e a importância dos componentes genéticos sobre a variação fenotípica das características de interesse de produção em animais. Objetivou-se, com este trabalho, estimar a tendência genética, a herdabilidade e a correlação genética para altura de cernelha e funcionalidade da marcha em equinos brasileiros da raça Campolina. A Associação Brasileira dos Criadores de Cavalo Campolina disponibilizou 107.630 dados de animais registrados desde 1951 até julho de 2016. As avaliações genéticas foram obtidas por modelo animal uni-característico, para altura de cernelha, com dados de 11.765 indivíduos, e bi-característico, para os atributos de qualidade de marcha, que são: comodidade, desenvolvimento, dissociação, estilo e regularidade, pertencentes a 2.148, 2.148, 2.145, 2.125 e 2.148 equinos, respectivamente. Incremento genético de 3,88cm foi observado para altura de cernelha ao longo dos anos, sugerindo a eficiência de seleção para porte elevado no Campolina. Não foi verificada evolução genética nos atributos de marcha, podendo indicar necessidade de melhoria nos processos de avaliação e seleção dos animais para maior comodidade e desenvoltura desse andamento. Verificou-se herdabilidade igual a 0,37 para altura de cernelha e 0,77 para dissociação, além de herdabilidades de comodidade, desenvolvimento, estilo e regularidade iguais a 0,15, 0,23, 0,22 e 0,28. Os resultados indicam que essas características podem ser utilizadas como critério de seleção para melhor qualidade de marcha. As correlações genéticas verificadas entre a medida linear e todos os atributos de marcha foram de baixa magnitude, variando entre -0,01 e 0,05. Desta forma, é sugerido que a seleção para altura na cernelha exerce baixa influência sobre os ganhos genéticos em atributos de marcha.

Genetic evaluations allow to describe the genetic evolution of a breed and to understand the importance of the genetic variability on the phenotypic variance of a production interesting trait. This study aimed to estimate genetic tendency, heritability and genetic correlation for withers height and gait functionality traits in Brazilian Campolina horses. The Brazilian Association of Campolina Horse Breeders provided 107,630 records from registered animals born from 1951 until July 2016. Genetic evaluations were obtained by uni-trait animal model, for withers height using data from 11,765 individuals, and bi-trait models for attributes of gait quality: comfort, reach, dissociation, style and regularity, belonging to 2,148, 2,148, 2,145, 2,125 and 2,148 horses, respectively. A genetic increase of 3.88cm was observed for withers height over the years, suggesting the efficiency of selection for high height in Campolina. There was no genetic evolution in the gait attributes, which may indicate the need for improvement in the evaluation and selection processes of the animals for greater comfort and range of their gait. Heritability equal to 0.37 and 0.77 was observed for withers height and dissociation. Comfort, reach, style and regularity showed heritabilities of 0.15; 0.23; 0.22 and 0.28, respectively. The results indicate that these characteristics can be used as selection criteria for better gait quality. The genetic correlations observed between the linear measurement and all gait attributes were low varying between -0.01 and 0.05. Therefore, the selection for withers height would have little influence on the genetic gains in gait attributes.

Genetic and environmental factors that affect tick infestation in Nelore x Angus crossbreed cattle / Fatores genéticos e ambientais que afetam a infestação de carrapatos em bovinos cruzados Nelore x Angus

This study evaluated the effects of seasons and latitude on tick counting and determined the best model to estimate genetic parameters for tick count and hair coat. Records of animals naturally exposed to ticks on farms in several Brazilian states and in Paraguay were used. The ANOVA was used to verify the effects of seasons and latitude on the tick count trait. Spring was the season with the highest average, followed by summer and autumn, which showed no differences between them. The winter presented the lowest average values. Latitude -11° had the highest mean value followed by latitude -18°. The Bayesian approach was used to evaluate tick count and hair coat and to identify a suitable model for estimating genetic parameters for use in genetic evaluations. The data were analyzed using an animal model with four different specifications for “fixed” purposes. The inference was based on a Markov chain Monte Carlo (MCMC). The criteria for selection of the Bayesian model indicated that the M1 model, which considered the breed composition in the contemporary group, was superior to the other models, both for tick count and hair coat. Heritability estimates for tick count and hair coat obtained using the M1 model were 0.14 and 0.22, respectively. The rank correlations between the models for tick count and hair coat were estimated and reordering was verified for tick count. The estimated genetic correlation between tick count and hair coat traits was negative (-0.12). These findings suggest that different genes regulate tick count and hair coat.

Os objetivos foram avaliar os efeitos das estações e latitude na contagem de carrapatos e determinar o melhor modelo para estimar parâmetros genéticos para contagem de carrapatos e pelame. Foram utilizados registros de animais expostos naturalmente a carrapatos em fazendas em vários estados brasileiros e no Paraguai. A ANOVA foi utilizada para verificar os efeitos das estações e da latitude na característica de contagem de carrapatos. A primavera foi a estação com a maior média, seguida pelo verão e outono, que não mostraram diferenças entre eles. O inverno apresentou os menores valores médios. A latitude -11° teve o maior valor médio seguido pela latitude -18°. A abordagem bayesiana foi usada para avaliar a contagem de carrapatos e o pelame e identificar o modelo adequado para estimar parâmetros genéticos e para uso em avaliações genéticas. Os dados foram analisados usando um modelo animal com quatro especificações diferentes para efeitos “fixos”. A inferência foi baseada em uma cadeia de Markov Monte Carlo (MCMC). Os critérios de seleção do modelo bayesiano indicaram que o modelo M1, que considerou a composição racial no grupo contemporâneo, foi superior aos demais modelos, tanto na contagem de carrapatos e para pelame. As estimativas de herdabilidade para contagem de carrapatos e pelame obtidas usando o modelo M1 foram de 0,14 e 0,22, respectivamente. As correlações de ranking entre os modelos para a contagem de carrapatos e pelame foram estimadas e a reordenação foi verificada para a contagem de carrapatos. A correlação genética estimada entre a contagem de carrapatos e pelame foi negativa (-0,12). Esses achados sugerem que genes diferentes regulam a contagem de carrapatos e pelame.

Estimation of genetic parameters and relationships between type traits and milk yield of Holstein cows in Turkey / [Estimativa de parâmetros genéticos e relações entre características de tipo e produção de leite das vacas Holstein na Turquia]

In this study, milk yield, reproductive yield, and type traits of 533 Holstein cows in the first lactation raised in 54 farms were examined. In the three-year study, phenotypic (rP) and genetic (rG) correlations between type traits and milk yield were estimated based on the variance elements and heritability of the type traits of Holstein cows in the first lactation. Linear identification and scoring systems have been applied to classify the cows according to type traits. Heritability and correlations were estimated with ASREML models. The type traits included stature, angularity, rump width, hocks, rear udder height, central ligament, teat length, body capacity, feet and legs, udder composite and final score for genetic correlations with 305-day milk yield were estimated as -0.49, -0.14, -0.93, 0.35, 0.40, 0.11, -0.65, 0.70, 0.31, 0.54, and 0.70, for phenotypic correlations were estimated as 0.28, 0.28, 0.30, 0.21, 0.35, 0.39, -0.06, 0.46, 0.48, 0.56, and 0.58 respectively. Among the phenotypic correlations between the type traits, especially the phenotypic correlations between the final score and various type traits were found to be high and significant. The fact that these traits are in high correlation with other traits and milk yield may enable these to be used as indirect selection criteria in the selection for milk yield.(AU)

Neste estudo, foram examinadas a produção de leite, a produção reprodutiva e as características de tipo de 533 vacas Holstein na primeira lactação criadas em 54 fazendas. No estudo trienal, as correlações fenotípicas (rP) e genéticas (rG) entre características de tipo e produção de leite foram estimadas com base nos elementos de variação e hereditariedade das características de tipo das vacas Holstein na primeira lactação. Sistemas de identificação linear e de pontuação foram aplicados para classificar as vacas de acordo com os traços de tipo. A hereditariedade e correlações foram estimadas com os modelos ASREML. Os traços de tipo incluíam estatura, angularidade, largura da alcatra, jarretes, altura do úbere traseiro, ligamento central, comprimento das tetas, capacidade corporal, pés e patas, composição do úbere e pontuação final para correlações genéticas com a produção de leite de 305 dias foram estimados como -0. 49, -0,14, -0,93, 0,35, 0,40, 0,11, -0,65, 0,70, 0,31, 0,54, e 0,70, para correlações fenotípicas foram estimadas como 0,28, 0,28, 0,30, 0,21, 0,35, 0,39, -0,06, 0,46, 0,48, 0,56, e 0,58 respectivamente. Dentre as correlações fenotípicas entre os traços de tipo, especialmente as correlações fenotípicas entre a pontuação final e vários traços de tipo foram encontradas como altas e significativas. O fato destes traços estarem em alta correlação com outros traços e a produção de leite pode permitir que sejam usados como critérios de seleção indiretos na seleção para a produção de leite.(AU)

Genetic and environmental factors that affect tick infestation in Nelore x Angus crossbreed cattle / Fatores genéticos e ambientais que afetam a infestação de carrapatos em bovinos cruzados Nelore x Angus

This study evaluated the effects of seasons and latitude on tick counting and determined the best model to estimate genetic parameters for tick count and hair coat. Records of animals naturally exposed to ticks on farms in several Brazilian states and in Paraguay were used. The ANOVA was used to verify the effects of seasons and latitude on the tick count trait. Spring was the season with the highest average, followed by summer and autumn, which showed no differences between them. The winter presented the lowest average values. Latitude -11° had the highest mean value followed by latitude -18°. The Bayesian approach was used to evaluate tick count and hair coat and to identify a suitable model for estimating genetic parameters for use in genetic evaluations. The data were analyzed using an animal model with four different specifications for “fixed” purposes. The inference was based on a Markov chain Monte Carlo (MCMC). The criteria for selection of the Bayesian model indicated that the M1 model, which considered the breed composition in the contemporary group, was superior to the other models, both for tick count and hair coat. Heritability estimates for tick count and hair coat obtained using the M1 model were 0.14 and 0.22, respectively. The rank correlations between the models for tick count and hair coat were estimated and reordering was verified for tick count. The estimated genetic correlation between tick count and hair coat traits was negative (-0.12). These findings suggest that different genes regulate tick count and hair coat.(AU)

Os objetivos foram avaliar os efeitos das estações e latitude na contagem de carrapatos e determinar o melhor modelo para estimar parâmetros genéticos para contagem de carrapatos e pelame. Foram utilizados registros de animais expostos naturalmente a carrapatos em fazendas em vários estados brasileiros e no Paraguai. A ANOVA foi utilizada para verificar os efeitos das estações e da latitude na característica de contagem de carrapatos. A primavera foi a estação com a maior média, seguida pelo verão e outono, que não mostraram diferenças entre eles. O inverno apresentou os menores valores médios. A latitude -11° teve o maior valor médio seguido pela latitude -18°. A abordagem bayesiana foi usada para avaliar a contagem de carrapatos e o pelame e identificar o modelo adequado para estimar parâmetros genéticos e para uso em avaliações genéticas. Os dados foram analisados usando um modelo animal com quatro especificações diferentes para efeitos “fixos”. A inferência foi baseada em uma cadeia de Markov Monte Carlo (MCMC). Os critérios de seleção do modelo bayesiano indicaram que o modelo M1, que considerou a composição racial no grupo contemporâneo, foi superior aos demais modelos, tanto na contagem de carrapatos e para pelame. As estimativas de herdabilidade para contagem de carrapatos e pelame obtidas usando o modelo M1 foram de 0,14 e 0,22, respectivamente. As correlações de ranking entre os modelos para a contagem de carrapatos e pelame foram estimadas e a reordenação foi verificada para a contagem de carrapatos. A correlação genética estimada entre a contagem de carrapatos e pelame foi negativa (-0,12). Esses achados sugerem que genes diferentes regulam a contagem de carrapatos e pelame.(AU)

Estimation of genetic parameters for test-day milk yield in Girolando cows using a random regression model / [Estimação de parâmetros genéticos para produção de leite no dia do teste em vacas da raça Girolando utilizando modelo de regressão aleatória]

The objective of this study was to estimate the components of variance and genetic parameters of test-day milk yield in first lactation Girolando cows, using a random regression model. A total of 126,892 test-day milk yield (TDMY) records of 15,351 first-parity Holstein, Gyr, and Girolando breed cows were used, obtained from the Associação Brasileira dos Criadores de Girolando. To estimate the components of (co) variance, the additive genetic functions and permanent environmental covariance were estimated by random regression in three functions: Wilmink, Legendre Polynomials (third order) and Linear spline Polynomials (three knots). The Legendre polynomial function showed better fit quality. The genetic and permanent environment variances for TDMY ranged from 2.67 to 5.14 and from 9.31 to 12.04, respectively. Heritability estimates gradually increased from the beginning (0.13) to mid-lactation (0.19). The genetic correlations between the days of the control ranged from 0.37 to 1.00. The correlations of permanent environment followed the same trend as genetic correlations. The use of Legendre polynomials via random regression model can be considered as a good tool for estimating genetic parameters for test-day milk yield records.(AU)

O objetivo deste estudo foi estimar os componentes de variância e os parâmetros genéticos da produção de leite no dia do teste (TDMY) em vacas Girolando de primeira lactação, usando modelo de regressão aleatória. Foram utilizados 126.892 registros de produção de leite no dia controle de 15.351 vacas primíparas das raças Holandesa, Gir e Girolando, obtidas na Associação Brasileira dos Criadores de Girolando. Para estimar os componentes de (co) variância, as funções genéticas aditivas e de covariância ambiental permanente foram estimadas por regressão aleatória em três funções: Wilmink, polinômios de Legendre (terceira ordem) e polinômios splines lineares (três nós). A função polinomial de Legendre apresentou melhor qualidade de ajuste. As variâncias genéticas e de ambiente permanente para produção de leite no dia do controle variaram de 2,67 a 5,14 e de 9,31 a 12,04, respectivamente. As estimativas de herdabilidade aumentaram gradativamente do início (0,13) para o meio da lactação (0,19). As correlações genéticas entre os dias do controle variaram de 0,37 a 1,00. As correlações de ambiente permanente seguiram a mesma tendência das correlações genéticas. A utilização dos polinômios de Legendre via modelos de regressão aleatória pode ser considerada como uma boa ferramenta para estimação de parâmetros genéticos da produção de leite no dia do teste.(AU)

Genetic parameter and genetic trend estimates for reproductive traits in Wistar rats / [Estimativas de parâmetros genéticos e tendências genéticas de características reprodutivas em ratos Wistar]

The aim of this study was to estimate genetic parameters and genetic trends for reproductive traits in Wistar rats. A total of 1,167 data records from 283 females over six generations of monogamous mating pairs was used. Heritability and genetic correlation were estimated through Bayesian inference and genetic trends were calculated by linear regression of breeding values over generations. Heritability estimates for litter size at birth (LS), calving interval (CI), pup mortality (PM) and maternal cannibalism (CAN) presented low magnitude, ranging from 0.01 to 0.13. CAN presented high and positive genetic correlation with LS and PM (0.77 and 0.78, respectively). On the other hand, all the other estimated genetic correlations were not significant. Genetic trend was positive for LS (+0.0900 pups per generation), and negative for PM and CAN (-1.0085 and -0.5217 pups per generation, respectively). For CI the genetic trend was not significant. It is recommended to increase selection intensity on dams in this Wistar rat population in order to accelerate the genetic progress.(AU)

O objetivo deste estudo foi estimar os parâmetros genéticos e as tendências genéticas de características reprodutivas em ratos Wistar. Foram analisados 1.167 registros coletados em 283 fêmeas ao longo de seis gerações de pares de acasalamentos monogâmicos. Herdabilidade e correlação genética foram estimadas por meio de inferência bayesiana, e as tendências genéticas foram calculadas pela regressão linear dos valores genéticos em função das gerações. As estimativas de herdabilidades para as características número de filhotes nascidos (LS), intervalo de parto (CI), mortalidade de filhotes (PM) e canibalismo materno (CAN) foram de baixa magnitude (0,01 a 0,13). CAN apresentou correlação genética alta e positiva com LS e PM, 0,77 e 0,78, respectivamente. As demais correlações genéticas estimadas foram não significativas. A tendência genética foi positiva para LS (+0,0900 filhote por geração) e negativa para PM e CAN (-1,0085 e -0,5217 filhote por geração, respectivamente). A tendência genética não foi significativa para CI. Recomenda-se aumentar a intensidade de seleção nas fêmeas nessa população de ratos Wistar, a,fim de acelerar o progresso genético.(AU)

Genetic parameter and genetic trend estimates for reproductive traits in Wistar rats / [Estimativas de parâmetros genéticos e tendências genéticas de características reprodutivas em ratos Wistar]

The aim of this study was to estimate genetic parameters and genetic trends for reproductive traits in Wistar rats. A total of 1,167 data records from 283 females over six generations of monogamous mating pairs was used. Heritability and genetic correlation were estimated through Bayesian inference and genetic trends were calculated by linear regression of breeding values over generations. Heritability estimates for litter size at birth (LS), calving interval (CI), pup mortality (PM) and maternal cannibalism (CAN) presented low magnitude, ranging from 0.01 to 0.13. CAN presented high and positive genetic correlation with LS and PM (0.77 and 0.78, respectively). On the other hand, all the other estimated genetic correlations were not significant. Genetic trend was positive for LS (+0.0900 pups per generation), and negative for PM and CAN (-1.0085 and -0.5217 pups per generation, respectively). For CI the genetic trend was not significant. It is recommended to increase selection intensity on dams in this Wistar rat population in order to accelerate the genetic progress.(AU)

O objetivo deste estudo foi estimar os parâmetros genéticos e as tendências genéticas de características reprodutivas em ratos Wistar. Foram analisados 1.167 registros coletados em 283 fêmeas ao longo de seis gerações de pares de acasalamentos monogâmicos. Herdabilidade e correlação genética foram estimadas por meio de inferência bayesiana, e as tendências genéticas foram calculadas pela regressão linear dos valores genéticos em função das gerações. As estimativas de herdabilidades para as características número de filhotes nascidos (LS), intervalo de parto (CI), mortalidade de filhotes (PM) e canibalismo materno (CAN) foram de baixa magnitude (0,01 a 0,13). CAN apresentou correlação genética alta e positiva com LS e PM, 0,77 e 0,78, respectivamente. As demais correlações genéticas estimadas foram não significativas. A tendência genética foi positiva para LS (+0,0900 filhote por geração) e negativa para PM e CAN (-1,0085 e -0,5217 filhote por geração, respectivamente). A tendência genética não foi significativa para CI. Recomenda-se aumentar a intensidade de seleção nas fêmeas nessa população de ratos Wistar, a,fim de acelerar o progresso genético.(AU)

Estimation of genetic parameters for weight traits and Kleiber Index in a Brahman cattle population

Interest in improving feed efficiency of cattle has been increasing. The residual feed intake (RFI), the most commonly used measurement of feed efficiency, is expensive and can only be used in a small number of animals. The Kleiber Index has also been proposed to measure RFI. In this study, we estimated genetic parameters for the Kleiber Index average daily weight gain and adjusted weights to obtain a more comprehensive understanding of potential responses to selection and support the development of breeding strategies. Genetic analyses were conducted on animal records from a data file with 36,505 animals recorded by ABCZ (Brazilian Association of Zebu Breeders). Restricted maximum likelihood estimates of genetic parameters were computed with Wombat software. Heritabilities ranged from 0.24 to 0.22 for adjusted weights, from 0.12 to 0.26 for Kleiber Indexes and from 0.15 to 0.22 for average daily gains. Correlations between traits ranged from -0.06 to 0.99. Results indicated that Kleiber Indexes at different ages do not constitute a viable solution for the selection of bulls and cows for Brazilian Brahman populations in terms of feeding efficiency.

Estimação de parâmetros genéticos para características de pesos e pesos metabólicos na desmama e pós-desmama em bovinos Brahman / Estimation of genetic parameters for weaning weights and metabolic weights characteristics and post weaning in Brahman cattle

Objetivou-se estimar herdabilidades e correlações de características ponderais com 36.505 animais, da Associação Brasileira de Criadores Zebu. O modelo incluiu efeito genético direto, materno, ambiente permanente, residual - aleatórios e efeitos de grupos contemporâneos - fixos. Os parâmetros foram estimados pelo método de máxima verossimilhança restrita (REML), utilizando-se software Wombat. Os resultados das herdabilidades variaram de 0,20 a 0,25 peso à desmama e ao sobreano; 0,16 a 0,20 peso metabólico não ajustado e ajustado à desmama, 0,21 a 0,25 peso metabólico ajustado à desmama e metabólico ajustado ao sobreano. As correlações genéticas entre peso à desmama e peso metabólico não ajustado à desmama, peso à desmama e peso metabólico ajustado à desmama são, respectivamente 0,76 e 1,00. A correlação genética entre peso ao sobreano e metabólico ao sobreano não ajustado, peso ao sobreano com metabólico sobreano ajustado foram 0,97 e 1,00. Correlação genética entre peso à desmama e ao sobreano foi 0,72, peso metabólico não ajustado à desmama e metabólico não ajustado ao sobreano 0,54, peso metabólico ajustado à desmama e metabólico ajustado ao sobreano foi 0,71. Correlações genéticas entre peso à desmama e metabólico ajustado à desmama e peso ano com metabólico ano ajustado foram 1,00 e 1,00. Portanto, utilização de peso metabólico sem ajuste de idade pode viesar estimativas de parâmetros genéticos.(AU)

The objective of this study was to estimate heritability and correlations of 36,505 animals, belonging to the Brazilian Association of Zebu Breeders. They were estimated by Restricted Maximum Likelihood method (REML) using Wombat software. The model included the direct additive genetic effect, maternal, permanent maternal environment and residual as random and fixed effects of contemporary group. The results of heritability ranged from 0,20 to 0,25 for weaning weight and yearling; 0,16 to 0,20 for real metabolic weaning, 0,21 to 0,25 for metabolic adjusted weight at weaning and yearling metabolic adjusted. The genetic correlations between weaning weight with metabolic real, weaning weight adjusted with metabolic are respectively 0,76 and 1,00. The genetic correlation between yearling weight and metabolic real, yearling weight adjusted metabolic were 0,97 and 1,00. Genetic correlations between weaning weight and yearling was 0,72, real metabolic weight at weaning and yearling real metabolic was 0,54, adjusted metabolic weight at weaning and yearling metabolic adjusted was 0,71. Genetic correlations between weight at weaning and adjusted metabolic and weight-adjusted metabolic year were 1,00 and 1,00. Therefore, the use of metabolic weight without age adjustment can warn the estimates.(AU)

Estimação de parâmetros genéticos para características de pesos e pesos metabólicos na desmama e pós-desmama em bovinos Brahman / Estimation of genetic parameters for weaning weights and metabolic weights characteristics and post weaning in Brahman cattle

Objetivou-se estimar herdabilidades e correlações de características ponderais com 36.505 animais, da Associação Brasileira de Criadores Zebu. O modelo incluiu efeito genético direto, materno, ambiente permanente, residual - aleatórios e efeitos de grupos contemporâneos - fixos. Os parâmetros foram estimados pelo método de máxima verossimilhança restrita (REML), utilizando-se software Wombat. Os resultados das herdabilidades variaram de 0,20 a 0,25 peso à desmama e ao sobreano; 0,16 a 0,20 peso metabólico não ajustado e ajustado à desmama, 0,21 a 0,25 peso metabólico ajustado à desmama e metabólico ajustado ao sobreano. As correlações genéticas entre peso à desmama e peso metabólico não ajustado à desmama, peso à desmama e peso metabólico ajustado à desmama são, respectivamente 0,76 e 1,00. A correlação genética entre peso ao sobreano e metabólico ao sobreano não ajustado, peso ao sobreano com metabólico sobreano ajustado foram 0,97 e 1,00. Correlação genética entre peso à desmama e ao sobreano foi 0,72, peso metabólico não ajustado à desmama e metabólico não ajustado ao sobreano 0,54, peso metabólico ajustado à desmama e metabólico ajustado ao sobreano foi 0,71. Correlações genéticas entre peso à desmama e metabólico ajustado à desmama e peso ano com metabólico ano ajustado foram 1,00 e 1,00. Portanto, utilização de peso metabólico sem ajuste de idade pode viesar estimativas de parâmetros genéticos.(AU)

The objective of this study was to estimate heritability and correlations of 36,505 animals, belonging to the Brazilian Association of Zebu Breeders. They were estimated by Restricted Maximum Likelihood method (REML) using Wombat software. The model included the direct additive genetic effect, maternal, permanent maternal environment and residual as random and fixed effects of contemporary group. The results of heritability ranged from 0,20 to 0,25 for weaning weight and yearling; 0,16 to 0,20 for real metabolic weaning, 0,21 to 0,25 for metabolic adjusted weight at weaning and yearling metabolic adjusted. The genetic correlations between weaning weight with metabolic real, weaning weight adjusted with metabolic are respectively 0,76 and 1,00. The genetic correlation between yearling weight and metabolic real, yearling weight adjusted metabolic were 0,97 and 1,00. Genetic correlations between weaning weight and yearling was 0,72, real metabolic weight at weaning and yearling real metabolic was 0,54, adjusted metabolic weight at weaning and yearling metabolic adjusted was 0,71. Genetic correlations between weight at weaning and adjusted metabolic and weight-adjusted metabolic year were 1,00 and 1,00. Therefore, the use of metabolic weight without age adjustment can warn the estimates.(AU)

Estimation of genetic parameters for weight traits and Kleiber Index in a Brahman cattle population

Interest in improving feed efficiency of cattle has been increasing. The residual feed intake (RFI), the most commonly used measurement of feed efficiency, is expensive and can only be used in a small number of animals. The Kleiber Index has also been proposed to measure RFI. In this study, we estimated genetic parameters for the Kleiber Index average daily weight gain and adjusted weights to obtain a more comprehensive understanding of potential responses to selection and support the development of breeding strategies. Genetic analyses were conducted on animal records from a data file with 36,505 animals recorded by ABCZ (Brazilian Association of Zebu Breeders). Restricted maximum likelihood estimates of genetic parameters were computed with Wombat software. Heritabilities ranged from 0.24 to 0.22 for adjusted weights, from 0.12 to 0.26 for Kleiber Indexes and from 0.15 to 0.22 for average daily gains. Correlations between traits ranged from -0.06 to 0.99. Results indicated that Kleiber Indexes at different ages do not constitute a viable solution for the selection of bulls and cows for Brazilian Brahman populations in terms of feeding efficiency.(AU)

Genotype x environment interaction for reproductive traits in Brazilian Nellore breed cattle / Interação Genotipo x Ambiente para características reprodutivas em bovinos da raça Nelore no Brasil

The objective of this study was to evaluate the effect of the genotype-environment interaction (GEI) for scrotal circumference traits measured at different ages, 365 (SC365), 450 (SC450) and 550 (SC550) days of age, and age at first calving (AFC) for Nellore animals raised in different regions of Brazil. For the evaluation, the herds were grouped in the following regions of the country: North, Southeast and Central-west, using information from 26,619, 28,730, 14,476, 15,397 for the traits SC365, SC450, SC550 and AFC respectively. Genetic parameters, as well as the assessment of GEI were performed using Bayesian inference, using the programs of the BLUPF90. The estimated heritabilities were: 0.465 ± 0.021, 0.500 ± 0.022, 0.492 ± 0.026, 0.117 ± 0.017 for SC365, SC450, SC550 and AFC respectively. The results obtained in the analysis, indicated that this interaction was not significant for SC at different ages (genetic correlation, rg> 0.8). For AFC, significant effect of GEI was observed for combinations involving the Northern region (rg<0.8), indicating that this interaction should be considered by the genetic evaluation programs in this region.(AU)

O presente estudo teve como objetivo avaliar o efeito da interação genotipo-ambiente (IGA) para as características perímetro escrotal mensurado em diferentes idades, 365 (PE365), 450 (PE450) e 550 (PE550) dias de idade, e da idade ao primeiro parto (IPP) para animais da raça Nelore criados em diferentes regiões do Brasil. Para a avaliação foram agrupados os rebanhos dos diferentes estados do país, nas seguintes regiões: Norte, Sudeste e Centro-Oeste, sendo utilizados informações de 26619, 28730, 14476, 15397 para as características PE365, PE450, PE550 e IPP respectivamente. Os parâmetros genéticos, assim como, a avaliação da IGA foi realizada utilizando a inferência Bayesiana, com uso dos programas BLUPF90. As herdabilidades estimadas foram: 0,465 ± 0,021, 0,500 ± 0,022, 0,492 ± 0,026, 0,117 ± 0,017 para PE365, PE450, PE550 e IPP respectivamente. Os resultados obtidos indicaram que a interação não foi significativa sobre o perímetro escrotal avaliado nas diferentes idades (correlação genética, rg>0,8). No entanto, para a IPP foi evidenciado efeito significativo da IGA para as combinações envolvendo a região Norte (rg< 0,8), indicando que esta interação é significativa devendo ser considerada pelos diferentes programas de avaliação genética da raça,para os animais criados nesta região.(AU)

Genetic parameters in agronomic characters for selection of superior lineages of Ricinus communis L / Parâmetros genéticos em caracteres agronômicos na seleção de linhagens superiores de Ricinus communis L

Knowledge on the variability and heritability of agronomic characters of interest aid the selection of superior materials. Thus, the objective of this study was to evaluate the genetic parameters of agronomic traits in castor bean plant lineages and to quantify the genetic correlations between them. The study was performed in the experimental area of the Federal University of the Recôncavo da Bahia, Cruz das Almas, Bahia. Seed oil content, vegetative cycle, plant height, and the number and weight of seeds per plant were evaluated in 47 lineages of castor bean seedlings. The coefficient of genetic variation was higher for weight of seeds per plant, revealing greater variability. The broad-sense heritability of individual plots presented a higher value for oil content and a lower value for seed number per plant. Selection precision was moderate for plant height, number and weight of seeds per plant, high for vegetative cycle, and very high for oil content. The genetic parameters allowed superior genotypes to be ranked and selected. Positive correlations between vegetative cycle and plant height, associated with negative correlations for number and weight of seeds, and oil content, allow significant gains for crop productivity.(AU)

O conhecimento da variabilidade e herdabilidade dos caracteres agronômicos de interesse auxiliam na seleção de materiais superiores. Desta forma, objetivou-se avaliar os parâmetros genéticos de caracteres agronômicos em linhagens de mamoneira e quantificar as correlações genéticas entre eles. O trabalho foi desenvolvido na área experimental da Universidade Federal do Recôncavo da Bahia, Cruz das Almas, Bahia. Foram avaliados o teor de óleo na semente, ciclo vegetativo, estatura de planta, número de sementes por planta e peso de sementes por planta em 47 linhagens de mamoneira. O coeficiente de variação genético foi maior para o peso de sementes por planta revelando maior variabilidade. A herdabilidade de parcelas individuais no sentido amplo apresentou maior valor para o teor de óleo e menor valor para o número de sementes por planta. A precisão de seleção foi moderada para estatura de planta, número de sementes por planta e peso de semente por planta; alta para o ciclo vegetativo; e muito alta para o teor de óleo. Os parâmetros genéticos permitiram o ranqueamento e seleção dos genótipos superiores. As correlações positivas entre o ciclo vegetativo e estatura de planta, associada às correlações negativas para o número de sementes, peso de sementes e teor de óleo, possibilitam ganhos expressivos para a produtividade da cultura.(AU)

Genotype x environment interaction for reproductive traits in Brazilian Nellore breed cattle / Interação Genotipo x Ambiente para características reprodutivas em bovinos da raça Nelore no Brasil

The objective of this study was to evaluate the effect of the genotype-environment interaction (GEI) for scrotal circumference traits measured at different ages, 365 (SC365), 450 (SC450) and 550 (SC550) days of age, and age at first calving (AFC) for Nellore animals raised in different regions of Brazil. For the evaluation, the herds were grouped in the following regions of the country: North, Southeast and Central-west, using information from 26,619, 28,730, 14,476, 15,397 for the traits SC365, SC450, SC550 and AFC respectively. Genetic parameters, as well as the assessment of GEI were performed using Bayesian inference, using the programs of the BLUPF90. The estimated heritabilities were: 0.465 ± 0.021, 0.500 ± 0.022, 0.492 ± 0.026, 0.117 ± 0.017 for SC365, SC450, SC550 and AFC respectively. The results obtained in the analysis, indicated that this interaction was not significant for SC at different ages (genetic correlation, rg> 0.8). For AFC, significant effect of GEI was observed for combinations involving the Northern region (rg<0.8), indicating that this interaction should be considered by the genetic evaluation programs in this region.

O presente estudo teve como objetivo avaliar o efeito da interação genotipo-ambiente (IGA) para as características perímetro escrotal mensurado em diferentes idades, 365 (PE365), 450 (PE450) e 550 (PE550) dias de idade, e da idade ao primeiro parto (IPP) para animais da raça Nelore criados em diferentes regiões do Brasil. Para a avaliação foram agrupados os rebanhos dos diferentes estados do país, nas seguintes regiões: Norte, Sudeste e Centro-Oeste, sendo utilizados informações de 26619, 28730, 14476, 15397 para as características PE365, PE450, PE550 e IPP respectivamente. Os parâmetros genéticos, assim como, a avaliação da IGA foi realizada utilizando a inferência Bayesiana, com uso dos programas BLUPF90. As herdabilidades estimadas foram: 0,465 ± 0,021, 0,500 ± 0,022, 0,492 ± 0,026, 0,117 ± 0,017 para PE365, PE450, PE550 e IPP respectivamente. Os resultados obtidos indicaram que a interação não foi significativa sobre o perímetro escrotal avaliado nas diferentes idades (correlação genética, rg>0,8). No entanto, para a IPP foi evidenciado efeito significativo da IGA para as combinações envolvendo a região Norte (rg< 0,8), indicando que esta interação é significativa devendo ser considerada pelos diferentes programas de avaliação genética da raça,para os animais criados nesta região.

Inferences on the effects of selection for feed conversion over meat quality traits in broiler

The intense selection process for economic traits conducted by the poultry breeding programs has been caused several changes in broiler meat quality. A database belonging to a selection program of a broiler male line was used to estimate heritability and genetic correlations for feed conversion ratio and meat quality traits, which were: initial and final pH, lightness, drip loss, thawing loss and shear force. Two-trait analyses were performed and the components of co(variance) and genetic parameters were determined using the Bayesian approach and the GIBBS3F90 software. The heritability estimate found for feed conversion ratio (0.52) showed high influence of direct additive genetic effects on the expression of this trait; therefore, this trait is able to respond to selection. The genetic correlation estimates obtained (-0.50 to 0.33) were indicative of important associations between feed conversion ratio and meat quality traits. The selection to improve feed conversion ratio may cause injury in greater or lesser degree for L*, drip loss (DL), thawing loss (TL) and shear force (SF) in broilers. It is recommended the monitoring of consequences of feed conversion ratio used as selection criteria or meat quality traits in broilers, due to its unfavorable indirect selection for these variables in this population. Breeding methods for efficiency improvements in broilers feed are suggested, which also benefit sensorial and functional properties of the meat.

Inferences on the effects of selection for feed conversion over meat quality traits in broiler

The intense selection process for economic traits conducted by the poultry breeding programs has been caused several changes in broiler meat quality. A database belonging to a selection program of a broiler male line was used to estimate heritability and genetic correlations for feed conversion ratio and meat quality traits, which were: initial and final pH, lightness, drip loss, thawing loss and shear force. Two-trait analyses were performed and the components of co(variance) and genetic parameters were determined using the Bayesian approach and the GIBBS3F90 software. The heritability estimate found for feed conversion ratio (0.52) showed high influence of direct additive genetic effects on the expression of this trait; therefore, this trait is able to respond to selection. The genetic correlation estimates obtained (-0.50 to 0.33) were indicative of important associations between feed conversion ratio and meat quality traits. The selection to improve feed conversion ratio may cause injury in greater or lesser degree for L*, drip loss (DL), thawing loss (TL) and shear force (SF) in broilers. It is recommended the monitoring of consequences of feed conversion ratio used as selection criteria or meat quality traits in broilers, due to its unfavorable indirect selection for these variables in this population. Breeding methods for efficiency improvements in broilers feed are suggested, which also benefit sensorial and functional properties of the meat.(AU)

Estimates of genetic parameters for growth and survival in pacific oyster (Crassostrea gigas) / Estimativa de parâmetros genéticos para crescimento e sobrevivência em ostras do pacífico (Crassostrea gigas)

The rapid growth associated with high tolerance to adverse environmental conditions has made the Pacific oyster, Crassostrea gigas, the species chosen for cultivation in Santa Catarina, Brazil. Variance components and genetic parameters for survival and growth of Pacific oyster families were estimated using data from half-sibs (n = 41) and full-sibs (n = 2) families. In the juvenile stage and at harvest, we measured total weight and shell height of 80 animals per family. In addition, at harvest we measured yield (total weight of animals per floor of lantern) and calculated survival. The covariance components were estimated in the program AIREMLF90 using an animal model. The heritabilities (Standard Deviation) at harvest were: 0.26 (0.05) (individual weight (SD)), 0.34 (0.05) (height), 0.54 (0.09) (yield), 0.58 (0.08) (average individual weight) and 0.16 (0.07) (survival). Genetic correlations were 0.88 (0.03) (between individual weight and height), 0.98 (0.03) (between yield and average individual weight), 0.58 (0.39) (between average individual weight and survival) and 0.47 (0.36) (between yield and survival). The heritability and genetic correlations suggest that gains could be obtained for the studied traits. The yield and mean individual weight should be used as a criterion for selection.(AU)

Componentes de variância e parâmetros genéticos para a sobrevivência e crescimento de ostras do Pacífico Crassostrea gigas foram estimadas usando dados de famílias de meio-irmão (n = 41) e de irmãos completos (n = 2). No estágio juvenil e na colheita, medimos o peso total e a altura da concha de 80 animais por família. Além disso, na colheita, medimos o rendimento (peso total de animais por andar de lanterna) e a sobrevivência foi calculada. Os componentes de covariância foram estimados no programa AIREMLF90 usando um modelo animal. As herdabilidades na colheita foram: 0,26 (0,05) (peso individual (DP)), 0,34 (0,05) (altura), 0,54 (0,09) (rendimento), 0,58 (0,08) (peso médio individual) e 0,16 (0,07) (sobrevivência). As correlações genéticas foram de 0,88 (0,03) (entre o peso individual e a altura), 0,98 (0,03) (entre o rendimento e o peso médio individual), 0,58 (0,39) (entre o peso médio individual e a sobrevivência) e 0,47 (0,36) (entre o rendimento e a sobrevivência). As herdabilidades e as correlações genéticas sugerem que podem ser obtidos ganhos para os caracteres estudados. O rendimento e o peso médio individual podem ser utilizados como critério de seleção.(AU)

Estimates of genetic parameters for growth and survival in pacific oyster (Crassostrea gigas) / Estimativa de parâmetros genéticos para crescimento e sobrevivência em ostras do pacífico (Crassostrea gigas)

The rapid growth associated with high tolerance to adverse environmental conditions has made the Pacific oyster, Crassostrea gigas, the species chosen for cultivation in Santa Catarina, Brazil. Variance components and genetic parameters for survival and growth of Pacific oyster families were estimated using data from half-sibs (n = 41) and full-sibs (n = 2) families. In the juvenile stage and at harvest, we measured total weight and shell height of 80 animals per family. In addition, at harvest we measured yield (total weight of animals per floor of lantern) and calculated survival. The covariance components were estimated in the program AIREMLF90 using an animal model. The heritabilities (Standard Deviation) at harvest were: 0.26 (0.05) (individual weight (SD)), 0.34 (0.05) (height), 0.54 (0.09) (yield), 0.58 (0.08) (average individual weight) and 0.16 (0.07) (survival). Genetic correlations were 0.88 (0.03) (between individual weight and height), 0.98 (0.03) (between yield and average individual weight), 0.58 (0.39) (between average individual weight and survival) and 0.47 (0.36) (between yield and survival). The heritability and genetic correlations suggest that gains could be obtained for the studied traits. The yield and mean individual weight should be used as a criterion for selection.

Componentes de variância e parâmetros genéticos para a sobrevivência e crescimento de ostras do Pacífico Crassostrea gigas foram estimadas usando dados de famílias de meio-irmão (n = 41) e de irmãos completos (n = 2). No estágio juvenil e na colheita, medimos o peso total e a altura da concha de 80 animais por família. Além disso, na colheita, medimos o rendimento (peso total de animais por andar de lanterna) e a sobrevivência foi calculada. Os componentes de covariância foram estimados no programa AIREMLF90 usando um modelo animal. As herdabilidades na colheita foram: 0,26 (0,05) (peso individual (DP)), 0,34 (0,05) (altura), 0,54 (0,09) (rendimento), 0,58 (0,08) (peso médio individual) e 0,16 (0,07) (sobrevivência). As correlações genéticas foram de 0,88 (0,03) (entre o peso individual e a altura), 0,98 (0,03) (entre o rendimento e o peso médio individual), 0,58 (0,39) (entre o peso médio individual e a sobrevivência) e 0,47 (0,36) (entre o rendimento e a sobrevivência). As herdabilidades e as correlações genéticas sugerem que podem ser obtidos ganhos para os caracteres estudados. O rendimento e o peso médio individual podem ser utilizados como critério de seleção.