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1.
Zoologia (Curitiba, Impr.) ; 39: e21029, 2022. tab, graf, ilus, mapas
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1410368

Resumo

This contribution endeavored to investigate the genetic structure and gene flow of the flood mosquito, Aedes vexans (Meigen, 1830). Using partial sequences of the mitochondrial COI gene, available from BOLD Systems and GenBank, the Haplotypic (Hd) and nucleotide (π) gene diversity, genetic structuring and gene flow of A. vexans at the global, continental, and country levels were calculated. In total, 1,184 sequences were obtained, distributed among America (88.60%; represented by EUA and Canada), Europe (7.35%), Asia (3.89%), and Africa (0.17%). From these, 395 haplotypes (H) without presence of pseudogenes (NUMTs) were detected. The cluster analyses grouped the haplotypes into six clades. Clade I includes haplotypes from countries in America and Europe, while clades II and III include haplotypes exclusively from Asia and Europe; clade IV grouped only one haplotype from Africa and clade V grouped haplotypes from America and Africa. The global Hd and π were 0.92 and 0.01, respectively. In addition, there is evidence of genetic structuring among continents (7.07%), countries (1.62%), and within countries (91.30%; FST = 0.08, p < 0.05) and no isolation by distance was detected (r = 0.003, p > 0.05). The genetic diversity of A. vexans was found to be greater in North America than in other continents. Although this provisional conclusion might be influenced by a sample bias, since 88.60% of the sequences are from America, is also plausible to consider that America corresponds to the ancestral distribution area of the flood mosquito. This hypothesis needs further testing, using a more comprehensive sample from other continents. Additionally, the six clusters found and their geographical distribution do not support previous proposals of splitting the genus into three subspecies confined to certain geographical areas.


Assuntos
Animais , Variação Genética , DNA Mitocondrial/análise , Culicidae/classificação , Culicidae/genética , Filogeografia
2.
Arq. Ciênc. Vet. Zool. UNIPAR (Online) ; 24(1, cont.): e2402, jan-jun. 2021. ilus
Artigo em Português | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1222351

Resumo

O abutre real (Sarcoramphus papa) é um pássaro compacto de cor extraordinária, cabeça nua, possui carúnculas e papilas carnudas vermelhas e alaranjadas em torno do bico, a íris é branca com um anel orbital vermelho. Em cativeiro, o estresse é uma condição bastante observada, o que pode levar a automutilação, podendo evoluir para lesões graves na pele e músculos. O objetivo do presente relato é descrever os procedimentos adotados em um caso de automutilação em Sarcoramphus papa, mantido em cativeiro, e a importância do manejo adequado para essa espécie em cativeiro. Foi atendido em um Hospital Veterinário Universitário, um urubu-rei apresentando ferimento contaminado, com exposição óssea na asa direita. Após tratamento o animal foi encaminhado para uma reserva conservacionista para que fosse condicionada a voltar para seu habitat natural.(AU)


The king vulture (Sarcoramphus papa) is a large bird with extraordinary color, bold head, presenting red and orange fleshy papules and papillae around its beak, with white iris and a red orbital ring. In captivity, stress is a condition that is widely observed, which can lead to self-mutilation. Such mutilation, in turn, can progress to severe skin and muscle injuries. The purpose of this report is to describe the procedures adopted in a case of self-mutilation in Sarcoramphus papa, kept in captivity, and the importance of proper management for this species in captivity. The king vulture presenting a contaminated wound with bone exposure on the right wing was treated at a University Veterinary Hospital. After treatment, the bird was sent to a conservation reserve to be conditioned to return to its natural habitat.(AU)


El buitre real (Sarcoramphus papa) es un ave compacta de extraordinario color, cabeza descubierta, tiene carúnculas y papilas carnosas rojas y anaranjadas alrededor del pico, el iris es blanco con un anillo orbital rojo. En cautiverio, el estrés es una condición ampliamente observada, que puede conducir a la automutilación, pudiendo progresar lesiones graves en la piel y músculos. El propósito de este informe es describir los procedimientos adoptados en un caso de automutilación en Sarcoramphus papa, mantenida en cautiverio, y la importancia del manejo adecuado de esta especie en cautiverio. Se atendió en un Hospital Veterinario Universitario, un buitre real presentando una herida contaminada, con exposición ósea en el ala derecha. Luego después del tratamiento, se envió el animal a una reserva de conservación para que fuera condicionado a volver a su hábitat natural.(AU)


Assuntos
Animais , Automutilação , Ferimentos e Lesões , Aves/lesões , Bem-Estar do Animal
3.
Arq. ciênc. vet. zool. UNIPAR ; 24: e2402, jan.-jun. 2021. ilus
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-765243

Resumo

O abutre real (Sarcoramphus papa) é um pássaro compacto de cor extraordinária, cabeça nua, possui carúnculas e papilas carnudas vermelhas e alaranjadas em torno do bico, a íris é branca com um anel orbital vermelho. Em cativeiro, o estresse é uma condição bastante observada, o que pode levar a automutilação, podendo evoluir para lesões graves na pele e músculos. O objetivo do presente relato é descrever os procedimentos adotados em um caso de automutilação em Sarcoramphus papa, mantido em cativeiro, e a importância do manejo adequado para essa espécie em cativeiro. Foi atendido em um Hospital Veterinário Universitário, um urubu-rei apresentando ferimento contaminado, com exposição óssea na asa direita. Após tratamento o animal foi encaminhado para uma reserva conservacionista para que fosse condicionada a voltar para seu habitat natural.(AU)


The king vulture (Sarcoramphus papa) is a large bird with extraordinary color, bold head, presenting red and orange fleshy papules and papillae around its beak, with white iris and a red orbital ring. In captivity, stress is a condition that is widely observed, which can lead to self-mutilation. Such mutilation, in turn, can progress to severe skin and muscle injuries. The purpose of this report is to describe the procedures adopted in a case of self-mutilation in Sarcoramphus papa, kept in captivity, and the importance of proper management for this species in captivity. The king vulture presenting a contaminated wound with bone exposure on the right wing was treated at a University Veterinary Hospital. After treatment, the bird was sent to a conservation reserve to be conditioned to return to its natural habitat.(AU)


El buitre real (Sarcoramphus papa) es un ave compacta de extraordinario color, cabeza descubierta, tiene carúnculas y papilas carnosas rojas y anaranjadas alrededor del pico, el iris es blanco con un anillo orbital rojo. En cautiverio, el estrés es una condición ampliamente observada, que puede conducir a la automutilación, pudiendo progresar lesiones graves en la piel y músculos. El propósito de este informe es describir los procedimientos adoptados en un caso de automutilación en Sarcoramphus papa, mantenida en cautiverio, y la importancia del manejo adecuado de esta especie en cautiverio. Se atendió en un Hospital Veterinario Universitario, un buitre real presentando una herida contaminada, con exposición ósea en el ala derecha. Luego después del tratamiento, se envió el animal a una reserva de conservación para que fuera condicionado a volver a su hábitat natural.(AU)


Assuntos
Animais , Automutilação , Ferimentos e Lesões , Aves/lesões , Bem-Estar do Animal
4.
Arq. ciênc. vet. zool. UNIPAR ; 24: e2402, jan.-jun. 2021. ilus
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-31916

Resumo

O abutre real (Sarcoramphus papa) é um pássaro compacto de cor extraordinária, cabeça nua, possui carúnculas e papilas carnudas vermelhas e alaranjadas em torno do bico, a íris é branca com um anel orbital vermelho. Em cativeiro, o estresse é uma condição bastante observada, o que pode levar a automutilação, podendo evoluir para lesões graves na pele e músculos. O objetivo do presente relato é descrever os procedimentos adotados em um caso de automutilação em Sarcoramphus papa, mantido em cativeiro, e a importância do manejo adequado para essa espécie em cativeiro. Foi atendido em um Hospital Veterinário Universitário, um urubu-rei apresentando ferimento contaminado, com exposição óssea na asa direita. Após tratamento o animal foi encaminhado para uma reserva conservacionista para que fosse condicionada a voltar para seu habitat natural.(AU)


The king vulture (Sarcoramphus papa) is a large bird with extraordinary color, bold head, presenting red and orange fleshy papules and papillae around its beak, with white iris and a red orbital ring. In captivity, stress is a condition that is widely observed, which can lead to self-mutilation. Such mutilation, in turn, can progress to severe skin and muscle injuries. The purpose of this report is to describe the procedures adopted in a case of self-mutilation in Sarcoramphus papa, kept in captivity, and the importance of proper management for this species in captivity. The king vulture presenting a contaminated wound with bone exposure on the right wing was treated at a University Veterinary Hospital. After treatment, the bird was sent to a conservation reserve to be conditioned to return to its natural habitat.(AU)


El buitre real (Sarcoramphus papa) es un ave compacta de extraordinario color, cabeza descubierta, tiene carúnculas y papilas carnosas rojas y anaranjadas alrededor del pico, el iris es blanco con un anillo orbital rojo. En cautiverio, el estrés es una condición ampliamente observada, que puede conducir a la automutilación, pudiendo progresar lesiones graves en la piel y músculos. El propósito de este informe es describir los procedimientos adoptados en un caso de automutilación en Sarcoramphus papa, mantenida en cautiverio, y la importancia del manejo adecuado de esta especie en cautiverio. Se atendió en un Hospital Veterinario Universitario, un buitre real presentando una herida contaminada, con exposición ósea en el ala derecha. Luego después del tratamiento, se envió el animal a una reserva de conservación para que fuera condicionado a volver a su hábitat natural.(AU)


Assuntos
Animais , Automutilação , Ferimentos e Lesões , Aves/lesões , Bem-Estar do Animal
5.
Artigo em Inglês | LILACS-Express | VETINDEX | ID: biblio-1483318

Resumo

ABSTRACT Crane flies are the most diverse group within Diptera, but they are rarely studied in coastal ecosystems. Considering the scarcity of information on the biology and ecology of this group in the Neotropics, and the sparse literature available for taxonomic identification, we developed a descriptive checklist that incorporates morphology and DNA barcoding. We also created a generic identification key for crane flies of southern Brazilian salt marshes. We sampled crane flies continuously at three areas along the Patos Lagoon salt marshes over one year. A total of 14 genera/subgenera, 6 species, and 12 morphotypes belonging to Limoniidae and Tipulidae were identified. Distribution ranges of Symplecta cana (Walker, 1848) and two Ormosia Rondani, 1856 species were expanded. mtDNA COI sequences were compared to the BOLD and NCBI databases, but were matched only at the family level. Therefore, we provided sequences to both platforms, updated to the genus level. We found low (0.00-0.03) intraspecific and high (0.11-0.25) interspecific molecular differences indicating that the mtDNA COI region is adequate for distinguishing species within the Tipuloidea. The Dicranomyia Stephens, 1829 species complex showed low genetic difference, indicating that they could be one species with high morphological plasticity. This study will serve as a basis for future research on insects of Neotropical salt marshes.

6.
Zoologia (Curitiba, Impr.) ; 36: e.34604, Apr. 18, 2019. ilus, tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1504561

Resumo

Larvae of many-plumed moths (Alucitidae), especially in the world-wide genus Alucita Linnaeus, 1758 are known as borers or gall-inducers on flowers, fruits and shoots of a few dicotyledonous families, including Bignoniaceae, Caprifoliaceae and Rubiaceae. However, there is no study available on the biology of the monotypic, Neotropical genus Prymnotomis Meyrick, 1931 except for its original description that was based on a single male, the holotype of Prymnotomis crypsicroca Meyrick, 1931 from Espirito Santo, Brazil. We describe here a second species for this genus, Prymnotomis cecidicola sp. nov. whose larvae induce galls on Cordiera elliptica (Cham.) Kuntze (Rubiaceae), a dioecious plant with dimorphic inflorescences found in the Brazilian Cerrado, Planaltina City, Federal District. Adults, larvae, pupae and galls are illustrated under light and scanning electron microscopy. Galls are green, spherical, unilocular and develop individually on C. elliptica flower buds. During development they look like fruits in shape and colour but are larger, do not have style scars when on female plants, and are induced also in male inflorescences. Pupation occurs outside the gall within a silk cocoon, presumably in the litter. A preliminary analysis of DNA barcode sequences including putative members of other alucitid lineages and Neotropical BINs (Barcode Index Number) supports Prymnotomis cecidicola sp. nov. as an independent phylogenetic unit, with 12 to 18% divergence. Its nearest-neighbour was the BIN cluster 5 (BOLD:AAA0842) that includes specimens from Costa Rica.


Assuntos
Animais , Lepidópteros/anatomia & histologia , Lepidópteros/classificação , Brasil , Pradaria
7.
Zoologia (Curitiba) ; 36: e.34604, Nov. 25, 2019. ilus, tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-24608

Resumo

Larvae of many-plumed moths (Alucitidae), especially in the world-wide genus Alucita Linnaeus, 1758 are known as borers or gall-inducers on flowers, fruits and shoots of a few dicotyledonous families, including Bignoniaceae, Caprifoliaceae and Rubiaceae. However, there is no study available on the biology of the monotypic, Neotropical genus Prymnotomis Meyrick, 1931 except for its original description that was based on a single male, the holotype of Prymnotomis crypsicroca Meyrick, 1931 from Espirito Santo, Brazil. We describe here a second species for this genus, Prymnotomis cecidicola sp. nov. whose larvae induce galls on Cordiera elliptica (Cham.) Kuntze (Rubiaceae), a dioecious plant with dimorphic inflorescences found in the Brazilian Cerrado, Planaltina City, Federal District. Adults, larvae, pupae and galls are illustrated under light and scanning electron microscopy. Galls are green, spherical, unilocular and develop individually on C. elliptica flower buds. During development they look like fruits in shape and colour but are larger, do not have style scars when on female plants, and are induced also in male inflorescences. Pupation occurs outside the gall within a silk cocoon, presumably in the litter. A preliminary analysis of DNA barcode sequences including putative members of other alucitid lineages and Neotropical BINs (Barcode Index Number) supports Prymnotomis cecidicola sp. nov. as an independent phylogenetic unit, with 12 to 18% divergence. Its nearest-neighbour was the BIN cluster 5 (BOLD:AAA0842) that includes specimens from Costa Rica.(AU)


Assuntos
Animais , Lepidópteros/anatomia & histologia , Lepidópteros/classificação , Pradaria , Brasil
8.
Iheringia. Sér. Zool. ; 109: e2019013, 20190328. mapas, graf, tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-762679

Resumo

Crane flies are the most diverse group within Diptera, but they are rarely studied in coastal ecosystems. Considering the scarcity of information on the biology and ecology of this group in the Neotropics, and the sparse literature available for taxonomic identification, we developed a descriptive checklist that incorporates morphology and DNA barcoding. We also created a generic identification key for crane flies of southern Brazilian salt marshes. We sampled crane flies continuously at three areas along the Patos Lagoon salt marshes over one year. A total of 14 genera/subgenera, 6 species, and 12 morphotypes belonging to Limoniidae and Tipulidae were identified. Distribution ranges of Symplecta cana (Walker, 1848) and two Ormosia Rondani, 1856 species were expanded. mtDNA COI sequences were compared to the BOLD and NCBI databases, but were matched only at the family level. Therefore, we provided sequences to both platforms, updated to the genus level. We found low (0.00-0.03) intraspecific and high (0.11-0.25) interspecific molecular differences indicating that the mtDNA COI region is adequate for distinguishing species within the Tipuloidea. The Dicranomyia Stephens, 1829 species complex showed low genetic difference, indicating that they could be one species with high morphological plasticity. This study will serve as a basis for future research on insects of Neotropical salt marshes.(AU)


Assuntos
Animais , Dípteros/genética , Áreas Alagadas , Código de Barras de DNA Taxonômico , Complexo IV da Cadeia de Transporte de Elétrons
9.
Iheringia, Sér. zool ; 109: e2019013, 20190328. map, graf, tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1483267

Resumo

Crane flies are the most diverse group within Diptera, but they are rarely studied in coastal ecosystems. Considering the scarcity of information on the biology and ecology of this group in the Neotropics, and the sparse literature available for taxonomic identification, we developed a descriptive checklist that incorporates morphology and DNA barcoding. We also created a generic identification key for crane flies of southern Brazilian salt marshes. We sampled crane flies continuously at three areas along the Patos Lagoon salt marshes over one year. A total of 14 genera/subgenera, 6 species, and 12 morphotypes belonging to Limoniidae and Tipulidae were identified. Distribution ranges of Symplecta cana (Walker, 1848) and two Ormosia Rondani, 1856 species were expanded. mtDNA COI sequences were compared to the BOLD and NCBI databases, but were matched only at the family level. Therefore, we provided sequences to both platforms, updated to the genus level. We found low (0.00-0.03) intraspecific and high (0.11-0.25) interspecific molecular differences indicating that the mtDNA COI region is adequate for distinguishing species within the Tipuloidea. The Dicranomyia Stephens, 1829 species complex showed low genetic difference, indicating that they could be one species with high morphological plasticity. This study will serve as a basis for future research on insects of Neotropical salt marshes.


Assuntos
Animais , Complexo IV da Cadeia de Transporte de Elétrons , Código de Barras de DNA Taxonômico , Dípteros/genética , Áreas Alagadas
10.
Acta sci., Biol. sci ; 40: e39401, 20180000. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS-Express | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1460838

Resumo

The ability of microalgae to grow heterotrophically lies in the ability to oxidize organic compounds present in the external environment. The aim of this work was to evaluate the growth of Chlorella vulgaris under heterotrophic culture conditions using Basal Bold and NPK media supplemented with different sole carbon sources (glucose, fructose, sucrose, glycerol or acetate). The kinetic parameters obtained were maximum specific growth rate (μmax), doubling time (DT), maximal absorbance, which was also converted to cell concentration values using a linear relation, and cell productivity (PX). Among all the treatments analyzed, the highest maximum specific growth rate found was 0.030 hour-1 (0.72 day-1) in the treatment using Basal Bold medium supplemented with glucose. The highest cellular concentration and cell productivity were also found for this same treatment (4.03 x 106 cell mL-1 and 64.0 x 106 cell L-1 day-1, respectively). It was concluded that that the Basal Bold medium was more efficient for Chlorella vulgaris growth, since it induced higher values of μmax and cellular concentration. Results obtained were very reproducible using microplate assay.


A capacidade das microalgas de crescer heterotroficamente reside na habilidade de oxidar compostos orgânicos presentes no ambiente externo. O objetivo deste trabalho foi avaliar o crescimento de Chlorella vulgaris em condições heterotróficas de cultura, usando meios Basal Bold e NPK, suplementados com diferentes fontes de carbono (glicose, frutose, sacarose, glicerol ou acetato). Os parâmetros cinéticos obtidos foram a velocidade específica máxima de crescimento (μmax), tempo de duplicação (TD), absorbância máxima, sendo que esta última também foi convertida em valores de concentração celular, usando uma relação linear e produtividade celular (PX). Entre todos os tratamentos analisados, a maior velocidade específica máxima de crescimento encontrada foi de 0,030 h-1 (0,72 dia-1) no tratamento usando o meio Basal Bold suplementado com glicose. A maior concentração celular e a maior produtividade celular também foram encontradas para esse mesmo tratamento (4,03 x 106 cel mL-1 e 64,0 x 106 cel L-1 dia-1, respectivamente). Concluiu-se que o meio Basal Bold foi mais eficiente para o crescimento de Chlorella vulgaris, pois induziu valores mais elevados de μmax e de concentração celular. Os resultados obtidos foram muito reproduzíveis, utilizando o ensaio de microplacas.

11.
Acta Sci. Biol. Sci. ; 40: e39401, 2018. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-15991

Resumo

The ability of microalgae to grow heterotrophically lies in the ability to oxidize organic compounds present in the external environment. The aim of this work was to evaluate the growth of Chlorella vulgaris under heterotrophic culture conditions using Basal Bold and NPK media supplemented with different sole carbon sources (glucose, fructose, sucrose, glycerol or acetate). The kinetic parameters obtained were maximum specific growth rate (μmax), doubling time (DT), maximal absorbance, which was also converted to cell concentration values using a linear relation, and cell productivity (PX). Among all the treatments analyzed, the highest maximum specific growth rate found was 0.030 hour-1 (0.72 day-1) in the treatment using Basal Bold medium supplemented with glucose. The highest cellular concentration and cell productivity were also found for this same treatment (4.03 x 106 cell mL-1 and 64.0 x 106 cell L-1 day-1, respectively). It was concluded that that the Basal Bold medium was more efficient for Chlorella vulgaris growth, since it induced higher values of μmax and cellular concentration. Results obtained were very reproducible using microplate assay.(AU)


A capacidade das microalgas de crescer heterotroficamente reside na habilidade de oxidar compostos orgânicos presentes no ambiente externo. O objetivo deste trabalho foi avaliar o crescimento de Chlorella vulgaris em condições heterotróficas de cultura, usando meios Basal Bold e NPK, suplementados com diferentes fontes de carbono (glicose, frutose, sacarose, glicerol ou acetato). Os parâmetros cinéticos obtidos foram a velocidade específica máxima de crescimento (μmax), tempo de duplicação (TD), absorbância máxima, sendo que esta última também foi convertida em valores de concentração celular, usando uma relação linear e produtividade celular (PX). Entre todos os tratamentos analisados, a maior velocidade específica máxima de crescimento encontrada foi de 0,030 h-1 (0,72 dia-1) no tratamento usando o meio Basal Bold suplementado com glicose. A maior concentração celular e a maior produtividade celular também foram encontradas para esse mesmo tratamento (4,03 x 106 cel mL-1 e 64,0 x 106 cel L-1 dia-1, respectivamente). Concluiu-se que o meio Basal Bold foi mais eficiente para o crescimento de Chlorella vulgaris, pois induziu valores mais elevados de μmax e de concentração celular. Os resultados obtidos foram muito reproduzíveis, utilizando o ensaio de microplacas.(AU)

12.
Neotrop. ichthyol ; 15(4): e170097, 2017. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-895108

Resumo

A fundamental challenge for both sustainable fisheries and biodiversity protection in the Neotropics is the accurate determination of species identity. The biodiversity of the coastal sharks of Guyana is poorly understood, but these species are subject to both artisanal fishing as well as harvesting by industrialized offshore fleets. To determine what species of sharks are frequently caught and consumed along the coastline of Guyana, we used DNA barcoding to identify market specimens. We sequenced the mitochondrial co1 gene for 132 samples collected from six markets, and compared our sequences to those available in the Barcode of Life Database (BOLD) and GenBank. Nearly 30% of the total sample diversity was represented by two species of Hammerhead Sharks (Sphyrna mokarran and S. lewini), both listed as Endangered by the International Union for Conservation of Nature (IUCN). Other significant portions of the samples included Sharpnose Sharks (23% - Rhizoprionodon spp.), considered Vulnerable in Brazilian waters due to unregulated gillnet fisheries, and the Smalltail Shark (17% - Carcharhinus porosus). We found that barcoding provides efficient and accurate identification of market specimens in Guyana, making this study the first in over thirty years to address Guyana's coastal shark biodiversity.(AU)


Um desafio fundamental para a pesca sustentável e a proteção da biodiversidade nos neotrópicos é a identificação precisa das espécies. A biodiversidade dos tubarões costeiros da Guiana é pouco compreendida, porém essas espécies estão sujeitas tanto à pesca artesanal quanto à pesca industrializada não costeira. Para determinar quais espécies de tubarões são frequentemente capturadas e consumidas ao longo do litoral da Guiana, utilizamos DNA barcoding para identificar espécimes comumente encontrados e adquiridos em mercados. Nós sequenciamos o gene mitocondrial coI para 132 espécimes adquiridos de seis mercados e comparamos estas sequências com as disponíveis no Barcode of Life Database (BOLD) e GenBank. Quase 30% da diversidade total amostrada foi constituída por duas espécies de tubarões martelo (Sphyrna mokarran e S. lewini), ambas listadas como espécies ameaçadas pela UICN. Outras porções significativas da amostragem incluem Cações-Frango (23% - Rhizoprionodon spp.), considerados vulneráveis em águas brasileiras, devido a pesca de arrasto não regulamentada, e o Cação-azeiteiro (17% - Carcharhinus porosus). Descobrimos que o barcoding é uma forma identificação eficiente e precisa para espécimes de mercado na Guiana, tornando este estudo o pioneiro na documentação da biodiversidade dos tubarões costeiros da Guiana.(AU)


Assuntos
Código de Barras de DNA Taxonômico/métodos , Tubarões/classificação , Tubarões/genética , Biodiversidade , Elasmobrânquios
13.
Neotrop. ichthyol ; 15(4): [e170097], dez. 2017. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-18827

Resumo

A fundamental challenge for both sustainable fisheries and biodiversity protection in the Neotropics is the accurate determination of species identity. The biodiversity of the coastal sharks of Guyana is poorly understood, but these species are subject to both artisanal fishing as well as harvesting by industrialized offshore fleets. To determine what species of sharks are frequently caught and consumed along the coastline of Guyana, we used DNA barcoding to identify market specimens. We sequenced the mitochondrial co1 gene for 132 samples collected from six markets, and compared our sequences to those available in the Barcode of Life Database (BOLD) and GenBank. Nearly 30% of the total sample diversity was represented by two species of Hammerhead Sharks (Sphyrna mokarran and S. lewini), both listed as Endangered by the International Union for Conservation of Nature (IUCN). Other significant portions of the samples included Sharpnose Sharks (23% - Rhizoprionodon spp.), considered Vulnerable in Brazilian waters due to unregulated gillnet fisheries, and the Smalltail Shark (17% - Carcharhinus porosus). We found that barcoding provides efficient and accurate identification of market specimens in Guyana, making this study the first in over thirty years to address Guyana's coastal shark biodiversity.(AU)


Um desafio fundamental para a pesca sustentável e a proteção da biodiversidade nos neotrópicos é a identificação precisa das espécies. A biodiversidade dos tubarões costeiros da Guiana é pouco compreendida, porém essas espécies estão sujeitas tanto à pesca artesanal quanto à pesca industrializada não costeira. Para determinar quais espécies de tubarões são frequentemente capturadas e consumidas ao longo do litoral da Guiana, utilizamos DNA barcoding para identificar espécimes comumente encontrados e adquiridos em mercados. Nós sequenciamos o gene mitocondrial coI para 132 espécimes adquiridos de seis mercados e comparamos estas sequências com as disponíveis no Barcode of Life Database (BOLD) e GenBank. Quase 30% da diversidade total amostrada foi constituída por duas espécies de tubarões martelo (Sphyrna mokarran e S. lewini), ambas listadas como espécies ameaçadas pela UICN. Outras porções significativas da amostragem incluem Cações-Frango (23% - Rhizoprionodon spp.), considerados vulneráveis em águas brasileiras, devido a pesca de arrasto não regulamentada, e o Cação-azeiteiro (17% - Carcharhinus porosus). Descobrimos que o barcoding é uma forma identificação eficiente e precisa para espécimes de mercado na Guiana, tornando este estudo o pioneiro na documentação da biodiversidade dos tubarões costeiros da Guiana.(AU)


Assuntos
Animais , Tubarões/genética , Tubarões/classificação , Código de Barras de DNA Taxonômico/métodos , Elasmobrânquios , Biodiversidade
14.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-219219

Resumo

O objetivo deste trabalho foi classificar juvenis de tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus) por personalidade e realizar testes de exploração e competição entre os indivíduos das diferentes personalidades frente à desafios. Foram utilizadas 324 tilápias para a classificação de personalidade utilizando o teste de novo ambiente, que foi realizado até a obtenção de 60 animais bold e 60 shy. Após a seleção, os animais foram identificados com microchip e divididos em seis tanques de 200L em sistema de recirculação, sendo 20 animais por tanque e divididos por personalidade. Foram realizados dois testes: o teste do novo objeto que consistiu na seleção de dois amimais aleatórios, bold e shy. Estes foram transferidos para o tanque de teste e verificado qual se aproximava do objeto colocado no tanque. O segundo teste foi o de competição por alimento. Em um tanque de 200L, na região central, foi adicionado um cilindro transparente, contendo um orifício quadrado na sua região central, com espaço suficiente para a passagem de um peixe. Um animal bold e um shy foram colocados ao mesmo tempo para cada teste. Após 10 min de aclimatação, foi adicionado um pellet de ração no interior do cilindro. Quando o pellet era capturado, era anotado o tempo. Em seguida era adicionado outro pellet de ração. Após o consumo do segundo pellet era adicionado um terceiro e novamente realizada as observações. O tempo total adotado para o consumo dos três pellets foi de 20 min. No primeiro teste, animais com personalidade bold, apresentaram um tempo médio de aproximação ao novo objeto menor em relação aos animais com personalidade shy (p < 0.001). Em relação aos 60 testes realizados com as duplas bold e shy, 65 % bolds e 21,6% shys chegaram primeiro ao objeto. Em 13,3% dos testes nenhum dos animais se aproximou do objeto. Para o teste de competição por alimento, verificou-se que para a primeira alimentação (Pellet 1), os animais de personalidade bold obtiveram uma média de tempo menor em relação aos animais com personalidade shy (p < 0,001). Já, na segunda alimentação (Pellet 2), os dados não apresentaram diferença estatística (p = 0,1733). O mesmo registrado para o pellet 1 foi observado para a terceira alimentação (Pellet 3) (p = 0,001). A média de animais de personalidade bold que capturaram o pellet 1 foi maior (58,4%) comparada ao shy (33,3%). De maneira geral os animais bold se mostraram mais exploradores aos dois tipos de desafios.


In the study of behavior, the terms used to differentiate animals by personality are bold and shy or proactive and reactive, respectively. The objective of this work was to classify Nile tilapia (Oreochromis niloticus) juveniles by personality and to conduct exploration and competition tests among individuals of different personalities in the face of challenges. For the personality classification with the new environment test, 324 tilapias were used. The test was carried out until 60 bold and 60 shy animals were obtained. After selection, the animals were identified with a microchip and divided into six tanks of 200L in a recirculation system, with 20 animals per tank and divided by personality. Two tests were carried out: the test of the new object which consisted of the selection of two random animals, bold and shy. These animals were transferred to the test tank and checked which one approached to the object placed in the tank. The second test was the competition for food. In a 200L tank, a transparent cylinder was placed in the central region, the cylinder contained a square hole in its central region with enough space for the passage of a fish. A bold and a shy animal were placed at the same time in the tank for each test. After 10 min of acclimatization, a feed pellet was added inside the cylinder. When the pellet was captured by the fish, the time was recorded, and another feed pellet was added. After consuming the second pellet, a third one was added, and observations were again made. The total time taken to consume the three pellets was 20 min. In the first test, animals with a bold personality showed a shorter average approach time to the new object compared to animals with a shy personality (p <0.001). Regarding the 60 tests carried out with the pairs "bold" and "shy", 65% "bold" and 21.6% "shy" arrived at the object first. 13.3% of the tests none of the animals approached the object. For the competition test for food, it was found that for the first feeding (Pellet 1), animals with a bold personality obtained a shorter average time compared to animals with a shy personality (p <0.001). In the second feeding (Pellet 2), the data did not show a statistical difference (p = 0.1733). The same verified to pellet 1 was observed for the third feeding (Pellet 3) (p = 0.001). The average number of bold animals that captured pellet 1 was higher (58.4%) compared to shy (33.3%). In general, the bold animals proved to be more exploitative to both types of challenges.

15.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-219149

Resumo

O presente estudo objetivou identificar as espécies de elasmobrânquios demersais de profundidade capturadas no talude continental do Estado de Pernambuco e analisar a distribuição e abundância relativa, correlacionando as mesmas com informações biológicas sobre a reprodução, com foco nas espécies da família Squalidae. As capturas foram realizadas entre as latitudes 7°1545-9°2818S e as longitudes 34°4835- 41°1954W, nordeste do Brasil, com base em prospecções pesqueiras realizadas entre 2014 e 2018, utilizando armadilhas de fundo (covos) e espinhel de fundo em profundidades entre 200 a 600 m. Foram capturados 261 exemplares, representados por sete espécies, pertencentes a três ordens. Todos os Squaliformes pertenciam a família Squalidae e apresentaram o maior número de indivíduos: Squalus cubensis (47,5%), Squalus bahiensis (20,1%) e Cirrhigaleus asper (9,3%). A ordem Carcharhiniformes teve um representante para as famílias Carcharhinidae, Carcharhinus signatus (1,1%), Triakidae, Mustelus canis (1,9%), e Scyliorhinidae, Scyliorhinus sp. (19,7%). Já a ordem Hexanchiformes foi representada por um único exemplar da espécie Heptranchias perlo (0,4%). Exemplares de todas as espécies, ou partes destes, foram retidos para composição de coleções cientificas ou didáticas. As espécies Squalus bahiensis e S. cubensis tiveram seus códigos genéticos acessados e disponibilizados na base de dados Barcode of Life Data (BOLD), constituindo cerca de 50 novas sequencias do gene cytochrome c oxidase subunit I (COI). Essas duas espécies tiveram a extensão da área de ocorrência devidamente registrada. Cento e dez indivíduos de S. cubensis tiveram seus aspectos reprodutivos avaliados. Diferenças estatisticamente significativas em relação ao gênero não foram observadas para o total de animais capturados, nem tão pouco para aqueles que estavam capazes de se reproduzir ou eram embriões. As fêmeas encontraram-se em cinco estágios maturacionais e os machos em quatro, não sendo observado nenhum animal em repouso. O comprimento total dos exemplares examinados variou de 231 mm a 860 mm = 613 mm) para fêmeas, e de 244 mm a 542 mm = 485 mm), para os machos. As fêmeas apresentaram picos reprodutivos em abril e novembro. O tamanho de primeira maturação das fêmeas foi estimado em 571,4 mm, enquanto que dos machos o valor médio foi igual a 452,1 mm. O estudo revela uma população adulta nas profundidades de captura, o que pode revelar sítios de agregações reprodutivas. Este estudo revela a importância biológica do talude superior de Pernambuco como hotspots ecológicos, servindo de base para estratégias de manejo e conservação no Atlântico tropical.


The present study aimed to identify deep-water elasmobranch species caught in the breakdown continental slope off Pernambuco State and to analyze their distribution and relative abundance, correlating them with biological aspects of reproduction, with emphasis on Squalidae family. Catches were made between the coordinates 7°1545-9°2818S and 34°4835- 41°1954W, northeastern Brazil, based on deep-sea fishing surveys conducted between 2014 and 2018 using as fishing gear bottom longlines and traps (covos) at depths ranging from 200 to 600 m. A total of 261 specimens were collected, represented by 7 species, belonging to 3 orders. All Squaliformes specimens belonged to Squalidae family and show the largest number of individuals: Squalus cubensis (47.5%), Squalus bahiensis (20.%) and Cirrhigaleus asper (9.3%). The order Carcharhiniformes had representative for Carcharhinidae, Triakidae and Scyliorhinidae family: Carcharhinus signatus (1.1%), Mustelus canis (1.9%) and Scyliorhinus sp. (19.7%), respectively. The order Hexanchiformes was represented by a single specimen, the Hexanchidae Heptranchias perlo (0.4%). Samples of all species, or subsamples of them, were retained to compose scientific or didactic collections. Squalus bahiensis and S. cubensis species had their genetic codes accessed and made available in the Barcode of Life Data (BOLD), constituting about 50 new sequences of the cytochrome c oxidase subunit I (COI) gene. These two species had the range limit extended. Biological analyzes of Squalus cubensis were performed to 110 individuals, being 55 females and 53 males. Significant statistical differences were not related to gender of the total catch, mature individuals or embryos. Females were found in five maturation stages and males in four, with no animals at regenerating or regressing. The total length (TL) ranged from 231 mm to 860 mm (= 613 mm) for females, and from 244 mm to 542 mm ( = 485 mm), for males. Females showed reproductive peaks in April and November. The first maturation size of females was estimated at 571.4 mm TL, while for males the average value was 452.1 mm TL. The study reveals an adult population on the depths of capture, which may reveal sites of reproductive aggregations. This study reveals the biological importance of the upper slope of Pernambuco as ecological hotspots, serving as a basis for management and conservations strategies in the tropical Atlantic

16.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-222178

Resumo

A microalga Chlorella vulgaris apresenta em sua biomassa diferentes metabólitos, tais como, lipídios, polissacarídeos, enzimas, proteínas, que auxiliam na produção de agentes cicatrizantes. Um único tratamento não preenche os requisitos para ser aplicado a todos os tipos de lesões cutâneas, tendo em vista que um produto deve ser selecionado com base na profundidade, extensão, localização e origem da lesão. Desse modo, o objetivo desse trabalho foi realizar a caracterização do extrato de C. vulgaris e da formulação para a atividade cicatrizante. Inicialmente a microalga foi cultivada em meio padrão suplementado com 1% de milhocina. A biomassa seca foi ressuspendida em tampão na concentração de 50 mg/mL, sonicada e centrifugada para caracterização do sobrenadante, denominado de extrato celular. A caracterização foi realizada pela análise qualitativa de fitoquímicos por ensaio colorimétrico e para o doseamento de fenóis totais foi realizado espectroscopia e expresso por ácido gálico (AG). As proteínas presentes no extrato foram precipitadas com sulfato de amônio, purificadas por cromatografia de troca iônica e o perfil eletroforético analisado por gel SDS-PAGE. Foi realizada atividade hemaglutinante das frações proteicas obtidas utilizando eritrócitos bovinos, equinos e do sistema sanguíneo humano ABO (tipo A, B e O). A citotoxicidade in vitro do extrato celular foi testada em diferentes concentrações em fibroblastos primários. A caracterização da formulação foi realizada através de estudo organoléptico, avaliação do pH, espalhabilidade e viscosidade. Os excipientes da formulação foram submetidos à espectroscopia no infravermelho por transformada de Fourier (FT-IR) para análise da estrutura das moléculas, e ao analisador termogravimétrico (TGA) para análise da estabilidade térmica. No extrato foi detectado a presença de terpenos e conteúdo de fenóis totais de 1,35 ± 0,18 mg/g de AG. Na etapa de purificação foram obtidos dois picos, o primeiro eluído a 0,15 M de NaCl e o segundo pico eluído a 1,0 M. Apenas o primeiro pico demonstrou teor proteico de 250 g/mL, atividade hemaglutinante de 2 5 para tipo B e uma única banda com aproximadamente 36 kDa. O extrato apresentou citocompatibilidade, não induzindo efeito citotóxico nas células durante o período de 48h. A formulação apresentou cor esverdeada, textura suave, ligeiramente turva, odor característico do extrato da microalga e pH na faixa de 7,09 ± 0,07. Os resultados do teste de espalhabilidade e viscosidade indicam que a formulação pode facilmente fluir e se espalhar na área aplicada. A partir do FT-IR foi possível observar a presença de amina, carboidratos e terpenos. De acordo com a curva TGA, o percentual de perda de massa final do extrato celular foi de 23,56%, ocorrendo a 218,64 °C. carbopol teve perda de massa de 19,39%, ocorrida a 301,62%. A perda de massa da metilisotiazolinona foi de 94,69%; a curva mostra que a qualidade diminuiu rapidamente até 152,2 °C, principalmente por evaporação da água. A eficácia terapêutica das formulações tópicas é influenciada por fitoconstituintes ativos e características veiculares que desempenham um papel importante no controle da permeabilidade do medicamento. As biomoléculas ativas provenientes destes microrganismos fotossintéticos tornam-se uma alternativa potencial para o tratamento de doenças, apresentando alta disponibilidade e baixa toxicidade.


The microalgae Chlorella vulgaris presents in its biomass different metabolites such as lipids, polysaccharides, enzymes, proteins, which help in the production of healing agents. A single treatment does not meet the requirements to be applied to all types of skin lesions, since a product must be selected based on the depth, extent, location and origin of the lesion. Therefore, the objective of this work was to perform the characterization of C. vulgaris extract and the formulation for healing activity. Initially, the microalgae was cultivated in standard Bold's Basal medium supplemented with 1% corn steep liquor. The dried biomass was resuspended in a concentration of 50 mg/mL buffer, sonic and centrifuged for characterization of the supernatant, called cell extract. The characterization was performed by qualitative analysis of phytochemicals by colorimetric test and for the dosage of total phenols, spectroscopy was performed and expressed by gallic acid (AG). The proteins present in the extract were precipitated with ammonium sulfate, purified by ion exchange chromatography and the electrophoretic profile analyzed by SDS-PAGE gel. Hemagglutinating activity of the protein fractions obtained using bovine, equine and human ABO (type A, B and O) red blood cells was performed. The in vitro cytotoxicity of the cell extract was tested in different concentrations in primary fibroblasts. The characterization of the formulation was performed through organoleptic study, evaluation of pH, spreadability and viscosity. The excipients of the formulation were submitted to Fourier transform infrared spectroscopy (FT-IR) for analysis of the structure of the molecules, and to a thermogravimetric analyzer (TGA) for thermal stability analysis. Terpenes and total phenol content of 1.35 ± 0.18 mg/g AG were detected in the extract. In the purification step two peaks were obtained, the first eluate at 0.15 M of NaCl and the second at 1.0 M. Only the first peak showed protein content of 250 g/mL, hemagglutinating activity of 25 for type B and a single band with approximately 36 kDa. The extract showed cytocompatibility, not inducing cytotoxic effect in the cells during the 48h period. The formulation had a greenish color, smooth texture, slightly cloudy, characteristic odor of the microalgae extract and pH in the range of 7.09 ± 0.07. The results of the spreadability and viscosity test indicate that the formulation can easily flow and spread over the applied area. From the FT-IR it was possible to observe the presence of amine, carbohydrates and terpenes. According to the TGA curve, the percentage of final cell extract mass loss was 23.56%, occurring at 218.64 °C. carbopol had a mass loss of 19.39%, occurring at 301.62%. The loss in mass of methylisothiazolinone was 94.69%; the curve shows that the quality decreased rapidly to 152.2 °C, mainly by evaporation of water. The therapeutic efficacy of topical formulations is influenced by active phytoconstituents and vehicular characteristics that play an important role in the control of the drug permeability. The active biomolecules from these photosynthetic microorganisms become a potential alternative for the treatment of diseases, presenting high availability and low toxicity

17.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-213770

Resumo

Os anfíbios do gênero Rhinella pertencem à família Bufonidae, possuindo grande diversidade, com 92 espécies, onde 20 destas espécies ocorrem na região meio norte do Brasil distribuindo se nos biomas Amazônico (Pará e Maranhão), Cerrado (Maranhão e Piauí) e Caatinga (Piauí). Este estudo objetivou identificar as espécies dos complexos Rhinella marina e Rhinella granulosa avaliando sua unidade evolutiva em áreas de biomas Amazônico, Cerrado, Caatinga e ecótonos na região meio norte do Brasil. Os espécimes foram obtidos através dos métodos: Procura Limitada por Tempo (PLT), Amostragem em Sítios Reprodutivos e Armadilha de Interceptação e Queda (Pitfail trap). O DNA total foi extraído, a partir de tecido muscular utilizando o kit Wizard Genomic DNA Purification Promega. Para o isolamento e amplificação dos genes nucleares e mitocondriais foi utilizada a técnica de Reação em Cadeia da Polimerase (PCR). Os produtos das PCRs foram purificados usando o kit ExoSap IT e submetidos à reação de sequenciamento. Os dados obtidos foram analisados em softwares específicos, tais como: BioEdit, MEGA, DNAsp e plataformas BLAST e BOLD Systems. Os dados deste estudo mostraram que através da morfologia externa foram identificadas espécies pertencentes a dois complexos R. marina e R. granulosa, onde o Rhinella marina compreende as espécies R. marina, R. schneideri, R. jimi e R. cerradensis e Rhinella granulosa as espécies, R. granulosa e R. mirandaribeiroi. Além disso, foi identificada a espécie R. margaritifera que não faz parte de nenhum dos complexos. Diferentemente da morfologia, com o uso do gene rRNA16S, evidenciou-se o complexo R. marina formado apenas pelas espécies R. schneideri e R. marina e R. granulosa por R. granulosa e R. mirandaribeiroi. A espécie R. cf. margaritifera foi confirmada como uma unidade evolutiva independente. A magnitude das divergências genéticas somada a filogenia indicaram que ocorre diferenciação interespecíficas entre e dentro dos complexos. No entanto não houve diferenciação para seis espécies como morfologicamente esperado, mas para apenas quatro espécies. Os dados apontam para hibridização e introgressão entre as espécies R. schneideri, R. jimi e R. cerradensis, isto é explicado por essas coabitarem e por geneticamente não haver diferenciação que separem em status taxonômicos distintos.


Amphibians of the genus Chaunus belong to the family Bufonidae, possessing great diversity, with 93 species, where 20 of these species occur in the region North of Brazil being distributed in the biomes Amazon (Pará and Maranhão), Cerrado. if we Amazon biomes (Pará and Maranhão), Savannah (Maranhão and Piauí) and Caatinga (Piauí). This study aimed at identifying the species of the complex Rninella marina and chaunus granulosus evaluating their evolutionary unit in areas of the Amazon, Cerrado, Caatinga biomes and ecotones in North region of Brazil. The specimens were obtained through the methods: Search limited by time (PLT), sampling in Reproductive Sites; Pitfall traps and by donations. Total DNA was extracted from muscle tissue using Genomic DNA Purification kit Promega Wizard. For the isolation and amplification of nuclear and mitochondrial genes was used the technique of polymerase chain reaction (PCR). The products of PCRs were purified using kit ExoSap IT and submitted to the sequencing reaction. The data obtained were analysed in specific software, such as: BioEdit, MEGA, DNAsp BLAST and BOLD platforms and Systems. The data from this study showed that through the external morphology were identified belonging to two species complex R. marina and R. granulosa, where the R. marina group comprises.the species R. marina, R. diptycha, R. jimi and R. cerradensis and the R. granulosus species, R. granulosa and R. mirandaribeiroi. A specie R. cf. margaritifera foi confirmed as an independent evolutionary unit. A magnitude of genetic divergences somada a phylogeny indicate that ocrere interespecíficas difference between e within two complexes. No entanto não houve diferenciação for six species as morphologically expected, but for only four species. The data given for hybridization and introgression between the species R. schneideri, R. jimi and R. cerradensis, is explained by essas coabitarem e for genetically não haver diferenciação that separem em different taxonomic status.

18.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-216939

Resumo

O tráfico, contrabando e comércio ilegal de animais é a quarta atividade ilícita mais comum no mundo, colocando em risco a extinção de diversas espécies. Além disso, o comércio ilegal de animais silvestres pode ser meio de veiculação de enfermidades, principalmente de caráter zoonótico, ao serem transportadas por animais. O trabalho tem por objetivo identificar espécies de animais da fauna silvestre através do DNA mitocondrial (mtDNA), tricologia e determinar a prevalência de Trypanosoma cruzi agente etiológico da enfermidade de Chagas, uma Enfermidade Tropical Negligenciada (NTD), segundo a Organização Mundial da Saúde (OMS). Foram coletadas amostras de tecido muscular, pele, sangue e pelos em animais oriundos de apreensões no território brasileiro. Para a identificação genética, foi sequenciada uma região conservada do mtDNA de aproximadamente 600 pares de bases e comparados com o banco de dados genético Barcode of Life Database (BOLD). A identificação por pelos foi realizada através de análise comparada e o diagnóstico T. cruzi através da técnica Loop-mediated Isothermal Amplification (LAMP), uma técnica rápida, barata e sensível. Foram identificados animais das espécies Dasypus sp., Mazama gouazoubira, Pantera onca, Cerdocyon thous, Tamandua tetradactyla, Didelphis aurita, Puma concolor, Myoprocta sp., Cavia sp., Galictis cuja; através do sequenciamento genético do mtDNA e as espécies Alouatta sp., Ozotoceros bezoarticus, Sylvilagus brasiliensis, Didelphis albiventris, Panthera onca, Puma concolor, Myrmecophaga tridactyla, Leopardus tigrinus, Dasyprocta sp.; por meio da morfologia dos pelos, verificou-se que a associação das técnicas é uma potencial ferramenta para a identificação de espécies. Com relação ao diagnóstico por meio de LAMP,verificou-se positividade de 50% (25/50) das amostras, sendo potenciais reservatórios do parasita T. cruzi.


Animal trafficking, smuggling and illegal trade is the fourth most common illegal activity in the world, increases the risk of extinction of several endangered species. An important point concerning illegal animal trade and the increasing globalization is that represents a possible vehicle for illness spreading, including zoonosis, creating a health public issue. The aim of this research is to identify species from the wildlife by mitochondrial DNA (mtDNA), hair and determines the prevalence of the zoonotic agent Trypanosoma cruzi, etiological agent of Chagas disease, a Neglected Tropical Disease (NTD) according to World Health Organization (WHO). Samples were collected from blood, muscle and skin from trafficking animals in Brazilian territory. A preserved region from mtDNA (600 base pair) was sequenced and compared to the Barcode of Life Database (BOLD) in order to do the genetic identification. Hair identification was complete by compared analysis. The diagnosis of T. cruzi ware made using the Loop-mediated Isotehrmal Amplification (LAMP) assay, a rapid, cheap and sensible technique. Have been identified the following species: Dasypus sp., Mazama gouazoubira, Pantera onca, Cerdocyon thous, Tamandua tetradactyla, Didelphis aurita, Puma concolor, Myoprocta sp., Cavia sp., Galictis cuja; using mtDNA sequencing and these species: Alouatta sp., Ozotoceros bezoarticus, Sylvilagus brasiliensis, Didelphis albiventris, Panthera onca, Puma concolor, Myrmecophaga tridactyla, Leopardus tigrinus, Dasyprocta sp.; by hair morphology analysis. The identification could be effective because of its association between forensic genetic and trichology techniques. In our research 50% (25/50) of animals were positive in LAMP assay to T. cruzi. This analysis could be important to identify reservoirs and the risk of animal trafficking to human health.

19.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-215371

Resumo

Popularmente conhecidos como cascudos, os indivíduos do gênero Hypostomus são um importante recurso pesqueiro na região do Alto rio Uruguai, sendo composta por espécies que apresentam alta adaptabilidade a diferentes tipos de ambientes. O gênero Hypostomus é o mais numeroso e um dos mais complexos da família Loricariidae, composto por espécies que apresentam características morfológicas similares, dificultando assim a sua diferenciação. Esse estudo teve como objetivo inferir, através da técnica do DNA barcoding, o número de MOTUs e sua variação intra e interespecíficas entre as espécies do gênero Hypostomus da bacia do Alto rio Uruguai. Foram analisadas sequências parciais do gene COI de 35 indivíduos de cinco espécies do gênero Hypostomus do Alto rio Uruguai identificados taxonomicamente como H. spiniger, H. isbrueckeri, H. roseopunctatus, H. luteus e H. uruguayensis. Foram utilizadas 52 sequências de espécies do gênero Hypostomus, obtidas do BOLD (Barcode of Life Data System). A árvore bayesiana com todas as sequências revelou agrupamento polifilético entre as espécies do Alto rio Uruguai, onde H. spiniger se separa dos demais. A análise GMYC revelou cinco MOTUs dentre os indivíduos analisados, indicando subdivisão de H. isbrueckeri. Os indivíduos previamente identificados como H. roseopunctatus e H. luteus foram agrupados na mesma MOTU. Os exemplares identificados morfologicamente como H. regani foram agrupados na MOTU H. roseopunctatus/H. luteus, levantando uma dúvida sobre a existência da espécie na bacia. Os indivíduos de H. uruguayensis agruparam-se em apenas uma MOTU, corroborando a delimitação taxonômica. As distâncias interespecíficas médias variaram de 0,68 a 8,24%, e as distâncias intraespecíficas médias variaram de 0,0 a 0,58%. Os resultados do presente estudo indicam a complexidade da identificação morfológica de algumas espécies de Hypostomus do Alto rio Uruguai. Os resultados do presente estudo indicam a necessidade de ampliar a amostragem e utilizar outros marcadores moleculares para elucidar o complexo H. luteus/H. roseopunctatus e a subdivisão de H. isbrueckeri. A correta identificação e delimitação das espécies permite manejo adequado dessas espécies que se destacam pelo seu potencial para pesca e aquariofilia.


Popularly known as cascudos, individuals of the genus Hypostomus are an important fishing resource in the Upper Uruguay River region, being composed of species that show high adaptability to different types of environments. The genus Hypostomus is the most numerous and one of the most complex of the family Loricariidae, composed of species that present similar morphological characteristics, making it difficult to differentiate them. The aim of this study was to infer, through the technique of DNA barcoding, the number of MOTUs and their intra and interspecific variation among the species of the genus Hypostomus of the Upper Uruguay river basin. Partial sequences of the COI gene from 35 individuals of five species of the genus Hypostomus of the Upper Uruguay River were analyzed, taxonomically identified as H. spiniger, H. isbrueckeri, H. roseopunctatus, H. luteus and H. uruguayensis. Fifty-two sequences of Hypostomus species obtained from the Barcode of Life Data System (BOLD) were used. The Bayesian tree with all sequences revealed polyphyletic grouping among the Upper Uruguay River species, where H. spiniger separates from the others. GMYC analysis revealed five MOTUs among the individuals analyzed, indicating subdivision of H. isbrueckeri. The individuals previously identified as H. roseopunctatus and H. luteus were grouped in the same MOTU. The morphologically identified specimens as H. regani were grouped in MOTU H. roseopunctatus / H. luteus, raising a doubt about the existence of the species in the basin. Hypostomus uruguayensis individuals were grouped in only one MOTU, corroborating the taxonomic delimitation. Mean interspecific distances ranged from 0.68 to 8.24%, and mean intraspecific distances ranged from 0.0 to 0.58%. The results of the present study indicate the complexity of morphological identification of some species of Hypostomus from the Upper Uruguay river. The results of the present study indicate the need to extend sampling and use other molecular markers to elucidate the H. luteus / H. roseopunctatus complex and the subdivision of H. isbrueckeri. The correct identification and delimitation of species allows proper management of these species that stand out for their potential for fishing and aquarium.

20.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-208691

Resumo

Os morcegos pertencem à ordem Chiroptera, segunda maior ordem de mamíferos em diversidade de espécies. Os Molossídeos compõem um importante segmento da fauna de quirópteros, com implicações ecológicas, econômicas e sanitárias. Apesar do grande número de caracteres morfológicos e moleculares utilizados para a identificação e reconstruções filogenéticas das espécies de morcegos, os resultados ainda são inconclusivos. Marcadores moleculares têm sido amplamente usados como ferramentas em estudos populacionais e filogenéticos, aumentando a capacidade em identificar espécies. Dessa forma, o presente estudo tem como objetivo caracterizar através da morfologia, morfometria, craniometria e dados moleculares os morcegos da família Molossidae de ocorrência nos biomas Cerrado e Amazônia maranhenses, bem como, detectar presença/ausência do vírus rábico. Para tanto fez-se expedições para os municípios maranhenses: Godofredo Viana, Carutapera, Cândido Mendes e Caxias. Após a coleta os morcegos foram levados ao Laboratório de Genética e Biologia Molecular do CESC/UEMA, onde ocorreu a identificação morfológica com base em chaves de classificação, retirada do tecido muscular, que foi armazenado e fixado em álcool a 90% para a realização dos estudos moleculares, e tecido encefálico para o teste de Imunofluorescência Direta. Após identificação, fotografias e retirada das medidas morfométricas foi realizada a retirada da estrutura craniana dos espécimes pela abertura bucal com o rebatimento da pele. Com auxílio de paquímetro manual, foram aferidas 15 medidas morfométricas e 25 craniométricas. O DNA total foi obtido utilizando o kit PROMEGA, o isolamento e amplificação dos genes rRNA 16S e COI ocorreu via Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) usando-se primes específicos e os produtos das PCRs purificados foram sequenciados. As análises moleculares foram realizadas por softwares como: BIOEDIT 7.0 e MEGA 7.0. Para a identificação correta das espécies e análises de similaridades foram usadas as plataformas BOLD Systems v3 e BLAST. A análise multivariada foi realizada no software STATISTICA 7.0. O diagnóstico para o vírus da raiva ocorreu através da técnica da Imunofluorescência Direta (IFD) no Laboratório de Virologia da Universidade Estadual do Maranhão, Campus São Luís. Nesse estudo, 115 espécimes distribuídos em seis espécies e quatro gêneros, pertencentes à família Molossidae foram registrados para os biomas maranhenses. Para as espécies do gênero Molossus, a discriminação entre as variáveis pelo método de stepwise foi significativa, tanto para os machos =00020, F= (26,8) =21.516 p< 0001, quanto para as fêmeas com valores de = 00430, F= (36,59) =8.8476 p< 0000. Os dados moleculares a partir do gene rRNA 16S mostraram uma média de divergência intraespecífica variando de 0 a 1,4%. Para o gene COI a média divergência intraespecífica variou de 0,7 a 1%. A morfologia, considerando morfometria, craniometria e dados moleculares registram a ocorrência de seis espécies para a família Molossidae sendo elas: Molossus rufus (Geoffroy, 1805) Cynomops abrasus (Temminck,1826) Nyctinomops laticaudatus (E. Geoffroy 1805) Molossops temminckii (Williams e Genoways, 1980) e Cynomops planirostris (Peters,1866) para o bioma Cerrado e Molossus molossus (Pallas, 1766) para o bioma Amazônia. As amostras de tecido encefálico submetidas ao teste de (IFD), apresentaram resultados negativos.


The bats belong to the order Chiroptera, the second largest order of mammals in species diversity. The Molossids make up an important segment of the fauna of bats, with ecological, economic and sanitary implications. Despite the large number of morphological and molecular characters used for identification and phylogenetic reconstructions of bat species, the results are still inconclusive. Molecular markers have been widely used as tools in population and phylogenetic studies, increasing the ability to identify species. Thus, the present study aims to characterize through morphology, morphometry, craniometry and molecular data the bats of the Molossidae family occurring in the Cerrado and Amazonian Maranhenses biomes, as well as to detect the presence/absence of the rabies virus. For this purpose, expeditions were made to the municipalities of Maranhão: Godofredo Viana, Carutapera, Cândido Mendes and Caxias. After the collection, the bats were taken to the Laboratory of Genetics and Molecular Biology of the CESC/UEMA, where morphological identification occurred based on classification keys, removal of muscle tissue, which was stored and fixed in 90% alcohol for the molecular studies, and encephalic tissue for the Direct Immunofluorescence test. After identification, photographs and removal of the morphometric measurements, the cranial structure of the specimens was removed through the mouth opening with the skin folded. Using a manual pachymeter, 15 morphometric and 25 craniometric measures were measured. Total DNA was obtained using the PROMEGA kit, isolation and amplification of the genes rRNA 16S and COI occurred via Polymerase Chain Reaction (PCR) using specific primers and the purified PCRs products were sequenced. The molecular analyzes were performed by software such as: BIOEDIT 7.0 and MEGA 7.0. For the correct species identification and analysis of similarities The BOLD Systems v3 and BLAST platforms were used. The multivariate analysis was performed in STATISTICA 7.0 software. The diagnosis for the rabies virus occurred through the technique of Direct Immunofluorescence (IFD) in the Laboratory of Virology of the Universidade Estadual of Maranhão, Campus São Luís. In this study, 115 specimens distributed in six species and four genera belonging to the Molossidae family were registered for the Maranhão biomes. For species of the genus Molossus, the discrimination between the variables by the stepwise method was significant, for males = 00020, F = (26.8) = 21.516 p <0001, and for females with values of = 00430, F = (36.59) = 8.8476 p <0000. Molecular data from the 16S rRNA gene showed an average intraspecific divergence ranging from 0 to 1.4%. For the COI gene the mean intraspecific divergence ranged from 0.7 to 1%. The morphology, considering morphometry, craniometry and molecular data record the occurrence of six species for the Molossidae family: Molossus rufus (Geoffroy, 1805) Cynomops abrasus (Temminck, 1826) Nyctinomops laticaudatus (E. Geoffroy 1805) Molossops temminckii (Williams and Genoways, 1980) and Cynomops planirostris (Peters, 1866) for the Cerrado biome and Molossus molossus (Pallas, 1766) for the Amazon biome. The brain tissue samples submitted to the test (IFD), were negative.

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