Molecular detection of Toxoplasma gondii, Neospora caninum and Sarcocystis spp in tissues of Sus scrofa slaughtered in southern Brazil / Detecção molecular de Toxoplasma gondii, Neospora caninum e Sarcocystis spp. em tecidos de Sus scrofa abatidos no Sul do Brasil

The aim of this study was to determine the presence of deoxyribonucleic acid (DNA) from Toxoplasma gondii, Sarcocystis spp. and Neospora caninum, in tissues of wild boars slaughtered in southern Brazil. A total of 156 samples were collected from different organs of 25 wild boars, and DNA from at least one of the protozoa investigated was detected in 79 samples. To differentiate between infectious agents, restriction fragment length polymorphism was performed using the restriction enzymes DdeI and HpaII. For N. caninum, conventional PCR was performed with specific primers. The DNA of at least one of the studied pathogens was detected in each animal: 26.58% for T. gondii, 68.36% for Sarcocystis spp. and 5.06% for N. caninum. Coinfection between T. gondii and Sarcocystis spp. occurred in 14 animals, between T. gondii and N. caninum in only one male animal, between Sarcocystis spp. and N. caninum in a female, while co-infection with the three agents was equally observed in only one male animal. Considering the high frequency of detection and its zoonotic risk, especially T. gondii, it appears that wild boars can be potential sources of transmission of infectious agents and the adoption of monitoring measures in these populations should be prioritized.(AU)

O objetivo deste estudo foi determinar a presença de ácido desoxirribonucléico (DNA) de Toxoplasma gondii, Sarcocystis spp. e Neospora caninum, em tecidos de javalis abatidos no sul do Brasil. Foram coletadas 156 amostras de diferentes órgãos de 25 javalis, sendo detectado o DNA de pelo menos um dos protozoários pesquisados em 79 amostras. Para diferenciar entre os agentes infecciosos, o polimorfismo do comprimento do fragmento de restrição, foi realizado usando-se as enzimas de restrição DdeI e HpaII. Para N. caninum, a PCR convencional foi realizada com "primers" específicos. O DNA de pelo menos um dos patógenos estudados foi detectado em cada animal: 26,58% para T. gondii, 68,36% para Sarcocystis spp. e 5,06% para N. caninum. Coinfecção entre T. gondii e Sarcocystis spp. ocorreu em 14 animais; entre T. gondii e N. caninum em apenas um animal macho; entre Sarcocystis spp. e N. caninum em uma fêmea, enquanto a coinfecção com os três agentes foi observada igualmente em apenas um animal macho. Considerando-se a alta frequência de detecção e seu risco zoonótico, especialmente T. gondii, constata-se que os javalis podem ser potenciais fontes de transmissão de agentes infecciosos, e a adoção de medidas de monitoramento nessas populações devem ser priorizadas.(AU)

Efficient, fast and low-cost strategies for DNA extraction from different nucleated sheep cells

DNA extraction is usually the first step to perform molecular studies. This process can be nonviable due to genomic DNA (gDNA) extraction commercial kits prices. Furthermore, available DNA extraction protocols generally have high specificity, limiting their use to specific sources of biological material. In order to reduce costs, optimize time and laboratory logistics, besides to demonstrate a versatile protocol, the present study worked on an efficient DNA extraction protocol from somatic and non-somatic cells, using biological material from sheep as a model. For that, gDNA was extracted from whole blood, spermatozoa, and hair bulb cells, collected from three adult sheep, transported at 5ºC and stored at -20ºC until lab procedures. After extraction, gDNA concentration and purity were evaluated in a nano spectrophotometer. gDNA concentration from whole blood was greater (p < 0.05) than extracted from hair bulb cells, which in turn was superior (p < 0.05) than in spermatozoa. Also, gDNA from whole blood and, followed by, sperm showed greater (p < 0.05) purity when compared to gDNA of hair bulb cells. Adapting a gDNA extraction protocol, originally developed for bovine whole blood, enabled to obtain and isolate gDNA in different nucleated sheep cells.(AU)

Ameliorative effects of morel mushroom (Morchella esculenta) against Cadmium-induced reproductive toxicity in adult male rats / Efeitos benéficos do cogumelo morel (Morchella esculenta) contra a toxicidade reprodutiva induzida por cádmio em ratos machos adultos

Cadmium (Cd) is one of the major toxicants, which affects human health through occupational and environmental exposure. In the current study, we evaluated the protective effects of morel mushrooms against Cd-induced reproductive damages in rats. For this purpose, 30 male rats were divided into 6 groups (n=5/group), the first group served as the control group, second group was treated with an intraperitoneal (i.p) injection of 1 mg/kg/day of Cd. Third and fourth groups were co-treated with 1 mg/kg/day of Cd (i.p) and 10 and 20 mg/kg/day of morel mushroom extract (orally) respectively. The final 2 groups received oral gavage of 10 and 20 mg/kg/day of morel mushroom extract alone. After treatment for 17 days, the animals were euthanized, and testes and epididymis were dissected out. One testis and epididymis of each animal were processed for histology, while the other testis and epididymis were used for daily sperm production (DSP) and comet assay. Our results showed that Cd and morel mushrooms have no effect on animal weight, but Cd significantly decreases the DSP count and damages the heritable DNA which is reversed in co-treatment groups. Similarly, the histopathological results of testes and epididymis show that morel mushrooms control the damage to these tissues. Whereas the morel mushroom extract alone could enhance the production of testosterone. These results conclude that morel mushrooms not only control the damage done by Cd, but it could also be used as a protection mechanism for heritable DNA damage.

O cádmio (Cd) é um dos principais tóxicos, que afeta a saúde humana por meio da exposição ocupacional e ambiental. No presente estudo, avaliamos os efeitos protetores dos cogumelos morel contra os danos reprodutivos induzidos pelo Cd em ratos. Para tanto, 30 ratos machos foram divididos em 6 grupos (n = 5 / grupo); o primeiro grupo serviu de controle, o segundo grupo foi tratado com injeção intraperitoneal (i.p) de 1 mg / kg / dia de Cd. O terceiro e o quarto grupos foram cotratados com 1 mg / kg / dia de Cd (i.p) e 10 e 20 mg / kg / dia de extrato de cogumelo morel (por via oral), respectivamente. Os dois grupos finais receberam gavagem oral de 10 e 20 mg / kg / dia de extrato de cogumelo morel sozinho. Após o tratamento por 17 dias, os animais foram sacrificados e os testículos e o epidídimo foram dissecados. Um testículo e epidídimo de cada animal foram processados para histologia, enquanto o outro testículo e epidídimo foram usados para produção diária de esperma (DSP) e ensaio cometa. Nossos resultados mostraram que os cogumelos Cd e morel não têm efeito sobre o peso do animal, mas o Cd diminui significativamente a contagem de DSP e danifica o DNA hereditário, que é revertido em grupos de cotratamento. Da mesma forma, os resultados histopatológicos dos testículos e do epidídimo mostram que os cogumelos morel controlam os danos a esses tecidos. Considerando que o extrato de cogumelo morel sozinho pode aumentar a produção de testosterona. Esses resultados concluem que os cogumelos morel não apenas controlam os danos causados pelo Cd, mas também podem ser usados como um mecanismo de proteção para danos hereditários ao DNA.

Ameliorative effects of morel mushroom (Morchella esculenta) against Cadmium-induced reproductive toxicity in adult male rats / Efeitos benéficos do cogumelo morel (Morchella esculenta) contra a toxicidade reprodutiva induzida por cádmio em ratos machos adultos

Cadmium (Cd) is one of the major toxicants, which affects human health through occupational and environmental exposure. In the current study, we evaluated the protective effects of morel mushrooms against Cd-induced reproductive damages in rats. For this purpose, 30 male rats were divided into 6 groups (n=5/group), the first group served as the control group, second group was treated with an intraperitoneal (i.p) injection of 1 mg/kg/day of Cd. Third and fourth groups were co-treated with 1 mg/kg/day of Cd (i.p) and 10 and 20 mg/kg/day of morel mushroom extract (orally) respectively. The final 2 groups received oral gavage of 10 and 20 mg/kg/day of morel mushroom extract alone. After treatment for 17 days, the animals were euthanized, and testes and epididymis were dissected out. One testis and epididymis of each animal were processed for histology, while the other testis and epididymis were used for daily sperm production (DSP) and comet assay. Our results showed that Cd and morel mushrooms have no effect on animal weight, but Cd significantly decreases the DSP count and damages the heritable DNA which is reversed in co-treatment groups. Similarly, the histopathological results of testes and epididymis show that morel mushrooms control the damage to these tissues. Whereas the morel mushroom extract alone could enhance the production of testosterone. These results conclude that morel mushrooms not only control the damage done by Cd, but it could also be used as a protection mechanism for heritable DNA damage.(AU)

O cádmio (Cd) é um dos principais tóxicos, que afeta a saúde humana por meio da exposição ocupacional e ambiental. No presente estudo, avaliamos os efeitos protetores dos cogumelos morel contra os danos reprodutivos induzidos pelo Cd em ratos. Para tanto, 30 ratos machos foram divididos em 6 grupos (n = 5 / grupo); o primeiro grupo serviu de controle, o segundo grupo foi tratado com injeção intraperitoneal (i.p) de 1 mg / kg / dia de Cd. O terceiro e o quarto grupos foram cotratados com 1 mg / kg / dia de Cd (i.p) e 10 e 20 mg / kg / dia de extrato de cogumelo morel (por via oral), respectivamente. Os dois grupos finais receberam gavagem oral de 10 e 20 mg / kg / dia de extrato de cogumelo morel sozinho. Após o tratamento por 17 dias, os animais foram sacrificados e os testículos e o epidídimo foram dissecados. Um testículo e epidídimo de cada animal foram processados para histologia, enquanto o outro testículo e epidídimo foram usados para produção diária de esperma (DSP) e ensaio cometa. Nossos resultados mostraram que os cogumelos Cd e morel não têm efeito sobre o peso do animal, mas o Cd diminui significativamente a contagem de DSP e danifica o DNA hereditário, que é revertido em grupos de cotratamento. Da mesma forma, os resultados histopatológicos dos testículos e do epidídimo mostram que os cogumelos morel controlam os danos a esses tecidos. Considerando que o extrato de cogumelo morel sozinho pode aumentar a produção de testosterona. Esses resultados concluem que os cogumelos morel não apenas controlam os danos causados pelo Cd, mas também podem ser usados como um mecanismo de proteção para danos hereditários ao DNA.(AU)

Intraspecific C-value variation and the outcomes in Psidium cattleyanum Sabine essential oil / Variação do valor C intraespecífico e os efeitos no óleo essencial de Psidium cattleyanum Sabine

Polyploidy, a numerical alteration of the karyotype, is one of the most important mechanisms in plant speciation and diversification, but could also be detected among populations, the cytotypes. For example, Psidium cattleyanum, a polyploid complex, has chromosome numbers ranging from 2n=3x=33 to 2n=12x=132. Polyploidization causes an increase in DNA content, and both modifications may cause alteration in plant growth, physiology, and epigenetics. Based on this possibility, here we aim to verify the influence of the polyploidization on the production of P. cattleyanum essential oil chemotypes. Differences in the DNA contents, as a proxy to different ploidies, were observed and three distinct chemotypes were identified through the chromatographic profile analysis. The Psidium cattleyanum DNA content and qualitative and quantitative characteristics of the essential oils presented a positive relationship. Plants with higher DNA contents presented higher levels of oil production, which was mostly composed of hydrogenated sesquiterpenes, while plants with lower DNA contents produced lower amount of oil, which was mostly composed of hydrogenated monoterpenes. Based on the importance of essential oils, polyploid plants, which present higher DNA content, are recommended as possible matrices for the propagation of new plants with the potential to produce major compounds of agronomic and pharmacological interest.

A poliploidia, uma alteração numérica do cariótipo, é um dos mecanismos mais importantes na especiação e diversificação das plantas, mas também pode ser detectada entre populações, os citótipos. Por exemplo, Psidium cattleyanum, um complexo poliplóide, tem números de cromossomos que variam de 2n=3x=33 a 2n=12x=132. A poliploidização causa um aumento no conteúdo de DNA, e ambas as modificações podem alterar o crescimento, a fisiologia e a epigenética da planta. Com base nessa possibilidade, objetivamos verificar a influência da poliploidização na produção de quimiotipos de óleo essencial de P. cattleyanum. Diferenças nos conteúdos de DNA, representando diferentes ploidias, foram observadas e três quimiotipos distintos foram identificados através da análise do perfil cromatográfico. O conteúdo de DNA de Psidium cattleyanum e as características qualitativas e quantitativas dos óleos essenciais apresentaram correlação positiva. Plantas com maiores conteúdos de DNA apresentaram maiores rendimentos na produção de óleo, que era majoritariamente composto por sesquiterpenos hidrogenados, enquanto plantas com menores conteúdos de DNA produziram menores quantidade de óleo, que era majoritariamente composto por monoterpenos hidrogenados. Com base na importância dos óleos essenciais, plantas poliplóides, que apresentam maiores conteúdos de DNA, são recomendadas como possíveis matrizes para a propagação de novas plantas com potencial para produzir compostos importantes de interesse agronômico e farmacológico.

DNA barcoding of a tropical anguillid eel, Anguilla bicolor (Actinopterygii: Anguilliformes), in Indo-Pacific region and notes on its population structure

The tropical anguillid eel, Anguilla bicolor McCelland, 1844, includes two subspecies, Anguilla bicolor bicolor McCelland, 1844 and Anguilla bicolor pacifica Schmidt, 1928, and is distributed across the Indo-Pacific region. Although A. bicolor is widely distributed and recognized as an important fish resource in the Indo-Pacific region, few studies have been conducted on its genetic variation and population structure. DNA barcoding of A. bicolor specimens collected in the Indo-Pacific region was carried out in this study using mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I. Anguilla bicolor was found to diverge genetically, which supported its classification into two different subspecies. In addition, our study showed that A. bicolor bicolor had two genetically distinct populations/groups, and these different populations co-occur geographically in Indonesia and Malaysia in the eastern Indian Ocean. Our findings suggest that the eel larvae might be transported from at least two geographically different spawning grounds in the Indian Ocean, and then recruited to and settled in the same habitats in Indonesian and Malaysian waters. The molecular evidence calls for further research on the life history, stock assessment and protection of the populations of A. bicolor bicolor in Indonesia and Malaysia.(AU)

Cryptic speciation in populations of the genus Aphyocharax (Characiformes: Characidae) from eastern Amazon coastal river drainages and surroundings revealed by single locus species delimitation methods

Recent studies in eastern Amazon coastal drainages and their surroundings have revealed new fish species that sometimes exhibit little morphological differentiation (cryptic species). Thus, we used a DNA-based species delimitation approach to test if populations showing the morphotype and typical character states of the Aphyocharax avary holotype correspond either to A. avary or A. brevicaudatus, two known species from the region, or if they form independent lineages, indicating cryptic speciation. WP and GMYC analyses recovered five lineages (species) in the ingroup, while a bPTP analysis delimited three lineages. ABGD analyses produced two possible results: one corroborating the WP and GMYC methods and another corroborating the bPTP method. All methods indicate undescribed cryptic species in the region and show variation from at least 1 to 4 species in the ingroup, depending on the approach, corroborating previous studies, and revealing this region as a possible hotspot for discovering undescribed fish species.(AU)

Estudos recentes nas drenagens costeiras da Amazônia oriental e seus arredores revelaram novas espécies de peixes que às vezes exibem pouca diferenciação morfológica (espécies crípticas). Assim, usamos uma abordagem de delimitação de espécies baseada em DNA para testar se as populações que apresentam o morfotipo e os estados de caráter típicos do holótipo Aphyocharax avary correspondem a A. avary ou A. brevicaudatus, duas espécies conhecidas da região, ou se formam linhagens independentes, indicando especiação críptica. As análises de WP e GMYC recuperaram cinco linhagens (espécies) no grupo interno, enquanto uma análise de bPTP delimitou três linhagens. As análises ABGD produziram dois resultados possíveis: um corroborando os métodos WP e GMYC e outro corroborando o método bPTP. Todos os métodos indicam espécies crípticas não descritas na região e apresentam variação de pelo menos uma a quatro espécies no grupo interno, dependendo da abordagem, corroborando estudos anteriores, e revelando esta região como um possível "hotspot" para descoberta de espécies de peixes não descritas.(AU)

A new Hyphessobrycon (Characiformes: Characidae) of the Hyphessobrycon heterorhabdus species-group from the lower Amazon basin, Brazil

A new species of Hyphessobrycon belonging to the Hyphessobrycon heterorhabdus species-group from the lower rio Tapajós, state of Pará, Brazil, is described. The new species is allocated into the Hyphessobrycon heterorhabdus species-group due to its color pattern, composed by an anteriorly well-defined, horizontally elongated humeral blotch that becomes diffuse and blurred posteriorly, where it overlaps with a conspicuous midlateral dark stripe that becomes blurred towards the caudal peduncle and the presence, in living specimens, of a tricolored longitudinal pattern composed by a dorsal red or reddish longitudinal stripe, a middle iridescent, golden or silvery longitudinal stripe, and a more ventrally-lying longitudinal dark pattern composed by the humeral blotch and dark midlateral stripe. It can be distinguished from all other species of the group by possessing humeral blotch with a straight or slightly rounded ventral profile, lacking a ventral expansion present in all other species of the group. The new species is also distinguished from Hyphessobrycon heterorhabdus by a 9.6% genetic distance in the cytochrome c oxidase I gene. The little morphological distinction of the new species when compared with its most similar congener, H. heterorhabdus, indicates that the new species is one of the first truly cryptic fish species described from the Amazon basin.(AU)

Uma nova espécie de Hyphessobrycon pertencente ao grupo Hyphessobrycon heterorhabdus é descrita da região do baixo rio Tapajós, estado do Pará, Brasil. A nova espécie é incluída no grupo Hyphessobrycon heterorhabdus devido ao seu padrão de coloração, composto por uma mancha umeral alongada, anteriormente bem definida, que se torna difusa e borrada posteriormente, onde se sobrepõe a uma conspícua faixa escura médio-lateral que se torna borrada próxima ao pedúnculo caudal, e pela presença, em exemplares vivos, de um padrão longitudinal tricolor, composto por uma faixa longitudinal vermelha ou avermelhada dorsal, uma faixa média iridescente dourada ou prateada e, mais ventralmente, o padrão longitudinal escuro composto pela faixa escura médio-lateral e mancha umeral. A espécie pode ser distinguida das outras espécies pertencentes ao grupo por possuir uma mancha umeral com região ventral retilínea ou levemente arredondada, sem uma expansão ventral presente nas demais espécies do grupo. A espécie também se diferencia de Hyphessobrycon heterorhabdus por uma distância genética de 9,6% no gene citocromo c oxidase I. A sutil diferença morfológica da nova espécie quando comparada ao seu congênere mais similar, H. heterorhabdus, indica que a nova espécie é uma das primeiras espécies de peixes verdadeiramente crípticas descritas da Bacia Amazônica.(AU)

Cryptic speciation in populations of the genus Aphyocharax (Characiformes: Characidae) from eastern Amazon coastal river drainages and surroundings revealed by single locus species delimitation methods

Recent studies in eastern Amazon coastal drainages and their surroundings have revealed new fish species that sometimes exhibit little morphological differentiation (cryptic species). Thus, we used a DNA-based species delimitation approach to test if populations showing the morphotype and typical character states of the Aphyocharax avary holotype correspond either to A. avary or A. brevicaudatus, two known species from the region, or if they form independent lineages, indicating cryptic speciation. WP and GMYC analyses recovered five lineages (species) in the ingroup, while a bPTP analysis delimited three lineages. ABGD analyses produced two possible results: one corroborating the WP and GMYC methods and another corroborating the bPTP method. All methods indicate undescribed cryptic species in the region and show variation from at least 1 to 4 species in the ingroup, depending on the approach, corroborating previous studies, and revealing this region as a possible hotspot for discovering undescribed fish species.(AU)

Estudos recentes nas drenagens costeiras da Amazônia oriental e seus arredores revelaram novas espécies de peixes que às vezes exibem pouca diferenciação morfológica (espécies crípticas). Assim, usamos uma abordagem de delimitação de espécies baseada em DNA para testar se as populações que apresentam o morfotipo e os estados de caráter típicos do holótipo Aphyocharax avary correspondem a A. avary ou A. brevicaudatus, duas espécies conhecidas da região, ou se formam linhagens independentes, indicando especiação críptica. As análises de WP e GMYC recuperaram cinco linhagens (espécies) no grupo interno, enquanto uma análise de bPTP delimitou três linhagens. As análises ABGD produziram dois resultados possíveis: um corroborando os métodos WP e GMYC e outro corroborando o método bPTP. Todos os métodos indicam espécies crípticas não descritas na região e apresentam variação de pelo menos uma a quatro espécies no grupo interno, dependendo da abordagem, corroborando estudos anteriores, e revelando esta região como um possível "hotspot" para descoberta de espécies de peixes não descritas.(AU)

A new Hyphessobrycon (Characiformes: Characidae) of the Hyphessobrycon heterorhabdus species-group from the lower Amazon basin, Brazil

A new species of Hyphessobrycon belonging to the Hyphessobrycon heterorhabdus species-group from the lower rio Tapajós, state of Pará, Brazil, is described. The new species is allocated into the Hyphessobrycon heterorhabdus species-group due to its color pattern, composed by an anteriorly well-defined, horizontally elongated humeral blotch that becomes diffuse and blurred posteriorly, where it overlaps with a conspicuous midlateral dark stripe that becomes blurred towards the caudal peduncle and the presence, in living specimens, of a tricolored longitudinal pattern composed by a dorsal red or reddish longitudinal stripe, a middle iridescent, golden or silvery longitudinal stripe, and a more ventrally-lying longitudinal dark pattern composed by the humeral blotch and dark midlateral stripe. It can be distinguished from all other species of the group by possessing humeral blotch with a straight or slightly rounded ventral profile, lacking a ventral expansion present in all other species of the group. The new species is also distinguished from Hyphessobrycon heterorhabdus by a 9.6% genetic distance in the cytochrome c oxidase I gene. The little morphological distinction of the new species when compared with its most similar congener, H. heterorhabdus, indicates that the new species is one of the first truly cryptic fish species described from the Amazon basin.(AU)

Uma nova espécie de Hyphessobrycon pertencente ao grupo Hyphessobrycon heterorhabdus é descrita da região do baixo rio Tapajós, estado do Pará, Brasil. A nova espécie é incluída no grupo Hyphessobrycon heterorhabdus devido ao seu padrão de coloração, composto por uma mancha umeral alongada, anteriormente bem definida, que se torna difusa e borrada posteriormente, onde se sobrepõe a uma conspícua faixa escura médio-lateral que se torna borrada próxima ao pedúnculo caudal, e pela presença, em exemplares vivos, de um padrão longitudinal tricolor, composto por uma faixa longitudinal vermelha ou avermelhada dorsal, uma faixa média iridescente dourada ou prateada e, mais ventralmente, o padrão longitudinal escuro composto pela faixa escura médio-lateral e mancha umeral. A espécie pode ser distinguida das outras espécies pertencentes ao grupo por possuir uma mancha umeral com região ventral retilínea ou levemente arredondada, sem uma expansão ventral presente nas demais espécies do grupo. A espécie também se diferencia de Hyphessobrycon heterorhabdus por uma distância genética de 9,6% no gene citocromo c oxidase I. A sutil diferença morfológica da nova espécie quando comparada ao seu congênere mais similar, H. heterorhabdus, indica que a nova espécie é uma das primeiras espécies de peixes verdadeiramente crípticas descritas da Bacia Amazônica.(AU)

DNA barcoding of a tropical anguillid eel, Anguilla bicolor (Actinopterygii: Anguilliformes), in Indo-Pacific region and notes on its population structure

The tropical anguillid eel, Anguilla bicolor McCelland, 1844, includes two subspecies, Anguilla bicolor bicolor McCelland, 1844 and Anguilla bicolor pacifica Schmidt, 1928, and is distributed across the Indo-Pacific region. Although A. bicolor is widely distributed and recognized as an important fish resource in the Indo-Pacific region, few studies have been conducted on its genetic variation and population structure. DNA barcoding of A. bicolor specimens collected in the Indo-Pacific region was carried out in this study using mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I. Anguilla bicolor was found to diverge genetically, which supported its classification into two different subspecies. In addition, our study showed that A. bicolor bicolor had two genetically distinct populations/groups, and these different populations co-occur geographically in Indonesia and Malaysia in the eastern Indian Ocean. Our findings suggest that the eel larvae might be transported from at least two geographically different spawning grounds in the Indian Ocean, and then recruited to and settled in the same habitats in Indonesian and Malaysian waters. The molecular evidence calls for further research on the life history, stock assessment and protection of the populations of A. bicolor bicolor in Indonesia and Malaysia.

First record of cannibalism in the giant mottled eel Anguilla marmorata (Actinopterygii: Anguilliformes) as revealed by DNA barcoding

Although the giant mottled eel, Anguilla marmorata Quoy & Gaimard, 1824, is widely distributed in the Indo-Pacific region, few ecological studies have been conducted on the species. We investigated the stomach contents of A. marmorata visually and used the DNA-barcode region of the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 (CO1) to confirm the species identification. The stomach content analysis revealed that teleosts and crustaceans are the major prey items of A. marmorata. Interestingly, the stomach content of one of the specimens, which was 1029 mm in total length (TL), contained an eel-like fish identified as A. marmorata measuring 510 mm in TL. This study is the first to record cannibalism in the diet of A. marmorata. Although the diet of anguillid eels is generally selective for a single prey species, larger eels are more likely to adopt a diverse feeding habit that includes cannibalism in the tropical river ecosystems.(AU)

Through DNA sensors and hidden mitochondrial effects of SARS-CoV-2

The COVID-19 pandemic brought attention to studies about viral infections and their impact on the cell machinery. SARS-CoV-2, for example, invades the host cells by ACE2 interaction and possibly hijacks the mitochondria. To better understand the disease and to propose novel treatments, crucial aspects of SARS-CoV-2 enrolment with host mitochondria must be studied. The replicative process of the virus leads to consequences in mitochondrial function, and cell metabolism. The hijacking of mitochondria, on the other hand, can drive the extrusion of mitochondrial DNA (mtDNA) to the cytosol. Extracellular mtDNA evoke robust proinflammatory responses once detected, that may act in different pathways, eliciting important immune responses. However, few receptors are validated and are able to detect and respond to mtDNA. In this review, we propose that the mtDNA and its detection might be important in the immune process generated by SARS-CoV-2 and that this mechanism might be important in the lung pathogenesis seen in clinical symptoms. Therefore, investigating the mtDNA receptors and their signaling pathways might provide important clues for therapeutic interventions.(AU)

Through DNA sensors and hidden mitochondrial effects of SARS-CoV-2

The COVID-19 pandemic brought attention to studies about viral infections and their impact on the cell machinery. SARS-CoV-2, for example, invades the host cells by ACE2 interaction and possibly hijacks the mitochondria. To better understand the disease and to propose novel treatments, crucial aspects of SARS-CoV-2 enrolment with host mitochondria must be studied. The replicative process of the virus leads to consequences in mitochondrial function, and cell metabolism. The hijacking of mitochondria, on the other hand, can drive the extrusion of mitochondrial DNA (mtDNA) to the cytosol. Extracellular mtDNA evoke robust proinflammatory responses once detected, that may act in different pathways, eliciting important immune responses. However, few receptors are validated and are able to detect and respond to mtDNA. In this review, we propose that the mtDNA and its detection might be important in the immune process generated by SARS-CoV-2 and that this mechanism might be important in the lung pathogenesis seen in clinical symptoms. Therefore, investigating the mtDNA receptors and their signaling pathways might provide important clues for therapeutic interventions.(AU)

Polymerase chain reaction using conjunctival swab samples for detecting Leishmania DNA in dogs / Reação em cadeia da polimerase usando amostras de Swab de conjuntiva para detecção de DNA de Leishmania em cães

The dog is the main domestic reservoir of Leishmania and font of infection for the vector, constituting an important host for the transmission of the parasite to humans. Non-invasive collection of swab samples for leishmaniasis diagnosis has been a promising alternative. This study analyzed the positivity of polymerase chain reaction (PCR) for the diagnosis of canine leishmaniasis in conjunctiva samples. DNA extraction was performed using SDS 20% and PCR was performed using 13A/13B primers that amplify 120-bp of Leishmania kDNA. Of the 77 dogs analyzed, 50 (64.93%) had ocular changes: 25 (32.47%) dogs had periocular lesion, 41 (53.25%) dogs had purulent eye discharge, and 17 (22.08%) dogs had both signals. PCR was positive in 35 dogs (45.45%), and there was no significant difference between dogs with and without ocular signals (p=0.4074). PCR positivity was significant higher in dogs without periocular injury (p=0.0018). Conjunctive PCR, a less invasive, fast, and painless collection technique, is indicated to complement the diagnosis, especially in dogs without periocular injury, independent of the presence of purulent eye discharge.(AU)

O cão é o principal reservatório doméstico de Leishmania e também fonte de infecção para o vetor, constituindo um importante hospedeiro para a transmissão do parasita ao homem. A coleta não invasiva de amostras em swab para diagnóstico das leishmanioses tem sido uma alternativa promissora. Este estudo analisou a positividade da reação em cadeia da polimerase (PCR) para o diagnóstico de leishmaniose canina em amostras de conjuntiva. A extração do DNA foi realizada com SDS 20%. A PCR foi realizada com primers 13A/13B que amplificam 120-pb do kDNA de Leishmania. Dos 77 cães analisados, 50 (64,93%) tiveram alterações oculares; 25 (32,47%) cães tiveram uma lesão periocular; 41 (53,25%) tiveram secreção ocular purulenta e 17 (22,08%) cães tiveram ambos os sinais. A PCR foi positiva em 35 cães (45,45%) e não houve diferença significativa em cães com e sem sinais oculares (p = 0,4074). A positividade da PCR foi significativamente maior em cães sem lesão periocular (p = 0,0018). PCR em conjuntiva, uma técnica de coleta menos invasiva, rápida e indolor, é indicada para complementar o diagnóstico, principalmente em cães sem lesão periocular, independentemente da presença de secreção ocular purulenta.(AU)

Polymerase chain reaction using conjunctival swab samples for detecting Leishmania DNA in dogs / Reação em cadeia da polimerase usando amostras de Swab de conjuntiva para detecção de DNA de Leishmania em cães

Abstract The dog is the main domestic reservoir of Leishmania and font of infection for the vector, constituting an important host for the transmission of the parasite to humans. Non-invasive collection of swab samples for leishmaniasis diagnosis has been a promising alternative. This study analyzed the positivity of polymerase chain reaction (PCR) for the diagnosis of canine leishmaniasis in conjunctiva samples. DNA extraction was performed using SDS 20% and PCR was performed using 13A/13B primers that amplify 120-bp of Leishmania kDNA. Of the 77 dogs analyzed, 50 (64.93%) had ocular changes: 25 (32.47%) dogs had periocular lesion, 41 (53.25%) dogs had purulent eye discharge, and 17 (22.08%) dogs had both signals. PCR was positive in 35 dogs (45.45%), and there was no significant difference between dogs with and without ocular signals (p=0.4074). PCR positivity was significant higher in dogs without periocular injury (p=0.0018). Conjunctive PCR, a less invasive, fast, and painless collection technique, is indicated to complement the diagnosis, especially in dogs without periocular injury, independent of the presence of purulent eye discharge.

Resumo O cão é o principal reservatório doméstico de Leishmania e também fonte de infecção para o vetor, constituindo um importante hospedeiro para a transmissão do parasita ao homem. A coleta não invasiva de amostras em swab para diagnóstico das leishmanioses tem sido uma alternativa promissora. Este estudo analisou a positividade da reação em cadeia da polimerase (PCR) para o diagnóstico de leishmaniose canina em amostras de conjuntiva. A extração do DNA foi realizada com SDS 20%. A PCR foi realizada com primers 13A/13B que amplificam 120-pb do kDNA de Leishmania. Dos 77 cães analisados, 50 (64,93%) tiveram alterações oculares; 25 (32,47%) cães tiveram uma lesão periocular; 41 (53,25%) tiveram secreção ocular purulenta e 17 (22,08%) cães tiveram ambos os sinais. A PCR foi positiva em 35 cães (45,45%) e não houve diferença significativa em cães com e sem sinais oculares (p = 0,4074). A positividade da PCR foi significativamente maior em cães sem lesão periocular (p = 0,0018). PCR em conjuntiva, uma técnica de coleta menos invasiva, rápida e indolor, é indicada para complementar o diagnóstico, principalmente em cães sem lesão periocular, independentemente da presença de secreção ocular purulenta.

Estudo da conservação de material biológico com a tecnologia Fta-card® / Study on the conservation of biological material with Fta-card® technology / Estudio de conservación de material biológico con la tecnología Fta-card®

O Whatman FTA-Card® é um papel-filtro quimicamente tratado, destinado à coleta, transporte, armazenamento de amostras para posterior extração de ácidos nucléicos. A tecnologia FTA-Card® é utilizada para manter estável DNA e RNA em temperatura ambiente, podendo ser utilizados para fixação de uma ampla variedade de material orgânico ou tecidos. Foram realizados testes para certificar sua eficiência na conservação do material a ser analisado com o intuito de eliminar a cadeia fria de conservação, agilizando o processo e diminuindo os custos da execução de exames moleculares associados ao diagnóstico de patologias. Foram testadas oito amostras de felinos na forma de sangue total e soro, para a extração utilizou-se o kit Magazorb RNA Total mini-prep kit (Promega®, EUA), para o diagnóstico foi utilizada a técnica de PCR em tempo real para amplificar o gene CI2 de mamíferos, a fim de visualizar a eficácia na conservação de ácidos nucleicos. A utilização desse método torna possível que o material biológico seja enviado por serviços de transporte postais, reduzindo os custos e viabilizando diagnósticos provenientes de áreas mais remotas.(AU)

Whatman FTA-Card® is a chemically treated filter paper intended for the collection, transport, and storage of samples for later extraction of nucleic acids. FTA-Card® technology is used to keep DNA and RNA stable at room temperature and can be used to fix a wide variety of organic material or tissues. Tests were carried out to certify its efficiency in the conservation of the material to be analyzed in order to eliminate the cold conservation chain, speeding up the process and decreasing the costs of performing molecular tests associated with the diagnosis of pathologies. By using this method, biological material can be sent by postal transport services, reducing costs and making diagnoses from more remote areas feasible. Samples of feline specimens were tested in the form of whole blood and serum, using the Magazorb RNA Total mini-prep kit (Promega®, USA) for the extraction. Diagnosis was performed using real-time PCR technique to amplify the mammalian CI2 gene in order to visualize the effectiveness in conserving nucleic acids.(AU)

Whatman FTA-Card® es un papel de filtro tratado químicamente, destinado a la recogida, transporte, almacenamiento de muestras para su posterior extracción de ácidos nucleicos. La tecnología FTA-Card® se usa para mantener el ADN y el ARN estables a la temperatura ambiente y se puede usar para la fijación de una amplia variedad de materiales o tejidos orgánicos. Se realizaron pruebas para certificar su eficiencia en la conservación del material a analizar con el fin de eliminar la cadena de frío de conservación, agilizando el proceso y reduciendo los costos de realización de pruebas moleculares asociadas al diagnóstico de patologías. Se analizaron ocho muestras felinas en forma de sangre total y suero, para la extracción se utilizó el mini-prep kit Magazorb RNA Total (Promega®, USA), para el diagnóstico se utilizó la técnica de PCR en tiempo real para amplificar el CI2 de mamífero gen, con el fin de visualizar la efectividad en la conservación de ácidos nucleicos. El uso de ese método permite el envío de material biológico por los servicios de transporte postal, lo que reduce los costes y permite realizar diagnósticos desde zonas más remotas.(AU)

Estudo da conservação de material biológico com a tecnologia Fta-card® / Study on the conservation of biological material with Fta-card® technology / Estudio de conservación de material biológico con la tecnología Fta-card®

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Whatman FTA-Card® is a chemically treated filter paper intended for the collection, transport, and storage of samples for later extraction of nucleic acids. FTA-Card® technology is used to keep DNA and RNA stable at room temperature and can be used to fix a wide variety of organic material or tissues. Tests were carried out to certify its efficiency in the conservation of the material to be analyzed in order to eliminate the cold conservation chain, speeding up the process and decreasing the costs of performing molecular tests associated with the diagnosis of pathologies. By using this method, biological material can be sent by postal transport services, reducing costs and making diagnoses from more remote areas feasible. Samples of feline specimens were tested in the form of whole blood and serum, using the Magazorb RNA Total mini-prep kit (Promega®, USA) for the extraction. Diagnosis was performed using real-time PCR technique to amplify the mammalian CI2 gene in order to visualize the effectiveness in conserving nucleic acids.(AU)

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Estudo da conservação de material biológico com a tecnologia Fta-card® / Study on the conservation of biological material with Fta-card® technology / Estudio de conservación de material biológico con la tecnología Fta-card®

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Identity of Gymnophthalmus (Squamata: Gymnophthalmidae) from northeastern Amazonia with evidence for G. underwoodi as invasive in Belém / Identidade dos Gymnophthalmus (Squamata: Gymnophthalmidae) do nordesteda Amazônia, com evidência para G. underwoodi como invasora em Belém

We report the occurrence of the lizard Gymnophthalmus underwoodi in the municipality of Belém, state of Pará, Brazil. This is the first record of that species south of the Amazonas River, probably because of an accidental introduction by ships that dock in Belém, the same pathway suggested for the recent introduction of another species of exotic lizard recently recorded in the city. We also determined the identity of some specimens of Gymnophthalmus from the states of Amapá and Pará through external morphology and molecular data, confirming that, until now, G. vanzoi is the only Gymnophthalmus occurring in the savanna enclaves of those states. Finally, we provide a new distribution map for the species of Gymnophthalmus, including the new occurrence record for G. underwoodi for the state of Pará, where it can be considered as an invasive species.

Nós relatamos a ocorrência do lagarto Gymnophthalmus underwoodi no município de Belém, estado do Pará, Brasil. Este é o primeiro registro ao sul do Rio Amazonas, provavelmente como resultado de uma introdução acidental por navios que atracam em Belém, o mesmo caminho sugerido para a introdução de outra espécie exótica de lagarto recentemente encontrada na cidade. Nós também determinamos a identidade de alguns espécimes de Gymnophthalmus dos estados do Amapá e Pará, através de dados morfológicos externos e moleculares, confirmando que, até o momento, G. vanzoi é o único Gymnophthalmus ocorrendo nos enclaves de savana desses estados. Por fim, nós fornecemos um novo mapa de distribuição para as espécies de Gymnophthalmus, incluindo o novo registro de ocorrência de G. underwoodi para o estado do Pará, onde ela pode ser considerada como uma espécie invasiva.