Citrus orchards under formation evaluated by UAV-Based RGB Imagery

Few studies have investigated the biometric attributes of citrus orchards under formation that use RGB sensors on board unmanned aerial vehicles (UAV) and the challenges are great. This study aimed to develop and validate a method of using aerial UAV images by automated routines to evaluate the biometric attributes of a crop of 'Tahiti' acid lime under formation. We used a multirotor UAV, programmed to capture images at three different map scales, with a frontal and side overlap of 80 %. Geoprocessing was carried out both with and without ground control points on each scale. An automated routine was developed in an open-source environment, consisting of three processing phases: i) Estimation of the plant biometric attributes, ii) Statistical analysis, and iii) Statistical Report Map (SRM). The use of the developed routine allowed to delimit and estimate the crown projection area with an accuracy of more than 95 % as well as identify and quantify the plants with an accuracy of over 97 %. The use of ground control points during the processing stage does not increase accuracy in estimating the biometric attributes under evaluation. On the other hand, map scale is strongly correlated with the quality of the estimates, especially plant height. The results allowed to define a method for the acquisition and analysis of aerophotogrammetric data using a UAV, which can be used to measure the plant biometric attributes under analysis and the method can be easily adapted to perennial crops.

Methodology to filter out outliers in high spatial density data to improve maps reliability

The considerable volume of data generated by sensors in the field presents systematic errors; thus, it is extremely important to exclude these errors to ensure mapping quality. The objective of this research was to develop and test a methodology to identify and exclude outliers in high-density spatial data sets, determine whether the developed filter process could help decrease the nugget effect and improve the spatial variability characterization of high sampling data. We created a filter composed of a global, anisotropic, and an anisotropic local analysis of data, which considered the respective neighborhood values. For that purpose, we used the median to classify a given spatial point into the data set as the main statistical parameter and took into account its neighbors within a radius. The filter was tested using raw data sets of corn yield, soil electrical conductivity (ECa), and the sensor vegetation index (SVI) in sugarcane. The results showed an improvement in accuracy of spatial variability within the data sets. The methodology reduced RMSE by 85 %, 97 %, and 79 % in corn yield, soil ECa, and SVI respectively, compared to interpolation errors of raw data sets. The filter excluded the local outliers, which considerably reduced the nugget effects, reducing estimation error of the interpolated data. The methodology proposed in this work had a better performance in removing outlier data when compared to two other methodologies from the literature.

Accuracy and reliability of two body weight estimators based on linear measurements in horses / Acurácia e confiabilidade de dois estimadores de peso corporal baseados em mensurações lineares em equídeos

Estimation methods are routinely used to determine the body weight of a horse when a scale is not available. However, it is important to evaluate the accuracy and reliability of these predictions since nutritional management and drug dosage, among others, require knowledge of the animal’s weight. The objective of this study was to evaluate the accuracy and reliability of estimated weights of horses using two prediction models, and to discuss the effect of the predictions on animal management. Seventy-one adult male animals (40 mules and 31 horses) were weighed on a precision scale (control weight). Chest circumference and body length were measured and used to estimate body weight using the two models. Accuracy was evaluated by analysis of fit indices, comparison of squared prediction errors, delta Akaike’s information criterion, and decomposition of the mean squared error of prediction. For economic evaluation, three production scenarios were established: simple (worming + forage), traditional (worming + forage + concentrate mixture), and traditional with supplementation (worming + forage + concentrate mixture + supplementation). Economic values were collected through a pricing survey carried out in the Midwest region of Brazil and converted to US dollars. Percent differences in costs were evaluated using Fisher’s exact test. The most suitable model for the morphometric profile of the animals was that using a combination of chest circumference and body length. The differences in economic values between production scenarios were significant (P<0.05). Losses using the inadequate model are 10% higher compared to control; thus, in a facility with 20 equids that uses this model, the losses are ≈ US$ 10,000/year. When investment in a scale is not possible, it is fundamental to evaluate which model is more compatible with the body biotype of the herd since all types of management that depend on the body weight of the animals may result in significant economic losses.

Estimativas para determinar o peso corporal de um equino são rotineiramente usadas quando uma balança não está disponível. Todavia, é fundamental realizar um diagnóstico da acurácia e confiabilidade das predições destes estimadores, pois o manejo nutricional, dosificação de fármacos, entre outros, exigem o conhecimento do peso. Assim, objetivou-se avaliar a acurácia e confiabilidade de predições de peso estimado de equídeos utilizando dois modelos de cálculos e discutir o reflexo das predições no manejo dos animais. Foram pesados 71 equídeos machos (40 Muares e 31 Equinos) com idade adulta, em balança de precisão (peso controle). Medidas de perímetro torácico e comprimento corporal foram realizadas e utilizadas para estimar o peso corporal usando os modelos. A acurácia foi avaliada via análise do índice de adequação, comparação entre o quadrado do erro de predição, critério de informação Delta Akaike's e decomposição do erro quadrático médio da predição. Para avaliação econômica, criaram-se três cenários de produção: simples (vermifugação + volumoso), tradicional (vermifugação + volumoso + concentrado) e tradicional com suplementação (vermifugação + volumoso + concentrado + suplementação). Valores econômicos foram verificados em pesquisa de preço na região Centro Oeste do Brasil e convertidos em dólar. Avaliou-se as diferenças de percentagem dos custos utilizando teste de Fisher. O modelo mais adequado para o perfil morfométrico dos animais foi o que usa combinação entre perímetro torácico e comprimento corporal. Foram significativas (P<0,05) as diferenças para os valores econômicos nos cenários de produção. Prejuízos usando o modelo inadequado são 10% superiores em relação ao controle, assim em um estabelecimento com 20 equídeos que usa este modelo, os prejuízos são ≈ 10 mil dólares/ano. Na ausência da balança, é fundamental avaliar qual modelo de cálculo será mais compatível com biotipo corporal do rebanho, pois todo tipo de manejo que depende do peso corporal dos animais, pode gerar prejuízos econômicos significativos.

Accuracy and reliability of two body weight estimators based on linear measurements in horses / Acurácia e confiabilidade de dois estimadores de peso corporal baseados em mensurações lineares em equídeos

Estimation methods are routinely used to determine the body weight of a horse when a scale is not available. However, it is important to evaluate the accuracy and reliability of these predictions since nutritional management and drug dosage, among others, require knowledge of the animals weight. The objective of this study was to evaluate the accuracy and reliability of estimated weights of horses using two prediction models, and to discuss the effect of the predictions on animal management. Seventy-one adult male animals (40 mules and 31 horses) were weighed on a precision scale (control weight). Chest circumference and body length were measured and used to estimate body weight using the two models. Accuracy was evaluated by analysis of fit indices, comparison of squared prediction errors, delta Akaikes information criterion, and decomposition of the mean squared error of prediction. For economic evaluation, three production scenarios were established: simple (worming + forage), traditional (worming + forage + concentrate mixture), and traditional with supplementation (worming + forage + concentrate mixture + supplementation). Economic values were collected through a pricing survey carried out in the Midwest region of Brazil and converted to US dollars. Percent differences in costs were evaluated using Fishers exact test. The most suitable model for the morphometric profile of the animals was that using a combination of chest circumference and body length. The differences in economic values between production scenarios were significant (P<0.05). Losses using the inadequate model are 10% higher compared to control; thus, in a facility with 20 equids that uses this model, the losses are ≈ US$ 10,000/year. When investment in a scale is not possible, it is fundamental to evaluate which model is more compatible with the body biotype of the herd since all types of management that depend on the body weight of the animals may result in significant economic losses.(AU)

Estimativas para determinar o peso corporal de um equino são rotineiramente usadas quando uma balança não está disponível. Todavia, é fundamental realizar um diagnóstico da acurácia e confiabilidade das predições destes estimadores, pois o manejo nutricional, dosificação de fármacos, entre outros, exigem o conhecimento do peso. Assim, objetivou-se avaliar a acurácia e confiabilidade de predições de peso estimado de equídeos utilizando dois modelos de cálculos e discutir o reflexo das predições no manejo dos animais. Foram pesados 71 equídeos machos (40 Muares e 31 Equinos) com idade adulta, em balança de precisão (peso controle). Medidas de perímetro torácico e comprimento corporal foram realizadas e utilizadas para estimar o peso corporal usando os modelos. A acurácia foi avaliada via análise do índice de adequação, comparação entre o quadrado do erro de predição, critério de informação Delta Akaike's e decomposição do erro quadrático médio da predição. Para avaliação econômica, criaram-se três cenários de produção: simples (vermifugação + volumoso), tradicional (vermifugação + volumoso + concentrado) e tradicional com suplementação (vermifugação + volumoso + concentrado + suplementação). Valores econômicos foram verificados em pesquisa de preço na região Centro Oeste do Brasil e convertidos em dólar. Avaliou-se as diferenças de percentagem dos custos utilizando teste de Fisher. O modelo mais adequado para o perfil morfométrico dos animais foi o que usa combinação entre perímetro torácico e comprimento corporal. Foram significativas (P<0,05) as diferenças para os valores econômicos nos cenários de produção. Prejuízos usando o modelo inadequado são 10% superiores em relação ao controle, assim em um estabelecimento com 20 equídeos que usa este modelo, os prejuízos são ≈ 10 mil dólares/ano. Na ausência da balança, é fundamental avaliar qual modelo de cálculo será mais compatível com biotipo corporal do rebanho, pois todo tipo de manejo que depende do peso corporal dos animais, pode gerar prejuízos econômicos significativos.(AU)

Determinação da acurácia do monitor oscilométrico Delta Life DL 1000 na mensuração da pressão arterial em cães anestesiados de diferentes faixas de peso / Evaluation of the accuracy of the Delta Life DL 1000 oscillometric monitor for blood pressure measurement in anesthetized dogs of different weight ranges

Background: Arterial blood pressure is one of the most commonly variables monitored during anesthetic procedures in veterinary patients. The most reliable method for measuring arterial blood pressure in dogs and cats is the direct (invasive) method. However, the oscillometric method is less complex and more practical for clinical routine in small animals. Nevertheless, oscillometric monitors present great variability in accuracy. The present study aimed to determine the accuracy of the Delta Life DL 1000 oscillometric monitor for measurement of systolic, mean and diastolic blood pressures (SAP, MAP and DAP, respectively) in anesthetized dogs of different weight ranges. Materials, Methods & Results: This study was approved by the Institutional Ethics Committee of Animal Use. Fifteen female dogs of different breeds, weighing 11.6 ± 10.0 kg and with a mean age of 48 ± 51 months were used. All animals were scheduled for elective surgery under general anesthesia in the Institution Veterinary Hospital. Dogs were anesthetized with morphine, propofol and isoflurane and had a 20 or 22 gauge catheter introduced into the dorsal pedal artery for continuous, invasive monitoring of SAP, MAP and DAP. A blood pressure cuff was positioned over the middle third of the radius and connected to Delta Life DL 1000 monitor. Oscillometric readings of SAP, MAP and DAP were registered every 5 minutes, and invasive values were simultaneously recorded. Values obtained with both methods were compared (invasive versus oscillometric) by use of the Bland Altman method to determine the bias, standard deviation of bias and 95% limits of agreement. The percentages of errors between the methods within 10 mmHg and within...

Verificação de desempenho do método analítico de determinação de pH em carne, produtos cárneos, pescados e derivados e estimativa de incerteza da medição: em atendimento aos requisitos da ABNT NBR ISO/IEC 17025 / Performance verification of the analytical method of determination of pH in meat, meat products, fish and derivatives and uncertainty of measurement: following the requirement of ISO / IEC 17025

A cada dia torna-se mais importante dispor de técnicas e metodologias confiáveis para quantificação de substâncias, bem como das suas características. Este trabalho objetivou a confirmação do desempenho do método analítico e o cálculo da estimativa da incerteza para determinação de pH em carnes e pescados conforme ISO 2917. O estudo do desempenho do método foi feito através da avaliação dos parâmetros de precisão e exatidão, cujos testes foram realizados em amostras de cárneos e pescados (precisão) e de recuperação para determinação da exatidão do método, comparando-se a recuperação tabelada e a recuperação obtida com a leitura de solução tampão pH 9,05, utilizando um MRC. Estimou-se a incerteza do método tendo como fontes pesagem; incerteza do pHmetro; a recuperação e a precisão; sendo realizada ao final uma comparação interlaboratorial.(AU)

Verificação de desempenho do método analítico de determinação de pH em carne, produtos cárneos, pescados e derivados e estimativa de incerteza da medição: em atendimento aos requisitos da ABNT NBR ISO/IEC 17025 / Performance verification of the analytical method of determination of pH in meat, meat products, fish and derivatives and uncertainty of measurement: following the requirement of ISO / IEC 17025

A cada dia torna-se mais importante dispor de técnicas e metodologias confiáveis para quantificação de substâncias, bem como das suas características. Este trabalho objetivou a confirmação do desempenho do método analítico e o cálculo da estimativa da incerteza para determinação de pH em carnes e pescados conforme ISO 2917. O estudo do desempenho do método foi feito através da avaliação dos parâmetros de precisão e exatidão, cujos testes foram realizados em amostras de cárneos e pescados (precisão) e de recuperação para determinação da exatidão do método, comparando-se a recuperação tabelada e a recuperação obtida com a leitura de solução tampão pH 9,05, utilizando um MRC. Estimou-se a incerteza do método tendo como fontes pesagem; incerteza do pHmetro; a recuperação e a precisão; sendo realizada ao final uma comparação interlaboratorial.

Acompanhamento por exames imagiológicos de fêmeas caninas e felinas gestantes / Follow-up by imagiological exams of canine and feline pregnant females / Examen imagiológico de hembras caninas y felinas embarazadas

A gestação é um período muito importante no desenvolvimento fetal no qual é preciso sempre se atentar a qualquer problema que a fêmea ou os conceptos possam desenvolver. Um destes pode ocorrer no final do período gestacional, durante o parto. Algumas cadelas e gatas têm dificuldades para realizar o parto normal, seja por distocia materna ou fetal. A partir disso, o animal pode correr sérios riscos, juntamente com sua prole, que está prestes a nascer. Para evitar a morte dos animais devido a distocia, recomenda-se a realização do acompanhamento gestacional por meio de exames ultrassonográficos e radiográficos. O ultrassom auxilia na predição estimada da data do parto enquanto o raio-x verifica a possibilidade de um parto distócico. O objetivo deste trabalho foi verificar a acurácia desses exames imagiológicos nos acompanhamentos gestacionais realizados entre anos de 2014 a 2019 no Hospital Veterinário da instituição. Com as devidas análises, visualizou-se que ambos os exames possuem alta taxa de acerto quanto às suas predições. Além disso, também se concluiu a existência de variáveis que afetam essa acurácia. Vale ressaltar que ainda são necessários estudos com uma amostra maior para uma melhor constatação, visando também a verificação das melhores datas para se fazer os exames. Recomenda-se a realização destes estudos com maior especificidade, verificando diferenças entre raças, espécies e tipos de crânio. Este estudo retrospectivo é de suma importância para orientação da conduta dos médicos veterinários quanto à necessidade de realização de acompanhamentos gestacionais, visando a diminuição dos riscos inerentes ao parto.(AU)

Pregnancy is a very important period in fetal development where you always have to pay attention to any problems the female or offspring may develop. One of these may occur at the end of the gestational period, during childbirth. Some female dogs and cats have difficulty performing normal delivery, either by maternal or fetal dystocia. From this, the animal can take serious risks, along with its offspring, which is about to be born. To prevent the death of animals due to dystocia, it is recommended to perform gestational follow-up through ultrasound and radiographic examinations. Ultrasound assists in the estimated prediction of the delivery date while the x-ray verifies the possibility of a dystocic delivery. The objective of this study was to verify the accuracy of these imaging exams in gestational follow-up performed between 2014 and 2019 at the institution's Veterinary Hospital. With the proper analyzes, it was visualized that both exams have high accuracy rate regarding their predictions. In addition, it was also concluded that there are variables that affect this accuracy. It is noteworthy that studies with a larger sample are still necessary for a better finding, also aiming to verify the best dates for the exams. It is recommended to conduct these studies with greater specificity, checking differences between races, species and types of skull. This retrospective study is extremely important to guide the conduct of veterinarians regarding the need for gestational follow-up, aiming at reducing the risks inherent in childbirth.(AU)

El embarazo es un período muy importante en el desarrollo fetal en el que siempre hay que prestar atención a cualquier problema que la hembra o la descendencia puedan desarrollar. Uno de estos puede ocurrir al final del período gestacional, durante el parto. Algunas perras y gatas tienen dificultades para realizar el parto normal, ya sea por distocia materna o fetal. A partir de esto, el animal puede asumir graves riesgos, junto con su descendencia, que está a punto de nacer. Para prevenir la muerte de animales debido a la distocia, se recomienda realizar un seguimiento gestacional mediante ecografías y exámenes radiográficos. El ultrasonido asiste en la predicción estimada de la fecha de entrega, mientras que la radiografía verifica la posibilidad de una entrega distócica. El objetivo de este estudio fue verificar la precisión de estos exámenes de imagen en el seguimiento gestacional realizado entre 2014 y 2019 en el Hospital Veterinario de la institución. Con los análisis adecuados, se visualizó que ambos exámenes tienen una alta tasa de precisión con respecto a sus predicciones. Además, también se concluyó que hay variables que afectan esta precisión. Cabe destacar que los estudios con una muestra más grande todavía son necesarios para un mejor hallazgo, también con el objetivo de verificar las mejores fechas para los exámenes. Se recomienda realizar estos estudios con mayor especificidad, comprobando las diferencias entre razas, especies y tipos de cráneos. Este estudio retrospectivo es extremadamente importante para guiar la conducta de los veterinarios con respecto a la necesidad del seguimiento gestacional, con el objetivo de reducir los riesgos inherentes al parto.(AU)

Acompanhamento por exames imagiológicos de fêmeas caninas e felinas gestantes / Follow-up by imagiological exams of canine and feline pregnant females / Examen imagiológico de hembras caninas y felinas embarazadas

A gestação é um período muito importante no desenvolvimento fetal no qual é preciso sempre se atentar a qualquer problema que a fêmea ou os conceptos possam desenvolver. Um destes pode ocorrer no final do período gestacional, durante o parto. Algumas cadelas e gatas têm dificuldades para realizar o parto normal, seja por distocia materna ou fetal. A partir disso, o animal pode correr sérios riscos, juntamente com sua prole, que está prestes a nascer. Para evitar a morte dos animais devido a distocia, recomenda-se a realização do acompanhamento gestacional por meio de exames ultrassonográficos e radiográficos. O ultrassom auxilia na predição estimada da data do parto enquanto o raio-x verifica a possibilidade de um parto distócico. O objetivo deste trabalho foi verificar a acurácia desses exames imagiológicos nos acompanhamentos gestacionais realizados entre anos de 2014 a 2019 no Hospital Veterinário da instituição. Com as devidas análises, visualizou-se que ambos os exames possuem alta taxa de acerto quanto às suas predições. Além disso, também se concluiu a existência de variáveis que afetam essa acurácia. Vale ressaltar que ainda são necessários estudos com uma amostra maior para uma melhor constatação, visando também a verificação das melhores datas para se fazer os exames. Recomenda-se a realização destes estudos com maior especificidade, verificando diferenças entre raças, espécies e tipos de crânio. Este estudo retrospectivo é de suma importância para orientação da conduta dos médicos veterinários quanto à necessidade de realização de acompanhamentos gestacionais, visando a diminuição dos riscos inerentes ao parto.

Pregnancy is a very important period in fetal development where you always have to pay attention to any problems the female or offspring may develop. One of these may occur at the end of the gestational period, during childbirth. Some female dogs and cats have difficulty performing normal delivery, either by maternal or fetal dystocia. From this, the animal can take serious risks, along with its offspring, which is about to be born. To prevent the death of animals due to dystocia, it is recommended to perform gestational follow-up through ultrasound and radiographic examinations. Ultrasound assists in the estimated prediction of the delivery date while the x-ray verifies the possibility of a dystocic delivery. The objective of this study was to verify the accuracy of these imaging exams in gestational follow-up performed between 2014 and 2019 at the institution's Veterinary Hospital. With the proper analyzes, it was visualized that both exams have high accuracy rate regarding their predictions. In addition, it was also concluded that there are variables that affect this accuracy. It is noteworthy that studies with a larger sample are still necessary for a better finding, also aiming to verify the best dates for the exams. It is recommended to conduct these studies with greater specificity, checking differences between races, species and types of skull. This retrospective study is extremely important to guide the conduct of veterinarians regarding the need for gestational follow-up, aiming at reducing the risks inherent in childbirth.

El embarazo es un período muy importante en el desarrollo fetal en el que siempre hay que prestar atención a cualquier problema que la hembra o la descendencia puedan desarrollar. Uno de estos puede ocurrir al final del período gestacional, durante el parto. Algunas perras y gatas tienen dificultades para realizar el parto normal, ya sea por distocia materna o fetal. A partir de esto, el animal puede asumir graves riesgos, junto con su descendencia, que está a punto de nacer. Para prevenir la muerte de animales debido a la distocia, se recomienda realizar un seguimiento gestacional mediante ecografías y exámenes radiográficos. El ultrasonido asiste en la predicción estimada de la fecha de entrega, mientras que la radiografía verifica la posibilidad de una entrega distócica. El objetivo de este estudio fue verificar la precisión de estos exámenes de imagen en el seguimiento gestacional realizado entre 2014 y 2019 en el Hospital Veterinario de la institución. Con los análisis adecuados, se visualizó que ambos exámenes tienen una alta tasa de precisión con respecto a sus predicciones. Además, también se concluyó que hay variables que afectan esta precisión. Cabe destacar que los estudios con una muestra más grande todavía son necesarios para un mejor hallazgo, también con el objetivo de verificar las mejores fechas para los exámenes. Se recomienda realizar estos estudios con mayor especificidad, comprobando las diferencias entre razas, especies y tipos de cráneos. Este estudio retrospectivo es extremadamente importante para guiar la conducta de los veterinarios con respecto a la necesidad del seguimiento gestacional, con el objetivo de reducir los riesgos inherentes al parto.

Simplification of the analysis of dry matter in fluid milk / Simplificação da análise de matéria seca em leite fluído / Simplificación del análisis de materia seca en leche fluida

This study aims to evaluate a simpler methodology for determination of dry matter in three types of milk. The treatments consisted of three methodologies: AOAC (Association of Official Agricultural Chemists), characterized by the drying in porcelain capsules and pre-heating; use of analytical sand in the process of drying, as well as a simplified methodology characterized by drying in Petri dishes without analytical sand and pre-heating proceeding. The statistical analysis was performed with F test (5% significance level), Pearson's correlation and Lin's concordance correlation coefficient. All methodologies showed precision and accuracy in the measurement of the dry matter in milk, however, the simplified methodology was superior in material savings and shorter time consumption for the analysis.(AU)

Este estudo teve como objetivo avaliar metodologia simplificada de determinação de matéria seca em três tipos de leite. Os tratamentos consistiram de três metodologias: AOAC (Association of Official Agricultural Chemists), caracterizada pela secagem em cápsulas de porcelana e pré-secagem; uso de areia analítica no processo de secagem e utilização de metodologia simplificada baseada no uso de placas de Petri com secagem direta em estufa, sem o uso de areia analítica e procedimento de pré-secagem. A análise estatística envolveu o teste F ao nível de significância de 5%, correlação de Pearson e coeficiente de concordância de Lin. Todas as metodologias mostraram acurácia na determinação da matéria seca para todos os tipos de leite, mas a metodologia simplificada foi superior em economia e menor tempo de análise.(AU)

Este estudio tuvo como objetivo evaluar la metodología simplificada de determinación de materia seca en tres tipos de leche. Los tratamientos consistieron en tres metodologías: AOAC (Association of Official Agricultural Chemists), caracterizada por pre-secado y secado en cápsulas de porcelana; uso de arena analítica en el proceso de secado y utilización de metodología simplificada basada en el uso de placas de Petri con secado directo en invernadero, sin el uso de arena analítica y procedimiento de pre secado. El análisis estadístico involucró la prueba F al nivel de significancia del 5%, correlación de Pearson y coeficiente de concordancia de Lin. Todas las metodologías mostraron precisión en la determinación de la materia seca para todos los tipos de leche, pero la metodología simplificada fue superior en economía y menor tiempo de análisis.(AU)

Simplification of the analysis of dry matter in fluid milk / Simplificação da análise de matéria seca em leite fluído / Simplificación del análisis de materia seca en leche fluida

This study aims to evaluate a simpler methodology for determination of dry matter in three types of milk. The treatments consisted of three methodologies: AOAC (Association of Official Agricultural Chemists), characterized by the drying in porcelain capsules and pre-heating; use of analytical sand in the process of drying, as well as a simplified methodology characterized by drying in Petri dishes without analytical sand and pre-heating proceeding. The statistical analysis was performed with F test (5% significance level), Pearson's correlation and Lin's concordance correlation coefficient. All methodologies showed precision and accuracy in the measurement of the dry matter in milk, however, the simplified methodology was superior in material savings and shorter time consumption for the analysis.(AU)

Este estudo teve como objetivo avaliar metodologia simplificada de determinação de matéria seca em três tipos de leite. Os tratamentos consistiram de três metodologias: AOAC (Association of Official Agricultural Chemists), caracterizada pela secagem em cápsulas de porcelana e pré-secagem; uso de areia analítica no processo de secagem e utilização de metodologia simplificada baseada no uso de placas de Petri com secagem direta em estufa, sem o uso de areia analítica e procedimento de pré-secagem. A análise estatística envolveu o teste F ao nível de significância de 5%, correlação de Pearson e coeficiente de concordância de Lin. Todas as metodologias mostraram acurácia na determinação da matéria seca para todos os tipos de leite, mas a metodologia simplificada foi superior em economia e menor tempo de análise.(AU)

Este estudio tuvo como objetivo evaluar la metodología simplificada de determinación de materia seca en tres tipos de leche. Los tratamientos consistieron en tres metodologías: AOAC (Association of Official Agricultural Chemists), caracterizada por pre-secado y secado en cápsulas de porcelana; uso de arena analítica en el proceso de secado y utilización de metodología simplificada basada en el uso de placas de Petri con secado directo en invernadero, sin el uso de arena analítica y procedimiento de pre secado. El análisis estadístico involucró la prueba F al nivel de significancia del 5%, correlación de Pearson y coeficiente de concordancia de Lin. Todas las metodologías mostraron precisión en la determinación de la materia seca para todos los tipos de leche, pero la metodología simplificada fue superior en economía y menor tiempo de análisis.(AU)

Evaluation of the accuracy and precision of the GE Dash 4000 oscillometric monitor for blood pressure measurement in anesthetized female dogs / Determinação da acurácia do monitor oscilométrico GE Dash 4000 na mensuração da pressão arterial em cadelas anestesiadas

Background: Indirect measurement of arterial blood pressure, such as the oscillometric method, is the most commonly used in clinical practice of dogs and cats. This method measures blood pressure values that are estimates of direct (invasive) arterial blood pressure values. Oscillometric devices are easy to use even for non-experienced personnel. However, there is considerable variation in accuracy and precision of blood pressure values measured by different oscillometric monitors. The present study aimed to determine the accuracy and precision of the GE Dash 4000 oscillometric monitor for arterial blood pressure measurement in anesthetized female dogs.Materials, Methods & Results:Sixteen healthy adult female dogs received 0.3 mg/kg morphine as premedication and were anesthetized with propofol and isoflurane. A 22-gauge catheter was introduced into the dorsal pedal artery and connected to a rigid tubular system and a pressure transducer filled with heparinized solution to allow direct (invasive) measurement of systolic (SAP), mean (MAP) and diastolic arterial pressure (DAP). A blood pressure cuff was positioned proximal to the carpus and connected to the oscillometric device (GE-DASH 4000 monitor) in order to obtain indirect measurements of SAP, MAP and DAP. Cuff width was 40% of limb circumference. During anesthesia, invasive arterial blood pressure values were measured and recorded simultaneously with the oscillometric method. The Bland Altman method was used to evaluate agreement between the methods by calculating the bias (invasive - oscillometric) and limits of agreement. Percentages of differences between the methods with an error ≤ 10 mmHg and ≤ 20 mmHg were calculated. Results were compared with the criteria from the American College of Veterinary Internal Medicine (ACVIM) for validation of noninvasive blood pressure methods.[...]

Evaluation of the accuracy and precision of the GE Dash 4000 oscillometric monitor for blood pressure measurement in anesthetized female dogs / Determinação da acurácia do monitor oscilométrico GE Dash 4000 na mensuração da pressão arterial em cadelas anestesiadas

Background: Indirect measurement of arterial blood pressure, such as the oscillometric method, is the most commonly used in clinical practice of dogs and cats. This method measures blood pressure values that are estimates of direct (invasive) arterial blood pressure values. Oscillometric devices are easy to use even for non-experienced personnel. However, there is considerable variation in accuracy and precision of blood pressure values measured by different oscillometric monitors. The present study aimed to determine the accuracy and precision of the GE Dash 4000 oscillometric monitor for arterial blood pressure measurement in anesthetized female dogs.Materials, Methods & Results:Sixteen healthy adult female dogs received 0.3 mg/kg morphine as premedication and were anesthetized with propofol and isoflurane. A 22-gauge catheter was introduced into the dorsal pedal artery and connected to a rigid tubular system and a pressure transducer filled with heparinized solution to allow direct (invasive) measurement of systolic (SAP), mean (MAP) and diastolic arterial pressure (DAP). A blood pressure cuff was positioned proximal to the carpus and connected to the oscillometric device (GE-DASH 4000 monitor) in order to obtain indirect measurements of SAP, MAP and DAP. Cuff width was 40% of limb circumference. During anesthesia, invasive arterial blood pressure values were measured and recorded simultaneously with the oscillometric method. The Bland Altman method was used to evaluate agreement between the methods by calculating the bias (invasive - oscillometric) and limits of agreement. Percentages of differences between the methods with an error ≤ 10 mmHg and ≤ 20 mmHg were calculated. Results were compared with the criteria from the American College of Veterinary Internal Medicine (ACVIM) for validation of noninvasive blood pressure methods.[...](AU)

Spatial variability of chemical attributes of soil cropped with soybean under no-tillage / Variabilidade espacial de atributos químicos do solo cultivado com soja sob plantio direto

During the 2012/2013 agricultural year, in the city of Campo Novo do Parecis, MT, the study aimed analyze the spatial variability of soybean and of the fertility attributes of Typic Tropudox under no-tillage. The sampling grid for data collect was installed in an area of 5.0 ha. The productivity of soybeans, plant population, organic matter, P, Ca+2, Mg+2, K+ , Al+3, H+ + Al+3, pH (CaCl2), sum bases, cation exchange capacity and base saturation were evaluated. A classic descriptive analysis was carried out with the help of the SAS statistical software, correlation and regression analysis with Excel and semivariograms were then modeled for all attributes, giving the respective cross-validations and kriging charts with the GS+ 7.0 software. Most surveyed attributes presented spatial dependence, and modeled their semivariograms by predominantly Gaussian type. The geostatistical ranges used for the attributes analyzed should not be less than 43.8 m, being the distance at which the attribute values are related to each other. The study of the variability of soil attributes and the adoption of techniques that help in the management of soil, such as geostatistics, is essential to proper plant development.

Durante o ano agrícola de 2012/2013, no município de Campo Novo do Parecis, MT, objetivou-se analisar a variabilidade espacial de atributos da soja e da fertilidade num Latossolo Vermelho distrófico típico cultivado sob plantio direto. Foi instalada a malha de amostragem para a coleta de dados numa área de 5,0 ha. Foram avaliadas a produtividade de grãos de soja, população de plantas, matéria orgânica, P, Ca+2, Mg+2, K+ , Al+3, H+ + Al+3, pH (CaCl2), soma de bases, capacidade de troca catiônica e saturação por bases. Efetuou-se a análise descritiva clássica, com auxílio do software estatístico SAS, análise de correlação e regressão com o Excel, sendo modelados semivariogramas para todos os atributos, obtendo-se as respectivas validações cruzadas e mapas de krigagens com o GS+ 7.0. A maior parte dos atributos pesquisados apresentou dependência espacial, sendo possível modelar seus respectivos semivariogramas, predominantemente do tipo gaussiano. Os alcances geoestatísticos utilizados para os atributos analisados não deverão ser inferiores a 43,8 m, por serem a distância na qual os valores dos atributos estão relacionados entre si. O estudo da variabilidade dos atributos do solo bem como a adoção de técnicas que auxiliem no manejo do solo, como a geoestatística, é essencial ao adequado desenvolvimento vegetal.

Spatial variability of chemical attributes of soil cropped with soybean under no-tillage / Variabilidade espacial de atributos químicos do solo cultivado com soja sob plantio direto

During the 2012/2013 agricultural year, in the city of Campo Novo do Parecis, MT, the study aimed analyze the spatial variability of soybean and of the fertility attributes of Typic Tropudox under no-tillage. The sampling grid for data collect was installed in an area of 5.0 ha. The productivity of soybeans, plant population, organic matter, P, Ca+2, Mg+2, K+ , Al+3, H+ + Al+3, pH (CaCl2), sum bases, cation exchange capacity and base saturation were evaluated. A classic descriptive analysis was carried out with the help of the SAS statistical software, correlation and regression analysis with Excel and semivariograms were then modeled for all attributes, giving the respective cross-validations and kriging charts with the GS+ 7.0 software. Most surveyed attributes presented spatial dependence, and modeled their semivariograms by predominantly Gaussian type. The geostatistical ranges used for the attributes analyzed should not be less than 43.8 m, being the distance at which the attribute values are related to each other. The study of the variability of soil attributes and the adoption of techniques that help in the management of soil, such as geostatistics, is essential to proper plant development.(AU)

Durante o ano agrícola de 2012/2013, no município de Campo Novo do Parecis, MT, objetivou-se analisar a variabilidade espacial de atributos da soja e da fertilidade num Latossolo Vermelho distrófico típico cultivado sob plantio direto. Foi instalada a malha de amostragem para a coleta de dados numa área de 5,0 ha. Foram avaliadas a produtividade de grãos de soja, população de plantas, matéria orgânica, P, Ca+2, Mg+2, K+ , Al+3, H+ + Al+3, pH (CaCl2), soma de bases, capacidade de troca catiônica e saturação por bases. Efetuou-se a análise descritiva clássica, com auxílio do software estatístico SAS, análise de correlação e regressão com o Excel, sendo modelados semivariogramas para todos os atributos, obtendo-se as respectivas validações cruzadas e mapas de krigagens com o GS+ 7.0. A maior parte dos atributos pesquisados apresentou dependência espacial, sendo possível modelar seus respectivos semivariogramas, predominantemente do tipo gaussiano. Os alcances geoestatísticos utilizados para os atributos analisados não deverão ser inferiores a 43,8 m, por serem a distância na qual os valores dos atributos estão relacionados entre si. O estudo da variabilidade dos atributos do solo bem como a adoção de técnicas que auxiliem no manejo do solo, como a geoestatística, é essencial ao adequado desenvolvimento vegetal.(AU)

Methods of analysis and number of replicates for trials with large numbers of soybean genotypes / Métodos de análise e número de repetições para ensaios com grande número de genótipos de soja

The aim of this study was to evaluate the experimental precision of different methods of statistical analysis for trials with large numbers of soybean genotypes, and their relationship with the number of replicates. Soybean yield data (nine trials; 324 genotypes; 46 cultivars; 278 lines; agricultural harvest of 2014/15) were used. Two of these trials were performed at the same location, side by side, forming a trial with six replicates. Each trial was analyzed by the randomized complete block, triple lattice design, and use of the Papadakis method. The selective accuracy, least significant difference, and Fasoulas differentiation index were estimated, and model assumptions were tested. The resampling method was used to study the influence of the number of replicates, by varying the number of blocks and estimating the precision measurements. The experimental precision indicators of the Papadakis method are more favorable as compared to the randomized complete block design and triple lattice. To obtain selective accuracy above the high experimental precision range in trials with 324 soybean genotypes, two repetitions can be used, and data can be analyzed using the randomized complete block design or Papadakis method.

O objetivo deste estudo foi avaliar a precisão experimental de diferentes métodos de análise estatística para ensaios com grande número de genótipos de soja e sua relação com o número de repetições. Foram usados dados de produtividade de grãos de soja (nove ensaios, 324 genótipos, 46 cultivares, 278 linhagens, safra agrícola de 2014/15). Dois destes ensaios foram realizados no mesmo local, lado a lado, constituindo um ensaio com seis repetições. Cada ensaio foi analisado pelos delineamentos de blocos ao acaso, látice triplo e uso do método de Papadakis. Foram estimados a acurácia seletiva, diferença mínima significativa e índice de diferenciação de Fasoulas, e, ainda foram testados os pressupostos do modelo. O método de reamostragem foi usado para estudar a influência do número de repetições, variando o número de blocos e estimando as medidas de precisão. Os indicadores de precisão experimental do método de Papadakis são mais favoráveis, quando comparados com os delineamentos de blocos ao acaso e látice triplo. Para obter acurácia seletiva acima da faixa de alta precisão experimental em ensaios com 324 genótipos de soja, pode-se usar duas repetições e analisar os dados, usando o delineamento de blocos completos ao acaso ou método de Papadakis.

Methods of analysis and number of replicates for trials with large numbers of soybean genotypes / Métodos de análise e número de repetições para ensaios com grande número de genótipos de soja

The aim of this study was to evaluate the experimental precision of different methods of statistical analysis for trials with large numbers of soybean genotypes, and their relationship with the number of replicates. Soybean yield data (nine trials; 324 genotypes; 46 cultivars; 278 lines; agricultural harvest of 2014/15) were used. Two of these trials were performed at the same location, side by side, forming a trial with six replicates. Each trial was analyzed by the randomized complete block, triple lattice design, and use of the Papadakis method. The selective accuracy, least significant difference, and Fasoulas differentiation index were estimated, and model assumptions were tested. The resampling method was used to study the influence of the number of replicates, by varying the number of blocks and estimating the precision measurements. The experimental precision indicators of the Papadakis method are more favorable as compared to the randomized complete block design and triple lattice. To obtain selective accuracy above the high experimental precision range in trials with 324 soybean genotypes, two repetitions can be used, and data can be analyzed using the randomized complete block design or Papadakis method.(AU)

O objetivo deste estudo foi avaliar a precisão experimental de diferentes métodos de análise estatística para ensaios com grande número de genótipos de soja e sua relação com o número de repetições. Foram usados dados de produtividade de grãos de soja (nove ensaios, 324 genótipos, 46 cultivares, 278 linhagens, safra agrícola de 2014/15). Dois destes ensaios foram realizados no mesmo local, lado a lado, constituindo um ensaio com seis repetições. Cada ensaio foi analisado pelos delineamentos de blocos ao acaso, látice triplo e uso do método de Papadakis. Foram estimados a acurácia seletiva, diferença mínima significativa e índice de diferenciação de Fasoulas, e, ainda foram testados os pressupostos do modelo. O método de reamostragem foi usado para estudar a influência do número de repetições, variando o número de blocos e estimando as medidas de precisão. Os indicadores de precisão experimental do método de Papadakis são mais favoráveis, quando comparados com os delineamentos de blocos ao acaso e látice triplo. Para obter acurácia seletiva acima da faixa de alta precisão experimental em ensaios com 324 genótipos de soja, pode-se usar duas repetições e analisar os dados, usando o delineamento de blocos completos ao acaso ou método de Papadakis.(AU)

Accuracy of quantitative polymerase chain reaction in samples of frozen and paraffin-embedded healthy skin for the diagnosis of canine visceral leishmaniasis / Acurácia da reação em cadeia da polimerase quantitativa em amostras de pele íntegra congelada e parafinada no diagnóstico da leishmaniose visceral canina

The purpose of the present work was to evaluate the accuracy of quantitative polymerase chain reaction (qPCR) performed on samples of fresh frozen tissue (FT) and formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) healthy skin. This is a validation study conducted with samples from 46 dogs from an endemic area in Brazil. After sample collection, DNA extractions were conducted using commercial kits and qPCR was oriented to kinetoplast DNA (kDNA) targets of the Leishmania infantum species. The results obtained for the FFPE samples showed 63.6% sensitivity and 77.1% specificity, whereas those obtained for the FT samples showed 100% and 48.6%, respectively. Poor agreement was observed for the results of the qPCR technique with FT and FFPE samples. Our results suggest freezing as the most suitable conservation method for the formation of sample databases considering DNA recovery.(AU)

O objetivo deste trabalho foi avaliar a acurácia da PCR quantitativa (qPCR) realizada em amostras de pele íntegra congelada (FT) e parafinada (FFPE). Trata-se de um estudo de validação, com amostras provenientes de 46 cães de uma área endêmica no Brasil. Após as coletas de amostras, as extrações de DNA foram realizadas utilizando-se kits comerciais, e a qPCR foi orientada para alvos do kDNA da espécie Leishmania infantum. Os resultados obtidos para as amostras FFPE foram 63,6% de sensibilidade e 77,1% de especificidade; para as amostras FT, 100% e 48,6%, respectivamente. A concordância dos resultados da técnica de qPCR com amostras FT e FFPE foi pobre. Os resultados sugerem que o congelamento é o método mais adequado de conservação para banco de amostras para recuperação de DNA.(AU)

Accuracy of quantitative polymerase chain reaction in samples of frozen and paraffin-embedded healthy skin for the diagnosis of canine visceral leishmaniasis / Acurácia da reação em cadeia da polimerase quantitativa em amostras de pele íntegra congelada e parafinada no diagnóstico da leishmaniose visceral canina

The purpose of the present work was to evaluate the accuracy of quantitative polymerase chain reaction (qPCR) performed on samples of fresh frozen tissue (FT) and formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) healthy skin. This is a validation study conducted with samples from 46 dogs from an endemic area in Brazil. After sample collection, DNA extractions were conducted using commercial kits and qPCR was oriented to kinetoplast DNA (kDNA) targets of the Leishmania infantum species. The results obtained for the FFPE samples showed 63.6% sensitivity and 77.1% specificity, whereas those obtained for the FT samples showed 100% and 48.6%, respectively. Poor agreement was observed for the results of the qPCR technique with FT and FFPE samples. Our results suggest freezing as the most suitable conservation method for the formation of sample databases considering DNA recovery.(AU)

O objetivo deste trabalho foi avaliar a acurácia da PCR quantitativa (qPCR) realizada em amostras de pele íntegra congelada (FT) e parafinada (FFPE). Trata-se de um estudo de validação, com amostras provenientes de 46 cães de uma área endêmica no Brasil. Após as coletas de amostras, as extrações de DNA foram realizadas utilizando-se kits comerciais, e a qPCR foi orientada para alvos do kDNA da espécie Leishmania infantum. Os resultados obtidos para as amostras FFPE foram 63,6% de sensibilidade e 77,1% de especificidade; para as amostras FT, 100% e 48,6%, respectivamente. A concordância dos resultados da técnica de qPCR com amostras FT e FFPE foi pobre. Os resultados sugerem que o congelamento é o método mais adequado de conservação para banco de amostras para recuperação de DNA.(AU)

Improving reproducibility and external validity: the role of standardization and data reporting of laboratory rat husbandry and housing

Purpose: To identify the most relevant flaws in standardization in husbandry practices and lack of transparency to report them. This review proposes some measures in order to improve transparency, reproducibility and eventually external validity in experimental surgery experiments with rat model. Methods: We performed a search of scientific articles in PUBMED data base. The survey was conducted from august 2016 to January 2017. The keywords used were "reproducibility", "external validity", "rat model", "rat husbandry", "rat housing", and the time frame was up to January 2017. Articles discarded were the ones which the abstract or the key words did not imply that the authors would discuss any relationship of husbandry and housing with the reproducibility and transparency of reporting animal experiment. Reviews and papers that discussed specifically reproducibility and data reporting transparency were laboriously explored, including references for other articles that could fulfil the inclusion criteria. A total of 246 articles were initially found but only 44 were selected. Results: Lack of transparency is the rule and not the exception when reporting results with rat model. This results in poor reproducibility and low external validity with the consequence of considerable loss of time and financial resources. There are still much to be done to improve compliance and adherence of researchers, editors and reviewers to adopt guidelines to mitigate some of the challenges that can impair reproducibility and external validity. Conclusions: Authors and reviewers should avoid pitfalls of absent, insufficient or inaccurate description of relevant information the rat model used. This information should be correctly published or reported on another source easily available for readers. Environmental conditions are well known by laboratory animal personnel and are well controlled in housing facilities, but usually neglected in experimental laboratories when the rat model is a novelty for the researcher.(AU)