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1.
Ciênc. Anim. (Impr.) ; 31(3): 13-26, 2021. tab, graf
Artigo em Português | VETINDEX | ID: biblio-1369014

Resumo

As avaliações genéticas permitem compreender a evolução da raça e a importância dos componentes genéticos sobre a variação fenotípica das características de interesse de produção em animais. Objetivou-se, com este trabalho, estimar a tendência genética, a herdabilidade e a correlação genética para altura de cernelha e funcionalidade da marcha em equinos brasileiros da raça Campolina. A Associação Brasileira dos Criadores de Cavalo Campolina disponibilizou 107.630 dados de animais registrados desde 1951 até julho de 2016. As avaliações genéticas foram obtidas por modelo animal uni-característico, para altura de cernelha, com dados de 11.765 indivíduos, e bi-característico, para os atributos de qualidade de marcha, que são: comodidade, desenvolvimento, dissociação, estilo e regularidade, pertencentes a 2.148, 2.148, 2.145, 2.125 e 2.148 equinos, respectivamente. Incremento genético de 3,88cm foi observado para altura de cernelha ao longo dos anos, sugerindo a eficiência de seleção para porte elevado no Campolina. Não foi verificada evolução genética nos atributos de marcha, podendo indicar necessidade de melhoria nos processos de avaliação e seleção dos animais para maior comodidade e desenvoltura desse andamento. Verificou-se herdabilidade igual a 0,37 para altura de cernelha e 0,77 para dissociação, além de herdabilidades de comodidade, desenvolvimento, estilo e regularidade iguais a 0,15, 0,23, 0,22 e 0,28. Os resultados indicam que essas características podem ser utilizadas como critério de seleção para melhor qualidade de marcha. As correlações genéticas verificadas entre a medida linear e todos os atributos de marcha foram de baixa magnitude, variando entre -0,01 e 0,05. Desta forma, é sugerido que a seleção para altura na cernelha exerce baixa influência sobre os ganhos genéticos em atributos de marcha.


Genetic evaluations allow to describe the genetic evolution of a breed and to understand the importance of the genetic variability on the phenotypic variance of a production interesting trait. This study aimed to estimate genetic tendency, heritability and genetic correlation for withers height and gait functionality traits in Brazilian Campolina horses. The Brazilian Association of Campolina Horse Breeders provided 107,630 records from registered animals born from 1951 until July 2016. Genetic evaluations were obtained by uni-trait animal model, for withers height using data from 11,765 individuals, and bi-trait models for attributes of gait quality: comfort, reach, dissociation, style and regularity, belonging to 2,148, 2,148, 2,145, 2,125 and 2,148 horses, respectively. A genetic increase of 3.88cm was observed for withers height over the years, suggesting the efficiency of selection for high height in Campolina. There was no genetic evolution in the gait attributes, which may indicate the need for improvement in the evaluation and selection processes of the animals for greater comfort and range of their gait. Heritability equal to 0.37 and 0.77 was observed for withers height and dissociation. Comfort, reach, style and regularity showed heritabilities of 0.15; 0.23; 0.22 and 0.28, respectively. The results indicate that these characteristics can be used as selection criteria for better gait quality. The genetic correlations observed between the linear measurement and all gait attributes were low varying between -0.01 and 0.05. Therefore, the selection for withers height would have little influence on the genetic gains in gait attributes.


Assuntos
Animais , Análise da Marcha/veterinária , Cavalos/anatomia & histologia , Cavalos/genética , Seleção Genética , Hereditariedade , Correlação de Dados , Região Lombossacral/anatomia & histologia
2.
Rev. bras. zootec ; 50: e20200047, 2021. ilus, tab
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1443395

Resumo

The objective of this study was to evaluate the accuracy of the following six body weight (BW) estimation methods in Campolina (CAM) horses: A - weight tape placed at three different positions on the animal's thorax; B - Crevat and Quetelet's formula; C - Hall's formula; D - Hintz and Griffiths's table; E - Santos's table; and F - Cintra's formula. A total of 380 CAM horses were separated according to sex, age class, and gestational stage and evaluated. To determine their accuracy, weights measured on a scale and weight estimates of the six methods were compared by paired t-test, mean prediction error (MPE), and coefficient of determination (R²), using R software. The predictive capacity of method F was lower in the 6-12 months age class, so this formula is not indicated. The BW was overestimated compared with the actual weight by methods A (with weight tape placed in position 3) and B and underestimated by method C. Methods D and E accurately estimated BW of CAM horses. Correction factors are required to accurately estimate BW in this breed using methods B and C. Method A with the weight tape placed in position 2 is the most accurate for predicting BW, including pregnant female horses, and can, therefore, be considered the most suitable method for estimating BW of CAM horses.


Assuntos
Animais , Peso Corporal , Pesos e Medidas Corporais/veterinária , Cavalos/anatomia & histologia , Precisão da Medição Dimensional
3.
Arq. bras. med. vet. zootec. (Online) ; 71(4): 1364-1374, jul.-ago. 2019. tab, graf
Artigo em Português | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1038613

Resumo

Desde tempos remotos, a pelagem é valorizada no agronegócio equestre. Em animais Campolina, objetivou-se avaliar a ocorrência de pelagens e a distribuição entre sexos nos estados do Brasil, assim como verificar a frequência desse fenótipo nos acasalamentos e associá-lo com medidas lineares e qualidade da marcha. Foram selecionados 44.437 registros definitivos e utilizaram-se testes de qui-quadrado para avaliar a distribuição de pelagens entre sexos, estados e décadas. Por análise descritiva, foi obtida frequência de acasalamento dos fenótipos e proporções resultantes nos filhos. Foram contabilizados os indivíduos acasalados e os mais usados por décadas de nascimento e de registro. Pelagens baia, alazã e castanha predominaram, com 20.422; 11.941 e 5.256 animais, respectivamente. O fenótipo baio representou 45,21% em Minas Gerais; 46,98% no Rio de Janeiro e 48,98% em São Paulo. Para machos e fêmeas constatou-se maior frequência de pelagens baia, alazã e castanha. Os acasalamentos mais frequentes foram alazã x baia, baia x baia e baia x castanha. Este é o primeiro artigo a avaliar a ocorrência das pelagens em equinos da raça Campolina, sendo baia a mais prevalente em ambos os sexos. A qualidade da marcha ao registro não está associada à pelagem. Esse fenótipo deve ser usado com cautela na seleção.(AU)


Since ancient times, coat colors are valued in the equestrian business. The objective of this study was to evaluate the occurrence of coat colors and distribution among sexes in Brazil and also verify the frequency of this phenotype in reproduction to associate it with linear measurements and functionality. 44,437 definitive records were selected, and chi-square tests were used to evaluate coat colors and distribution between sexes, states and decades. By descriptive analysis the phenotypes breeding frequency and proportions in the offspring were obtained. Breeding and most used individuals were accounted by decade of birth and registration. Dun, chestnut and bay coat colors predominated, with 20,422; 11,941 and 5,256 animals, respectively. Dun represented 45.21% in Minas Gerais; 46.98% in Rio de Janeiro and 48.98% in São Paulo. For males and females there was a higher frequency of dun, chestnut and bay. The most frequent breeding colors were chestnut x dun, dun x dun and dun x bay. This is the first article to evaluate the coat colors in the Campolina population, dun being the most prevalent coat color in both sexes. The gait quality at the register is not associated with the coat color. This phenotype should be used with caution in selection.(AU)


Assuntos
Animais , Fenótipo , Pelo Animal/anatomia & histologia , Frequência do Gene , Cavalos
4.
Arq. bras. med. vet. zootec. (Online) ; 71(4): 1364-1374, jul.-ago. 2019. tab, graf
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-25244

Resumo

Desde tempos remotos, a pelagem é valorizada no agronegócio equestre. Em animais Campolina, objetivou-se avaliar a ocorrência de pelagens e a distribuição entre sexos nos estados do Brasil, assim como verificar a frequência desse fenótipo nos acasalamentos e associá-lo com medidas lineares e qualidade da marcha. Foram selecionados 44.437 registros definitivos e utilizaram-se testes de qui-quadrado para avaliar a distribuição de pelagens entre sexos, estados e décadas. Por análise descritiva, foi obtida frequência de acasalamento dos fenótipos e proporções resultantes nos filhos. Foram contabilizados os indivíduos acasalados e os mais usados por décadas de nascimento e de registro. Pelagens baia, alazã e castanha predominaram, com 20.422; 11.941 e 5.256 animais, respectivamente. O fenótipo baio representou 45,21% em Minas Gerais; 46,98% no Rio de Janeiro e 48,98% em São Paulo. Para machos e fêmeas constatou-se maior frequência de pelagens baia, alazã e castanha. Os acasalamentos mais frequentes foram alazã x baia, baia x baia e baia x castanha. Este é o primeiro artigo a avaliar a ocorrência das pelagens em equinos da raça Campolina, sendo baia a mais prevalente em ambos os sexos. A qualidade da marcha ao registro não está associada à pelagem. Esse fenótipo deve ser usado com cautela na seleção.(AU)


Since ancient times, coat colors are valued in the equestrian business. The objective of this study was to evaluate the occurrence of coat colors and distribution among sexes in Brazil and also verify the frequency of this phenotype in reproduction to associate it with linear measurements and functionality. 44,437 definitive records were selected, and chi-square tests were used to evaluate coat colors and distribution between sexes, states and decades. By descriptive analysis the phenotypes breeding frequency and proportions in the offspring were obtained. Breeding and most used individuals were accounted by decade of birth and registration. Dun, chestnut and bay coat colors predominated, with 20,422; 11,941 and 5,256 animals, respectively. Dun represented 45.21% in Minas Gerais; 46.98% in Rio de Janeiro and 48.98% in São Paulo. For males and females there was a higher frequency of dun, chestnut and bay. The most frequent breeding colors were chestnut x dun, dun x dun and dun x bay. This is the first article to evaluate the coat colors in the Campolina population, dun being the most prevalent coat color in both sexes. The gait quality at the register is not associated with the coat color. This phenotype should be used with caution in selection.(AU)


Assuntos
Animais , Fenótipo , Pelo Animal/anatomia & histologia , Frequência do Gene , Cavalos
5.
Arq. bras. med. vet. zootec. (Online) ; 71(6): 1773-1780, Nov.-Dec. 2019. tab
Artigo em Português | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1055107

Resumo

A laminite endocrinopática tem acometido um número crescente de equinos com sinais de obesidade. Em um estudo recente com fêmeas jovens (até cinco anos) da raça Campolina, demonstraram-se indícios de alterações no dígito, ainda discretas, aparentemente associadas ao aumento da adiposidade. Com a hipótese de que essa associação é mais evidente em animais em faixa etária superior, o objetivo do presente estudo foi estudar éguas adultas (acima de cinco anos) da raça Campolina com e sem obesidade, avaliando-se radiograficamente a relação espacial entre estojo córneo e falange distal. Foram utilizadas 27 éguas entre seis e 14 anos de idade, sendo analisadas variáveis de adiposidade e medidas radiográficas dos cascos dos membros torácicos de equinos com escore corporal de 5 a 7/9 (grupo controle) e de 8 a 9 (grupo obeso). Foram feitas comparações entre os grupos e correlacionaram-se as variáveis de adiposidade com variáveis casco. A distância de afundamento da falange distal foi cerca de 20% superior nas éguas obesas (12,3±2,5 contra 10,2±2,2mm no grupo controle). Esse parâmetro também correlacionou (P<0,01) com vários parâmetros de adiposidade, com destaque para o escore de condição corporal (r=0,47) e a circunferência de pescoço a 75% (r=0,42). Os resultados corroboram estudos prévios que demonstraram associação entre obesidade e indícios de separação entre falange distal e estojo córneo em equinos de raças nacionais, comprovando, assim, a utilidade da avaliação radiográfica nesses animais. Em conclusão, éguas da raça Campolina com obesidade possuem alterações evidentes na relação espacial entre estojo córneo e falange distal, que se intensificam com o aumento da idade e da adiposidade.(AU)


In a recent study with young females (up to 5 years old) of the Campolina breed, there were discrete indications of alterations in the digit, apparently associated to the increase in adiposity. With the hypothesis that this association is more evident in horses in the upper age group, the objective was to study Campolina adult mares (above 5 years) with and without obesity, evaluating radiographically the spatial relationship between the horn and distal phalanx. Eighteen mares between six and fourteen years and with a body score of 5 to 7/9 (Control Group) and 8 to 9 (Obeso Group) were used. Adiposity and radiographic measurements from the forelimbs were analyzed. Comparisons were made between groups and adiposity variables were correlated with hoof variables. The sinking distance of the distal phalanx was about 20% higher in obese mares (12.3±2.5 versus 10.2±2.2mm). This parameter also correlated (P< 0.01) with several adiposity parameters, with emphasis on body score condition (r= 0.47) and neck circumference at 75% (r= 0.42). In conclusion, Campolina mares with obesity have obvious alterations in the spatial relation between the corneal and the distal phalanx, which get intense according to increases in age and adiposity.(AU)


Assuntos
Animais , Feminino , Pesos e Medidas Corporais/veterinária , Falanges dos Dedos do Pé/anatomia & histologia , Casco e Garras/anatomia & histologia , Cavalos/anatomia & histologia , Padrões de Referência
6.
Arq. bras. med. vet. zootec. (Online) ; 71(6): 1773-1780, Nov.-Dec. 2019. tab
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-26610

Resumo

A laminite endocrinopática tem acometido um número crescente de equinos com sinais de obesidade. Em um estudo recente com fêmeas jovens (até cinco anos) da raça Campolina, demonstraram-se indícios de alterações no dígito, ainda discretas, aparentemente associadas ao aumento da adiposidade. Com a hipótese de que essa associação é mais evidente em animais em faixa etária superior, o objetivo do presente estudo foi estudar éguas adultas (acima de cinco anos) da raça Campolina com e sem obesidade, avaliando-se radiograficamente a relação espacial entre estojo córneo e falange distal. Foram utilizadas 27 éguas entre seis e 14 anos de idade, sendo analisadas variáveis de adiposidade e medidas radiográficas dos cascos dos membros torácicos de equinos com escore corporal de 5 a 7/9 (grupo controle) e de 8 a 9 (grupo obeso). Foram feitas comparações entre os grupos e correlacionaram-se as variáveis de adiposidade com variáveis casco. A distância de afundamento da falange distal foi cerca de 20% superior nas éguas obesas (12,3±2,5 contra 10,2±2,2mm no grupo controle). Esse parâmetro também correlacionou (P<0,01) com vários parâmetros de adiposidade, com destaque para o escore de condição corporal (r=0,47) e a circunferência de pescoço a 75% (r=0,42). Os resultados corroboram estudos prévios que demonstraram associação entre obesidade e indícios de separação entre falange distal e estojo córneo em equinos de raças nacionais, comprovando, assim, a utilidade da avaliação radiográfica nesses animais. Em conclusão, éguas da raça Campolina com obesidade possuem alterações evidentes na relação espacial entre estojo córneo e falange distal, que se intensificam com o aumento da idade e da adiposidade.(AU)


In a recent study with young females (up to 5 years old) of the Campolina breed, there were discrete indications of alterations in the digit, apparently associated to the increase in adiposity. With the hypothesis that this association is more evident in horses in the upper age group, the objective was to study Campolina adult mares (above 5 years) with and without obesity, evaluating radiographically the spatial relationship between the horn and distal phalanx. Eighteen mares between six and fourteen years and with a body score of 5 to 7/9 (Control Group) and 8 to 9 (Obeso Group) were used. Adiposity and radiographic measurements from the forelimbs were analyzed. Comparisons were made between groups and adiposity variables were correlated with hoof variables. The sinking distance of the distal phalanx was about 20% higher in obese mares (12.3±2.5 versus 10.2±2.2mm). This parameter also correlated (P< 0.01) with several adiposity parameters, with emphasis on body score condition (r= 0.47) and neck circumference at 75% (r= 0.42). In conclusion, Campolina mares with obesity have obvious alterations in the spatial relation between the corneal and the distal phalanx, which get intense according to increases in age and adiposity.(AU)


Assuntos
Animais , Feminino , Pesos e Medidas Corporais/veterinária , Falanges dos Dedos do Pé/anatomia & histologia , Casco e Garras/anatomia & histologia , Cavalos/anatomia & histologia , Padrões de Referência
7.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-218889

Resumo

KREBS, Lisia Castro. Estudo das Características Morfométricas e da Associação Genômica Ampla (GWAS) em Equinos da Raça Campolina. 2021. N. 117p. Dissertação de mestrado. Pós-Graduação em Zootecnia, Programa de Pós-Graduação em Zootecnia, Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Seropédica, RJ, 2021. Os estudos em análises morfométricas dos equinos progrediram nos últimos anos; sempre partindo da premissa desta avaliação estar relacionada com a aptidão do cavalo. Com o avanço da avaliação genética na equinocultura criou-se a oportunidade de obter informações precisas sobre a funcionalidade dos animais, assim como a maior exatidão da descendência e obter o alelo desejado. Esta pesquisa tem como objetivo realizar Estudo das características Fenotípicas e o Estudo de Associação Genômica Ampla (GWAS) de medidas morfométricas em equinos da raça Campolina. Foram mensurados 270 equinos, com idade acima de 36 meses de idade, registrados na Associação Brasileira dos Criadores do Cavalo Campolina (ABCCCampolina), pertencentes aos estados da Bahia, Rio de Janeiro e Minas Gerais, para a Análise Fenotípica de 45 medidas morfométricas. Destes equinos foram selecionados, com base no pedigree, 48 animais para extração do DNA para posterior realização do GWAS. E, para a realização do GWAS foram utilizados os dados de 18.876 registros genealógicos da ABCCCampolina, o qual contém as informações de 15 medidas morfométricas. O DNA genômico foi extraído de amostras de bulbo capilar utilizando o kit Nucleospin Tissue. Posteriormente a extração do DNA, ocorreu a genotipagem do DNA com a utilização do chip GGP Equine Illumina ~65000SNP. As análises estatísticas realizadas para os dados fenotípicos foram correlação de Pearson, covariância, análise discriminante e componentes principais. Após foi realizado a análise genotípica e o GWAS. As análises foram realizadas utilizando o Excel®, RStudio® e softwares BLUPF90®. Na análise de correlação de Pearson observou-se que as medidas lineares e de perímetro correlacionaram positivamente com as 45 medidas morfométricas. A maioria das medidas angulares possuíram correlações não significantes com as medidas morfométricas. Verificou-se que na análise de covariância, de componentes principais e discriminante que os machos apresentaram menor variação das medidas lineares e de perímetros em relação as fêmeas. Os machos foram mais altos e apresentaram peito mais largo, maior ângulo escapulo-umeral e maior pescoço, tanto no comprimento quanto no perímetro em relação as fêmeas (P<0,05). As fêmeas apresentaram maior perímetro torácico, ancas mais largas e maior abertura dos ângulos coxo-solo e femorotibial do que os machos (P<0,05). Na análise de GWAS observou-se que para as 15 medidas morfométricas 628 SNPs foram responsáveis por explicar mais de 1% da variação genética ocorrida em equinos da raça Campolina. Conclui-se que na raça Campolina, as medidas lineares e de perímetros são as medidas morfométricas mais indicadas para classificação dos equinos quanto ao sexo, apresentando maior dimorfismo sexual, quando comparadas as medidas angulares. Os possíveis genes candidatos para as medidas morfométricas avaliadas foram: RBMS3, HAUS, PIK3R1, SUCLG2, ZCWPW2, CLYBL, DNAJC3, DNAJC15, KMO, LMOD3, LOC100630169, LOC102148584, LRCH1 e THRB.


KREBS, Lisia Castro. Study of Morphometric Characteristics and Genomic Wide Association (GWAS) in Campolina Horses. 2021. N. 117p. Master's dissertation. Post- Graduation in Animal Science, Programa de Pós-Graduação em Zootecnia, Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Seropédica, RJ, 2021. Studies in morphometric analyzes of horses have progressed in recent years; always assuming this assessment is related to the horse's fitness. With the advance of genetic evaluation in equine culture, the opportunity has been created to obtain precise information about the functionality of the animals, as well as greater accuracy of offspring and to obtain the desired allele. This research aims to study the Phenotypic characteristics and the Genomic Wide Association Study (GWAS) of morphometric measurements in Campolina horses. A total of 267 horses, aged over 36 months, registered at the Brazilian Association of Horse Breeders Campolina (ABCCCampolina), belonging to the states of Bahia, Rio de Janeiro and Minas Gerais, were measured for the Phenotypic analysis of 45 morphometric measurements. From these horses, 48 animals were selected, based on the pedigree, for DNA extraction for subsequent GWAS performance. And, to carry out the GWAS, data from 18,876 genealogical records of ABCCCampolina were used, which contains information from 15 morphometric measurements. Genomic DNA was extracted from hair bulb samples using the Nucleospin Tissue kit. After DNA extraction, DNA genotyping was performed using the GGP Equine Illumina ~65000SNP chip. Statistical analyzes performed for phenotypic data were Pearson correlation, covariance, discriminant analysis and principal components. Afterwards, genotypic analysis and GWAS were performed. Analyzes were performed using Excel®, RStudio® and BLUPF90®. In the Pearson correlation analysis, it was observed that the linear and perimeter measurements correlated positively with the 45 morphometric measurements. Most angular measurements had non-significant correlations with morphometric measurements. It was found that in the analysis of covariance, principal components and discriminant that males presented less variation in linear and perimeter measurements than females. Males were taller and had wider chest, greater scapulohumeral angle and larger neck, both in length and perimeter than females (P<0.05). Females had greater thoracic perimeter, wider hips and greater opening of the thigh-ground and femoro-tibial angles than males (P<0.05). In the GWAS analysis, it was observed that for the 15 morphometric measurements, 628 SNPs were responsible for explaining more than 1% of the genetic variation that occurred in Campolina horses. It is concluded that in Campolina breed, linear and perimeter measurements are the most suitable morphometric measurements for classifying horses according to gender, with greater sexual dimorphism when compared to angular measurements. Possible candidate genes for the morphometric measurements evaluated were: RBMS3, HAUS, PIK3R1, SUCLG2, ZCWPW2, CLYBL, DNAJC3, DNAJC15, KMO, LMOD3, LOC100630169, LOC102148584, LRCH1 and THRB.

8.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-219916

Resumo

BUSSIMAN, F. O. Avaliação genética de cavalos Campolina: do pedigree à possibilidade de seleção genômica [Genetic evaluation of Campolina horses: from pedigree to the genomic selection possibility]. 2021. 222 f. Tese (Doutorado em Ciências) Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Universidade de São Paulo, 2021. Embora os custos da genotipagem tenham diminuído ao longo dos últimos anos, em cavalos, chips comerciais ainda apresentam um preço elevado e, atualmente, há no mercado apenas duas alternativas disponíveis. Com efeito, o número de cavalos genotipados nos estudos publicados é baixo e, em geral, os pesquisadores encontram problemas quanto a representatividade das populações por parte dos animais genotipados. Assim, o objetivo do presente trabalho foi propor estratégias de genotipagem em populações de cavalos não genotipadas, prospectando, antes de investimentos financeiros, quais os melhores métodos para seleção genômica nesta espécie. Foi utilizada como material de estudo, a população de cavalos Campolina. Inicialmente um estudo sobre os fundadores, bem como a formação de linhagens no pedigree foi conduzido. Para tanto, foi utilizada análise de componentes principais e conseguiu-se determinar a ocorrência de três linhagens fundadoras na população recente desta raça. Além disso foi conduzido um estudo de redução de posto, no qual testaram-se 19 modelos sendo nove modelos de componentes principais; nove modelos fatores analíticos e um modelo multicaracterística padrão. Em abordagem frequentista, via máxima verossimilhança restrita em algoritmo de informação média, pôde-se determinar que o melhor modelo é um modelo fator analítico com cinco fatores. Foi ainda empregado um estudo utilizando análise confirmatória de fatores para determinar como as características mensuradas na população Campolina se combinam e quais os efeitos causais entre as características latentes que, de fato, causam os fenótipos observáveis. Como resultados, a qualidade morfológica tem um efeito causal sobre a morfologia que, por sua vez, tem um efeito causal sobre o andamento. A partir destes resultados, um estudo com modelos recursivos bem como estruturais permitiu concluir como os atributos de andamento se interconectam causando uns aos outros para criar a pontuação total de andamento. Por fim, um estudo com dados simulados foi feito. Para tanto foram simulados três cenários com diferentes estruturas populacionais e quatro características. Foram então testadas seis diferentes estratégias de genotipagem juntamente quatro diferentes modelos estatísticos para predições genômicas. Houve efeito significativo da interação entre característica e cenário, bem como da interação entre característica e estratégia de genotipagem sobre a acurácia de predição do valor genômico. Sobre a porcentagem de viés, houve efeito significativo apenas da estratégia de genotipagem. No tocante a modelos, os métodos em passo único foram mais acurados e menos viesados tanto para características contínuas quanto para binárias. Futuras implementações de seleção genômica em cavalos deveriam considerar a amostragem de animais com o maior número de progênies para genotipagem, implementando modelos de passo único semiparamétricos para as predições genômicas.


BUSSIMAN, F. O. Genetic evaluation of Campolina horses: from pedigree to the genomic selection possibility [Avaliação genética de cavalos Campolina: do pedigree à possibilidade de seleção genômica]. 2021. 222 f. PhD. Thesis (Doctoral) College of Veterinary Medicine and Animal Science, University of Sao Paulo, 2021. Although genotyping costs have decreased over the last few years, in horses, commercial chips still carry a high price and, currently, there are only two alternatives available on the market. In fact, the number of genotyped horses in the published studies is low and, in general, researchers find problems regarding the representativeness of populations by the genotyped animals. Thus, the aim of the present work was to propose genotyping strategies in non-genotyped horse populations, prospecting, before financial investments, which are the best methods for genomic selection in this species. The Campolina horse population was used as study material. Initially a study on the founders as well as the formation of pedigree lines was conducted. Therefore, principal component analysis was used, and it was possible to determine the occurrence of three founder lines in the recent population of this breed. In addition, a study of rank reduction was conducted, in which 19 models were tested, being nine models of principal components; nine factor analytic models and one standard multi-trait model. In a frequentist approach, through restricted maximum likelihood in an average information algorithm, was found best model is a factor-analytic model with five common factors. A study using confirmatory factor analysis was also employed to determine how measured traits in the Campolina population are combined and what causal effects among latent traits causes the observable phenotypes. As a result, morphological quality has a causal effect on morphology which, in turn, has a causal effect on gait. From these results, a study with recursive as well as structural equation models allowed to conclude how the gait attributes interconnect causing each other to create the total gait score. Finally, a study with simulated data was carried out. For this, three scenarios with different population structures and four traits were simulated. Six different genotyping strategies were then tested along with four different statistical models for genomic predictions. There was a significant effect of the interaction between trait and scenario, as well as the interaction between trait and genotyping strategy on prediction accuracy. On the percentage of bias, there was only a significant effect of the genotyping strategy. About models, the single-step methods were more accurate and less biased for both continuous and binary traits. Future implementations of genomic selection in horses should consider sampling animals with the largest number of progenies for genotyping, implementing semi-parametric single-step models for genomic predictions.

9.
Arq. bras. med. vet. zootec. (Online) ; 68(2): 431-438, mar.-abr. 2016. tab
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-334208

Resumo

O presente estudo objetivou avaliar os índices morfométricos para garanhões, machos castrados e fêmeas da raça Campolina, bem como caracterizá-los morfologicamente. Para tanto, foram utilizadas as medidas lineares de 4.840 garanhões, 19.037 fêmeas e 1.371 machos castrados, obtidas no banco de dados do Serviço de Registro Genealógico da ABCCCampolina, com base nas quais nove índices morfométricos foram calculados utilizando-se seis medidas lineares. A análise de variância foi realizada para avaliar o efeito do sexo e da idade sobre os índices obtidos. Verificou-se que ambos os fatores influenciaram os índices morfométricos. Garanhões apresentaram peso calculado aproximado superior tanto às fêmeas quanto aos machos castrados. De acordo com o índice peitoral, todas as categorias foram classificadas como "longe do chão". Em relação aos valores médios dos índices corporal e dáctilo torácico, garanhões e castrados foram classificados como mediolíneos e eumétricos, respectivamente, enquanto as fêmeas foram classificadas como brevilíneas e hipométricas. Conclui-se que os machos castrados e os garanhões da raça Campolina enquadram-se no padrão da raça para animais tipo sela, mas as fêmeas não. Entretanto, os índices de compacidade 1 e 2 apresentam resultados contraditórios e precisam ser melhor avaliados para fins de uso em classificações. Para a maioria dos índices, os animais castrados apresentaram-se melhor proporcionados que as demais categorias.(AU)


The present study aimed to evaluate the morphometric indexes for Campolina stallions, gelded and mare horses, as well as morphologically characterizing them. For this purpose linear measurements from 4.840 stallions, 19.037 mares and 1371 gelded horses were used, obtained from ABCCCampolina's stud book database, from which nine morphometric indexes were calculated from six linear measurements. Analysis of variance was carried out to evaluate the effect of sex and age on the indexes obtained. We found that both factors influenced the morphometric index. Stallions have presented higher estimate body weight values than mares and gelded horses. According to the pectoral index values all categories were classified as far from the ground. According to body index and dactyl thoracic index average values, stallions and gelded horses were classified as medium lined and middleweight, respectively, once the mares were classified as more compact and overweight. It is concluded that Campolina stallions and gelded horses fall within the breed standard for saddle animals, but mares don't. However, the compact indexes 1 and 2 showed contradictory results and need to be better evaluated for its intended use in classifications. For most indexes gelded animals showed better proportion than the other categories.(AU)


Assuntos
Animais , Cavalos/metabolismo , Forma do Núcleo Celular/genética , Análise de Variância , Pesos e Medidas Corporais/veterinária , Castração/veterinária , Anotação de Sequência Molecular
10.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-219319

Resumo

Objetivou-se determinar a frequência de participação e o desempenho competitivo de equinos Campolina e Mangalarga Marchador em exposições nacionais, relacionando às variáveis: tipo de marcha, sexo e idade. Para tanto, foram extraídos dos bancos de dados das associações de criadores de cada raça, os resultados dos julgamentos das exposições nacionais, realizadas entre 2007 e 2017, de 1781 equinos Campolina e 5239 animais Mangalarga Marchador. Os resultados referentes à frequência de participação nesses eventos e o desempenho obtido pelos equinos foram agrupados por raça, tipo de marcha, sexo e faixa etária, sendo submetidos a testes de distribuição de frequência. Em ambas as raças, a maioria dos animais participou de apenas uma exposição nacional. Porém, ao separar os indivíduos por tipo de marcha, sexo e idade, observou-se que 54,39% dos machos Campolina de marcha batida competiram duas vezes, com maior participação dos indivíduos adultos (41,41%) do que jovens (22,22%). Na raça Mangalarga Marchador, independentemente do tipo de marcha, a proporção de equinos que competiram na fase adulta foi superior à dos jovens, embora na marcha picada a proporção entre competidores jovens (13,97%) e adultos (81,91%) tenha sido ainda mais expressiva. Além disso, em ambas as raças registrou-se grande variação quanto a fase da vida na qual os equinos obtiveram melhor desempenho competitivo. Concluiu-se que ao longo da carreira competitiva, a maioria dos equinos de ambas as raças participam de apenas uma exposição nacional; os animais da modalidade de marcha picada geralmente competem apenas na fase adulta, enquanto as fêmeas de marcha batida participam mais quando jovens. Além disso, a faixa etária na qual os competidores obtêm melhores desempenhos varia de indivíduo para indivíduo.


This study aimed to determine the participation frequency and competitive performance of Campolina and Mangalarga Marchador horses in national shows concerning marcha type, sex, and age. To that end, the trial results of national horse shows between 2007 and 2017, comprising 1,781 Campolina and 5,239 Mangalarga Marchador animals, were extracted from the databases of the breeders associations of each breed. The results regarding participation frequency in these events and the performance achieved by horses were grouped by breed, marcha type, sex, and age group and then subjected to frequency distribution tests. In both breeds, most animals attended only one national show. However, when the specimens were separated by marcha type, sex, and age, it was observed that 54.39% of marcha batida Campolina males competed twice, with greater participation of adult horses (41.41%) than of young ones (22.22%). For Mangalarga Marchador, irrespective of gait type, the proportion of adult horses (67.22%) that competed was higher than that of young ones (25.63%). For marcha picada competitors, the proportion between young (13.97%) and adult (81.91%) was even higher. It was concluded that, over their competitive careers, most horses of either breed attended only one national show, that marcha picada animals usually compete only when adults, and that marcha batida females compete more often when young. In addition, the age group in which competitors achieve their best performances varies according to the specimen.

11.
Ci. Vet. Tróp. ; 18(1): 58-64, jan.-abr. 2015. tab, graf
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-688284

Resumo

Recently, few papers had shown that DMRT3 allele has association with different aspects of the locomotion in horses and other animals, principally ones that have relationships with animal legs associations and now is denominated the Gait Keeper. This allele, when mutant, produce dissociated gaits, with ou without flying phase. However, there is no information about the DMRT3 mutant allele presence when it is compared different types of marcha, batida and picada, and different gaited horses breeds, Campolina (CAMP) and Mangalarga Marchador (MM). The aims of this paper were the evaluation of the DMRT3 wild type and mutant alleles in gaited horses with batida and picada gait from CAMP and MM breeds. It was used DNA samples from 105 adult horses (50 CAMP (batida n=27; picada n=25); 53 MM (batida n=27; picada n=26). All genetic samples was sequenced using the Borlaug Center protocol by Illumina Hi-Seq 100-PE and the results were analyzed by frequency distribution of this allele between breeds and gaits. Results showed that CAMP and MM have the DMRT3 mutant allele. In CAMP breed it was not observed DMRT3 wild type allele in homozygous, in batida and picada horses. In addition, the DMRT3 mutant homozygous in CAMP breed occurred in picada (~44%) and batida (~26%) gaits animals in large frequencies. The MM breed did not have DMRT3 mutant homozygous in batida horses. The largest frequency in batida horses in MM breed was obtained in DMRT3 wild type homozygous (~43%) and in picada horses was in DMRT3 mutant homozygous (~32%). This research showed that DMRT3 mutant allele is present in CAMP and MM breeds and its frequency has relationships not only with horses breed but also with type of the horses gait. Finally, to understand the importance for gaited horses of the DMRT3 allele, mutant or wild type, it is necessary more studies because this knowledge has important implication for development new genetic selection methods and training programs to these breeds.(AU)


Recentemente, diferentes publicações demonstraram que o alelo DMRT3 esta associado aos importantes aspectos da locomoção relacionados com a associações entre bípedes e por isso é denominado the Gait Keeper. Ele, quando mutante, promove os andamentos dissociados, sejam eles marchados ou saltados. Todavia, as comparações entre os tipos de marcha e as raças Campolina (CAMP) e Mangalarga Marchador (MM) no que se refere à presença desse alelo mutante não foram estudadas. Esse trabalho objetivou o estudo da presença do alelo DMRT3 mutante em equinos de marcha batida e picada das raças Campolina e Mangalarga Marchador. Foram utilizadas amostras de DNA de 105 equinos adultos (50 CAMP (batida n=27; picada n=25); 53 MM (batida n=27; picada n=26). O material genético o foi sequenciado utilizando-se protocolos do Borlaug Center através Illumina Hi-Seq 100-PE e os resultados foram analisados através da distribuição da frequência desse gene entre as raças e entre os andamentos. As raças Campolina (CAMP) e Mangalarga Marchador (MM) possuem o DMRT3 mutante. Na CAMP não encontrou-se o alelo DMRT3 normal homozigoto, tanto na picada como na batida. Ainda na CAMP, a maior frequência no DMRT3 mutante homozigoto ocorreu tanto na picada (~44%) como na batida (~26%). Na raça MM não encontrou-se o alelo mutante em homozigose nos animais de marcha batida. As maiores frequências na MM de batida foi no alelo DMRT3 normal homozigoto (~43%) e na picada no alelo mutante em homozigose (~32%). Esse estudo indica que o alelo DMRT3 mutante encontra-se nas raças CAMP e MM e que a frequência dele tem relação não só com a raça, mas também com o tipo do andamento. Por isso, surge a necessidade de estudos mais detalhados para se determinar o possível uso da análise do alelo DMRT3,normal e mutante, como ferramenta dentro dos programas de melhoramento genético e de treinamento para que possam ser utilizados nos equinos marchadores.(AU)


Assuntos
Animais , Cavalos , Alelos , Mutação/genética , Locomoção/genética , Marcha , Frequência do Gene/genética
12.
Ciênc. vet. tróp ; 18(1): 58-64, jan.-abr. 2015. tab, graf
Artigo em Português | VETINDEX | ID: biblio-1480619

Resumo

Recently, few papers had shown that DMRT3 allele has association with different aspects of the locomotion in horses and other animals, principally ones that have relationships with animal legs associations and now is denominated the Gait Keeper. This allele, when mutant, produce dissociated gaits, with ou without flying phase. However, there is no information about the DMRT3 mutant allele presence when it is compared different types of marcha, batida and picada, and different gaited horses breeds, Campolina (CAMP) and Mangalarga Marchador (MM). The aims of this paper were the evaluation of the DMRT3 wild type and mutant alleles in gaited horses with batida and picada gait from CAMP and MM breeds. It was used DNA samples from 105 adult horses (50 CAMP (batida n=27; picada n=25); 53 MM (batida n=27; picada n=26). All genetic samples was sequenced using the Borlaug Center protocol by Illumina Hi-Seq 100-PE and the results were analyzed by frequency distribution of this allele between breeds and gaits. Results showed that CAMP and MM have the DMRT3 mutant allele. In CAMP breed it was not observed DMRT3 wild type allele in homozygous, in batida and picada horses. In addition, the DMRT3 mutant homozygous in CAMP breed occurred in picada (~44%) and batida (~26%) gaits animals in large frequencies. The MM breed did not have DMRT3 mutant homozygous in batida horses. The largest frequency in batida horses in MM breed was obtained in DMRT3 wild type homozygous (~43%) and in picada horses was in DMRT3 mutant homozygous (~32%). This research showed that DMRT3 mutant allele is present in CAMP and MM breeds and its frequency has relationships not only with horse’s breed but also with type of the horse’s gait. Finally, to understand the importance for gaited horses of the DMRT3 allele, mutant or wild type, it is necessary more studies because this knowledge has important implication for development new genetic selection methods and training programs to these breeds.


Recentemente, diferentes publicações demonstraram que o alelo DMRT3 esta associado aos importantes aspectos da locomoção relacionados com a associações entre bípedes e por isso é denominado the Gait Keeper. Ele, quando mutante, promove os andamentos dissociados, sejam eles marchados ou saltados. Todavia, as comparações entre os tipos de marcha e as raças Campolina (CAMP) e Mangalarga Marchador (MM) no que se refere à presença desse alelo mutante não foram estudadas. Esse trabalho objetivou o estudo da presença do alelo DMRT3 mutante em equinos de marcha batida e picada das raças Campolina e Mangalarga Marchador. Foram utilizadas amostras de DNA de 105 equinos adultos (50 CAMP (batida n=27; picada n=25); 53 MM (batida n=27; picada n=26). O material genético o foi sequenciado utilizando-se protocolos do Borlaug Center através Illumina Hi-Seq 100-PE e os resultados foram analisados através da distribuição da frequência desse gene entre as raças e entre os andamentos. As raças Campolina (CAMP) e Mangalarga Marchador (MM) possuem o DMRT3 mutante. Na CAMP não encontrou-se o alelo DMRT3 normal homozigoto, tanto na picada como na batida. Ainda na CAMP, a maior frequência no DMRT3 mutante homozigoto ocorreu tanto na picada (~44%) como na batida (~26%). Na raça MM não encontrou-se o alelo mutante em homozigose nos animais de marcha batida. As maiores frequências na MM de batida foi no alelo DMRT3 normal homozigoto (~43%) e na picada no alelo mutante em homozigose (~32%). Esse estudo indica que o alelo DMRT3 mutante encontra-se nas raças CAMP e MM e que a frequência dele tem relação não só com a raça, mas também com o tipo do andamento. Por isso, surge a necessidade de estudos mais detalhados para se determinar o possível uso da análise do alelo DMRT3,normal e mutante, como ferramenta dentro dos programas de melhoramento genético e de treinamento para que possam ser utilizados nos equinos marchadores.


Assuntos
Animais , Alelos , Cavalos , Mutação/genética , Frequência do Gene/genética , Locomoção/genética , Marcha
13.
Semina Ci. agr. ; 36(1): 353-366, Jan.-Fev. 2015. tab
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-28176

Resumo

In the equine species, the surface characteristics, present a close relationship with its functional classification. The scientific use of linear measurements can contribute decisively in the selective process of many breeds, by identifying the higher morphologically individuals and excluding from reproduction those that are not closed to desirable. The present study objected to evaluate and compare, the linear measures from stallions and gelded horses registered in ABCCCampolinas CP6 and CP8 books, and to determinate the existing correlations. In order to reach so, 15 linear measures from 4.837 stallions and 1.371 gelded were evaluated from descriptive statistic, Pearsons correlation and analysis of variance. Generally, higher values of correlations were observed for stallions than to gelded ones. To stallions, most of the measures were significantly influenced (P 0,01) by the year of birth, state of birth and coat color, while to gelded ones the coat color showed lower influence (P 0,01) upon the measures. Its important to notice that castration did not committed the animals final growth, however the breeders non sense the lack of appropriated criteria during the selection process and personal preferences can contribute towards stablishing breed characters rather than functionals. This can be highlighted by the fact that Campolinas gelded horses showed, in average, better proportioned than stallions.(AU)


A estreita relação entre as características de exterior e a classificação funcional dos equinos tem contribuído consideravelmente no processo seletivo a partir da identificação de indivíduos morfologicamente uperiores, permitindo a eliminação do processo reprodutivo de indivíduos portadores de caracteres indesejáveis. Objetivou-se avaliar as medidas lineares dos garanhões e castrados registrados no livro definitivo da ABCCCampolina, bem como compará-las e determinar as correlações existentes. Para tal, foram analisadas 15 medidas lineares de 4.837 garanhões e 1.371 castrados a partir da estatística descritiva, correlação de Pearson e análise de variância. De forma geral, as correlações encontradas apresentaram valores maiores para garanhões que para os castrados. Para aqueles a maioria das medidas foram significativamente influenciadas (P 0,01) pelo ano de nascimento, estado do criatório e pelagem, enquanto que para os castrados a pelagem foi a variável de menor influência (P 0,01) sobre as medidas. Destaca-se que a castração não comprometeu o desenvolvimento final dos animais, entretanto a falta de critérios dos produtores no momento da seleção e a preferência pessoal podem contribuir para a fixação de caracteres raciais em detrimento dos funcionais. Isso pode ser evidenciado pelo fato de os machos castrados da raça Campolina mostraram-se, em média, melhores proporcionados quando comparados aos garanhões.(AU)


Assuntos
Animais , Masculino , Cavalos/anatomia & histologia , Biometria , Análise de Variância , Castração/veterinária , Fatores Raciais , Melhoramento Genético
14.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-212941

Resumo

Síndrome Asmática Equina é composta por um grupo de enfermidades prevalentes e uma realidade já conhecida em modalidades equestres como corrida, enduro e adestramento, mas ainda não foram descritas nas raças Campolina e Mangalarga Marchador, onde os animais participam de concursos de marcha, uma prova de resistência. Este trabalho teve como objetivo investigar a ocorrência de síndrome asmática equina (SAE) em um grupo de animais das raças Campolina e Mangalarga Marchador aptos a participarem de concursos de marcha, assim como a ocorrência de SAE em diferentes grupos etários (abaixo e a partir de sete anos), sexo e raça. Avaliação clínica, endoscópica e citologia broncoalveolar total e diferencial foram realizadas em 30 cavalos (15 da raça Campolina e 15 Mangalarga Marchador) com idade entre três e 18 anos, sem histórico ou evidência clínica de doença respiratória, aptos a competirem e após serem submetidos a exercício padrão de exposições das raças. A endoscopia e coleta de lavado broncoalveolar foram realizadas 30 minutos após exercício padronizado. O exame clínico foi realizado em três momentos: antes (1º), imediatamente após o exercício (2º) e imediatamente antes do exame endoscópico (3º), além da coleta de sangue para hemograma basal. Para efeito de comparação, os animais foram agrupados por raça, abaixo e a partir de sete anos de idade, e por sexo. De acordo com a citologia específica do lavado broncoalveolar (LBA), 3% (1/30) foram diagnosticados com SAE moderada (Campolina) e 53% (16/30) com SAE leve. Todos do grupo SAE apresentaram contagem total de células nucleadas (CTCN) do lavado broncoalveolar >530 células/µL. Um total de 53% (9/17) dos equinos do grupo SAE apresentaram escore de muco 2/5. Houve diferença significativa nas médias entre as raças relacionada aos percentuais de macrófagos e linfócitos, mas não entre eosinófilos, mastócitos, células epiteliais e CTCN. Não houve diferença significativa na ocorrência de SAE entre raças, grupos etários e sexo. Até onde se sabe esse foi o primeiro trabalho a demonstrar que SAE está presente em cavalos marchadores (marcha batida) com bom desempenho atlético quando considerado o exame endoscópico e a citologia do LBA como diagnósticos.


Equine Asthmatic Syndrome are prevalent diseases already known in equestrian modalities such as races, endurance and dressage, but not yet described in Campolina and Mangalarga Marchador breeds, which participate in marcha competitions, a test of resistance. The objective of this study was to investigate the occurrence of equine asthma syndrome (EAS) in a group of animals in Campolina and Mangalarga Marchador breeds, able to participate in marcha competitions, as well as the occurrence of EAS in different age groups (below and from the age of seven), gender and breed. Clinical, endoscopic, total and differential bronchoalveolar cytology were performed on 30 horses (15 Campolina and 15 Mangalarga Marchador) aged between 3 and 18 years, with no history or clinical evidence of respiratory disease, able to competition and after being submitted to standard exercise of breed exposures. Endoscopy and bronchoalveolar lavage were collected 30 minutes after standardized exercise. The clinical examination was performed before and immediately after exercise and immediately before endoscopic examination, in addition to blood collection for baseline blood count. For comparison purposes, the animals were grouped by breed and under seven years of age or from seven years and by sex. According to the specific cytology of bronchoalveolar lavage (BAL), 3% (1/30) was diagnosed with moderate EAS (Campolina) and 53% (16/30) were diagnosed with mild EAS. All of the EAS group had a total nucleated cell count (TNCC) of bronchoalveolar lavage fluid > 530 cells / L. A total of 53% (9/17) of EAS horses presented mucus score 2 / 5. There was a significant difference in the means between the races related to the percentages of macrophages and lymphocytes, but not between eosinophils, mast cells, epithelial cells and TNCC. There was no significant difference in the occurrence of EAS between breeds, age groups and sex. As far as we know, this was the first work to show that EAS is present in marchadores horses with good athletic performance when considering BAL cytology as a diagnosis.

15.
Tese em Inglês | VETTESES | ID: vtt-212279

Resumo

O Mangalarga Marchador (MM) é a maior raça equina do Brasil, e com a análise de pedigree e de marcadores moleculares tornou-se possível a melhor investigação genética na raça. Os objetivos neste trabalho foram avaliar a estrutura populacional e pré-caracterizar geneticamente o MM com dados de pedigree e genotipagens. Pedigree de 514.283 animais foram utilizados para estimações da endogamia (F), probabilidade de origem gênica e de estruturação da raça. Genotiparam-se 3.193 equinos para 13 microssatélites (SSR) e em chip de polimorfismo de nucleotídeo único, SNP70K, 244 animais das raças MM, Andaluz (AND), Puro Sangue Lusitano (PSL), Puro Sangue Inglês (PSI), Árabe (ARA), Campolina (CAM), Mangalarga (MAN), Puro Sangue Espanhol (PSE) e Sorraia (SOR). Assim, calcularam-se o número de alelos raros (AR), heterozigosidades esperadas (He) e observadas (Ho), homozigosidades esperadas (Home) e observadas (Homo), frequência de alelos menores (MAF), estatísticas F (Fis, Fit e Fst), distância genética (DG), análise de componentes principais (ACP), equilíbrio de Hardy-Weinberg (EHW), desequilíbrio de ligação (DL), diferenciação populacional, estruturação populacional por agrupamento e presença de haplótipos comuns entre as raças. Por análise de pedigree da raça MM, o intervalo de geração foi de 9,48 a 10,43, F de 1,02% a 1,10%, relação genética aditiva de 0,0023 a 0,0045, números efetivos de ancestrais, fundadores e genomas fundadores foram de 198 a 1.038, 225 a 1.062 e 133 a 150, números de fundadores que apresentam 50% e 10% do pool genético representaram 7,94% a 19,09% e 0,69% a 6,64% dos fundadores. Por análise de SSR, o AR médio no MM foi de dois alelos/locus, médias de He e Ho oscilaram de 0,5767 a 0,8450 e 0,5331 a 0,7949, médias de Fis (-0,0195), Fit (0,0566) e Fst (0,0748) e observou-se desvios de EHW, além de diferenciação populacional nos loci e 60,26% dos alelos tinham forte DL. As DG foram maiores no ARA e PSI com as demais raças e menores entre o MM, MAN e CAM e estas com o AND e PSL, resultado corroborado pelo ACP. O MM foi uma entidade genética subestruturada, porém com alguns haras mais estruturados. Com os SNP, no MM obteve-se o maior valor de Homo (34.916,70), 51% dos animais possuíam perda de heterozigosidade, MAF médio de 0,2010, houve desvios de EHW nos cromossomos, He variou de 0,2940 a 0,3231 e extensões menores de DL. Encontrou-se bloco de haplótipo semelhante entre o MAN e MM. A menor diferenciação ocorreu entre o CAM e MM (Fst = 0,0411), e a maior entre PSI e SOR (Fst = 0,2284). A raça MM foi pouca estruturada ao contrário do PSL, PSE, PSI e SOR, e observou-se o compartilhamento de alelos entre MM e MAN. ACP discriminou em maior magnitude a SOR e PSI das demais raças, moderadamente o PSL e PSE, e menor entre MM, MAN e CAM. O MM não está em severa endogamia, o que não prejudica sua evolução como espécie. Contudo, é necessário o monitoramento contínuo da diversidade genética com o uso de marcadores e registros precisos de pedigree.


Mangalarga Marchador (MM) is the largest equine breed in Brazil, and the analysis of pedigree and molecular markers has made possible the best genetic research in the breed. The objectives of this work were to evaluate the population structure and to pre-characterize the MM with pedigree and genotyping data. Pedigree of 514,283 animals were used for estimates of inbreeding (F), probability of gene origin and breed structuring. Genotyped 3193 equines for 13 microsatellites (SSR) and in chip of the single nucleotide polymorphism, SNP70K, 244 animals of the breeds MM, Andalusian (AND), Lusitano (LUS), Thoroughbred (THO), Arabian (ARA), Campolina (CAM), Mangalarga (MAN), Puro Sangue Espanhol (PSE) and Sorraia (SOR). Thus, calculated the number of rare alleles (RA), expected heterozygosities (He) and observed (Ho), expected homozygosity (Home) and observed (Homo), minor allele frequency (MAF), F statistics (Fis, Fit e Fst), genetic distance (GD), principal component analysis (PCA), Hardy-Weinberg equilibrium (HWE), linkage disequilibrium (LD), population differentiation, population structuring by clustering and presence of common haplotypes between breeds. By pedigree analysis in the MM, the generation interval was from 9.48 to 10.43, F from 1.02% to 1.10, additive genetic ratio from 0.0023 to 0.0045, effective numbers of ancestors, founders, and genomes founders were from 198 to 1038, 225 to 1062 and 133 to 150, numbers of founders who presented 50% and 10% of the genetic pool accounted for 7.94% to 19.09% and 0.69% to 6.64% of the founders. For SSR analysis, the mean RA in the MM was two alleles/locus, He and Ho mean values ranged from 0.5767 to 0.8450 and 0.5331 to 0.7949, Fis averages (-0.0195), Fit (0.0566) and Fst (0.0748) and deviations of HWE were observed such as population differentiation in the loci and 60.26% of the alleles had strong LD. The GD were higher in the ARA and THO with the other breeds and minors between the MM, MAN and CAM and these with the AND and LUS, a result corroborated by the PCA. The MM was a substructured genetic entity, however with some more structured farms. With the SNP, in the MM the highest value of Homo (34,916.70) was found, 51% of the animals had loss of heterozygosity, mean MAF of 0.2010, there were deviations of EHW in the chromosomes, He ranged from 0.2940 to 0.3231 and smaller extensions of DL. A similar haplotype block was found between MAN and MM. The lowest differentiation occurred between CAM and MM (Fst = 0.0411), and the highest between THO and SOR (Fst = 0.2284). The MM was poorly defined unlike the LUS, PSE, THO and SOR, and the alleles sharing between MM and MAN was observed. PCA discriminated to a greater extent the SOR and THO of the other breeds, moderately the LUS and PSE, and smaller between MM, MAN and CAM. The MM is not in severe endogamy, which does not affect its evolution as a species. However, continuous monitoring of genetic diversity is necessary with the use of molecular and accurate pedigree records.

16.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-216610

Resumo

A realização de atividade física tanto em humanos quanto em animais proporciona uma boa saúde física para os praticantes. As atividades e cultura esportivas estão cada vez em evidência e, é sabido animais de alto rendimento exigem, a cada dia, animais mais condicionados, pois maior será sua valorização. Atualmente, existe pouca informação relacionada as respostas fisiológicas do organismo em cavalos atletas submetidos ao concurso de marcha. A resposta de fase aguda (RFA) é um mecanismo fisiopatológico de proteção muito rápido caracterizado pela alteração na concentração sérica de certas proteínas quando as células são submetidas a algum estresse capaz de quebrar sua homeostase e, antecede o surgimento dos sinais clínicos. É importante dados a fim de compreender como o cavalo se comporta perante um estresse fisiológico induzido pelo exercício. O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito da marcha sobres os marcadores séricos de lesão muscular e proteínas de fase aguda. Foram utilizados 20 equinos, de ambos os sexos, da raça Campolina, com idade entre 3,5 e 12,5 anos, pesando em torno de 400 Kg. Participaram do estudo animais atletas clinicamente saudáveis, sob inspeção do exame físico e laboratorial. Amostras de sangue (soro) foram coletadas 24 horas antes do concurso de marcha repouso (T0), imediatamente após o término do exercício, em torno de 5 minutos (T5m), trinta minutos e 12 horas após o concurso (T30m e T12h, respectivamente). Após a realização de todos os procedimentos foram observados diferenças significativas entre alguma situação (momento, interação momento sexo ou sexo) para a ureia, creatinina, aspartato aminotransferase, creatina quinase e nas proteínas de fase aguda (proteína plasmática total, albumina, haptoglobina, glicoproteína ácida e ceruloplasmina. Sendo assim, podemos concluir que os cavalos avaliados estavam aptos a competir em provas de marcha uma vez que após a realização do exercício todas as variáveis analisadas apresentavam um decréscimo podendo chegar a valores bem semelhantes ao observado no repouso, não evidenciando lesões.


Performing physical activity on both humans and animals provides good physical health for practitioners. Sports activities and culture are constantly in evidence and, it is well known that high-yielding animals require more and more conditioned animals every day, since their value will be greater. Currently, there is little information related to the physiological responses of the organism in horses submitted to the running contest. The acute phase response (RFA) is a pathophysiological mechanism of very rapid protection characterized by the alteration in the serum concentration of certain proteins when the cells are subjected to some stress capable of breaking their homeostasis and precedes the appearance of the clinical signs. Importance is given to understanding how the horse behaves in the face of an exercise-induced physiological stress. The aim of this study was to evaluate the effect of gait on serum markers of muscle injury and acute phase proteins. Twenty horses of both sexes of the Campolina breed, aged between 3.5 and 12.5 years, weighing around 400 kg were used. The animals were clinically healthy, under physical and laboratorial examination. Samples of blood were collected 24 hours before the end - of - exercise contest, at approximately 5 minutes (T5m), 30 minutes and 12 hours after the contest (T30m and T12h, respectively). After performing all procedures, significant differences were observed between any situation (moment, sex or sex moment interaction) for urea, creatinine, aspartate aminotransferase, creatine kinase and acute phase proteins (total plasma protein, albumin, haptoglobin, glycoprotein acid and ceruloplasmin, so we can conclude that the evaluated horses were able to compete in gait tests since after the exercise all the analyzed variables presented a decrease, reaching values very similar to that observed at rest, not showing any lesions

17.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-207536

Resumo

Objetivou-se com este estudo avaliar a estrutura demográfica e genética populacional da raça Campolina. Foram obtidas informações de registros genealógicos a partir do banco de dados cedido pela Associação Brasileira dos Criadores do Cavalo Campolina (ABCCCampolina) referente a 107.630 animais registrados entre os anos de 1951 e 2016, entre machos, fêmeas e castrados provenientes de livros provisórios, definitivos fechados e abertos. Parâmetros populacionais demográficos de intervalo de gerações, idade média dos pais ao nascimento dos filhos, número máximo de gerações e contribuição genética dos rebanhos e avaliações genéticas foram calculados visando a estimar o número efetivo de fundadores e ancestrais, número efetivo populacional e coeficientes de endogamia e parentesco. Análises dos parâmetros demográficos e genéticos foram obtidas por meio do software ENDOG V4.9. Para a população avaliada, observou-se que 26.672 fêmeas e 4.321 machos utilizados para reprodução deixaram descendentes, com média de 4,01 filhos/égua e 25,44 filhos/reprodutor. Foi estimado número efetivo de fundadores e ancestrais contribuindo para a formação da raça Campolina equivalente a 60 e 54 indivíduos, respectivamente. O intervalo de gerações estimado foi de 8,96 anos. O coeficiente médio de endogamia calculado para a população Campolina foi igual a 2,44% e coeficiente médio de parentesco de 2,15%. Atenção deve ser dada ao processo de seleção e escolha dos animais a serem acasalados, para evitar perdas econômicas e funcionais em consequência da depressão endogâmica.


The aim of this study was to evaluate the demographic structure and genetics population of Campolina horse breed. Were obtained information from genealogical records from the database provided by Associação Brasileira dos Criadores do Cavalo Campolina on the 107,630 animals recorded between the years of 1951 and 2016, to males, females and gelded ones from sutdbooks definitive and closed and open. Parameters of population to generations interval, average age of parents at the birth of their offspring, maximum number of generations and genetic importance of studs and genetic evaluations in order to estimate the actual number of founders and ancestors, effective population size and inbreeding coefficient and average relatedness coefficient. Demographic parameters analyzes were obtained through the software ENDOG V4.9. For the population evaluated, it was observed that 26,672 dams and 4,321 sires used for breeding have left descendants, with an average of 4.01 offspring/dam and 25.44 offspring/sire. It has been estimated to actual number of founders and ancestors contributing to the formation of the Campolina horse breed equivalent to 60 and 54 individuals. Generations intervals was estimated to 8.96 years. The inbreeding coefficient calculated for the population Campolina was equal to 2.44% and average coefficient of relatedness was 2.15%. Attention should be given to the process of selection and choice of animals that will be mated to prevent economic losses and functional as a result of inbreeding depression.

18.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-207659

Resumo

Objetivou-se nesta pesquisa verificar ocorrência e distribuição de pelagens em equinos de ambos os sexos da raça Campolina, além de avaliar características lineares e índices de classificação funcional. Os dados utilizados foram provenientes dos livros de registros genealógicos cedido pela Associação Brasileira dos Criadores do Cavalo Campolina com total de 107.630 animais registrados entre os anos de 1951 e 2016 compreendendo garanhões, castrados e fêmeas. Nas avaliações quanto às pelagens na população Campolina foram usadas informações de 44.437 animais que apresentavam pelagens classificadas. Para avaliações biométricas utilizaram-se 47.560 informações com medidas lineares e 12 índices funcionais foram estimados com base nas mensurações. Quanto à avaliação funcional dos animais foram utilizadas notas de pontuações recebidas no ato do registro definitivo desses com total de 5.196 dados. Análises exploratórias das informações disponibilizadas foram executadas. Verificou-se efeito da categoria animal sobre medidas lineares, índices e pontuações de andamento por meio de análise de variância e teste de comparação de média (p<0,05). Teste de qui-quadrado foi realizado para verificar a dispersão das pelagens, e observar diferenças entre machos e fêmeas além da associação destas com as pontuações de andamento. Os procedimentos foram realizados pelo software Statistical Analysis System (SAS, 9.4). As pelagens de maior recorrência na raça foram: baia, alazã e castanha, contudo ascensão do fenótipo pampa foi verificado. Não foram observados efeitos significativos da pelagem sobre as características de andamento. Garanhões, castrados e fêmeas apresentaram-se diferentes quanto as medidas de alturas na cernelha, no dorso e na garupa. Os equinos mostraram-se eumétricos, mediolíneos, longe do chão e estando as fêmeas mais similares ao tipo tração. Quanto ao andamento, garanhões apresentaram melhor desempenho ao registro definitivo. Na população de equinos Campolina permanece predominante o fenótipo baio. Garanhões da raça se encontram dentro do padrão almejado pela associação para animais de grande porte e com andamento marchado, fato este que pode estar relacionado ao rigor de seleção desses. No entanto, castrados e fêmeas não encontram-se dentro do ideal. Para a raça Campolina, foi constatada correlação de baixa magnitude entre medidas de altura e pontuações de andamentos; demonstrando inexistência de associação da altura com a qualidade da marcha avaliada ao registro definitivo.


The aim of this research was to evaluate morphometric characteristics and functional classification indexes, in addition to checking the occurrence and distribution of coat colors in horses of both genders of Campolina horse breed. The database used were from the studbook released by the Associação Brasileira dos Criadores do Cavalo Campolina with recorded about 107,630 animals between the years of 1951 and 2016 including stallions, mares and gelded ones.In the assessments regarding coat colorsCampolina horse population were used information of 44,437 animals presenting coat colors defined. Biometric evaluations it was used 47,560 information with linear measurements, and 12 indexes functional zootechnical were estimated on the basis of measurements. As for the functional assessment of the animals were used notes of scores received at the definitive registration act with a total of 5,196 data. Exploratory analyzes of the information provided have been performed. To verify the effect of animal category as linear measurements, indexes and scores of driving analysis of variance were made followed by test of mean comparisons (p<0.05). The chi-squared test was performed to verify coat colors dispersal, and observe differences between males and females in addition to the association of these with the progressof scores. The procedures were performed by the software Statistical Analysis System. Stallions, gelded ones and mares were different in the heights at withers, the back and the croup.The horses showed to be eumetric, longiliness, far from the groundand being the females most similar to the traction type. Campolina horse breed males have presented a better performance in progress at the time of definitive registration. The population of Campolina horses remains prevalent in the dun phenotype. Stallions of the breed are within the pattern desired by the association for large animals and gait, a fact that may be related to the rigor of selection. However, gelged ones and mares, are not within the ideal. For Campolina horse breed, correlation of low magnitude between measures of height and gait scores; demonstrating, absence of association of height with the gait quality assessed to definitive record.

19.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-207571

Resumo

Objetivou-se verificar se nos últimos anos o critério de julgamento adotado para as raças Campolina e Mangalarga Marchador obteve êxito, ou seja, se as gerações seguintes apresentam a morfologia preconizada pelo padrão racial associada ao andamento marchado de qualidade. Para tanto, as classificações conquistadas por cada equino durante as exposições nacionais nos julgamentos de morfologia e marcha foram submetidas à correlação de Spearman, para registrar o número de campeonatos com correlação (P<0,05) entre as classificações dos julgamentos de morfologia e marcha ou sem correlação (P>0,05). Em seguida, o número de campeonatos com ou sem correlação foram submetidos ao teste de distribuição de frequência, considerando as variáveis: raça, ano, idade, categoria de andamento e sexo. Também foram utilizados como parâmetro os coeficientes de correlação de Spearman (r) dos campeonatos com correlação. Apenas na raça Mangalarga Marchador houve diferença entre os anos avaliados, registrando-se entre 1998 e 2004 maior número de campeonatos com correlações entre as classificações nos julgamentos de morfologia e marcha. Em ambas as raças, os potros apresentaram maior número de campeonatos com correlação que os equinos adultos. Ao comparar os coeficientes de correlação de Spearman, os campeonatos da raça Campolina apresentaram r superior ao da raça Mangalarga Marchador, 68,14% e 63,68%, respectivamente. Apenas na raça Mangalarga Marchador os machos apresentaram valor de r superior ao das fêmeas, 67,27% e 59,73%, respectivamente. Concluiu-se que os critérios de julgamento adotado pelas associações das raças Campolina e Mangalarga Marchador não estão conseguindo convergir nas gerações seguintes a morfologia preconizada pelo padrão racial associada ao andamento marchado de qualidade.


It was aimed to verify if in recent years the criterion of exhibition contests adopted for Campolina and Mangalarga Marchador breeds was successful, in other words, if the succeeding generations present, the recommended morphology by the racial pattern in connection with a high quality ambling gait. Therefore, the classifications won by each horse during the national exhibitions on morphology and gait were submitted to the Spearman correlation, to register the number of contests with correlation (P<0,05) among the morphology and gait contest classifications or without correlation (P>0,05). Subsequently, the number of contests with or without correlation were submitted to the frequency distribution test, considering the variables: breed, year, age, ambling gait category and sex. The Spearman correlation coefficient (r) of contest with correlation was also used as a parameter. Only on Mangalarga Marchador was observed a difference between years of evaluation, registering between 1998 and 2004 greater number of contests with correlations between morphological and ambling gait performances. On both breeds, the foals presented more contests with correlation than adult horses. When comparing the Spearman correlation coefficients, the Campolinas contests presented superior r than Mangalarga Marchador, 68,14% and 63,68%, respectively. Only in Mangalarga Marchador breed the males presented higher r value than females, 67,27% and 59,73%, respectively. It was concluded that the contest criterion adopted by both Campolina and Mangalarga Marchador breeders associations are not succeeding in converging the following generations, the recommended morphology by the racial patterns in combination with a high quality ambling gait.

20.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-207865

Resumo

Este estudo teve como objetivo avaliar a conformação física e os parâmetros fisiológicos de equinos atletas da raça Campolina e participantes de provas de marcha com a finalidade de identificar quais parâmetros refletem melhor o desempenho nas competições. Foram selecionados 65 equinos (Equus caballus) da raça Campolina em treinamento e competições da modalidade marcha, machos e fêmeas, clinicamente saudáveis, pertencentes a quatros haras no Estado do Rio de Janeiro. Todos os animais foram submetidos à mensuração de 13 medidas lineares. A partir destas medidas foram calculados 10 índices morfométricos. Foi realizada mensuração da espessura da capa de gordura na região da garupa por meio de ultrassonografia em 25 destes animais. A partir dos dados obtidos foi calculado: percentual de gordura, massa gorda e magra. Foram coletadas amostras sanguíneas de 35 dos animais participantes e realizada análise bioquímica. Por fim, foi realizado teste de esforço com 11 animais, no qual foi simulada uma prova de marcha. Imediatamente antes do início do exercício e logo após o término foram aferidas a temperatura corporal e frequência cardíaca e coletadas amostras sanguíneas em condições anaeróbicas para realização de exame hemogasométrico. As medidas lineares e os índices morfométricos encontraram-se dentro do esperado para o tipo de exercício físico ao qual estes cavalos são submetidos e em conformidade com o Padrão Racial A maioria dos animais avaliados foi classificado com escore de condição corporal ideal e apresentaram percentual de gordura dentro dos parâmetros recomendados para animais atletas. Todos os parâmetros bioquímicos encontraram-se dentro dos valores de referência para a espécie. Os exames de hemogasometria realizados, antes e após exercício físico, apresentaram alterações compatíveis com o manejo e programa de treinamento ao qual os animais são submetidos. Os resultados obtidos nestes estudos foram importantes, não só para o conhecimento da evolução da raça, mas também para a sua adequação na rotina de esporte e trabalho e para a prevenção de lesões.


The objective of this study was to evaluate the physical conformation and the physiological parameters of Campolina equine athletes and participants in gait competitions in order to identify which parameters influence performance in competitions. Were selected a total of 65 equine horses (Equus caballus) of the Campolina race in training and competitions of the gait mode, males and females, clinically healthy, belonging to four farms in the State of Rio de Janeiro. All the animals were submitted to the measurement of 13 linear measurements. From these measurements, 10 morphometric indices were calculated. Fat thickness was measured in the rump region by ultrasonography in 25 of these animals. From the obtained data it was calculated: percentage of fat, fat and lean mass. Blood samples were collected from 35 of the participating animals and a biochemical analysis was performed. Finally, an exercise test was performed with 11 animals, in which a gait test was simulated. Immediately before the beginning of the exercise and immediately after the end, the body temperature and heart rate were checked and blood samples were collected under anaerobic conditions for a hemogasometric examination. Linear measures and morphometric indices were within the expected range for the type of physical exercise to which these horses are submitted and in accordance with the Racial Standard. Most of the evaluated animals were classified with ideal body condition score and presented percentage of fat Within recommended parameters for animal athletes. All biochemical parameters were within the reference values for the species. Hemogasometry examinations, before and after physical exercise, presented changes compatible with the management and training program to which the animals are submitted. The results obtained in these studies were important, not only for the knowledge of the evolution of the breed, but also for its adequacy in the routine of sports and work and for the prevention of injuries.

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